MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halorhabdus utahensis DSM 12940 chromosome

Total Repeats: 74047

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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8002	NC_013158	CGA	2	6	351598	351603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051449
8003	NC_013158	CTG	2	6	351782	351787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051449
8004	NC_013158	ACC	2	6	351859	351864	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257051449
8005	NC_013158	GTC	2	6	351884	351889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051449
8006	NC_013158	CTG	2	6	351890	351895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051449
8007	NC_013158	GCC	2	6	352007	352012	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051449
8008	NC_013158	GAT	2	6	352024	352029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257051449
8009	NC_013158	TCG	2	6	352224	352229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051449
8010	NC_013158	GC	3	6	352248	352253	0 %	0 %	50 %	50 %	257051449
8011	NC_013158	GAG	2	6	352271	352276	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257051449
8012	NC_013158	ACA	2	6	352414	352419	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257051449
8013	NC_013158	TAC	2	6	352421	352426	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257051449
8014	NC_013158	GAC	2	6	352448	352453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051449
8015	NC_013158	ACG	2	6	352469	352474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051449
8016	NC_013158	GCGCTG	2	12	352601	352612	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
8017	NC_013158	CGG	2	6	352667	352672	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8018	NC_013158	TCGG	2	8	352694	352701	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
8019	NC_013158	GA	3	6	352716	352721	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8020	NC_013158	GAC	2	6	352798	352803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051450
8021	NC_013158	GCG	2	6	352830	352835	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051450
8022	NC_013158	CCA	2	6	352944	352949	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257051450
8023	NC_013158	CGT	2	6	353031	353036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051450
8024	NC_013158	GTCG	2	8	353101	353108	0 %	25 %	50 %	25 %	257051450
8025	NC_013158	CGAT	2	8	353190	353197	25 %	25 %	25 %	25 %	257051450
8026	NC_013158	GGA	2	6	353199	353204	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257051450
8027	NC_013158	ACG	2	6	353209	353214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051450
8028	NC_013158	GTC	2	6	353280	353285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8029	NC_013158	GTCA	2	8	353287	353294	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8030	NC_013158	CGT	2	6	353336	353341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8031	NC_013158	GGC	2	6	353357	353362	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8032	NC_013158	ACA	2	6	353372	353377	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8033	NC_013158	ACG	2	6	353417	353422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8034	NC_013158	GTC	2	6	353439	353444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8035	NC_013158	GTA	2	6	353649	353654	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257051451
8036	NC_013158	AGCG	2	8	353702	353709	25 %	0 %	50 %	25 %	257051451
8037	NC_013158	GGCT	2	8	353769	353776	0 %	25 %	50 %	25 %	257051451
8038	NC_013158	AGA	2	6	353843	353848	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8039	NC_013158	TTC	2	6	353868	353873	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257051452
8040	NC_013158	GTA	2	6	353913	353918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257051452
8041	NC_013158	CGA	2	6	353945	353950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051452
8042	NC_013158	GAC	2	6	353958	353963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051452
8043	NC_013158	CAAC	2	8	353967	353974	50 %	0 %	0 %	50 %	257051452
8044	NC_013158	GGTC	2	8	353999	354006	0 %	25 %	50 %	25 %	257051452
8045	NC_013158	CAG	2	6	354011	354016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051452
8046	NC_013158	AGG	2	6	354019	354024	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257051452
8047	NC_013158	AGC	2	6	354064	354069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051452
8048	NC_013158	CCG	2	6	354070	354075	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051452
8049	NC_013158	GGCCTG	2	12	354096	354107	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	257051452
8050	NC_013158	TCA	2	6	354125	354130	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257051452
8051	NC_013158	GGC	2	6	354144	354149	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051452
8052	NC_013158	CAG	2	6	354198	354203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051452
8053	NC_013158	GCCG	2	8	354240	354247	0 %	0 %	50 %	50 %	257051452
8054	NC_013158	CCAG	2	8	354293	354300	25 %	0 %	25 %	50 %	257051452
8055	NC_013158	CCG	2	6	354352	354357	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051452
8056	NC_013158	CCGC	2	8	354379	354386	0 %	0 %	25 %	75 %	257051452
8057	NC_013158	TGA	2	6	354407	354412	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257051452
8058	NC_013158	GCCGA	2	10	354426	354435	20 %	0 %	40 %	40 %	257051452
8059	NC_013158	AACG	2	8	354447	354454	50 %	0 %	25 %	25 %	257051452
8060	NC_013158	AGC	2	6	354460	354465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051452
8061	NC_013158	CGGT	2	8	354591	354598	0 %	25 %	50 %	25 %	257051453
8062	NC_013158	GCT	2	6	354724	354729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051453
8063	NC_013158	CGT	2	6	354808	354813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051453
8064	NC_013158	TCG	2	6	354856	354861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051453
8065	NC_013158	TCG	3	9	354870	354878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051453
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8070	NC_013158	CGA	2	6	355235	355240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051454
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8073	NC_013158	GAC	2	6	355419	355424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051454
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8076	NC_013158	TCG	2	6	355492	355497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051454
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8080	NC_013158	ATC	2	6	355597	355602	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257051454
8081	NC_013158	ATCCG	2	10	355627	355636	20 %	20 %	20 %	40 %	257051454
8082	NC_013158	CGA	2	6	355661	355666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051454
8083	NC_013158	GTG	2	6	355689	355694	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257051454
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8087	NC_013158	CCCG	2	8	356026	356033	0 %	0 %	25 %	75 %	257051454
8088	NC_013158	CGA	2	6	356046	356051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051454
8089	NC_013158	GT	3	6	356060	356065	0 %	50 %	50 %	0 %	257051454
8090	NC_013158	GGCG	2	8	356084	356091	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
8091	NC_013158	AACG	2	8	356130	356137	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
8092	NC_013158	TCG	2	6	356197	356202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051455
8093	NC_013158	TCT	2	6	356222	356227	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257051455
8094	NC_013158	TCCG	2	8	356260	356267	0 %	25 %	25 %	50 %	257051455
8095	NC_013158	GTC	2	6	356268	356273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051455
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8103	NC_013158	GGC	2	6	356622	356627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051455
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8105	NC_013158	GGCG	2	8	356672	356679	0 %	0 %	75 %	25 %	257051455
8106	NC_013158	TGA	2	6	356753	356758	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257051455
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8108	NC_013158	CGG	2	6	356841	356846	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051455
8109	NC_013158	TCG	2	6	356860	356865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051455
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8112	NC_013158	GTT	2	6	357033	357038	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257051455
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8117	NC_013158	CTT	2	6	357189	357194	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257051455
8118	NC_013158	TTG	2	6	357232	357237	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257051455
8119	NC_013158	TTC	2	6	357306	357311	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257051455
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8121	NC_013158	CGT	4	12	357341	357352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051455
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8243	NC_013158	CCG	2	6	362082	362087	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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8363	NC_013158	CTCGAA	2	12	367719	367730	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	257051463
8364	NC_013158	GC	3	6	367739	367744	0 %	0 %	50 %	50 %	257051463
8365	NC_013158	TCC	2	6	367810	367815	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257051463
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8367	NC_013158	CGAGGA	2	12	367859	367870	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	257051463
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8377	NC_013158	CACGTC	2	12	368250	368261	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	257051463
8378	NC_013158	GTC	2	6	368277	368282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051463
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8382	NC_013158	AAGA	2	8	368433	368440	75 %	0 %	25 %	0 %	257051464
8383	NC_013158	GAG	2	6	368478	368483	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257051464
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8483	NC_013158	G	6	6	373351	373356	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
8484	NC_013158	CTA	2	6	373408	373413	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8485	NC_013158	ACTC	2	8	373444	373451	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
8486	NC_013158	GAA	3	9	373530	373538	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8487	NC_013158	TCAC	2	8	373604	373611	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
8488	NC_013158	GGC	2	6	373669	373674	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051469
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8490	NC_013158	GCG	2	6	373750	373755	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051469
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