MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halorhabdus utahensis DSM 12940 chromosome

Total Repeats: 74047

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
9501	NC_013158	CTC	2	6	418680	418685	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257051513
9502	NC_013158	CGA	2	6	418745	418750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051513
9503	NC_013158	CGA	2	6	418763	418768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051513
9504	NC_013158	CCG	2	6	418780	418785	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051513
9505	NC_013158	TGGCG	2	10	418913	418922	0 %	20 %	60 %	20 %	257051513
9506	NC_013158	TCG	2	6	418954	418959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051513
9507	NC_013158	CGA	2	6	418979	418984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051513
9508	NC_013158	CGT	2	6	419090	419095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051513
9509	NC_013158	GCA	2	6	419104	419109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051513
9510	NC_013158	GAG	2	6	419116	419121	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257051513
9511	NC_013158	CCT	2	6	419230	419235	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257051514
9512	NC_013158	CGA	2	6	419272	419277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051514
9513	NC_013158	CGA	2	6	419281	419286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051514
9514	NC_013158	GC	3	6	419298	419303	0 %	0 %	50 %	50 %	257051514
9515	NC_013158	CGA	2	6	419388	419393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051514
9516	NC_013158	CGG	2	6	419419	419424	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051514
9517	NC_013158	GTC	2	6	419432	419437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051514
9518	NC_013158	GCGGTG	2	12	419462	419473	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	257051514
9519	NC_013158	CGT	2	6	419486	419491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051514
9520	NC_013158	GTC	2	6	419492	419497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051514
9521	NC_013158	CCT	2	6	419581	419586	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257051514
9522	NC_013158	CGA	2	6	419680	419685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051514
9523	NC_013158	CGT	2	6	419725	419730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051514
9524	NC_013158	ACG	3	9	419796	419804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051514
9525	NC_013158	TCG	2	6	419814	419819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051514
9526	NC_013158	CGT	2	6	419827	419832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051514
9527	NC_013158	GTC	2	6	419865	419870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051514
9528	NC_013158	AG	3	6	420029	420034	50 %	0 %	50 %	0 %	257051514
9529	NC_013158	CGTC	2	8	420040	420047	0 %	25 %	25 %	50 %	257051514
9530	NC_013158	CGA	2	6	420091	420096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051514
9531	NC_013158	TCT	2	6	420175	420180	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257051514
9532	NC_013158	GTC	2	6	420203	420208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051514
9533	NC_013158	CCA	2	6	420217	420222	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257051514
9534	NC_013158	TCT	2	6	420283	420288	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257051514
9535	NC_013158	TTC	2	6	420297	420302	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257051514
9536	NC_013158	GTC	2	6	420338	420343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051514
9537	NC_013158	GCC	2	6	420413	420418	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051514
9538	NC_013158	GAT	2	6	420425	420430	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257051514
9539	NC_013158	GTC	2	6	420476	420481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051514
9540	NC_013158	GAT	2	6	420494	420499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257051514
9541	NC_013158	GGT	2	6	420566	420571	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257051514
9542	NC_013158	ATGTCG	2	12	420591	420602	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	257051514
9543	NC_013158	CGAGGT	2	12	420622	420633	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	257051514
9544	NC_013158	CGC	2	6	420640	420645	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051514
9545	NC_013158	GGC	2	6	420760	420765	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051514
9546	NC_013158	CGG	2	6	420775	420780	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051514
9547	NC_013158	CGC	2	6	420808	420813	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051514
9548	NC_013158	GGGC	2	8	420887	420894	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
9549	NC_013158	GAT	2	6	420947	420952	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257051515
9550	NC_013158	CG	3	6	421067	421072	0 %	0 %	50 %	50 %	257051515
9551	NC_013158	G	6	6	421106	421111	0 %	0 %	100 %	0 %	257051515
9552	NC_013158	TCG	2	6	421404	421409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051515
9553	NC_013158	ACG	2	6	421413	421418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051515
9554	NC_013158	CCAG	2	8	421447	421454	25 %	0 %	25 %	50 %	257051515
9555	NC_013158	GGT	2	6	421487	421492	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257051515
9556	NC_013158	AG	3	6	421571	421576	50 %	0 %	50 %	0 %	257051515
9557	NC_013158	TC	3	6	421579	421584	0 %	50 %	0 %	50 %	257051515
9558	NC_013158	GTC	2	6	421616	421621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051515
9559	NC_013158	TGA	2	6	421663	421668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257051515
9560	NC_013158	TCG	2	6	421707	421712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051515
9561	NC_013158	GAC	2	6	421730	421735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051515
9562	NC_013158	TGA	2	6	421740	421745	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257051515
9563	NC_013158	CGG	2	6	421796	421801	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9564	NC_013158	AATTT	2	10	421808	421817	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
9565	NC_013158	CAC	2	6	421836	421841	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9566	NC_013158	CCA	2	6	421868	421873	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9567	NC_013158	AAG	2	6	421877	421882	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9568	NC_013158	GCT	2	6	421934	421939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051516
9569	NC_013158	GAC	2	6	422033	422038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051516
9570	NC_013158	GAG	2	6	422076	422081	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257051516
9571	NC_013158	GGGAC	2	10	422126	422135	20 %	0 %	60 %	20 %	257051516
9572	NC_013158	CGCC	2	8	422141	422148	0 %	0 %	25 %	75 %	257051516
9573	NC_013158	GAA	2	6	422159	422164	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257051516
9574	NC_013158	AGA	2	6	422170	422175	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257051516
9575	NC_013158	GCA	2	6	422222	422227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051516
9576	NC_013158	AGA	2	6	422245	422250	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257051516
9577	NC_013158	CCT	2	6	422326	422331	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257051516
9578	NC_013158	CG	3	6	422332	422337	0 %	0 %	50 %	50 %	257051516
9579	NC_013158	CGAG	2	8	422393	422400	25 %	0 %	50 %	25 %	257051516
9580	NC_013158	CGAT	2	8	422467	422474	25 %	25 %	25 %	25 %	257051516
9581	NC_013158	GAA	2	6	422514	422519	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257051516
9582	NC_013158	CGA	2	6	422588	422593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051516
9583	NC_013158	GAA	2	6	422664	422669	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257051516
9584	NC_013158	GAG	2	6	422691	422696	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257051516
9585	NC_013158	CCG	2	6	422720	422725	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9586	NC_013158	G	6	6	422740	422745	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
9587	NC_013158	CAG	2	6	422785	422790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051517
9588	NC_013158	ACG	2	6	422843	422848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051517
9589	NC_013158	CTG	2	6	422856	422861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051517
9590	NC_013158	ATC	2	6	422867	422872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257051517
9591	NC_013158	GGAT	2	8	423010	423017	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
9592	NC_013158	TA	3	6	423034	423039	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9593	NC_013158	CGG	3	9	423155	423163	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9594	NC_013158	ACT	2	6	423182	423187	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257051518
9595	NC_013158	GAC	2	6	423218	423223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051518
9596	NC_013158	GGA	2	6	423284	423289	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257051518
9597	NC_013158	TCA	2	6	423304	423309	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257051518
9598	NC_013158	CGA	3	9	423320	423328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051518
9599	NC_013158	CGT	2	6	423344	423349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051518
9600	NC_013158	ACGA	2	8	423396	423403	50 %	0 %	25 %	25 %	257051518
9601	NC_013158	CGC	2	6	423455	423460	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051518
9602	NC_013158	GAAG	2	8	423461	423468	50 %	0 %	50 %	0 %	257051518
9603	NC_013158	CGAAG	2	10	423482	423491	40 %	0 %	40 %	20 %	257051518
9604	NC_013158	GGC	2	6	423497	423502	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051518
9605	NC_013158	TCC	2	6	423514	423519	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257051518
9606	NC_013158	GTCG	2	8	423719	423726	0 %	25 %	50 %	25 %	257051518
9607	NC_013158	CTCGT	2	10	423735	423744	0 %	40 %	20 %	40 %	257051518
9608	NC_013158	GAG	2	6	423786	423791	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257051518
9609	NC_013158	ACG	2	6	423835	423840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051518
9610	NC_013158	TCG	3	9	423922	423930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051518
9611	NC_013158	CGG	2	6	423935	423940	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051518
9612	NC_013158	GC	3	6	423976	423981	0 %	0 %	50 %	50 %	257051518
9613	NC_013158	TCGA	2	8	423984	423991	25 %	25 %	25 %	25 %	257051518
9614	NC_013158	GAT	2	6	424049	424054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257051518
9615	NC_013158	CCG	2	6	424160	424165	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051518
9616	NC_013158	AGC	2	6	424168	424173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051518
9617	NC_013158	GCG	2	6	424174	424179	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051518
9618	NC_013158	GC	3	6	424202	424207	0 %	0 %	50 %	50 %	257051518
9619	NC_013158	CCA	2	6	424433	424438	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257051518
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9621	NC_013158	CCA	2	6	424568	424573	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257051518
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9863	NC_013158	GCG	2	6	434397	434402	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051529
9864	NC_013158	GCCGT	2	10	434409	434418	0 %	20 %	40 %	40 %	257051529
9865	NC_013158	TCC	2	6	434427	434432	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257051529
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9882	NC_013158	TCG	3	9	435024	435032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051529
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9895	NC_013158	TGT	2	6	435434	435439	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9896	NC_013158	AGG	2	6	435502	435507	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9897	NC_013158	CGA	2	6	435525	435530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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9922	NC_013158	CGA	2	6	436528	436533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051530
9923	NC_013158	ATGGT	2	10	436558	436567	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
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9934	NC_013158	ACG	2	6	437109	437114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051531
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9958	NC_013158	CGA	2	6	438022	438027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051532
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9961	NC_013158	GTC	2	6	438287	438292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051533
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9964	NC_013158	GATC	2	8	438436	438443	25 %	25 %	25 %	25 %	257051533
9965	NC_013158	GTA	2	6	438461	438466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257051533
9966	NC_013158	CGTGA	2	10	438506	438515	20 %	20 %	40 %	20 %	257051533
9967	NC_013158	TGA	2	6	438544	438549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257051533
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9970	NC_013158	CGAT	2	8	438676	438683	25 %	25 %	25 %	25 %	257051533
9971	NC_013158	GTC	2	6	438726	438731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051533
9972	NC_013158	GGTC	2	8	438739	438746	0 %	25 %	50 %	25 %	257051533
9973	NC_013158	GGCGT	2	10	438762	438771	0 %	20 %	60 %	20 %	257051533
9974	NC_013158	AAC	2	6	438885	438890	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257051533
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9980	NC_013158	GCT	2	6	439135	439140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051533
9981	NC_013158	GTC	2	6	439151	439156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051533
9982	NC_013158	TTCGA	2	10	439189	439198	20 %	40 %	20 %	20 %	257051533
9983	NC_013158	CCCG	2	8	439240	439247	0 %	0 %	25 %	75 %	257051533
9984	NC_013158	CCCG	2	8	439268	439275	0 %	0 %	25 %	75 %	257051533
9985	NC_013158	CGGC	2	8	439288	439295	0 %	0 %	50 %	50 %	257051533
9986	NC_013158	TCG	2	6	439332	439337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051533
9987	NC_013158	TCG	2	6	439509	439514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051533
9988	NC_013158	TCG	2	6	439560	439565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051533
9989	NC_013158	TGAC	2	8	439567	439574	25 %	25 %	25 %	25 %	257051533
9990	NC_013158	GTT	2	6	439708	439713	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9991	NC_013158	TCC	2	6	439799	439804	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257051534
9992	NC_013158	CGT	2	6	439805	439810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051534
9993	NC_013158	GTC	2	6	439861	439866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051534
9994	NC_013158	TCA	2	6	439889	439894	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257051534
9995	NC_013158	GAC	2	6	439933	439938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051534
9996	NC_013158	GAC	2	6	439941	439946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051534
9997	NC_013158	GAC	2	6	440010	440015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051534
9998	NC_013158	ATCG	2	8	440056	440063	25 %	25 %	25 %	25 %	257051534
9999	NC_013158	GCG	2	6	440200	440205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051534
10000	NC_013158	CCG	2	6	440218	440223	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051534

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