MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halorhabdus utahensis DSM 12940 chromosome

Total Repeats: 74047

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_013158	CGC	3	9	503717	503725	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051585
11502	NC_013158	CG	3	6	503731	503736	0 %	0 %	50 %	50 %	257051585
11503	NC_013158	TCC	2	6	503748	503753	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257051585
11504	NC_013158	TCC	2	6	503868	503873	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257051585
11505	NC_013158	TCG	2	6	503896	503901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051585
11506	NC_013158	AGT	2	6	503926	503931	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257051585
11507	NC_013158	GTC	2	6	503967	503972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051585
11508	NC_013158	TCG	2	6	503976	503981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051585
11509	NC_013158	CGC	2	6	504017	504022	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051585
11510	NC_013158	CCCG	2	8	504041	504048	0 %	0 %	25 %	75 %	257051585
11511	NC_013158	TCG	2	6	504105	504110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051585
11512	NC_013158	C	6	6	504127	504132	0 %	0 %	0 %	100 %	257051585
11513	NC_013158	GA	3	6	504133	504138	50 %	0 %	50 %	0 %	257051585
11514	NC_013158	GCGG	2	8	504173	504180	0 %	0 %	75 %	25 %	257051585
11515	NC_013158	CTG	2	6	504239	504244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051585
11516	NC_013158	GTC	3	9	504321	504329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051585
11517	NC_013158	CCCCG	2	10	504332	504341	0 %	0 %	20 %	80 %	257051585
11518	NC_013158	GAA	2	6	504359	504364	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257051585
11519	NC_013158	T	6	6	504460	504465	0 %	100 %	0 %	0 %	257051585
11520	NC_013158	TCG	2	6	504477	504482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051585
11521	NC_013158	TA	3	6	504533	504538	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11522	NC_013158	TGAA	2	8	504546	504553	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11523	NC_013158	CGTCA	2	10	504568	504577	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
11524	NC_013158	AAG	2	6	504608	504613	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11525	NC_013158	CAGA	2	8	504674	504681	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
11526	NC_013158	CCA	2	6	504696	504701	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257051586
11527	NC_013158	GGA	2	6	504713	504718	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257051586
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11529	NC_013158	TC	3	6	504881	504886	0 %	50 %	0 %	50 %	257051586
11530	NC_013158	GCC	2	6	504930	504935	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051586
11531	NC_013158	ATA	2	6	504957	504962	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257051586
11532	NC_013158	GGA	2	6	504995	505000	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257051586
11533	NC_013158	TGCG	2	8	505030	505037	0 %	25 %	50 %	25 %	257051586
11534	NC_013158	CGA	2	6	505042	505047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051586
11535	NC_013158	CGA	2	6	505049	505054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051586
11536	NC_013158	CCA	2	6	505064	505069	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257051586
11537	NC_013158	TTC	2	6	505089	505094	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257051586
11538	NC_013158	ATC	2	6	505113	505118	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257051586
11539	NC_013158	GAG	2	6	505131	505136	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257051586
11540	NC_013158	CA	3	6	505182	505187	50 %	0 %	0 %	50 %	257051586
11541	NC_013158	GC	3	6	505272	505277	0 %	0 %	50 %	50 %	257051586
11542	NC_013158	GGC	2	6	505311	505316	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11543	NC_013158	CGA	2	6	505353	505358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051587
11544	NC_013158	CAG	2	6	505420	505425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051587
11545	NC_013158	TC	3	6	505428	505433	0 %	50 %	0 %	50 %	257051587
11546	NC_013158	TCG	2	6	505556	505561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051587
11547	NC_013158	CGAC	2	8	505572	505579	25 %	0 %	25 %	50 %	257051587
11548	NC_013158	CGT	2	6	505597	505602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051587
11549	NC_013158	GCC	2	6	505609	505614	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051587
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11551	NC_013158	GAACA	2	10	505705	505714	60 %	0 %	20 %	20 %	257051587
11552	NC_013158	ACG	3	9	505733	505741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051587
11553	NC_013158	CGA	2	6	505760	505765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051587
11554	NC_013158	CCG	2	6	505769	505774	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051587
11555	NC_013158	GGC	2	6	505824	505829	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051587
11556	NC_013158	TCA	2	6	505841	505846	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257051587
11557	NC_013158	CGA	3	9	505860	505868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051587
11558	NC_013158	AGGTG	2	10	505887	505896	20 %	20 %	60 %	0 %	257051587
11559	NC_013158	GAG	2	6	505918	505923	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257051587
11560	NC_013158	CGA	2	6	505959	505964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051587
11561	NC_013158	TCG	2	6	505970	505975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051587
11562	NC_013158	CGC	2	6	505989	505994	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051587
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11567	NC_013158	CAT	2	6	506379	506384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257051587
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11569	NC_013158	CGG	2	6	506418	506423	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051587
11570	NC_013158	CTG	2	6	506440	506445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051587
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11572	NC_013158	ACG	2	6	506510	506515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11574	NC_013158	GTC	3	9	506607	506615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051588
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11580	NC_013158	GAC	2	6	506924	506929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051588
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11586	NC_013158	CCATCG	2	12	507154	507165	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	257051588
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11591	NC_013158	CGA	2	6	507220	507225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051588
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11593	NC_013158	CGG	2	6	507405	507410	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051588
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11596	NC_013158	ACG	2	6	507518	507523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11601	NC_013158	AGGT	2	8	507747	507754	25 %	25 %	50 %	0 %	257051589
11602	NC_013158	GTC	2	6	507755	507760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051589
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11604	NC_013158	GTC	2	6	507824	507829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051589
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11606	NC_013158	GTA	2	6	507860	507865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257051589
11607	NC_013158	GCC	2	6	507869	507874	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051589
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11611	NC_013158	GCG	2	6	508188	508193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051589
11612	NC_013158	ACTC	2	8	508267	508274	25 %	25 %	0 %	50 %	257051589
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11918	NC_013158	TC	3	6	522356	522361	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11919	NC_013158	CGA	2	6	522420	522425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051602
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11927	NC_013158	GTCG	2	8	522690	522697	0 %	25 %	50 %	25 %	257051602
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11953	NC_013158	GCG	2	6	523289	523294	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051602
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11958	NC_013158	TCG	2	6	523463	523468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051603
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11961	NC_013158	GTG	2	6	523576	523581	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257051603
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11963	NC_013158	GGCT	2	8	523639	523646	0 %	25 %	50 %	25 %	257051603
11964	NC_013158	GCG	2	6	523655	523660	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051603
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11968	NC_013158	CGA	2	6	523830	523835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051603
11969	NC_013158	TCCG	2	8	523854	523861	0 %	25 %	25 %	50 %	257051603
11970	NC_013158	CGA	3	9	523863	523871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051603
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11973	NC_013158	GCT	2	6	523998	524003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11974	NC_013158	GGT	2	6	524019	524024	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11975	NC_013158	CGA	2	6	524030	524035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11976	NC_013158	GAT	2	6	524093	524098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11977	NC_013158	CAG	2	6	524288	524293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051604
11978	NC_013158	ACCA	2	8	524370	524377	50 %	0 %	0 %	50 %	257051604
11979	NC_013158	TCC	2	6	524388	524393	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257051604
11980	NC_013158	CCG	2	6	524578	524583	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051604
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11982	NC_013158	TGCA	2	8	524709	524716	25 %	25 %	25 %	25 %	257051604
11983	NC_013158	C	6	6	524718	524723	0 %	0 %	0 %	100 %	257051604
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11994	NC_013158	TCCTG	2	10	525258	525267	0 %	40 %	20 %	40 %	257051604
11995	NC_013158	CCGTC	2	10	525269	525278	0 %	20 %	20 %	60 %	257051604
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12000	NC_013158	CTC	2	6	525387	525392	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257051604

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