MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halorhabdus utahensis DSM 12940 chromosome

Total Repeats: 74047

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
73001	NC_013158	TC	3	6	3072141	3072146	0 %	50 %	0 %	50 %	257054043
73002	NC_013158	TCG	2	6	3072156	3072161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054043
73003	NC_013158	TGG	2	6	3072273	3072278	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257054043
73004	NC_013158	CCG	2	6	3072285	3072290	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054043
73005	NC_013158	TCG	3	9	3072294	3072302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054043
73006	NC_013158	AGCA	2	8	3072342	3072349	50 %	0 %	25 %	25 %	257054043
73007	NC_013158	CGC	2	6	3072424	3072429	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054043
73008	NC_013158	ACG	2	6	3072452	3072457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054043
73009	NC_013158	GAC	2	6	3072460	3072465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054043
73010	NC_013158	GTGGCT	2	12	3072482	3072493	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	257054043
73011	NC_013158	GTC	2	6	3072497	3072502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054043
73012	NC_013158	GAC	2	6	3072593	3072598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73013	NC_013158	ACC	2	6	3072624	3072629	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257054044
73014	NC_013158	CGG	2	6	3072667	3072672	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054044
73015	NC_013158	TCG	2	6	3072683	3072688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054044
73016	NC_013158	ACG	2	6	3072699	3072704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054044
73017	NC_013158	GAC	2	6	3072718	3072723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054044
73018	NC_013158	ACG	2	6	3072765	3072770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054044
73019	NC_013158	TCGA	2	8	3072872	3072879	25 %	25 %	25 %	25 %	257054044
73020	NC_013158	TCGG	2	8	3072915	3072922	0 %	25 %	50 %	25 %	257054044
73021	NC_013158	TCT	2	6	3072939	3072944	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257054044
73022	NC_013158	GGT	2	6	3072947	3072952	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257054044
73023	NC_013158	CGC	2	6	3072994	3072999	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054044
73024	NC_013158	ACG	2	6	3073131	3073136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054044
73025	NC_013158	GAG	2	6	3073148	3073153	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257054044
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73027	NC_013158	CGC	2	6	3073288	3073293	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054044
73028	NC_013158	TTC	2	6	3073307	3073312	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257054044
73029	NC_013158	CGG	2	6	3073445	3073450	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054044
73030	NC_013158	CGA	2	6	3073456	3073461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054044
73031	NC_013158	CGGG	2	8	3073508	3073515	0 %	0 %	75 %	25 %	257054044
73032	NC_013158	TGG	2	6	3073605	3073610	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257054044
73033	NC_013158	TCG	2	6	3073662	3073667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054044
73034	NC_013158	TCG	2	6	3073799	3073804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73035	NC_013158	CCG	2	6	3073815	3073820	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
73036	NC_013158	TCG	3	9	3073919	3073927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054045
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73039	NC_013158	CGTCGG	2	12	3074013	3074024	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	257054045
73040	NC_013158	TCA	2	6	3074091	3074096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257054045
73041	NC_013158	TCG	2	6	3074148	3074153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054045
73042	NC_013158	GCC	2	6	3074198	3074203	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054045
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73049	NC_013158	TCA	2	6	3074790	3074795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257054045
73050	NC_013158	CGC	2	6	3074829	3074834	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
73051	NC_013158	TCT	2	6	3074905	3074910	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257054046
73052	NC_013158	GTC	2	6	3074915	3074920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054046
73053	NC_013158	CGT	2	6	3074950	3074955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054046
73054	NC_013158	TCG	2	6	3075021	3075026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054046
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73056	NC_013158	ACG	2	6	3075069	3075074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054046
73057	NC_013158	GTC	2	6	3075126	3075131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73058	NC_013158	CCGT	2	8	3075211	3075218	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
73059	NC_013158	ATC	2	6	3075255	3075260	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257054047
73060	NC_013158	CGG	2	6	3075263	3075268	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054047
73061	NC_013158	CTG	2	6	3075288	3075293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054047
73062	NC_013158	GTCG	2	8	3075323	3075330	0 %	25 %	50 %	25 %	257054047
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73068	NC_013158	GGTG	2	8	3075539	3075546	0 %	25 %	75 %	0 %	257054047
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73089	NC_013158	CGA	2	6	3076517	3076522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054047
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73092	NC_013158	CAC	2	6	3076617	3076622	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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73100	NC_013158	CGGTT	2	10	3077027	3077036	0 %	40 %	40 %	20 %	257054048
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73102	NC_013158	GTCGA	2	10	3077066	3077075	20 %	20 %	40 %	20 %	257054048
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73231	NC_013158	CGA	3	9	3082544	3082552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054055
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73319	NC_013158	GCTG	2	8	3086148	3086155	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
73320	NC_013158	AT	3	6	3086213	3086218	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73321	NC_013158	TGAG	2	8	3086240	3086247	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
73322	NC_013158	ACA	2	6	3086293	3086298	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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73331	NC_013158	CGC	2	6	3086566	3086571	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054058
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73334	NC_013158	GGTGTC	2	12	3086648	3086659	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	257054058
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73339	NC_013158	GAT	2	6	3086923	3086928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257054058
73340	NC_013158	GCTC	2	8	3086943	3086950	0 %	25 %	25 %	50 %	257054058
73341	NC_013158	CTTG	2	8	3086986	3086993	0 %	50 %	25 %	25 %	257054058
73342	NC_013158	TCC	2	6	3087000	3087005	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257054058
73343	NC_013158	TCA	3	9	3087018	3087026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257054058
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73493	NC_013158	CGA	2	6	3092822	3092827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054062
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73499	NC_013158	GAC	2	6	3092996	3093001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73500	NC_013158	AG	3	6	3093036	3093041	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding

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