MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halorhabdus utahensis DSM 12940 chromosome

Total Repeats: 74047

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
68001	NC_013158	GGT	2	6	2859378	2859383	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
68002	NC_013158	ACAGC	2	10	2859455	2859464	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
68003	NC_013158	CGCT	2	8	2859542	2859549	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
68004	NC_013158	TCG	2	6	2859606	2859611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68005	NC_013158	CTC	2	6	2859617	2859622	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
68006	NC_013158	CGC	2	6	2859630	2859635	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
68007	NC_013158	TCGCT	2	10	2859678	2859687	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
68008	NC_013158	CGC	2	6	2859725	2859730	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
68009	NC_013158	ACC	2	6	2859776	2859781	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
68010	NC_013158	CCG	2	6	2859800	2859805	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
68011	NC_013158	ATCCC	2	10	2859819	2859828	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
68012	NC_013158	GTC	2	6	2859849	2859854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68013	NC_013158	CCGT	2	8	2859878	2859885	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
68014	NC_013158	GCCA	2	8	2859904	2859911	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
68015	NC_013158	CTG	2	6	2859978	2859983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68016	NC_013158	ACG	2	6	2860000	2860005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68017	NC_013158	GAT	2	6	2860073	2860078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257053847
68018	NC_013158	TCG	2	6	2860090	2860095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053847
68019	NC_013158	CCT	2	6	2860115	2860120	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257053847
68020	NC_013158	GGT	2	6	2860220	2860225	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257053847
68021	NC_013158	GCT	2	6	2860274	2860279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053847
68022	NC_013158	TCG	2	6	2860291	2860296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053847
68023	NC_013158	GCC	2	6	2860302	2860307	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257053847
68024	NC_013158	G	6	6	2860319	2860324	0 %	0 %	100 %	0 %	257053847
68025	NC_013158	TCG	2	6	2860381	2860386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053847
68026	NC_013158	GCT	2	6	2860451	2860456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053847
68027	NC_013158	TGC	2	6	2860465	2860470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053847
68028	NC_013158	C	6	6	2860485	2860490	0 %	0 %	0 %	100 %	257053847
68029	NC_013158	TAC	3	9	2860524	2860532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257053847
68030	NC_013158	GGC	2	6	2860533	2860538	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257053847
68031	NC_013158	CCT	2	6	2860541	2860546	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257053847
68032	NC_013158	GCT	2	6	2860553	2860558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053847
68033	NC_013158	CGGT	2	8	2860580	2860587	0 %	25 %	50 %	25 %	257053847
68034	NC_013158	GAA	2	6	2860652	2860657	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257053847
68035	NC_013158	TCG	2	6	2860714	2860719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053847
68036	NC_013158	CGG	2	6	2860741	2860746	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257053847
68037	NC_013158	CGA	2	6	2860772	2860777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053847
68038	NC_013158	CGCAA	2	10	2860781	2860790	40 %	0 %	20 %	40 %	257053847
68039	NC_013158	CGG	2	6	2860795	2860800	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257053847
68040	NC_013158	CTC	2	6	2860971	2860976	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257053847
68041	NC_013158	GCCA	3	12	2860994	2861005	25 %	0 %	25 %	50 %	257053847
68042	NC_013158	CGG	2	6	2861013	2861018	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257053847
68043	NC_013158	GCT	2	6	2861024	2861029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053847
68044	NC_013158	CGC	2	6	2861060	2861065	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257053847
68045	NC_013158	CGT	2	6	2861152	2861157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053847
68046	NC_013158	CGG	2	6	2861252	2861257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257053847
68047	NC_013158	CGGAG	2	10	2861320	2861329	20 %	0 %	60 %	20 %	257053847
68048	NC_013158	CTG	2	6	2861346	2861351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053847
68049	NC_013158	GGC	2	6	2861369	2861374	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257053847
68050	NC_013158	ACG	2	6	2861417	2861422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053847
68051	NC_013158	TGG	2	6	2861440	2861445	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257053847
68052	NC_013158	TCC	2	6	2861530	2861535	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257053847
68053	NC_013158	GAG	2	6	2861553	2861558	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257053847
68054	NC_013158	GTG	2	6	2861610	2861615	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257053847
68055	NC_013158	TCG	2	6	2861617	2861622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053847
68056	NC_013158	GTGA	2	8	2861634	2861641	25 %	25 %	50 %	0 %	257053847
68057	NC_013158	GTC	2	6	2861721	2861726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053847
68058	NC_013158	TCG	2	6	2861728	2861733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053847
68059	NC_013158	TC	3	6	2861765	2861770	0 %	50 %	0 %	50 %	257053847
68060	NC_013158	GAC	2	6	2861775	2861780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053847
68061	NC_013158	TCG	2	6	2861871	2861876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053847
68062	NC_013158	CAC	2	6	2861884	2861889	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257053847
68063	NC_013158	AC	3	6	2861928	2861933	50 %	0 %	0 %	50 %	257053847
68064	NC_013158	CGAA	2	8	2861938	2861945	50 %	0 %	25 %	25 %	257053847
68065	NC_013158	ACCC	2	8	2861987	2861994	25 %	0 %	0 %	75 %	257053847
68066	NC_013158	CAA	2	6	2862007	2862012	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257053847
68067	NC_013158	CCG	2	6	2862037	2862042	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257053847
68068	NC_013158	CGA	2	6	2862109	2862114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053847
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68070	NC_013158	G	6	6	2862289	2862294	0 %	0 %	100 %	0 %	257053847
68071	NC_013158	CGT	2	6	2862326	2862331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053847
68072	NC_013158	GAC	2	6	2862351	2862356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053847
68073	NC_013158	GCTCG	2	10	2862386	2862395	0 %	20 %	40 %	40 %	257053847
68074	NC_013158	CGA	2	6	2862414	2862419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053847
68075	NC_013158	AG	3	6	2862442	2862447	50 %	0 %	50 %	0 %	257053848
68076	NC_013158	GAT	2	6	2862637	2862642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257053848
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68078	NC_013158	GCC	2	6	2862940	2862945	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257053849
68079	NC_013158	ACG	2	6	2862973	2862978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053849
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68082	NC_013158	GC	3	6	2863079	2863084	0 %	0 %	50 %	50 %	257053849
68083	NC_013158	GAAC	2	8	2863153	2863160	50 %	0 %	25 %	25 %	257053850
68084	NC_013158	GTC	2	6	2863163	2863168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053850
68085	NC_013158	GGC	2	6	2863177	2863182	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257053850
68086	NC_013158	CGT	2	6	2863189	2863194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053850
68087	NC_013158	TCGT	2	8	2863218	2863225	0 %	50 %	25 %	25 %	257053850
68088	NC_013158	CCA	2	6	2863242	2863247	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257053850
68089	NC_013158	TGGC	2	8	2863293	2863300	0 %	25 %	50 %	25 %	257053851
68090	NC_013158	TCG	3	9	2863316	2863324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053851
68091	NC_013158	CGA	2	6	2863332	2863337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053851
68092	NC_013158	TCG	2	6	2863358	2863363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053851
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68096	NC_013158	TC	3	6	2863512	2863517	0 %	50 %	0 %	50 %	257053851
68097	NC_013158	ACC	2	6	2863535	2863540	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257053851
68098	NC_013158	GAC	2	6	2863624	2863629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053851
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68100	NC_013158	CACGG	2	10	2863705	2863714	20 %	0 %	40 %	40 %	257053851
68101	NC_013158	AGAC	2	8	2863727	2863734	50 %	0 %	25 %	25 %	257053851
68102	NC_013158	TCG	2	6	2863760	2863765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053851
68103	NC_013158	GGC	2	6	2863767	2863772	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257053851
68104	NC_013158	ACGTCA	2	12	2863796	2863807	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	257053851
68105	NC_013158	CGG	2	6	2864015	2864020	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257053851
68106	NC_013158	GAA	2	6	2864026	2864031	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257053851
68107	NC_013158	CCG	2	6	2864042	2864047	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257053851
68108	NC_013158	ACC	2	6	2864051	2864056	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257053851
68109	NC_013158	ACC	2	6	2864065	2864070	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257053851
68110	NC_013158	GT	3	6	2864097	2864102	0 %	50 %	50 %	0 %	257053852
68111	NC_013158	AGA	2	6	2864207	2864212	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257053852
68112	NC_013158	ACG	2	6	2864243	2864248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053852
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68115	NC_013158	GAA	2	6	2864381	2864386	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257053853
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68117	NC_013158	TC	3	6	2864518	2864523	0 %	50 %	0 %	50 %	257053853
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68218	NC_013158	TCGAT	2	10	2868393	2868402	20 %	40 %	20 %	20 %	257053857
68219	NC_013158	CA	3	6	2868403	2868408	50 %	0 %	0 %	50 %	257053857
68220	NC_013158	CGA	3	9	2868475	2868483	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053857
68221	NC_013158	CGA	2	6	2868493	2868498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053857
68222	NC_013158	GTC	2	6	2868564	2868569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68223	NC_013158	T	6	6	2868620	2868625	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
68224	NC_013158	ACA	2	6	2868666	2868671	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257053858
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68226	NC_013158	TCG	2	6	2868813	2868818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053858
68227	NC_013158	CGGCG	2	10	2868874	2868883	0 %	0 %	60 %	40 %	257053858
68228	NC_013158	AGG	2	6	2868939	2868944	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257053858
68229	NC_013158	CGC	2	6	2868946	2868951	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257053858
68230	NC_013158	CCT	2	6	2869009	2869014	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257053858
68231	NC_013158	GGCGA	2	10	2869034	2869043	20 %	0 %	60 %	20 %	257053858
68232	NC_013158	ACG	2	6	2869055	2869060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053858
68233	NC_013158	GGCG	2	8	2869069	2869076	0 %	0 %	75 %	25 %	257053858
68234	NC_013158	GCC	2	6	2869147	2869152	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257053858
68235	NC_013158	CGC	2	6	2869173	2869178	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257053858
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68237	NC_013158	TCG	2	6	2869215	2869220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053858
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68241	NC_013158	CGC	2	6	2869300	2869305	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257053858
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68243	NC_013158	CGGG	2	8	2869360	2869367	0 %	0 %	75 %	25 %	257053858
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68249	NC_013158	CGT	2	6	2869716	2869721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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68254	NC_013158	CGG	2	6	2869940	2869945	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257053860
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68320	NC_013158	GGCT	2	8	2872946	2872953	0 %	25 %	50 %	25 %	257053864
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68329	NC_013158	TCG	2	6	2873214	2873219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053864
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68331	NC_013158	CGT	2	6	2873386	2873391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053864
68332	NC_013158	GTC	2	6	2873515	2873520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053864
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68335	NC_013158	GGCT	2	8	2873594	2873601	0 %	25 %	50 %	25 %	257053864
68336	NC_013158	CGT	2	6	2873602	2873607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053864
68337	NC_013158	C	6	6	2873622	2873627	0 %	0 %	0 %	100 %	257053864
68338	NC_013158	CAG	2	6	2873674	2873679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053864
68339	NC_013158	CAG	2	6	2873803	2873808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053864
68340	NC_013158	CGG	2	6	2873818	2873823	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257053864
68341	NC_013158	TCG	2	6	2873865	2873870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053864
68342	NC_013158	GTC	2	6	2873885	2873890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053864
68343	NC_013158	AGT	2	6	2873895	2873900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257053864
68344	NC_013158	TCG	2	6	2873916	2873921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053864
68345	NC_013158	CGT	2	6	2873923	2873928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053864
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68347	NC_013158	AG	3	6	2874056	2874061	50 %	0 %	50 %	0 %	257053864
68348	NC_013158	TCG	2	6	2874105	2874110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053864
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68465	NC_013158	CGT	2	6	2879291	2879296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053869
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