MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halorhabdus utahensis DSM 12940 chromosome

Total Repeats: 74047

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
9001	NC_013158	CCT	2	6	397210	397215	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257051490
9002	NC_013158	GTC	2	6	397221	397226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051490
9003	NC_013158	TCG	2	6	397236	397241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051490
9004	NC_013158	CGT	2	6	397303	397308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051490
9005	NC_013158	GGATC	2	10	397309	397318	20 %	20 %	40 %	20 %	257051490
9006	NC_013158	C	6	6	397326	397331	0 %	0 %	0 %	100 %	257051490
9007	NC_013158	TCT	2	6	397374	397379	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9008	NC_013158	AAG	2	6	397387	397392	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9009	NC_013158	GTC	2	6	397515	397520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051491
9010	NC_013158	TCG	2	6	397573	397578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051491
9011	NC_013158	TC	3	6	397631	397636	0 %	50 %	0 %	50 %	257051491
9012	NC_013158	GTT	2	6	397689	397694	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257051491
9013	NC_013158	ACG	2	6	397726	397731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051491
9014	NC_013158	AGCG	2	8	397752	397759	25 %	0 %	50 %	25 %	257051491
9015	NC_013158	GA	3	6	397879	397884	50 %	0 %	50 %	0 %	257051491
9016	NC_013158	TCG	2	6	397900	397905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051491
9017	NC_013158	CG	3	6	397917	397922	0 %	0 %	50 %	50 %	257051491
9018	NC_013158	TCC	2	6	397933	397938	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257051491
9019	NC_013158	CAC	2	6	397964	397969	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257051491
9020	NC_013158	CGT	2	6	397970	397975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051491
9021	NC_013158	GTC	2	6	397983	397988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051491
9022	NC_013158	CCCTC	2	10	398037	398046	0 %	20 %	0 %	80 %	257051492
9023	NC_013158	ACG	2	6	398083	398088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051492
9024	NC_013158	GTCG	2	8	398095	398102	0 %	25 %	50 %	25 %	257051492
9025	NC_013158	CGC	2	6	398121	398126	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051492
9026	NC_013158	CGG	2	6	398146	398151	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051492
9027	NC_013158	CCA	2	6	398152	398157	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257051492
9028	NC_013158	ACG	2	6	398248	398253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051492
9029	NC_013158	CGCC	2	8	398273	398280	0 %	0 %	25 %	75 %	257051492
9030	NC_013158	AGT	2	6	398295	398300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257051492
9031	NC_013158	CGG	2	6	398311	398316	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051492
9032	NC_013158	GT	3	6	398448	398453	0 %	50 %	50 %	0 %	257051492
9033	NC_013158	AGTC	2	8	398494	398501	25 %	25 %	25 %	25 %	257051492
9034	NC_013158	GGA	2	6	398600	398605	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257051492
9035	NC_013158	TTG	2	6	398682	398687	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257051492
9036	NC_013158	TCG	2	6	398712	398717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051492
9037	NC_013158	CAG	2	6	398740	398745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051492
9038	NC_013158	CGG	2	6	399011	399016	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051492
9039	NC_013158	TCG	2	6	399066	399071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051492
9040	NC_013158	ACG	2	6	399072	399077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051492
9041	NC_013158	CTC	2	6	399083	399088	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257051492
9042	NC_013158	GCA	2	6	399216	399221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9043	NC_013158	TCG	2	6	399255	399260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051493
9044	NC_013158	GCC	2	6	399388	399393	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051493
9045	NC_013158	CGT	2	6	399394	399399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051493
9046	NC_013158	CGG	2	6	399411	399416	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051493
9047	NC_013158	GAT	2	6	399461	399466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257051493
9048	NC_013158	CGA	2	6	399481	399486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051493
9049	NC_013158	AGG	2	6	399522	399527	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257051493
9050	NC_013158	CGGG	2	8	399575	399582	0 %	0 %	75 %	25 %	257051493
9051	NC_013158	G	6	6	399580	399585	0 %	0 %	100 %	0 %	257051493
9052	NC_013158	GTC	2	6	399636	399641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051493
9053	NC_013158	CGC	2	6	399647	399652	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051493
9054	NC_013158	CGC	2	6	399673	399678	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051493
9055	NC_013158	GATC	2	8	399726	399733	25 %	25 %	25 %	25 %	257051493
9056	NC_013158	CGA	2	6	399822	399827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051493
9057	NC_013158	GTC	2	6	399912	399917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051494
9058	NC_013158	CGC	2	6	399921	399926	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051494
9059	NC_013158	GATC	2	8	399933	399940	25 %	25 %	25 %	25 %	257051494
9060	NC_013158	GCG	2	6	399944	399949	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051494
9061	NC_013158	GCCA	2	8	399961	399968	25 %	0 %	25 %	50 %	257051494
9062	NC_013158	GGC	2	6	399976	399981	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051494
9063	NC_013158	GCTGG	2	10	399990	399999	0 %	20 %	60 %	20 %	257051494
9064	NC_013158	GAT	2	6	400030	400035	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257051494
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9070	NC_013158	CGG	2	6	400235	400240	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051494
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9081	NC_013158	GTC	2	6	400688	400693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051494
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9088	NC_013158	GGTC	2	8	401081	401088	0 %	25 %	50 %	25 %	257051495
9089	NC_013158	CGA	2	6	401093	401098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051495
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9094	NC_013158	TCG	2	6	401357	401362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051496
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9102	NC_013158	ACGTC	2	10	401682	401691	20 %	20 %	20 %	40 %	257051496
9103	NC_013158	GCC	2	6	401756	401761	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051496
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9105	NC_013158	AGT	2	6	401868	401873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257051496
9106	NC_013158	GT	3	6	401955	401960	0 %	50 %	50 %	0 %	257051496
9107	NC_013158	CAT	2	6	401961	401966	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257051496
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9112	NC_013158	CGG	2	6	402128	402133	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051496
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9118	NC_013158	AGT	2	6	402356	402361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257051496
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9121	NC_013158	CCGC	2	8	402492	402499	0 %	0 %	25 %	75 %	257051496
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9484	NC_013158	GGC	2	6	417927	417932	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051511
9485	NC_013158	CGC	2	6	417948	417953	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051511
9486	NC_013158	CAG	2	6	418021	418026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051512
9487	NC_013158	GATC	2	8	418032	418039	25 %	25 %	25 %	25 %	257051512
9488	NC_013158	GAC	2	6	418090	418095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051512
9489	NC_013158	AGG	2	6	418160	418165	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257051512
9490	NC_013158	CGT	2	6	418233	418238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051512
9491	NC_013158	TCG	2	6	418274	418279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051512
9492	NC_013158	CGT	2	6	418340	418345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051513
9493	NC_013158	GAC	2	6	418347	418352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051513
9494	NC_013158	CGTTCT	2	12	418361	418372	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	257051513
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9499	NC_013158	CGCT	2	8	418666	418673	0 %	25 %	25 %	50 %	257051513
9500	NC_013158	GAT	2	6	418674	418679	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257051513

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