MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halorhabdus utahensis DSM 12940 chromosome

Total Repeats: 74047

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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69002	NC_013158	CGT	2	6	2900366	2900371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053888
69003	NC_013158	GCC	2	6	2900391	2900396	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257053888
69004	NC_013158	GAA	2	6	2900406	2900411	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257053888
69005	NC_013158	TTC	2	6	2900451	2900456	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257053889
69006	NC_013158	CCG	2	6	2900523	2900528	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257053889
69007	NC_013158	GAA	2	6	2900543	2900548	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257053889
69008	NC_013158	GAA	2	6	2900603	2900608	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257053889
69009	NC_013158	CGGAA	2	10	2900695	2900704	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
69010	NC_013158	GAC	3	9	2900716	2900724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69011	NC_013158	CTG	2	6	2900783	2900788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053890
69012	NC_013158	GACC	2	8	2900808	2900815	25 %	0 %	25 %	50 %	257053890
69013	NC_013158	AGG	2	6	2900859	2900864	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257053890
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69015	NC_013158	TCGA	2	8	2900982	2900989	25 %	25 %	25 %	25 %	257053890
69016	NC_013158	GGCG	2	8	2901070	2901077	0 %	0 %	75 %	25 %	257053890
69017	NC_013158	CGG	2	6	2901199	2901204	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257053890
69018	NC_013158	TCA	2	6	2901336	2901341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257053890
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69020	NC_013158	CTTC	2	8	2901454	2901461	0 %	50 %	0 %	50 %	257053890
69021	NC_013158	GGCG	2	8	2901516	2901523	0 %	0 %	75 %	25 %	257053890
69022	NC_013158	GCGG	2	8	2901535	2901542	0 %	0 %	75 %	25 %	257053890
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69062	NC_013158	ATCA	2	8	2903389	2903396	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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69091	NC_013158	CTCG	2	8	2904895	2904902	0 %	25 %	25 %	50 %	257053893
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69234	NC_013158	TGT	2	6	2910414	2910419	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69235	NC_013158	GCG	2	6	2910453	2910458	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
69236	NC_013158	GA	4	8	2910558	2910565	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
69237	NC_013158	G	6	6	2910628	2910633	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
69238	NC_013158	ACG	2	6	2910659	2910664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69239	NC_013158	CCT	2	6	2910702	2910707	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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69269	NC_013158	CGCTC	2	10	2911846	2911855	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
69270	NC_013158	CGTC	2	8	2911996	2912003	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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69343	NC_013158	TTCG	2	8	2915437	2915444	0 %	50 %	25 %	25 %	257053903
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69350	NC_013158	TCC	2	6	2915678	2915683	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257053903
69351	NC_013158	CGA	2	6	2915712	2915717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053903
69352	NC_013158	GCC	2	6	2915734	2915739	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257053903
69353	NC_013158	CGA	2	6	2915748	2915753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053903
69354	NC_013158	GAC	2	6	2915758	2915763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053903
69355	NC_013158	TAC	2	6	2915821	2915826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257053903
69356	NC_013158	CGTT	3	12	2915853	2915864	0 %	50 %	25 %	25 %	257053903
69357	NC_013158	CGA	2	6	2915868	2915873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053903
69358	NC_013158	CCG	2	6	2915884	2915889	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257053903
69359	NC_013158	CGA	2	6	2915937	2915942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053903
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69366	NC_013158	GCGT	2	8	2916132	2916139	0 %	25 %	50 %	25 %	257053903
69367	NC_013158	TGC	2	6	2916146	2916151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053903
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69370	NC_013158	CGA	2	6	2916219	2916224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053904
69371	NC_013158	GC	3	6	2916232	2916237	0 %	0 %	50 %	50 %	257053904
69372	NC_013158	CGA	2	6	2916243	2916248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053904
69373	NC_013158	GTC	2	6	2916256	2916261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053904
69374	NC_013158	CGA	3	9	2916321	2916329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053904
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69377	NC_013158	GGT	2	6	2916381	2916386	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257053904
69378	NC_013158	CAG	2	6	2916397	2916402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053904
69379	NC_013158	TCG	2	6	2916479	2916484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053904
69380	NC_013158	CGA	2	6	2916525	2916530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053904
69381	NC_013158	GC	3	6	2916544	2916549	0 %	0 %	50 %	50 %	257053904
69382	NC_013158	CGT	2	6	2916555	2916560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053904
69383	NC_013158	GAT	2	6	2916646	2916651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257053904
69384	NC_013158	CGT	3	9	2916666	2916674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053904
69385	NC_013158	GGA	2	6	2916705	2916710	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257053904
69386	NC_013158	CGT	2	6	2916723	2916728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053904
69387	NC_013158	CCA	2	6	2916750	2916755	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257053904
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69389	NC_013158	AGG	2	6	2916806	2916811	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257053904
69390	NC_013158	TCGC	2	8	2916812	2916819	0 %	25 %	25 %	50 %	257053904
69391	NC_013158	GTC	2	6	2916913	2916918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053904
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69396	NC_013158	GCG	2	6	2917200	2917205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257053905
69397	NC_013158	CGA	2	6	2917303	2917308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053905
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69400	NC_013158	GCC	2	6	2917385	2917390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257053905
69401	NC_013158	GTC	2	6	2917506	2917511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053905
69402	NC_013158	GT	3	6	2917552	2917557	0 %	50 %	50 %	0 %	257053905
69403	NC_013158	CGC	2	6	2917579	2917584	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257053905
69404	NC_013158	TCGT	2	8	2917755	2917762	0 %	50 %	25 %	25 %	257053905
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69408	NC_013158	CGG	2	6	2917888	2917893	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257053905
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69411	NC_013158	CGGGC	2	10	2917969	2917978	0 %	0 %	60 %	40 %	257053905
69412	NC_013158	CCG	2	6	2917998	2918003	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257053905
69413	NC_013158	AGATCG	2	12	2918040	2918051	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	257053905
69414	NC_013158	TGG	2	6	2918079	2918084	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257053905
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69416	NC_013158	GAC	2	6	2918192	2918197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053905
69417	NC_013158	CCCG	2	8	2918252	2918259	0 %	0 %	25 %	75 %	257053905
69418	NC_013158	TCGAT	2	10	2918262	2918271	20 %	40 %	20 %	20 %	257053905
69419	NC_013158	CGA	2	6	2918305	2918310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053905
69420	NC_013158	TC	3	6	2918342	2918347	0 %	50 %	0 %	50 %	257053905
69421	NC_013158	CGG	2	6	2918421	2918426	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257053905
69422	NC_013158	GCC	2	6	2918427	2918432	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257053905
69423	NC_013158	CGG	2	6	2918452	2918457	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257053905
69424	NC_013158	TCGC	2	8	2918463	2918470	0 %	25 %	25 %	50 %	257053905
69425	NC_013158	ACG	2	6	2918472	2918477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053905
69426	NC_013158	CTCG	2	8	2918575	2918582	0 %	25 %	25 %	50 %	257053905
69427	NC_013158	CA	3	6	2918617	2918622	50 %	0 %	0 %	50 %	257053905
69428	NC_013158	CAC	2	6	2918660	2918665	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257053905
69429	NC_013158	GAT	2	6	2918767	2918772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69430	NC_013158	GACG	2	8	2918870	2918877	25 %	0 %	50 %	25 %	257053906
69431	NC_013158	CGT	3	9	2918888	2918896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053906
69432	NC_013158	TCC	2	6	2918907	2918912	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257053906
69433	NC_013158	GACGC	2	10	2918933	2918942	20 %	0 %	40 %	40 %	257053906
69434	NC_013158	GGGC	2	8	2918997	2919004	0 %	0 %	75 %	25 %	257053906
69435	NC_013158	GACG	2	8	2919026	2919033	25 %	0 %	50 %	25 %	257053906
69436	NC_013158	CGT	2	6	2919052	2919057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053906
69437	NC_013158	ACG	2	6	2919084	2919089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053906
69438	NC_013158	CGA	2	6	2919130	2919135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053906
69439	NC_013158	CGT	2	6	2919220	2919225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053906
69440	NC_013158	GCCG	2	8	2919229	2919236	0 %	0 %	50 %	50 %	257053906
69441	NC_013158	TAG	2	6	2919246	2919251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257053906
69442	NC_013158	GTC	2	6	2919305	2919310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053906
69443	NC_013158	GCC	2	6	2919331	2919336	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257053906
69444	NC_013158	TCG	2	6	2919342	2919347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053906
69445	NC_013158	GTC	3	9	2919356	2919364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053906
69446	NC_013158	CGC	2	6	2919431	2919436	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257053906
69447	NC_013158	CGT	2	6	2919451	2919456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053906
69448	NC_013158	TGA	2	6	2919538	2919543	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257053906
69449	NC_013158	GCC	2	6	2919548	2919553	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257053906
69450	NC_013158	CCA	2	6	2919566	2919571	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257053906
69451	NC_013158	CGA	2	6	2919577	2919582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053906
69452	NC_013158	TCG	2	6	2919594	2919599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053906
69453	NC_013158	GTA	2	6	2919611	2919616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257053906
69454	NC_013158	GTC	2	6	2919654	2919659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053906
69455	NC_013158	GAAGTC	2	12	2919668	2919679	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	257053906
69456	NC_013158	CTC	2	6	2919695	2919700	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257053906
69457	NC_013158	CGT	2	6	2919754	2919759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053906
69458	NC_013158	TCG	2	6	2919826	2919831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053906
69459	NC_013158	CCG	2	6	2919889	2919894	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257053906
69460	NC_013158	CGT	2	6	2919911	2919916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053906
69461	NC_013158	CGT	2	6	2920001	2920006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053906
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