MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halorhabdus utahensis DSM 12940 chromosome

Total Repeats: 74047

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16501	NC_013158	CGA	2	6	711073	711078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051805
16502	NC_013158	G	6	6	711181	711186	0 %	0 %	100 %	0 %	257051805
16503	NC_013158	GAT	2	6	711191	711196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257051805
16504	NC_013158	CGA	2	6	711199	711204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051805
16505	NC_013158	ACG	2	6	711213	711218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051805
16506	NC_013158	GAC	2	6	711230	711235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051805
16507	NC_013158	TC	3	6	711318	711323	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16508	NC_013158	CGG	2	6	711420	711425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051806
16509	NC_013158	ACG	2	6	711438	711443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051806
16510	NC_013158	AGC	2	6	711519	711524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051806
16511	NC_013158	TCC	2	6	711529	711534	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257051806
16512	NC_013158	CCG	2	6	711535	711540	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051806
16513	NC_013158	AAC	2	6	711560	711565	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257051806
16514	NC_013158	GTC	2	6	711567	711572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051806
16515	NC_013158	GAA	2	6	711575	711580	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257051806
16516	NC_013158	CGG	2	6	711653	711658	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051806
16517	NC_013158	GCG	4	12	711700	711711	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051806
16518	NC_013158	GAA	2	6	711747	711752	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257051806
16519	NC_013158	AACCGA	2	12	711860	711871	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
16520	NC_013158	TCGACG	2	12	711892	711903	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	257051807
16521	NC_013158	CTT	2	6	711926	711931	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257051807
16522	NC_013158	CGT	2	6	711948	711953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051807
16523	NC_013158	CGA	2	6	712028	712033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051807
16524	NC_013158	TCG	2	6	712048	712053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051807
16525	NC_013158	GCC	2	6	712069	712074	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051807
16526	NC_013158	ATC	2	6	712081	712086	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257051807
16527	NC_013158	CTT	2	6	712131	712136	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257051807
16528	NC_013158	GTC	2	6	712138	712143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051807
16529	NC_013158	GTC	2	6	712173	712178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051807
16530	NC_013158	CGT	2	6	712179	712184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051807
16531	NC_013158	GAG	2	6	712213	712218	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257051807
16532	NC_013158	GTT	2	6	712326	712331	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257051807
16533	NC_013158	CGT	2	6	712340	712345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051807
16534	NC_013158	GTC	2	6	712363	712368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051807
16535	NC_013158	GTG	2	6	712411	712416	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257051807
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16538	NC_013158	TGTC	2	8	712476	712483	0 %	50 %	25 %	25 %	257051807
16539	NC_013158	GT	3	6	712513	712518	0 %	50 %	50 %	0 %	257051808
16540	NC_013158	ACG	2	6	712556	712561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051808
16541	NC_013158	GTC	2	6	712592	712597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051808
16542	NC_013158	TCG	2	6	712608	712613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051808
16543	NC_013158	GTC	3	9	712637	712645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051808
16544	NC_013158	GTG	2	6	712652	712657	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257051808
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16546	NC_013158	GTC	2	6	712712	712717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051808
16547	NC_013158	TCG	2	6	712722	712727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051808
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16549	NC_013158	GATC	2	8	712840	712847	25 %	25 %	25 %	25 %	257051809
16550	NC_013158	CG	3	6	712871	712876	0 %	0 %	50 %	50 %	257051809
16551	NC_013158	CGT	2	6	712879	712884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051809
16552	NC_013158	CGC	2	6	712895	712900	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051809
16553	NC_013158	CGA	2	6	712924	712929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051809
16554	NC_013158	CGAGC	2	10	712963	712972	20 %	0 %	40 %	40 %	257051809
16555	NC_013158	CGA	3	9	713002	713010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051809
16556	NC_013158	CGT	2	6	713047	713052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051809
16557	NC_013158	GC	3	6	713086	713091	0 %	0 %	50 %	50 %	257051809
16558	NC_013158	GCG	2	6	713151	713156	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051809
16559	NC_013158	CCG	2	6	713178	713183	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051809
16560	NC_013158	GTC	2	6	713187	713192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051809
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16566	NC_013158	GCA	2	6	713511	713516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051809
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16571	NC_013158	CGAG	2	8	713572	713579	25 %	0 %	50 %	25 %	257051809
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16575	NC_013158	GCG	2	6	713691	713696	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051809
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16578	NC_013158	GGC	2	6	713837	713842	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051809
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16587	NC_013158	CGT	2	6	714100	714105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051810
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16592	NC_013158	GTC	2	6	714254	714259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051810
16593	NC_013158	CGG	2	6	714324	714329	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051810
16594	NC_013158	CGAC	2	8	714392	714399	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
16595	NC_013158	CGAC	2	8	714401	714408	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
16596	NC_013158	GGTCG	2	10	714410	714419	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
16597	NC_013158	CCGG	2	8	714426	714433	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16598	NC_013158	CG	3	6	714490	714495	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16599	NC_013158	GT	3	6	714515	714520	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
16600	NC_013158	TGA	2	6	714649	714654	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257051811
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16602	NC_013158	GGT	2	6	714746	714751	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257051811
16603	NC_013158	CAA	2	6	714777	714782	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257051811
16604	NC_013158	GC	3	6	714797	714802	0 %	0 %	50 %	50 %	257051811
16605	NC_013158	CG	4	8	714829	714836	0 %	0 %	50 %	50 %	257051811
16606	NC_013158	TGG	2	6	714841	714846	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257051811
16607	NC_013158	CGACGC	2	12	714854	714865	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	257051811
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16609	NC_013158	GGC	2	6	715041	715046	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051811
16610	NC_013158	GGC	2	6	715051	715056	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051811
16611	NC_013158	CTG	3	9	715077	715085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051811
16612	NC_013158	CGC	2	6	715087	715092	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051811
16613	NC_013158	GACGCT	2	12	715115	715126	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	257051811
16614	NC_013158	ATC	2	6	715131	715136	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257051811
16615	NC_013158	GCGG	2	8	715164	715171	0 %	0 %	75 %	25 %	257051811
16616	NC_013158	CGAA	2	8	715222	715229	50 %	0 %	25 %	25 %	257051811
16617	NC_013158	ACGCGA	2	12	715303	715314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051811
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16852	NC_013158	ACG	2	6	725730	725735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051824
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16983	NC_013158	GC	3	6	730932	730937	0 %	0 %	50 %	50 %	257051831
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