MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halorhabdus utahensis DSM 12940 chromosome

Total Repeats: 74047

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_013158	GTT	2	6	483860	483865	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257051572
11002	NC_013158	CTG	2	6	483877	483882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051572
11003	NC_013158	CGA	2	6	483960	483965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051572
11004	NC_013158	CGGC	2	8	484046	484053	0 %	0 %	50 %	50 %	257051572
11005	NC_013158	CGT	2	6	484065	484070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051572
11006	NC_013158	TCG	2	6	484113	484118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051572
11007	NC_013158	ATA	2	6	484153	484158	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257051572
11008	NC_013158	GAAT	2	8	484186	484193	50 %	25 %	25 %	0 %	257051572
11009	NC_013158	CGAG	2	8	484251	484258	25 %	0 %	50 %	25 %	257051572
11010	NC_013158	CGA	2	6	484290	484295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051572
11011	NC_013158	CGT	3	9	484362	484370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051572
11012	NC_013158	T	6	6	484370	484375	0 %	100 %	0 %	0 %	257051572
11013	NC_013158	CGT	2	6	484441	484446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051572
11014	NC_013158	CGG	2	6	484474	484479	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051572
11015	NC_013158	CGT	2	6	484480	484485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051572
11016	NC_013158	CGG	2	6	484504	484509	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051572
11017	NC_013158	CGG	2	6	484626	484631	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051572
11018	NC_013158	CGT	3	9	484656	484664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051572
11019	NC_013158	TCT	2	6	484665	484670	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257051572
11020	NC_013158	TTC	2	6	484678	484683	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257051572
11021	NC_013158	GTCA	2	8	484696	484703	25 %	25 %	25 %	25 %	257051572
11022	NC_013158	CGA	2	6	484776	484781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051572
11023	NC_013158	GAC	2	6	484825	484830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051572
11024	NC_013158	CGC	2	6	484848	484853	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051572
11025	NC_013158	CGA	2	6	484874	484879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051572
11026	NC_013158	TC	4	8	484888	484895	0 %	50 %	0 %	50 %	257051572
11027	NC_013158	GT	3	6	484896	484901	0 %	50 %	50 %	0 %	257051572
11028	NC_013158	TGT	2	6	484934	484939	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257051572
11029	NC_013158	ACTT	2	8	484956	484963	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11030	NC_013158	AG	3	6	484971	484976	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11031	NC_013158	TGG	2	6	484998	485003	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11032	NC_013158	ATC	2	6	485063	485068	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11033	NC_013158	TCG	2	6	485144	485149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11034	NC_013158	GAC	2	6	485213	485218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11035	NC_013158	GCG	2	6	485223	485228	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11036	NC_013158	GGAC	2	8	485241	485248	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
11037	NC_013158	AAG	2	6	485295	485300	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11038	NC_013158	ACG	2	6	485351	485356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051573
11039	NC_013158	CCG	2	6	485412	485417	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051573
11040	NC_013158	CCT	2	6	485475	485480	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257051573
11041	NC_013158	GAA	2	6	485492	485497	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257051573
11042	NC_013158	CCG	2	6	485571	485576	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051573
11043	NC_013158	CG	3	6	485575	485580	0 %	0 %	50 %	50 %	257051573
11044	NC_013158	GCG	2	6	485755	485760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051573
11045	NC_013158	AC	4	8	485769	485776	50 %	0 %	0 %	50 %	257051573
11046	NC_013158	CGT	2	6	485781	485786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051573
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11048	NC_013158	CGGT	2	8	485966	485973	0 %	25 %	50 %	25 %	257051573
11049	NC_013158	TAC	2	6	486091	486096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257051573
11050	NC_013158	ACG	2	6	486154	486159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051573
11051	NC_013158	CCG	2	6	486193	486198	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051573
11052	NC_013158	AGC	2	6	486269	486274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051573
11053	NC_013158	GC	3	6	486273	486278	0 %	0 %	50 %	50 %	257051573
11054	NC_013158	GAG	2	6	486327	486332	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257051573
11055	NC_013158	CGG	2	6	486345	486350	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051573
11056	NC_013158	GATCG	2	10	486409	486418	20 %	20 %	40 %	20 %	257051573
11057	NC_013158	ACG	2	6	486451	486456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051573
11058	NC_013158	GATC	2	8	486474	486481	25 %	25 %	25 %	25 %	257051573
11059	NC_013158	ACCC	2	8	486535	486542	25 %	0 %	0 %	75 %	257051573
11060	NC_013158	CGA	2	6	486549	486554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051573
11061	NC_013158	GA	4	8	486553	486560	50 %	0 %	50 %	0 %	257051573
11062	NC_013158	GTC	2	6	486571	486576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051573
11063	NC_013158	TGCA	2	8	486701	486708	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11064	NC_013158	CATC	2	8	486723	486730	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
11065	NC_013158	GCCA	2	8	486756	486763	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
11066	NC_013158	GTC	2	6	486769	486774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11067	NC_013158	CCGC	2	8	486787	486794	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
11068	NC_013158	TGAC	2	8	486880	486887	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11069	NC_013158	GAC	2	6	486896	486901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11070	NC_013158	TGC	2	6	486948	486953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11071	NC_013158	GGT	2	6	486986	486991	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11072	NC_013158	TGAC	2	8	486996	487003	25 %	25 %	25 %	25 %	257051574
11073	NC_013158	TCG	2	6	487089	487094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051574
11074	NC_013158	GACG	2	8	487099	487106	25 %	0 %	50 %	25 %	257051574
11075	NC_013158	CGA	3	9	487108	487116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051574
11076	NC_013158	CGA	2	6	487135	487140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051574
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11078	NC_013158	CTG	2	6	487172	487177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051574
11079	NC_013158	CGT	2	6	487189	487194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051574
11080	NC_013158	TCG	2	6	487266	487271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051574
11081	NC_013158	CGA	2	6	487285	487290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051574
11082	NC_013158	GGTC	2	8	487348	487355	0 %	25 %	50 %	25 %	257051574
11083	NC_013158	CGG	2	6	487374	487379	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051574
11084	NC_013158	TCGA	2	8	487421	487428	25 %	25 %	25 %	25 %	257051574
11085	NC_013158	ATCG	2	8	487430	487437	25 %	25 %	25 %	25 %	257051574
11086	NC_013158	CGT	2	6	487474	487479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051574
11087	NC_013158	ACG	2	6	487497	487502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051574
11088	NC_013158	TGT	2	6	487512	487517	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257051574
11089	NC_013158	GAC	2	6	487562	487567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051574
11090	NC_013158	AGTTCG	2	12	487584	487595	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	257051574
11091	NC_013158	CA	3	6	487633	487638	50 %	0 %	0 %	50 %	257051574
11092	NC_013158	TCA	2	6	487695	487700	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257051574
11093	NC_013158	TCG	2	6	487720	487725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051574
11094	NC_013158	TCG	2	6	487740	487745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051574
11095	NC_013158	CGT	2	6	487780	487785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051574
11096	NC_013158	ACCGA	2	10	487862	487871	40 %	0 %	20 %	40 %	257051574
11097	NC_013158	CGG	2	6	487881	487886	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051574
11098	NC_013158	ATC	2	6	487907	487912	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257051574
11099	NC_013158	GCGG	2	8	488046	488053	0 %	0 %	75 %	25 %	257051575
11100	NC_013158	CGGG	2	8	488060	488067	0 %	0 %	75 %	25 %	257051575
11101	NC_013158	CGC	2	6	488115	488120	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051575
11102	NC_013158	CGGT	2	8	488147	488154	0 %	25 %	50 %	25 %	257051575
11103	NC_013158	TCCG	2	8	488166	488173	0 %	25 %	25 %	50 %	257051575
11104	NC_013158	TCG	2	6	488174	488179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051575
11105	NC_013158	CGG	2	6	488190	488195	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051575
11106	NC_013158	TCG	2	6	488234	488239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051575
11107	NC_013158	GTC	2	6	488245	488250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051575
11108	NC_013158	CGAC	2	8	488273	488280	25 %	0 %	25 %	50 %	257051575
11109	NC_013158	GCC	2	6	488302	488307	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051575
11110	NC_013158	CTG	2	6	488332	488337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051575
11111	NC_013158	GAC	3	9	488341	488349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051575
11112	NC_013158	TC	3	6	488358	488363	0 %	50 %	0 %	50 %	257051575
11113	NC_013158	CGT	2	6	488376	488381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051575
11114	NC_013158	TCG	2	6	488423	488428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051575
11115	NC_013158	GCC	2	6	488439	488444	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051575
11116	NC_013158	GAC	2	6	488448	488453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051575
11117	NC_013158	CTC	2	6	488476	488481	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257051575
11118	NC_013158	AC	3	6	488572	488577	50 %	0 %	0 %	50 %	257051575
11119	NC_013158	GTC	2	6	488584	488589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051575
11120	NC_013158	CGA	3	9	488598	488606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051575
11121	NC_013158	GCC	2	6	488620	488625	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051575
11122	NC_013158	ACG	2	6	488633	488638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051575
11123	NC_013158	TCG	2	6	488644	488649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051575
11124	NC_013158	ACG	3	9	488662	488670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051575
11125	NC_013158	CCAA	2	8	488738	488745	50 %	0 %	0 %	50 %	257051575
11126	NC_013158	GAG	2	6	488761	488766	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257051575
11127	NC_013158	GACATC	2	12	488770	488781	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	257051575
11128	NC_013158	GGGC	2	8	488847	488854	0 %	0 %	75 %	25 %	257051575
11129	NC_013158	ACG	2	6	488936	488941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051575
11130	NC_013158	GGC	2	6	488946	488951	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051575
11131	NC_013158	CGA	2	6	489003	489008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051575
11132	NC_013158	GC	3	6	489010	489015	0 %	0 %	50 %	50 %	257051575
11133	NC_013158	GGA	2	6	489180	489185	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257051575
11134	NC_013158	TCGG	2	8	489195	489202	0 %	25 %	50 %	25 %	257051575
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11136	NC_013158	CCGACA	2	12	489382	489393	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
11137	NC_013158	GCGA	2	8	489490	489497	25 %	0 %	50 %	25 %	257051576
11138	NC_013158	GAAG	2	8	489527	489534	50 %	0 %	50 %	0 %	257051576
11139	NC_013158	ACGA	2	8	489537	489544	50 %	0 %	25 %	25 %	257051576
11140	NC_013158	GATC	2	8	489563	489570	25 %	25 %	25 %	25 %	257051576
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11144	NC_013158	CGGAC	2	10	489665	489674	20 %	0 %	40 %	40 %	257051576
11145	NC_013158	CGT	3	9	489737	489745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051576
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11157	NC_013158	TAC	2	6	490164	490169	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257051576
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11231	NC_013158	CGA	2	6	492946	492951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051579
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11237	NC_013158	ACG	2	6	493050	493055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051579
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11355	NC_013158	GGA	2	6	497832	497837	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257051581
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11460	NC_013158	CCGGTC	2	12	502138	502149	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	257051583
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11469	NC_013158	GC	3	6	502389	502394	0 %	0 %	50 %	50 %	257051583
11470	NC_013158	CAC	2	6	502416	502421	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257051583
11471	NC_013158	GAGG	2	8	502425	502432	25 %	0 %	75 %	0 %	257051583
11472	NC_013158	TCG	2	6	502454	502459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051583
11473	NC_013158	GCG	2	6	502514	502519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051583
11474	NC_013158	CG	3	6	502590	502595	0 %	0 %	50 %	50 %	257051584
11475	NC_013158	GACCGC	2	12	502608	502619	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	257051584
11476	NC_013158	CCG	2	6	502681	502686	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051584
11477	NC_013158	TTG	2	6	502720	502725	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257051584
11478	NC_013158	CG	3	6	502738	502743	0 %	0 %	50 %	50 %	257051584
11479	NC_013158	GGC	2	6	502860	502865	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051584
11480	NC_013158	GAT	2	6	502866	502871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257051584
11481	NC_013158	TGA	2	6	502892	502897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257051584
11482	NC_013158	GAT	2	6	502953	502958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257051584
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11484	NC_013158	GAT	2	6	503019	503024	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257051584
11485	NC_013158	TCT	2	6	503108	503113	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257051584
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