MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halorhabdus utahensis DSM 12940 chromosome

Total Repeats: 74047

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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8503	NC_013158	ACAG	2	8	374241	374248	50 %	0 %	25 %	25 %	257051469
8504	NC_013158	GT	3	6	374308	374313	0 %	50 %	50 %	0 %	257051469
8505	NC_013158	GA	3	6	374339	374344	50 %	0 %	50 %	0 %	257051469
8506	NC_013158	TC	3	6	374429	374434	0 %	50 %	0 %	50 %	257051469
8507	NC_013158	CGTA	2	8	374462	374469	25 %	25 %	25 %	25 %	257051469
8508	NC_013158	TGA	2	6	374559	374564	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8509	NC_013158	AGGCAA	2	12	374643	374654	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
8510	NC_013158	TCAC	2	8	374711	374718	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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8530	NC_013158	AAC	2	6	375732	375737	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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8603	NC_013158	CGGA	2	8	378858	378865	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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8625	NC_013158	AC	3	6	379913	379918	50 %	0 %	0 %	50 %	257051475
8626	NC_013158	CTC	2	6	379935	379940	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257051475
8627	NC_013158	CCG	2	6	379958	379963	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051475
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8630	NC_013158	AT	3	6	380247	380252	50 %	50 %	0 %	0 %	257051475
8631	NC_013158	CAG	2	6	380350	380355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051475
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8633	NC_013158	ACG	2	6	380444	380449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051475
8634	NC_013158	ACG	2	6	380495	380500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051475
8635	NC_013158	TGG	2	6	380510	380515	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257051475
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8637	NC_013158	GAG	2	6	380755	380760	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257051475
8638	NC_013158	GCC	2	6	380781	380786	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051475
8639	NC_013158	ACG	2	6	380807	380812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051475
8640	NC_013158	GC	3	6	380851	380856	0 %	0 %	50 %	50 %	257051475
8641	NC_013158	CCGA	2	8	380890	380897	25 %	0 %	25 %	50 %	257051476
8642	NC_013158	GCCG	2	8	380906	380913	0 %	0 %	50 %	50 %	257051476
8643	NC_013158	ATC	2	6	380934	380939	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257051476
8644	NC_013158	TTA	2	6	380951	380956	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257051476
8645	NC_013158	CGG	2	6	381088	381093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051476
8646	NC_013158	GGCC	2	8	381170	381177	0 %	0 %	50 %	50 %	257051476
8647	NC_013158	CCGG	2	8	381244	381251	0 %	0 %	50 %	50 %	257051476
8648	NC_013158	TCC	2	6	381286	381291	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257051476
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8650	NC_013158	CA	3	6	381333	381338	50 %	0 %	0 %	50 %	257051476
8651	NC_013158	CTG	2	6	381342	381347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051476
8652	NC_013158	CGC	2	6	381520	381525	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051476
8653	NC_013158	CTG	2	6	381585	381590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051476
8654	NC_013158	TCT	2	6	381598	381603	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257051476
8655	NC_013158	GGC	2	6	381636	381641	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051476
8656	NC_013158	TCGC	2	8	381687	381694	0 %	25 %	25 %	50 %	257051476
8657	NC_013158	GTC	2	6	381720	381725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051476
8658	NC_013158	TATCTC	2	12	381753	381764	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	257051476
8659	NC_013158	CGC	2	6	381890	381895	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051476
8660	NC_013158	GTC	2	6	381897	381902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051476
8661	NC_013158	TAC	2	6	381972	381977	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257051476
8662	NC_013158	CAG	2	6	381993	381998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051476
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8665	NC_013158	CG	3	6	382117	382122	0 %	0 %	50 %	50 %	257051476
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8673	NC_013158	CTG	2	6	382491	382496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051476
8674	NC_013158	GGC	3	9	382503	382511	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051476
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8678	NC_013158	GCT	2	6	382675	382680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051477
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8684	NC_013158	TGGG	2	8	383051	383058	0 %	25 %	75 %	0 %	257051477
8685	NC_013158	G	6	6	383088	383093	0 %	0 %	100 %	0 %	257051477
8686	NC_013158	CG	3	6	383115	383120	0 %	0 %	50 %	50 %	257051477
8687	NC_013158	CCCGG	2	10	383131	383140	0 %	0 %	40 %	60 %	257051477
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8693	NC_013158	AAC	2	6	383392	383397	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257051477
8694	NC_013158	CGACG	2	10	383403	383412	20 %	0 %	40 %	40 %	257051477
8695	NC_013158	GAC	2	6	383451	383456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051477
8696	NC_013158	GGA	2	6	383466	383471	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257051477
8697	NC_013158	CAA	2	6	383485	383490	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257051477
8698	NC_013158	GTCC	2	8	383506	383513	0 %	25 %	25 %	50 %	257051477
8699	NC_013158	GGA	2	6	383514	383519	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257051477
8700	NC_013158	CGC	2	6	383679	383684	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051477
8701	NC_013158	CCG	2	6	383763	383768	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8702	NC_013158	GAG	2	6	383904	383909	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257051478
8703	NC_013158	CCGAT	2	10	383929	383938	20 %	20 %	20 %	40 %	257051478
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8705	NC_013158	GACG	2	8	383999	384006	25 %	0 %	50 %	25 %	257051478
8706	NC_013158	CGA	2	6	384071	384076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051478
8707	NC_013158	AC	3	6	384146	384151	50 %	0 %	0 %	50 %	257051478
8708	NC_013158	CGGC	2	8	384292	384299	0 %	0 %	50 %	50 %	257051478
8709	NC_013158	CAG	2	6	384403	384408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051478
8710	NC_013158	ACACG	2	10	384434	384443	40 %	0 %	20 %	40 %	257051478
8711	NC_013158	GAG	2	6	384451	384456	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257051478
8712	NC_013158	CGG	2	6	384461	384466	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051478
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8715	NC_013158	CTG	2	6	384625	384630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051478
8716	NC_013158	CGT	2	6	384635	384640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051478
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8718	NC_013158	GAG	2	6	384690	384695	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257051478
8719	NC_013158	CCGATC	2	12	384811	384822	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	257051479
8720	NC_013158	TCGCC	2	10	384886	384895	0 %	20 %	20 %	60 %	257051479
8721	NC_013158	CTC	2	6	384932	384937	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257051479
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8723	NC_013158	GC	3	6	384997	385002	0 %	0 %	50 %	50 %	257051479
8724	NC_013158	CTC	2	6	385019	385024	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257051479
8725	NC_013158	CGA	3	9	385036	385044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051479
8726	NC_013158	TGAC	2	8	385075	385082	25 %	25 %	25 %	25 %	257051479
8727	NC_013158	C	7	7	385088	385094	0 %	0 %	0 %	100 %	257051479
8728	NC_013158	CGC	2	6	385108	385113	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051479
8729	NC_013158	GTC	2	6	385127	385132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051479
8730	NC_013158	CGAC	2	8	385137	385144	25 %	0 %	25 %	50 %	257051479
8731	NC_013158	TCG	2	6	385203	385208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051479
8732	NC_013158	AC	3	6	385210	385215	50 %	0 %	0 %	50 %	257051479
8733	NC_013158	TCG	3	9	385227	385235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051479
8734	NC_013158	CGT	2	6	385306	385311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051479
8735	NC_013158	GAT	2	6	385313	385318	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257051479
8736	NC_013158	GTAG	2	8	385421	385428	25 %	25 %	50 %	0 %	257051479
8737	NC_013158	GCC	2	6	385446	385451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051479
8738	NC_013158	CCCA	2	8	385487	385494	25 %	0 %	0 %	75 %	257051479
8739	NC_013158	ACC	2	6	385525	385530	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257051479
8740	NC_013158	TCG	2	6	385555	385560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051479
8741	NC_013158	ACGA	2	8	385563	385570	50 %	0 %	25 %	25 %	257051479
8742	NC_013158	CTG	2	6	385600	385605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051479
8743	NC_013158	CGGC	2	8	385612	385619	0 %	0 %	50 %	50 %	257051479
8744	NC_013158	GGA	2	6	385633	385638	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257051479
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8992	NC_013158	GAA	2	6	396824	396829	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257051489
8993	NC_013158	CAC	2	6	396916	396921	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257051490
8994	NC_013158	CGA	2	6	396973	396978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051490
8995	NC_013158	TCGA	2	8	396981	396988	25 %	25 %	25 %	25 %	257051490
8996	NC_013158	CGGTCT	2	12	397039	397050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051490
8997	NC_013158	ACC	2	6	397059	397064	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257051490
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8999	NC_013158	GTCG	2	8	397180	397187	0 %	25 %	50 %	25 %	257051490
9000	NC_013158	GCC	2	6	397204	397209	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051490

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