MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halorhabdus utahensis DSM 12940 chromosome

Total Repeats: 74047

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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62002	NC_013158	CGT	2	6	2603840	2603845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62003	NC_013158	TG	3	6	2603948	2603953	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
62004	NC_013158	CGC	2	6	2604065	2604070	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257053602
62005	NC_013158	TCA	2	6	2604073	2604078	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257053602
62006	NC_013158	CTT	2	6	2604088	2604093	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257053602
62007	NC_013158	GTCG	2	8	2604107	2604114	0 %	25 %	50 %	25 %	257053602
62008	NC_013158	GC	3	6	2604125	2604130	0 %	0 %	50 %	50 %	257053602
62009	NC_013158	CGC	2	6	2604139	2604144	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257053602
62010	NC_013158	ACG	4	12	2604168	2604179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053602
62011	NC_013158	ACCC	2	8	2604201	2604208	25 %	0 %	0 %	75 %	257053602
62012	NC_013158	TTC	2	6	2604302	2604307	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257053602
62013	NC_013158	CGG	2	6	2604361	2604366	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257053602
62014	NC_013158	TCG	2	6	2604435	2604440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053602
62015	NC_013158	ACCC	2	8	2604450	2604457	25 %	0 %	0 %	75 %	257053602
62016	NC_013158	GGC	2	6	2604491	2604496	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257053602
62017	NC_013158	ACG	3	9	2604504	2604512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053602
62018	NC_013158	CGGC	2	8	2604532	2604539	0 %	0 %	50 %	50 %	257053602
62019	NC_013158	TCG	2	6	2604579	2604584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053602
62020	NC_013158	CGT	2	6	2604598	2604603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053602
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62032	NC_013158	GA	3	6	2605153	2605158	50 %	0 %	50 %	0 %	257053602
62033	NC_013158	C	6	6	2605268	2605273	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
62034	NC_013158	GAG	2	6	2605302	2605307	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257053603
62035	NC_013158	GGCC	2	8	2605370	2605377	0 %	0 %	50 %	50 %	257053603
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62038	NC_013158	CGT	2	6	2605544	2605549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053603
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62042	NC_013158	CGG	2	6	2605612	2605617	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257053603
62043	NC_013158	CGA	2	6	2605669	2605674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053603
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62050	NC_013158	GC	3	6	2605918	2605923	0 %	0 %	50 %	50 %	257053603
62051	NC_013158	G	6	6	2605927	2605932	0 %	0 %	100 %	0 %	257053603
62052	NC_013158	CGG	2	6	2605940	2605945	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257053603
62053	NC_013158	GC	4	8	2606068	2606075	0 %	0 %	50 %	50 %	257053603
62054	NC_013158	CGC	3	9	2606102	2606110	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257053603
62055	NC_013158	CGC	2	6	2606141	2606146	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257053603
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62061	NC_013158	AAC	2	6	2606329	2606334	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257053603
62062	NC_013158	CCGC	2	8	2606354	2606361	0 %	0 %	25 %	75 %	257053603
62063	NC_013158	TCG	2	6	2606371	2606376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053603
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62065	NC_013158	CGA	2	6	2606405	2606410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053603
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62082	NC_013158	GATCG	2	10	2607282	2607291	20 %	20 %	40 %	20 %	257053604
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62088	NC_013158	CGA	2	6	2607673	2607678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053605
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62103	NC_013158	TCGAC	2	10	2608429	2608438	20 %	20 %	20 %	40 %	257053605
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62106	NC_013158	CCGCC	2	10	2608555	2608564	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
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62116	NC_013158	GTC	2	6	2609051	2609056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053606
62117	NC_013158	GTA	2	6	2609081	2609086	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257053606
62118	NC_013158	GTCG	2	8	2609096	2609103	0 %	25 %	50 %	25 %	257053606
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62145	NC_013158	TA	3	6	2610059	2610064	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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62177	NC_013158	CGT	2	6	2611338	2611343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053608
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62209	NC_013158	GA	4	8	2612745	2612752	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
62210	NC_013158	TTA	2	6	2612808	2612813	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62211	NC_013158	TAT	2	6	2612896	2612901	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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62215	NC_013158	C	6	6	2613072	2613077	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
62216	NC_013158	GTT	2	6	2613208	2613213	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257053611
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62219	NC_013158	CG	4	8	2613243	2613250	0 %	0 %	50 %	50 %	257053611
62220	NC_013158	GCCG	2	8	2613286	2613293	0 %	0 %	50 %	50 %	257053611
62221	NC_013158	GTT	2	6	2613306	2613311	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257053611
62222	NC_013158	GATC	2	8	2613327	2613334	25 %	25 %	25 %	25 %	257053611
62223	NC_013158	CGA	2	6	2613363	2613368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053611
62224	NC_013158	GTC	2	6	2613379	2613384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053611
62225	NC_013158	CGC	2	6	2613465	2613470	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257053611
62226	NC_013158	TCA	2	6	2613471	2613476	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257053611
62227	NC_013158	TCA	2	6	2613483	2613488	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257053611
62228	NC_013158	GAA	2	6	2613505	2613510	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257053611
62229	NC_013158	GTC	2	6	2613523	2613528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053611
62230	NC_013158	TCGTC	2	10	2613533	2613542	0 %	40 %	20 %	40 %	257053611
62231	NC_013158	GATA	2	8	2613550	2613557	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
62232	NC_013158	GA	3	6	2613559	2613564	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
62233	NC_013158	CT	3	6	2613605	2613610	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
62234	NC_013158	AT	3	6	2613659	2613664	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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62466	NC_013158	ACCT	2	8	2623032	2623039	25 %	25 %	0 %	50 %	257053620
62467	NC_013158	GGA	2	6	2623040	2623045	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257053620
62468	NC_013158	TCG	2	6	2623108	2623113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053620
62469	NC_013158	TCC	2	6	2623147	2623152	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257053620
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62500	NC_013158	CCGGC	2	10	2624355	2624364	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding

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