MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halorhabdus utahensis DSM 12940 chromosome

Total Repeats: 74047

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
63001	NC_013158	CAT	2	6	2646302	2646307	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257053643
63002	NC_013158	TCG	2	6	2646321	2646326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053643
63003	NC_013158	CTG	2	6	2646344	2646349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053643
63004	NC_013158	TCGG	2	8	2646415	2646422	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
63005	NC_013158	TCGA	2	8	2646425	2646432	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
63006	NC_013158	TCC	2	6	2646471	2646476	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257053644
63007	NC_013158	GGT	2	6	2646501	2646506	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257053644
63008	NC_013158	TCT	2	6	2646541	2646546	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257053644
63009	NC_013158	GCG	2	6	2646559	2646564	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257053644
63010	NC_013158	CGT	2	6	2646620	2646625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053644
63011	NC_013158	GCG	2	6	2646633	2646638	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257053644
63012	NC_013158	AGC	2	6	2646639	2646644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053644
63013	NC_013158	GCCG	2	8	2646695	2646702	0 %	0 %	50 %	50 %	257053644
63014	NC_013158	ATC	2	6	2646705	2646710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257053644
63015	NC_013158	GTC	2	6	2646782	2646787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053644
63016	NC_013158	CGATC	2	10	2646793	2646802	20 %	20 %	20 %	40 %	257053644
63017	NC_013158	GACC	2	8	2646840	2646847	25 %	0 %	25 %	50 %	257053644
63018	NC_013158	CT	3	6	2646894	2646899	0 %	50 %	0 %	50 %	257053644
63019	NC_013158	CTC	2	6	2646911	2646916	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257053644
63020	NC_013158	AGTC	2	8	2646925	2646932	25 %	25 %	25 %	25 %	257053644
63021	NC_013158	GAAGTC	2	12	2646944	2646955	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	257053644
63022	NC_013158	CGA	2	6	2646982	2646987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053644
63023	NC_013158	GGA	2	6	2647000	2647005	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257053644
63024	NC_013158	GAT	2	6	2647067	2647072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257053644
63025	NC_013158	CTG	2	6	2647073	2647078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053644
63026	NC_013158	CGC	2	6	2647102	2647107	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257053644
63027	NC_013158	GAT	2	6	2647241	2647246	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257053644
63028	NC_013158	GGA	2	6	2647255	2647260	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257053644
63029	NC_013158	CGT	2	6	2647309	2647314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053644
63030	NC_013158	CGA	2	6	2647366	2647371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053644
63031	NC_013158	CG	3	6	2647385	2647390	0 %	0 %	50 %	50 %	257053644
63032	NC_013158	TCG	2	6	2647431	2647436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053644
63033	NC_013158	CGT	2	6	2647447	2647452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053644
63034	NC_013158	CGA	2	6	2647510	2647515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053644
63035	NC_013158	TGGTC	2	10	2647609	2647618	0 %	40 %	40 %	20 %	257053644
63036	NC_013158	TCG	2	6	2647623	2647628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053644
63037	NC_013158	TCA	2	6	2647659	2647664	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257053644
63038	NC_013158	CAG	2	6	2647673	2647678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053644
63039	NC_013158	GGA	2	6	2647684	2647689	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257053644
63040	NC_013158	GCA	2	6	2647696	2647701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053644
63041	NC_013158	GTA	2	6	2647781	2647786	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257053644
63042	NC_013158	CGT	2	6	2647882	2647887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053644
63043	NC_013158	CGGC	2	8	2647894	2647901	0 %	0 %	50 %	50 %	257053644
63044	NC_013158	CGG	2	6	2647943	2647948	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257053644
63045	NC_013158	CCGG	2	8	2647957	2647964	0 %	0 %	50 %	50 %	257053644
63046	NC_013158	TGA	2	6	2647987	2647992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257053644
63047	NC_013158	CAG	2	6	2648021	2648026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053644
63048	NC_013158	TCGT	2	8	2648036	2648043	0 %	50 %	25 %	25 %	257053644
63049	NC_013158	CGA	2	6	2648054	2648059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053644
63050	NC_013158	AGG	2	6	2648082	2648087	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257053644
63051	NC_013158	CGG	3	9	2648091	2648099	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257053644
63052	NC_013158	GGA	2	6	2648125	2648130	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257053644
63053	NC_013158	CGA	2	6	2648134	2648139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053644
63054	NC_013158	CGG	2	6	2648304	2648309	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257053645
63055	NC_013158	CTC	2	6	2648343	2648348	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257053645
63056	NC_013158	GTCG	2	8	2648364	2648371	0 %	25 %	50 %	25 %	257053645
63057	NC_013158	GTGC	2	8	2648419	2648426	0 %	25 %	50 %	25 %	257053645
63058	NC_013158	GGT	2	6	2648583	2648588	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
63059	NC_013158	CTCG	2	8	2648639	2648646	0 %	25 %	25 %	50 %	257053646
63060	NC_013158	CGG	2	6	2648679	2648684	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257053646
63061	NC_013158	TCG	2	6	2648697	2648702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053646
63062	NC_013158	GC	3	6	2648704	2648709	0 %	0 %	50 %	50 %	257053646
63063	NC_013158	GAG	2	6	2648711	2648716	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257053646
63064	NC_013158	TCCG	2	8	2648745	2648752	0 %	25 %	25 %	50 %	257053646
63065	NC_013158	CGA	2	6	2648764	2648769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053646
63066	NC_013158	CGC	2	6	2648838	2648843	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257053646
63067	NC_013158	TCG	2	6	2648865	2648870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053646
63068	NC_013158	GAC	2	6	2648873	2648878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053646
63069	NC_013158	CTCA	2	8	2648966	2648973	25 %	25 %	0 %	50 %	257053646
63070	NC_013158	GCG	2	6	2649011	2649016	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257053646
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63074	NC_013158	AGAACG	2	12	2649186	2649197	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	257053646
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63078	NC_013158	GTC	2	6	2649329	2649334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053646
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63082	NC_013158	CGC	2	6	2649526	2649531	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257053646
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63084	NC_013158	CGA	2	6	2649559	2649564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053646
63085	NC_013158	TGT	2	6	2649576	2649581	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63086	NC_013158	GTCCG	2	10	2649590	2649599	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
63087	NC_013158	ATG	2	6	2649626	2649631	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63088	NC_013158	TATG	2	8	2649641	2649648	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
63089	NC_013158	CGAT	2	8	2649658	2649665	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
63090	NC_013158	TAT	2	6	2649764	2649769	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63091	NC_013158	CGC	2	6	2649842	2649847	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257053647
63092	NC_013158	GAG	2	6	2649905	2649910	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257053647
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63099	NC_013158	TGA	2	6	2650245	2650250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257053647
63100	NC_013158	GAC	2	6	2650304	2650309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053647
63101	NC_013158	TCGAGA	2	12	2650317	2650328	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	257053647
63102	NC_013158	CTC	2	6	2650367	2650372	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257053647
63103	NC_013158	CAG	2	6	2650382	2650387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053647
63104	NC_013158	ACG	2	6	2650407	2650412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053647
63105	NC_013158	GAG	3	9	2650439	2650447	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257053647
63106	NC_013158	GCA	2	6	2650513	2650518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053647
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63108	NC_013158	ATG	2	6	2650541	2650546	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257053647
63109	NC_013158	ACG	2	6	2650767	2650772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053647
63110	NC_013158	GCCGC	2	10	2650778	2650787	0 %	0 %	40 %	60 %	257053647
63111	NC_013158	CACG	2	8	2650819	2650826	25 %	0 %	25 %	50 %	257053647
63112	NC_013158	CGT	2	6	2650843	2650848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053647
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63115	NC_013158	GTGG	2	8	2650931	2650938	0 %	25 %	75 %	0 %	257053647
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63226	NC_013158	CAG	2	6	2655907	2655912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053650
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63228	NC_013158	CGA	2	6	2655996	2656001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053650
63229	NC_013158	GAT	2	6	2656002	2656007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257053650
63230	NC_013158	CGA	2	6	2656008	2656013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053650
63231	NC_013158	GCG	2	6	2656118	2656123	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257053651
63232	NC_013158	ACC	2	6	2656124	2656129	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257053651
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63234	NC_013158	GAT	2	6	2656150	2656155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257053651
63235	NC_013158	GTG	2	6	2656175	2656180	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257053651
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63241	NC_013158	CTC	2	6	2656371	2656376	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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63343	NC_013158	GGC	2	6	2660523	2660528	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257053657
63344	NC_013158	CGA	2	6	2660530	2660535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053657
63345	NC_013158	AGG	2	6	2660556	2660561	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257053657
63346	NC_013158	TCG	2	6	2660580	2660585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053657
63347	NC_013158	CGC	2	6	2660587	2660592	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257053657
63348	NC_013158	CGCC	2	8	2660632	2660639	0 %	0 %	25 %	75 %	257053657
63349	NC_013158	CGC	2	6	2660644	2660649	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257053657
63350	NC_013158	TCCT	2	8	2660651	2660658	0 %	50 %	0 %	50 %	257053657
63351	NC_013158	GGGGC	2	10	2660688	2660697	0 %	0 %	80 %	20 %	257053657
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63353	NC_013158	G	6	6	2660788	2660793	0 %	0 %	100 %	0 %	257053657
63354	NC_013158	CGG	2	6	2660830	2660835	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257053657
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63357	NC_013158	GAG	2	6	2660988	2660993	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257053657
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63361	NC_013158	CT	3	6	2661252	2661257	0 %	50 %	0 %	50 %	257053658
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63365	NC_013158	ACT	2	6	2661353	2661358	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63366	NC_013158	TGAC	2	8	2661382	2661389	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
63367	NC_013158	CGGC	2	8	2661394	2661401	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
63368	NC_013158	CGA	2	6	2661534	2661539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053659
63369	NC_013158	CGA	2	6	2661585	2661590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053659
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63375	NC_013158	CGA	2	6	2661905	2661910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053660
63376	NC_013158	CTG	2	6	2661995	2662000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63377	NC_013158	ATC	2	6	2662062	2662067	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63378	NC_013158	CA	3	6	2662121	2662126	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
63379	NC_013158	CTC	2	6	2662138	2662143	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
63380	NC_013158	CGC	2	6	2662193	2662198	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
63381	NC_013158	GGT	2	6	2662199	2662204	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
63382	NC_013158	GCCAT	2	10	2662241	2662250	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
63383	NC_013158	CAG	2	6	2662273	2662278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63384	NC_013158	AC	3	6	2662331	2662336	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
63385	NC_013158	ACGA	2	8	2662410	2662417	50 %	0 %	25 %	25 %	257053661
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63392	NC_013158	CGA	2	6	2662756	2662761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053661
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63418	NC_013158	CGCGA	2	10	2663748	2663757	20 %	0 %	40 %	40 %	257053662
63419	NC_013158	GA	3	6	2663756	2663761	50 %	0 %	50 %	0 %	257053662
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63422	NC_013158	GTC	2	6	2663935	2663940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053663
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63434	NC_013158	GCCG	2	8	2664338	2664345	0 %	0 %	50 %	50 %	257053663
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63437	NC_013158	GCGA	2	8	2664436	2664443	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
63438	NC_013158	CGT	2	6	2664455	2664460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63439	NC_013158	CAA	2	6	2664495	2664500	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63440	NC_013158	GACACT	2	12	2664554	2664565	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
63441	NC_013158	ATCG	3	12	2664634	2664645	25 %	25 %	25 %	25 %	257053664
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63443	NC_013158	CG	3	6	2664686	2664691	0 %	0 %	50 %	50 %	257053664
63444	NC_013158	CGT	2	6	2664693	2664698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053664
63445	NC_013158	TGAC	2	8	2664707	2664714	25 %	25 %	25 %	25 %	257053664
63446	NC_013158	CGA	2	6	2664750	2664755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053664
63447	NC_013158	GAA	2	6	2664792	2664797	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257053664
63448	NC_013158	CAT	2	6	2664801	2664806	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257053664
63449	NC_013158	GTT	2	6	2664822	2664827	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257053664
63450	NC_013158	TCG	2	6	2664837	2664842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053664
63451	NC_013158	GAC	2	6	2664847	2664852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053664
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63453	NC_013158	GGC	2	6	2664918	2664923	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257053664
63454	NC_013158	ATCA	2	8	2664925	2664932	50 %	25 %	0 %	25 %	257053664
63455	NC_013158	CCG	2	6	2664975	2664980	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257053664
63456	NC_013158	TGAC	2	8	2665091	2665098	25 %	25 %	25 %	25 %	257053664
63457	NC_013158	GAG	2	6	2665183	2665188	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257053664
63458	NC_013158	ATCG	2	8	2665189	2665196	25 %	25 %	25 %	25 %	257053664
63459	NC_013158	GCT	2	6	2665213	2665218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053664
63460	NC_013158	CGG	2	6	2665256	2665261	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257053664
63461	NC_013158	GCT	2	6	2665272	2665277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053664
63462	NC_013158	GAC	2	6	2665291	2665296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053664
63463	NC_013158	GGA	2	6	2665308	2665313	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257053664
63464	NC_013158	TC	3	6	2665329	2665334	0 %	50 %	0 %	50 %	257053664
63465	NC_013158	CGT	2	6	2665350	2665355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053664
63466	NC_013158	GT	3	6	2665354	2665359	0 %	50 %	50 %	0 %	257053664
63467	NC_013158	CTG	2	6	2665444	2665449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053664
63468	NC_013158	GAG	2	6	2665489	2665494	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257053664
63469	NC_013158	CGA	2	6	2665744	2665749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053665
63470	NC_013158	CG	3	6	2665901	2665906	0 %	0 %	50 %	50 %	257053665
63471	NC_013158	TCGACG	2	12	2665986	2665997	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	257053665
63472	NC_013158	CCT	2	6	2666014	2666019	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257053665
63473	NC_013158	CGG	2	6	2666029	2666034	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257053665
63474	NC_013158	GAC	2	6	2666104	2666109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053665
63475	NC_013158	CCG	2	6	2666130	2666135	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257053665
63476	NC_013158	GCC	2	6	2666168	2666173	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257053665
63477	NC_013158	CGA	2	6	2666203	2666208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053665
63478	NC_013158	GGAC	2	8	2666230	2666237	25 %	0 %	50 %	25 %	257053665
63479	NC_013158	CGC	2	6	2666265	2666270	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257053665
63480	NC_013158	GCCC	2	8	2666310	2666317	0 %	0 %	25 %	75 %	257053665
63481	NC_013158	TCA	2	6	2666334	2666339	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257053665
63482	NC_013158	CGA	2	6	2666365	2666370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053665
63483	NC_013158	GTCT	2	8	2666450	2666457	0 %	50 %	25 %	25 %	257053665
63484	NC_013158	AGG	3	9	2666496	2666504	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257053665
63485	NC_013158	CTT	2	6	2666541	2666546	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257053666
63486	NC_013158	TCA	2	6	2666582	2666587	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257053666
63487	NC_013158	CTG	2	6	2666602	2666607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053666
63488	NC_013158	TCG	2	6	2666612	2666617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053666
63489	NC_013158	GTC	2	6	2666620	2666625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053666
63490	NC_013158	GTC	2	6	2666629	2666634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053666
63491	NC_013158	CGA	2	6	2666664	2666669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053666
63492	NC_013158	TCG	2	6	2666684	2666689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053666
63493	NC_013158	ACG	2	6	2666711	2666716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053666
63494	NC_013158	GTC	3	9	2666752	2666760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053666
63495	NC_013158	TGC	2	6	2666775	2666780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053666
63496	NC_013158	CGAT	2	8	2666933	2666940	25 %	25 %	25 %	25 %	257053666
63497	NC_013158	GAG	2	6	2666944	2666949	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257053666
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63500	NC_013158	CGG	2	6	2667113	2667118	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257053666

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