MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halorhabdus utahensis DSM 12940 chromosome

Total Repeats: 74047

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
72501	NC_013158	G	6	6	3051111	3051116	0 %	0 %	100 %	0 %	257054022
72502	NC_013158	CGGTGA	2	12	3051118	3051129	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	257054022
72503	NC_013158	GCC	3	9	3051143	3051151	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054022
72504	NC_013158	CGC	2	6	3051209	3051214	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054022
72505	NC_013158	TCG	2	6	3051231	3051236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054022
72506	NC_013158	TGA	2	6	3051241	3051246	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257054022
72507	NC_013158	GC	3	6	3051274	3051279	0 %	0 %	50 %	50 %	257054022
72508	NC_013158	GAC	2	6	3051287	3051292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054022
72509	NC_013158	GCG	2	6	3051334	3051339	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054022
72510	NC_013158	CGCC	2	8	3051367	3051374	0 %	0 %	25 %	75 %	257054022
72511	NC_013158	TCG	2	6	3051437	3051442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054022
72512	NC_013158	TCTG	2	8	3051459	3051466	0 %	50 %	25 %	25 %	257054022
72513	NC_013158	CCG	2	6	3051483	3051488	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
72514	NC_013158	CGA	2	6	3051568	3051573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054023
72515	NC_013158	CCCG	2	8	3051578	3051585	0 %	0 %	25 %	75 %	257054023
72516	NC_013158	CGT	2	6	3051626	3051631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054023
72517	NC_013158	ATC	2	6	3051669	3051674	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257054023
72518	NC_013158	CGG	2	6	3051688	3051693	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054023
72519	NC_013158	GAC	2	6	3051749	3051754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054023
72520	NC_013158	CGC	2	6	3051785	3051790	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054023
72521	NC_013158	CGA	2	6	3051814	3051819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054023
72522	NC_013158	TC	3	6	3051839	3051844	0 %	50 %	0 %	50 %	257054023
72523	NC_013158	CG	3	6	3051852	3051857	0 %	0 %	50 %	50 %	257054023
72524	NC_013158	AAC	2	6	3051897	3051902	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257054023
72525	NC_013158	CAG	2	6	3051905	3051910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054023
72526	NC_013158	CGA	2	6	3051916	3051921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054023
72527	NC_013158	CGGC	2	8	3051953	3051960	0 %	0 %	50 %	50 %	257054023
72528	NC_013158	CGC	2	6	3051971	3051976	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054023
72529	NC_013158	CGCT	2	8	3052012	3052019	0 %	25 %	25 %	50 %	257054023
72530	NC_013158	GC	3	6	3052051	3052056	0 %	0 %	50 %	50 %	257054023
72531	NC_013158	CTCC	2	8	3052057	3052064	0 %	25 %	0 %	75 %	257054023
72532	NC_013158	GTA	2	6	3052082	3052087	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257054023
72533	NC_013158	CGT	2	6	3052133	3052138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054023
72534	NC_013158	CGT	2	6	3052145	3052150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054023
72535	NC_013158	AAGT	2	8	3052177	3052184	50 %	25 %	25 %	0 %	257054023
72536	NC_013158	TCCGGG	2	12	3052226	3052237	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	257054024
72537	NC_013158	GAC	2	6	3052255	3052260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054024
72538	NC_013158	CCA	2	6	3052275	3052280	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257054024
72539	NC_013158	CAG	2	6	3052318	3052323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054024
72540	NC_013158	C	6	6	3052325	3052330	0 %	0 %	0 %	100 %	257054024
72541	NC_013158	CCG	2	6	3052358	3052363	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054024
72542	NC_013158	CAC	2	6	3052373	3052378	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257054024
72543	NC_013158	CGT	2	6	3052386	3052391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054024
72544	NC_013158	CGA	2	6	3052521	3052526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054024
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72547	NC_013158	AGTG	2	8	3052627	3052634	25 %	25 %	50 %	0 %	257054024
72548	NC_013158	GCC	2	6	3052642	3052647	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054024
72549	NC_013158	ACG	2	6	3052655	3052660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054024
72550	NC_013158	GCG	2	6	3052661	3052666	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054024
72551	NC_013158	CCG	2	6	3052667	3052672	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054024
72552	NC_013158	CGT	2	6	3052691	3052696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054024
72553	NC_013158	TCG	2	6	3052738	3052743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054025
72554	NC_013158	ACG	2	6	3052754	3052759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054025
72555	NC_013158	CAG	2	6	3052806	3052811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054025
72556	NC_013158	GC	3	6	3052817	3052822	0 %	0 %	50 %	50 %	257054025
72557	NC_013158	CATCTC	2	12	3052839	3052850	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	257054025
72558	NC_013158	CGT	2	6	3052907	3052912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054025
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72567	NC_013158	CGCT	2	8	3053302	3053309	0 %	25 %	25 %	50 %	257054025
72568	NC_013158	CGG	2	6	3053330	3053335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054025
72569	NC_013158	GA	3	6	3053460	3053465	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
72570	NC_013158	CGG	2	6	3053530	3053535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
72571	NC_013158	CGG	3	9	3053590	3053598	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
72572	NC_013158	CGG	2	6	3053634	3053639	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
72573	NC_013158	GCG	2	6	3053649	3053654	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
72574	NC_013158	TC	3	6	3053674	3053679	0 %	50 %	0 %	50 %	257054026
72575	NC_013158	CGA	2	6	3053713	3053718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054026
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72583	NC_013158	TCG	2	6	3054006	3054011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054026
72584	NC_013158	GTC	2	6	3054016	3054021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054026
72585	NC_013158	CGA	3	9	3054064	3054072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054026
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72588	NC_013158	CGC	2	6	3054228	3054233	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054027
72589	NC_013158	GCGCGA	2	12	3054242	3054253	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	257054027
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72599	NC_013158	GGA	2	6	3054664	3054669	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257054027
72600	NC_013158	G	6	6	3054683	3054688	0 %	0 %	100 %	0 %	257054027
72601	NC_013158	GGC	2	6	3054735	3054740	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054027
72602	NC_013158	GACCG	2	10	3054763	3054772	20 %	0 %	40 %	40 %	257054027
72603	NC_013158	TCG	2	6	3054780	3054785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054027
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72606	NC_013158	CGC	2	6	3054840	3054845	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054027
72607	NC_013158	CCG	2	6	3054862	3054867	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054027
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72609	NC_013158	CCCG	2	8	3054885	3054892	0 %	0 %	25 %	75 %	257054027
72610	NC_013158	ACG	2	6	3054899	3054904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054027
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72612	NC_013158	CCGCG	2	10	3054995	3055004	0 %	0 %	40 %	60 %	257054027
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72615	NC_013158	GTC	2	6	3055135	3055140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054027
72616	NC_013158	AGCG	2	8	3055191	3055198	25 %	0 %	50 %	25 %	257054027
72617	NC_013158	CGT	3	9	3055224	3055232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054027
72618	NC_013158	TCGA	2	8	3055243	3055250	25 %	25 %	25 %	25 %	257054027
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72633	NC_013158	CGT	2	6	3055869	3055874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054027
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72635	NC_013158	GGC	2	6	3055941	3055946	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054027
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72644	NC_013158	CGC	2	6	3056333	3056338	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054028
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72647	NC_013158	CGGG	2	8	3056506	3056513	0 %	0 %	75 %	25 %	257054028
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72669	NC_013158	CTG	2	6	3057235	3057240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054029
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72701	NC_013158	CGA	2	6	3058695	3058700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054030
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72713	NC_013158	CCG	2	6	3059192	3059197	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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72715	NC_013158	GAC	2	6	3059298	3059303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72716	NC_013158	G	6	6	3059390	3059395	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
72717	NC_013158	TTC	2	6	3059520	3059525	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257054032
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72719	NC_013158	GC	3	6	3059635	3059640	0 %	0 %	50 %	50 %	257054032
72720	NC_013158	TGG	3	9	3059668	3059676	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257054032
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72722	NC_013158	TCC	2	6	3059824	3059829	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257054032
72723	NC_013158	GTC	2	6	3059844	3059849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054032
72724	NC_013158	TGGA	2	8	3060060	3060067	25 %	25 %	50 %	0 %	257054032
72725	NC_013158	ATC	2	6	3060075	3060080	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257054032
72726	NC_013158	TCG	2	6	3060139	3060144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054032
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72728	NC_013158	CGA	2	6	3060169	3060174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054032
72729	NC_013158	GAG	2	6	3060207	3060212	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257054032
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72733	NC_013158	CGT	2	6	3060494	3060499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054032
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72847	NC_013158	CGC	2	6	3065334	3065339	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054038
72848	NC_013158	GCG	2	6	3065357	3065362	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054038
72849	NC_013158	TCCA	2	8	3065379	3065386	25 %	25 %	0 %	50 %	257054038
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72851	NC_013158	GGA	2	6	3065438	3065443	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257054038
72852	NC_013158	G	6	6	3065461	3065466	0 %	0 %	100 %	0 %	257054038
72853	NC_013158	GGC	2	6	3065490	3065495	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054038
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72857	NC_013158	CGA	2	6	3065793	3065798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054038
72858	NC_013158	AG	3	6	3065799	3065804	50 %	0 %	50 %	0 %	257054038
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72885	NC_013158	C	6	6	3067229	3067234	0 %	0 %	0 %	100 %	257054039
72886	NC_013158	CGA	2	6	3067296	3067301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054039
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72920	NC_013158	TCGCCA	2	12	3069120	3069131	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	257054041
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72932	NC_013158	GAA	2	6	3069539	3069544	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257054041
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72937	NC_013158	GCGT	2	8	3069629	3069636	0 %	25 %	50 %	25 %	257054042
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72954	NC_013158	TGG	2	6	3070197	3070202	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257054042
72955	NC_013158	TAC	2	6	3070203	3070208	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257054042
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72958	NC_013158	CGG	2	6	3070254	3070259	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054042
72959	NC_013158	GCC	2	6	3070314	3070319	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054042
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