MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halorhabdus utahensis DSM 12940 chromosome

Total Repeats: 74047

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_013158	A	6	6	286235	286240	100 %	0 %	0 %	0 %	257051389
6502	NC_013158	ACG	2	6	286256	286261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051389
6503	NC_013158	CGAT	2	8	286267	286274	25 %	25 %	25 %	25 %	257051389
6504	NC_013158	CGAC	2	8	286275	286282	25 %	0 %	25 %	50 %	257051389
6505	NC_013158	TCC	2	6	286328	286333	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257051389
6506	NC_013158	GTG	2	6	286367	286372	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257051389
6507	NC_013158	TGG	2	6	286376	286381	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257051389
6508	NC_013158	CA	3	6	286400	286405	50 %	0 %	0 %	50 %	257051389
6509	NC_013158	GCC	2	6	286540	286545	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051389
6510	NC_013158	CGAT	2	8	286550	286557	25 %	25 %	25 %	25 %	257051389
6511	NC_013158	CGT	2	6	286593	286598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051389
6512	NC_013158	GCC	2	6	286656	286661	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051389
6513	NC_013158	CGA	2	6	286668	286673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051389
6514	NC_013158	ATC	2	6	286750	286755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257051389
6515	NC_013158	ACC	2	6	286760	286765	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257051389
6516	NC_013158	TCG	2	6	286829	286834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051389
6517	NC_013158	CAGCC	2	10	286955	286964	20 %	0 %	20 %	60 %	257051389
6518	NC_013158	TCG	2	6	287006	287011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051389
6519	NC_013158	GGT	2	6	287021	287026	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257051389
6520	NC_013158	CGGTG	2	10	287040	287049	0 %	20 %	60 %	20 %	257051389
6521	NC_013158	GAG	2	6	287053	287058	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257051389
6522	NC_013158	CGA	2	6	287111	287116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051389
6523	NC_013158	CAA	2	6	287151	287156	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257051389
6524	NC_013158	CGG	3	9	287157	287165	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051389
6525	NC_013158	ACG	3	9	287177	287185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051389
6526	NC_013158	CGCC	2	8	287189	287196	0 %	0 %	25 %	75 %	257051389
6527	NC_013158	ACG	2	6	287240	287245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051389
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6529	NC_013158	CCA	2	6	287325	287330	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257051389
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6533	NC_013158	CGA	2	6	287535	287540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051389
6534	NC_013158	CGTCGG	2	12	287622	287633	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	257051389
6535	NC_013158	GATC	2	8	287654	287661	25 %	25 %	25 %	25 %	257051389
6536	NC_013158	GA	3	6	287666	287671	50 %	0 %	50 %	0 %	257051389
6537	NC_013158	GAC	2	6	287771	287776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051390
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6539	NC_013158	GAG	2	6	287955	287960	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257051390
6540	NC_013158	TCC	2	6	287965	287970	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257051390
6541	NC_013158	ATC	2	6	288001	288006	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257051390
6542	NC_013158	AGG	2	6	288013	288018	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257051390
6543	NC_013158	GAA	2	6	288051	288056	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6544	NC_013158	AGC	2	6	288141	288146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051391
6545	NC_013158	ACG	2	6	288229	288234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051391
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6550	NC_013158	TCG	2	6	288398	288403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051391
6551	NC_013158	GTC	2	6	288426	288431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051391
6552	NC_013158	CAA	2	6	288461	288466	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257051391
6553	NC_013158	AGA	2	6	288485	288490	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6554	NC_013158	ACG	2	6	288526	288531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6555	NC_013158	CGA	2	6	288622	288627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051392
6556	NC_013158	GACG	2	8	288653	288660	25 %	0 %	50 %	25 %	257051392
6557	NC_013158	ACG	2	6	288810	288815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051392
6558	NC_013158	GTA	2	6	288824	288829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257051392
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6560	NC_013158	GGA	2	6	288889	288894	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257051392
6561	NC_013158	TCG	2	6	288911	288916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051392
6562	NC_013158	GAC	3	9	288974	288982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051392
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6573	NC_013158	GTC	2	6	289253	289258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051392
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6583	NC_013158	GCC	2	6	289473	289478	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6584	NC_013158	CGG	2	6	289501	289506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6585	NC_013158	TCGCGG	2	12	289618	289629	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	257051393
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6587	NC_013158	CGG	2	6	289673	289678	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051393
6588	NC_013158	CGG	2	6	289739	289744	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051393
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6590	NC_013158	CGA	2	6	289802	289807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051393
6591	NC_013158	GGCG	2	8	289819	289826	0 %	0 %	75 %	25 %	257051393
6592	NC_013158	GATC	2	8	289858	289865	25 %	25 %	25 %	25 %	257051393
6593	NC_013158	GC	3	6	289868	289873	0 %	0 %	50 %	50 %	257051393
6594	NC_013158	GAT	2	6	289889	289894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257051393
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6603	NC_013158	TCGGA	2	10	290224	290233	20 %	20 %	40 %	20 %	257051393
6604	NC_013158	CG	3	6	290314	290319	0 %	0 %	50 %	50 %	257051393
6605	NC_013158	CCG	2	6	290373	290378	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051393
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6622	NC_013158	CTG	2	6	290847	290852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051393
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6863	NC_013158	CGA	2	6	301346	301351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051401
6864	NC_013158	CGT	3	9	301401	301409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051401
6865	NC_013158	CTC	2	6	301419	301424	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257051401
6866	NC_013158	GGC	2	6	301463	301468	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051401
6867	NC_013158	TCT	2	6	301505	301510	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257051401
6868	NC_013158	GAC	2	6	301545	301550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051401
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6871	NC_013158	AGT	2	6	301658	301663	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257051401
6872	NC_013158	CCT	2	6	301742	301747	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257051401
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6875	NC_013158	AGTG	2	8	301841	301848	25 %	25 %	50 %	0 %	257051401
6876	NC_013158	CGA	3	9	301871	301879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051401
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6878	NC_013158	CGGG	2	8	301964	301971	0 %	0 %	75 %	25 %	257051401
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6881	NC_013158	CGA	2	6	302072	302077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051401
6882	NC_013158	TCG	2	6	302104	302109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051401
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6884	NC_013158	GTC	2	6	302184	302189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051401
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6886	NC_013158	GTGTG	2	10	302331	302340	0 %	40 %	60 %	0 %	257051401
6887	NC_013158	CAG	2	6	302355	302360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051401
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6890	NC_013158	TTC	2	6	302422	302427	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257051401
6891	NC_013158	TCGA	2	8	302431	302438	25 %	25 %	25 %	25 %	257051401
6892	NC_013158	CG	3	6	302503	302508	0 %	0 %	50 %	50 %	257051401
6893	NC_013158	GA	3	6	302568	302573	50 %	0 %	50 %	0 %	257051401
6894	NC_013158	GA	3	6	302590	302595	50 %	0 %	50 %	0 %	257051401
6895	NC_013158	GAC	2	6	302601	302606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051401
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6898	NC_013158	GAAA	2	8	302927	302934	75 %	0 %	25 %	0 %	257051402
6899	NC_013158	CGT	2	6	302940	302945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051402
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6911	NC_013158	CTGG	2	8	303405	303412	0 %	25 %	50 %	25 %	257051402
6912	NC_013158	TGG	2	6	303424	303429	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257051402
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6920	NC_013158	T	6	6	303617	303622	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6921	NC_013158	TCAC	2	8	303669	303676	25 %	25 %	0 %	50 %	257051403
6922	NC_013158	CGTC	2	8	303705	303712	0 %	25 %	25 %	50 %	257051403
6923	NC_013158	TCGCG	2	10	303723	303732	0 %	20 %	40 %	40 %	257051403
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6928	NC_013158	TGC	2	6	303994	303999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051403
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6930	NC_013158	CGA	2	6	304089	304094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051403
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6938	NC_013158	TC	3	6	304530	304535	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6939	NC_013158	ACCG	2	8	304584	304591	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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6955	NC_013158	TCG	2	6	305171	305176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051404
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6967	NC_013158	C	6	6	305544	305549	0 %	0 %	0 %	100 %	257051404
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6971	NC_013158	TCG	2	6	305702	305707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051404
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6982	NC_013158	TCC	2	6	306089	306094	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257051404
6983	NC_013158	TGT	2	6	306218	306223	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257051404
6984	NC_013158	CGT	2	6	306291	306296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051404
6985	NC_013158	TCA	2	6	306326	306331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257051404
6986	NC_013158	CGG	2	6	306360	306365	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051404
6987	NC_013158	CGA	2	6	306374	306379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051404
6988	NC_013158	GAC	3	9	306409	306417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051404
6989	NC_013158	TCG	2	6	306509	306514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051404
6990	NC_013158	GTCG	2	8	306544	306551	0 %	25 %	50 %	25 %	257051404
6991	NC_013158	CGA	3	9	306558	306566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051404
6992	NC_013158	CGTC	2	8	306591	306598	0 %	25 %	25 %	50 %	257051404
6993	NC_013158	CGG	2	6	306731	306736	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6994	NC_013158	CGCTCG	2	12	306768	306779	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	257051405
6995	NC_013158	CGG	2	6	306796	306801	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051405
6996	NC_013158	TGA	2	6	306814	306819	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257051405
6997	NC_013158	TG	4	8	306926	306933	0 %	50 %	50 %	0 %	257051405
6998	NC_013158	TCG	2	6	306981	306986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051405
6999	NC_013158	GCC	2	6	306999	307004	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051405
7000	NC_013158	TCG	2	6	307086	307091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051405

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