MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halorhabdus utahensis DSM 12940 chromosome

Total Repeats: 74047

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13501	NC_013158	GCT	2	6	587329	587334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051675
13502	NC_013158	TC	3	6	587338	587343	0 %	50 %	0 %	50 %	257051675
13503	NC_013158	GC	3	6	587407	587412	0 %	0 %	50 %	50 %	257051675
13504	NC_013158	CCAG	2	8	587415	587422	25 %	0 %	25 %	50 %	257051675
13505	NC_013158	GGTG	2	8	587476	587483	0 %	25 %	75 %	0 %	257051675
13506	NC_013158	TCG	2	6	587517	587522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051675
13507	NC_013158	TC	3	6	587536	587541	0 %	50 %	0 %	50 %	257051675
13508	NC_013158	CGC	2	6	587548	587553	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051675
13509	NC_013158	CCGT	2	8	587554	587561	0 %	25 %	25 %	50 %	257051675
13510	NC_013158	CGA	2	6	587569	587574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051675
13511	NC_013158	GTC	2	6	587580	587585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051675
13512	NC_013158	CGT	2	6	587633	587638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051675
13513	NC_013158	CGA	2	6	587641	587646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051675
13514	NC_013158	TCG	2	6	587652	587657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051675
13515	NC_013158	ACGG	2	8	587681	587688	25 %	0 %	50 %	25 %	257051675
13516	NC_013158	TCG	2	6	587740	587745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051675
13517	NC_013158	AGG	2	6	587819	587824	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13518	NC_013158	GGC	2	6	587845	587850	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13519	NC_013158	GTG	2	6	587865	587870	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13520	NC_013158	GCCT	2	8	587899	587906	0 %	25 %	25 %	50 %	257051676
13521	NC_013158	ACG	2	6	587926	587931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051676
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13533	NC_013158	TCG	2	6	588239	588244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051676
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13539	NC_013158	CG	3	6	588373	588378	0 %	0 %	50 %	50 %	257051676
13540	NC_013158	GAG	2	6	588413	588418	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257051676
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13553	NC_013158	CGT	2	6	588951	588956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051676
13554	NC_013158	CGT	2	6	588996	589001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051676
13555	NC_013158	CGT	2	6	589018	589023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051676
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13557	NC_013158	CGT	2	6	589092	589097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051676
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13559	NC_013158	GGCC	2	8	589215	589222	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13560	NC_013158	GAG	3	9	589282	589290	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13561	NC_013158	CGA	2	6	589345	589350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051677
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13563	NC_013158	GAC	2	6	589387	589392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051677
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13571	NC_013158	GCG	2	6	589772	589777	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051677
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13579	NC_013158	AT	3	6	590137	590142	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13590	NC_013158	TCG	2	6	590750	590755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051679
13591	NC_013158	AGCC	2	8	590773	590780	25 %	0 %	25 %	50 %	257051679
13592	NC_013158	TGA	2	6	590827	590832	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257051679
13593	NC_013158	GAA	2	6	590860	590865	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257051679
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13596	NC_013158	CCAG	2	8	590911	590918	25 %	0 %	25 %	50 %	257051679
13597	NC_013158	C	6	6	590965	590970	0 %	0 %	0 %	100 %	257051679
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13602	NC_013158	TCACC	2	10	591188	591197	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
13603	NC_013158	TGG	2	6	591253	591258	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13604	NC_013158	CGAA	2	8	591309	591316	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
13605	NC_013158	TCGG	2	8	591334	591341	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
13606	NC_013158	CGGG	2	8	591389	591396	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
13607	NC_013158	GAACT	2	10	591480	591489	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
13608	NC_013158	GCT	2	6	591516	591521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13609	NC_013158	CGT	2	6	591681	591686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13610	NC_013158	GTC	2	6	591687	591692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13611	NC_013158	GAC	2	6	591695	591700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13612	NC_013158	CTT	2	6	591712	591717	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13613	NC_013158	CGG	2	6	591728	591733	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13614	NC_013158	CAC	2	6	591796	591801	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13615	NC_013158	GTC	2	6	591852	591857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051680
13616	NC_013158	GTC	2	6	591859	591864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051680
13617	NC_013158	CTG	2	6	591882	591887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051680
13618	NC_013158	GAC	2	6	591978	591983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051680
13619	NC_013158	TGTC	2	8	592004	592011	0 %	50 %	25 %	25 %	257051680
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13621	NC_013158	TCG	2	6	592045	592050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051680
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13744	NC_013158	CGT	2	6	597912	597917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051686
13745	NC_013158	CGA	2	6	597930	597935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051686
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13862	NC_013158	GTC	2	6	602716	602721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051689
13863	NC_013158	TG	3	6	602729	602734	0 %	50 %	50 %	0 %	257051689
13864	NC_013158	ACC	2	6	602741	602746	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257051689
13865	NC_013158	CCAC	2	8	602789	602796	25 %	0 %	0 %	75 %	257051689
13866	NC_013158	GC	3	6	602891	602896	0 %	0 %	50 %	50 %	257051689
13867	NC_013158	GCCGG	2	10	602917	602926	0 %	0 %	60 %	40 %	257051689
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13872	NC_013158	CGA	2	6	603303	603308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051689
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13874	NC_013158	ACG	2	6	603416	603421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051689
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13890	NC_013158	TCGA	2	8	603748	603755	25 %	25 %	25 %	25 %	257051689
13891	NC_013158	ACG	2	6	603776	603781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051689
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13894	NC_013158	CTG	2	6	603835	603840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051689
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13896	NC_013158	TCG	2	6	603875	603880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051689
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13900	NC_013158	ACG	2	6	604094	604099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051689
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13927	NC_013158	CGG	2	6	605280	605285	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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13961	NC_013158	CGGTC	2	10	606411	606420	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
13962	NC_013158	CCGA	2	8	606473	606480	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
13963	NC_013158	GAC	2	6	606498	606503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051692
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13966	NC_013158	GAAG	2	8	606617	606624	50 %	0 %	50 %	0 %	257051692
13967	NC_013158	GAG	2	6	606630	606635	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257051692
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13971	NC_013158	CGT	2	6	606764	606769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051692
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13974	NC_013158	CGA	2	6	606884	606889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051692
13975	NC_013158	CAC	2	6	607041	607046	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13976	NC_013158	T	6	6	607051	607056	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13977	NC_013158	ATCG	2	8	607150	607157	25 %	25 %	25 %	25 %	257051693
13978	NC_013158	GGC	2	6	607159	607164	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051693
13979	NC_013158	CGA	2	6	607168	607173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051693
13980	NC_013158	CGA	2	6	607273	607278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051693
13981	NC_013158	GAG	2	6	607283	607288	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257051693
13982	NC_013158	CGA	2	6	607291	607296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051693
13983	NC_013158	AGG	3	9	607305	607313	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257051693
13984	NC_013158	GCTC	2	8	607329	607336	0 %	25 %	25 %	50 %	257051693
13985	NC_013158	TGG	2	6	607610	607615	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13986	NC_013158	TCG	2	6	607681	607686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051694
13987	NC_013158	CGG	2	6	607736	607741	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051694
13988	NC_013158	CTC	2	6	607746	607751	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257051694
13989	NC_013158	CGT	2	6	607763	607768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051694
13990	NC_013158	GTC	2	6	607839	607844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051694
13991	NC_013158	GTG	2	6	607884	607889	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257051694
13992	NC_013158	ATC	2	6	608056	608061	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257051694
13993	NC_013158	TCGAA	2	10	608120	608129	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
13994	NC_013158	TTCAT	2	10	608196	608205	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
13995	NC_013158	ACG	2	6	608216	608221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13996	NC_013158	TGT	2	6	608241	608246	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13997	NC_013158	GTA	2	6	608296	608301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257051695
13998	NC_013158	CGG	2	6	608306	608311	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051695
13999	NC_013158	CAC	2	6	608383	608388	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257051695
14000	NC_013158	GCCGTC	2	12	608389	608400	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	257051695

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