MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halorhabdus utahensis DSM 12940 chromosome

Total Repeats: 74047

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
19001	NC_013158	CGG	2	6	813591	813596	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051925
19002	NC_013158	CGT	2	6	813630	813635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051925
19003	NC_013158	CAC	2	6	813645	813650	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257051925
19004	NC_013158	CGT	2	6	813717	813722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051925
19005	NC_013158	GAT	2	6	813799	813804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257051925
19006	NC_013158	C	6	6	813859	813864	0 %	0 %	0 %	100 %	257051925
19007	NC_013158	GAT	2	6	813868	813873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257051925
19008	NC_013158	GTT	2	6	813888	813893	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257051925
19009	NC_013158	CGG	2	6	813952	813957	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051925
19010	NC_013158	CGG	2	6	813975	813980	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051925
19011	NC_013158	CGA	3	9	813981	813989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051925
19012	NC_013158	TCG	2	6	814034	814039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051925
19013	NC_013158	TCG	3	9	814052	814060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051925
19014	NC_013158	GCA	2	6	814214	814219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051925
19015	NC_013158	GCC	2	6	814273	814278	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051925
19016	NC_013158	GCC	2	6	814351	814356	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051925
19017	NC_013158	ACG	3	9	814364	814372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051925
19018	NC_013158	TCC	2	6	814393	814398	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257051926
19019	NC_013158	GGA	2	6	814424	814429	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257051926
19020	NC_013158	CGGT	2	8	814462	814469	0 %	25 %	50 %	25 %	257051926
19021	NC_013158	GA	3	6	814470	814475	50 %	0 %	50 %	0 %	257051926
19022	NC_013158	CGA	2	6	814517	814522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051926
19023	NC_013158	CT	3	6	814549	814554	0 %	50 %	0 %	50 %	257051926
19024	NC_013158	GGT	2	6	814628	814633	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257051926
19025	NC_013158	TCCG	2	8	814655	814662	0 %	25 %	25 %	50 %	257051926
19026	NC_013158	GTG	2	6	814709	814714	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257051926
19027	NC_013158	TCG	2	6	814742	814747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051926
19028	NC_013158	ATA	2	6	814914	814919	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19029	NC_013158	CGT	2	6	814969	814974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051927
19030	NC_013158	ACG	2	6	815025	815030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051927
19031	NC_013158	CCG	2	6	815053	815058	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051927
19032	NC_013158	CG	3	6	815174	815179	0 %	0 %	50 %	50 %	257051927
19033	NC_013158	CGA	2	6	815194	815199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051927
19034	NC_013158	TCC	2	6	815208	815213	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257051927
19035	NC_013158	ATCCTC	2	12	815243	815254	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	257051927
19036	NC_013158	GCC	2	6	815264	815269	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051927
19037	NC_013158	TCG	2	6	815286	815291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051927
19038	NC_013158	GAGT	2	8	815318	815325	25 %	25 %	50 %	0 %	257051927
19039	NC_013158	TGG	2	6	815331	815336	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19040	NC_013158	GTCACA	2	12	815344	815355	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	257051928
19041	NC_013158	ATG	2	6	815394	815399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257051928
19042	NC_013158	CCCATC	2	12	815478	815489	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	257051928
19043	NC_013158	CCG	2	6	815490	815495	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051928
19044	NC_013158	CGT	2	6	815521	815526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051928
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19047	NC_013158	ATC	2	6	815583	815588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257051928
19048	NC_013158	GCTG	2	8	815597	815604	0 %	25 %	50 %	25 %	257051928
19049	NC_013158	GTCG	2	8	815611	815618	0 %	25 %	50 %	25 %	257051928
19050	NC_013158	CAG	2	6	815630	815635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051928
19051	NC_013158	ACG	3	9	815655	815663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051928
19052	NC_013158	GCT	2	6	815684	815689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051928
19053	NC_013158	TCGC	2	8	815700	815707	0 %	25 %	25 %	50 %	257051928
19054	NC_013158	ACGG	2	8	815796	815803	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
19055	NC_013158	TCG	3	9	815937	815945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051929
19056	NC_013158	CTGG	2	8	815963	815970	0 %	25 %	50 %	25 %	257051929
19057	NC_013158	TCG	2	6	815985	815990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051929
19058	NC_013158	CAC	2	6	816022	816027	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257051929
19059	NC_013158	GCT	2	6	816073	816078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051929
19060	NC_013158	CTCA	2	8	816088	816095	25 %	25 %	0 %	50 %	257051929
19061	NC_013158	TCG	2	6	816168	816173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051929
19062	NC_013158	TCG	2	6	816297	816302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051929
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19065	NC_013158	CGT	2	6	816427	816432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051929
19066	NC_013158	TCTT	2	8	816441	816448	0 %	75 %	0 %	25 %	257051929
19067	NC_013158	CGGC	2	8	816474	816481	0 %	0 %	50 %	50 %	257051929
19068	NC_013158	TCGT	2	8	816521	816528	0 %	50 %	25 %	25 %	257051929
19069	NC_013158	GC	3	6	816574	816579	0 %	0 %	50 %	50 %	257051929
19070	NC_013158	TCG	2	6	816582	816587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051929
19071	NC_013158	TCG	2	6	816606	816611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051929
19072	NC_013158	GCT	2	6	816643	816648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051929
19073	NC_013158	CA	3	6	816688	816693	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
19074	NC_013158	GTC	2	6	816705	816710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051930
19075	NC_013158	CG	3	6	816715	816720	0 %	0 %	50 %	50 %	257051930
19076	NC_013158	CTC	2	6	816729	816734	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257051930
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19080	NC_013158	CTG	2	6	816930	816935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051930
19081	NC_013158	GAG	2	6	816936	816941	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257051930
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19083	NC_013158	GTTC	2	8	816956	816963	0 %	50 %	25 %	25 %	257051930
19084	NC_013158	TCG	2	6	816985	816990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051930
19085	NC_013158	GCG	2	6	817003	817008	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051930
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19087	NC_013158	AC	3	6	817042	817047	50 %	0 %	0 %	50 %	257051930
19088	NC_013158	CGC	2	6	817128	817133	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051930
19089	NC_013158	ATCG	2	8	817315	817322	25 %	25 %	25 %	25 %	257051930
19090	NC_013158	TGGG	2	8	817343	817350	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
19091	NC_013158	CG	4	8	817367	817374	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19092	NC_013158	GAT	2	6	817403	817408	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257051931
19093	NC_013158	ATCGAG	2	12	817424	817435	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	257051931
19094	NC_013158	CGGT	3	12	817453	817464	0 %	25 %	50 %	25 %	257051931
19095	NC_013158	CGA	2	6	817498	817503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051931
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19097	NC_013158	TTGG	2	8	817662	817669	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
19098	NC_013158	GAC	2	6	817671	817676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19099	NC_013158	CGG	2	6	817695	817700	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19100	NC_013158	TA	3	6	817754	817759	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19101	NC_013158	ACCG	2	8	817801	817808	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
19102	NC_013158	AGT	2	6	817843	817848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19103	NC_013158	CAG	2	6	817863	817868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19104	NC_013158	ACGA	2	8	818048	818055	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
19105	NC_013158	CGA	2	6	818076	818081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19106	NC_013158	ATG	2	6	818211	818216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257051932
19107	NC_013158	GAG	2	6	818250	818255	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257051932
19108	NC_013158	GCAC	2	8	818381	818388	25 %	0 %	25 %	50 %	257051932
19109	NC_013158	AGCG	2	8	818446	818453	25 %	0 %	50 %	25 %	257051933
19110	NC_013158	GGATC	2	10	818566	818575	20 %	20 %	40 %	20 %	257051933
19111	NC_013158	CGG	2	6	818661	818666	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051933
19112	NC_013158	CCG	2	6	818676	818681	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051933
19113	NC_013158	GGC	2	6	818736	818741	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051933
19114	NC_013158	TGCT	2	8	818793	818800	0 %	50 %	25 %	25 %	257051933
19115	NC_013158	CCG	2	6	818855	818860	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19116	NC_013158	CA	3	6	818933	818938	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
19117	NC_013158	CGA	2	6	818974	818979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051934
19118	NC_013158	CGA	2	6	819010	819015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051934
19119	NC_013158	CA	3	6	819051	819056	50 %	0 %	0 %	50 %	257051934
19120	NC_013158	CCA	2	6	819157	819162	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257051934
19121	NC_013158	CGG	2	6	819238	819243	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051934
19122	NC_013158	CGA	3	9	819265	819273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051934
19123	NC_013158	CG	3	6	819296	819301	0 %	0 %	50 %	50 %	257051934
19124	NC_013158	ACG	2	6	819333	819338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051934
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19126	NC_013158	TCG	2	6	819387	819392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051934
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19142	NC_013158	CTG	2	6	819925	819930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051935
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19149	NC_013158	CGC	2	6	820254	820259	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051935
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19151	NC_013158	CGT	2	6	820308	820313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051935
19152	NC_013158	TCG	2	6	820337	820342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051935
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19182	NC_013158	CCGC	2	8	821509	821516	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
19183	NC_013158	CGC	2	6	821540	821545	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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19185	NC_013158	CCGA	2	8	821688	821695	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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19232	NC_013158	CGA	2	6	823395	823400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051939
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19239	NC_013158	GAG	2	6	823801	823806	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257051939
19240	NC_013158	ATC	2	6	823813	823818	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257051939
19241	NC_013158	CGA	2	6	823850	823855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051939
19242	NC_013158	GGA	2	6	823860	823865	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257051939
19243	NC_013158	TCG	2	6	823925	823930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051939
19244	NC_013158	CCGA	2	8	823966	823973	25 %	0 %	25 %	50 %	257051939
19245	NC_013158	CGA	2	6	824030	824035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051939
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19248	NC_013158	AC	3	6	824175	824180	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
19249	NC_013158	G	6	6	824252	824257	0 %	0 %	100 %	0 %	257051940
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19263	NC_013158	TCGA	2	8	824940	824947	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
19264	NC_013158	CGA	2	6	824983	824988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051941
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19305	NC_013158	GCT	2	6	826567	826572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051943
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19347	NC_013158	CGCAG	2	10	828454	828463	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
19348	NC_013158	AG	3	6	828512	828517	50 %	0 %	50 %	0 %	257051945
19349	NC_013158	CGG	2	6	828535	828540	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051945
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19351	NC_013158	GGATCG	2	12	828549	828560	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	257051945
19352	NC_013158	GACTT	2	10	828582	828591	20 %	40 %	20 %	20 %	257051945
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19355	NC_013158	GAAG	2	8	828679	828686	50 %	0 %	50 %	0 %	257051945
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19357	NC_013158	TCG	2	6	828789	828794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051945
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19475	NC_013158	GAC	3	9	833958	833966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051950
19476	NC_013158	CGC	2	6	834050	834055	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051950
19477	NC_013158	AC	3	6	834124	834129	50 %	0 %	0 %	50 %	257051950
19478	NC_013158	GCGACG	2	12	834130	834141	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	257051950
19479	NC_013158	GCA	2	6	834166	834171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051950
19480	NC_013158	CTC	2	6	834177	834182	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257051950
19481	NC_013158	TCG	2	6	834200	834205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051950
19482	NC_013158	AC	3	6	834274	834279	50 %	0 %	0 %	50 %	257051950
19483	NC_013158	GCGG	2	8	834309	834316	0 %	0 %	75 %	25 %	257051950
19484	NC_013158	CGT	2	6	834347	834352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051950
19485	NC_013158	CGA	2	6	834365	834370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051950
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19488	NC_013158	AGC	2	6	834424	834429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051950
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19490	NC_013158	TCG	2	6	834472	834477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051950
19491	NC_013158	GTC	2	6	834519	834524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051950
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