MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halorhabdus utahensis DSM 12940 chromosome

Total Repeats: 74047

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7501	NC_013158	GTCG	2	8	329207	329214	0 %	25 %	50 %	25 %	257051427
7502	NC_013158	ATCG	2	8	329259	329266	25 %	25 %	25 %	25 %	257051427
7503	NC_013158	CGT	2	6	329268	329273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051427
7504	NC_013158	CGA	2	6	329336	329341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051428
7505	NC_013158	CCCG	2	8	329346	329353	0 %	0 %	25 %	75 %	257051428
7506	NC_013158	CCG	2	6	329554	329559	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051428
7507	NC_013158	GC	3	6	329578	329583	0 %	0 %	50 %	50 %	257051428
7508	NC_013158	GGA	2	6	329585	329590	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257051428
7509	NC_013158	TTC	2	6	329656	329661	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257051428
7510	NC_013158	CGA	2	6	329693	329698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051428
7511	NC_013158	TGCC	2	8	329713	329720	0 %	25 %	25 %	50 %	257051428
7512	NC_013158	GC	3	6	329745	329750	0 %	0 %	50 %	50 %	257051428
7513	NC_013158	TCGT	2	8	329755	329762	0 %	50 %	25 %	25 %	257051428
7514	NC_013158	CCGA	2	8	329817	329824	25 %	0 %	25 %	50 %	257051428
7515	NC_013158	GTT	2	6	329826	329831	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257051428
7516	NC_013158	TCG	2	6	329854	329859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051428
7517	NC_013158	CAGCG	2	10	329865	329874	20 %	0 %	40 %	40 %	257051428
7518	NC_013158	GTC	2	6	329881	329886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051428
7519	NC_013158	TGC	2	6	329888	329893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051428
7520	NC_013158	CGG	2	6	329949	329954	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051428
7521	NC_013158	TCC	2	6	329968	329973	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257051428
7522	NC_013158	GTC	2	6	330021	330026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051428
7523	NC_013158	CAA	2	6	330036	330041	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257051428
7524	NC_013158	CGT	2	6	330044	330049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051428
7525	NC_013158	GTC	2	6	330112	330117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051428
7526	NC_013158	GAC	2	6	330135	330140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051428
7527	NC_013158	GCGG	2	8	330149	330156	0 %	0 %	75 %	25 %	257051428
7528	NC_013158	GCA	2	6	330163	330168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051428
7529	NC_013158	ATGGA	2	10	330220	330229	40 %	20 %	40 %	0 %	257051428
7530	NC_013158	TCA	2	6	330268	330273	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7531	NC_013158	T	6	6	330302	330307	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7532	NC_013158	TCG	2	6	330384	330389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051429
7533	NC_013158	ATC	2	6	330432	330437	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257051429
7534	NC_013158	CTC	2	6	330569	330574	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257051429
7535	NC_013158	CGC	2	6	330607	330612	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051429
7536	NC_013158	GAG	2	6	330614	330619	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257051429
7537	NC_013158	CTGG	2	8	330636	330643	0 %	25 %	50 %	25 %	257051429
7538	NC_013158	GAC	2	6	330698	330703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051429
7539	NC_013158	ACGA	2	8	330777	330784	50 %	0 %	25 %	25 %	257051429
7540	NC_013158	TCG	2	6	330858	330863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051429
7541	NC_013158	GCC	2	6	330893	330898	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051429
7542	NC_013158	ACTC	2	8	330954	330961	25 %	25 %	0 %	50 %	257051429
7543	NC_013158	GAG	2	6	330974	330979	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257051429
7544	NC_013158	CGACA	2	10	330987	330996	40 %	0 %	20 %	40 %	257051429
7545	NC_013158	GCA	2	6	331015	331020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051429
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7547	NC_013158	CGT	2	6	331244	331249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051430
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7549	NC_013158	TGG	2	6	331291	331296	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257051430
7550	NC_013158	CGACG	2	10	331298	331307	20 %	0 %	40 %	40 %	257051430
7551	NC_013158	CGG	2	6	331385	331390	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051430
7552	NC_013158	CCGT	2	8	331420	331427	0 %	25 %	25 %	50 %	257051430
7553	NC_013158	CGA	2	6	331454	331459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051430
7554	NC_013158	ACC	2	6	331467	331472	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257051430
7555	NC_013158	GACC	2	8	331491	331498	25 %	0 %	25 %	50 %	257051430
7556	NC_013158	CGG	2	6	331515	331520	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051430
7557	NC_013158	ATC	2	6	331554	331559	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257051430
7558	NC_013158	GTCGGC	2	12	331572	331583	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	257051430
7559	NC_013158	GGGC	2	8	331631	331638	0 %	0 %	75 %	25 %	257051430
7560	NC_013158	GCT	2	6	331649	331654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051430
7561	NC_013158	CGT	2	6	331655	331660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051430
7562	NC_013158	GCT	2	6	331679	331684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051430
7563	NC_013158	TCG	2	6	331717	331722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051430
7564	NC_013158	CGG	2	6	331774	331779	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051430
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7570	NC_013158	CGG	2	6	332002	332007	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051431
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7572	NC_013158	CGA	2	6	332230	332235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051431
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7581	NC_013158	GTTC	2	8	332494	332501	0 %	50 %	25 %	25 %	257051431
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7584	NC_013158	AAG	2	6	332638	332643	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7585	NC_013158	CCG	2	6	332685	332690	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7586	NC_013158	TCA	2	6	332691	332696	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7587	NC_013158	CGA	2	6	332725	332730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7588	NC_013158	CGGG	2	8	332764	332771	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
7589	NC_013158	ACC	2	6	332945	332950	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257051432
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7591	NC_013158	GAG	2	6	332984	332989	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257051432
7592	NC_013158	CGA	2	6	333001	333006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051432
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7601	NC_013158	CGAGAT	2	12	333304	333315	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	257051432
7602	NC_013158	CGG	2	6	333316	333321	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051432
7603	NC_013158	CGG	2	6	333382	333387	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051432
7604	NC_013158	ACG	2	6	333408	333413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051432
7605	NC_013158	CGA	3	9	333457	333465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051432
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7609	NC_013158	GCCC	2	8	333737	333744	0 %	0 %	25 %	75 %	257051433
7610	NC_013158	GCCA	2	8	333796	333803	25 %	0 %	25 %	50 %	257051433
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7612	NC_013158	CGA	2	6	333923	333928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051433
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7619	NC_013158	CG	3	6	334194	334199	0 %	0 %	50 %	50 %	257051433
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7744	NC_013158	TAT	3	9	340001	340009	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257051440
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7746	NC_013158	GCT	2	6	340105	340110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051440
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7771	NC_013158	CGA	2	6	341086	341091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051440
7772	NC_013158	GTC	2	6	341108	341113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051440
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7775	NC_013158	CTCG	2	8	341212	341219	0 %	25 %	25 %	50 %	257051440
7776	NC_013158	GTC	2	6	341252	341257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051440
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7780	NC_013158	ATCG	2	8	341434	341441	25 %	25 %	25 %	25 %	257051440
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7782	NC_013158	GAC	3	9	341540	341548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051440
7783	NC_013158	GAC	2	6	341570	341575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051440
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7830	NC_013158	AC	3	6	343326	343331	50 %	0 %	0 %	50 %	257051442
7831	NC_013158	AG	3	6	343344	343349	50 %	0 %	50 %	0 %	257051442
7832	NC_013158	AGC	2	6	343385	343390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051442
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7835	NC_013158	GTCG	2	8	343692	343699	0 %	25 %	50 %	25 %	257051442
7836	NC_013158	GGT	2	6	343705	343710	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257051442
7837	NC_013158	GTG	2	6	343746	343751	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7838	NC_013158	CGT	2	6	343871	343876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051443
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7842	NC_013158	GTC	2	6	344067	344072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051443
7843	NC_013158	GCG	2	6	344201	344206	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051443
7844	NC_013158	CGA	2	6	344297	344302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051443
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7857	NC_013158	GAC	2	6	344706	344711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051443
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7859	NC_013158	CCG	2	6	344821	344826	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051443
7860	NC_013158	CG	3	6	344861	344866	0 %	0 %	50 %	50 %	257051443
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7862	NC_013158	CCG	2	6	344992	344997	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051443
7863	NC_013158	TCG	2	6	345029	345034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051443
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7923	NC_013158	GCG	2	6	348409	348414	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051445
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7927	NC_013158	ACC	2	6	348629	348634	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7928	NC_013158	GAC	2	6	348655	348660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051446
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7948	NC_013158	GTTGA	2	10	349406	349415	20 %	40 %	40 %	0 %	257051447
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7953	NC_013158	CACCGC	2	12	349549	349560	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	257051447
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7956	NC_013158	TCA	2	6	349671	349676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257051447
7957	NC_013158	TGC	2	6	349814	349819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7958	NC_013158	GATCCC	2	12	350000	350011	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	257051448
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7962	NC_013158	GAC	2	6	350142	350147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051448
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7970	NC_013158	TCG	2	6	350365	350370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051448
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7974	NC_013158	CG	3	6	350558	350563	0 %	0 %	50 %	50 %	257051449
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7976	NC_013158	CGAT	2	8	350577	350584	25 %	25 %	25 %	25 %	257051449
7977	NC_013158	CGG	2	6	350632	350637	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051449
7978	NC_013158	GTC	2	6	350690	350695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051449
7979	NC_013158	TCG	2	6	350715	350720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051449
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7982	NC_013158	CGT	2	6	350788	350793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051449
7983	NC_013158	TCC	2	6	350817	350822	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257051449
7984	NC_013158	GAG	2	6	350831	350836	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257051449
7985	NC_013158	CGA	2	6	350878	350883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051449
7986	NC_013158	CGA	2	6	350974	350979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051449
7987	NC_013158	AC	3	6	351095	351100	50 %	0 %	0 %	50 %	257051449
7988	NC_013158	GTCGCG	2	12	351101	351112	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	257051449
7989	NC_013158	TCG	2	6	351156	351161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051449
7990	NC_013158	CCT	2	6	351198	351203	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257051449
7991	NC_013158	CGC	2	6	351219	351224	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051449
7992	NC_013158	GAC	2	6	351269	351274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051449
7993	NC_013158	CCTCGT	2	12	351286	351297	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	257051449
7994	NC_013158	CGA	3	9	351322	351330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051449
7995	NC_013158	CAG	2	6	351395	351400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051449
7996	NC_013158	CGG	2	6	351403	351408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051449
7997	NC_013158	CGG	2	6	351418	351423	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051449
7998	NC_013158	CGG	2	6	351436	351441	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051449
7999	NC_013158	CGG	2	6	351469	351474	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051449
8000	NC_013158	GAG	2	6	351476	351481	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257051449

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