MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halorhabdus utahensis DSM 12940 chromosome

Total Repeats: 74047

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
61501	NC_013158	GCC	2	6	2582473	2582478	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
61502	NC_013158	GTC	2	6	2582596	2582601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053576
61503	NC_013158	ACGA	2	8	2582656	2582663	50 %	0 %	25 %	25 %	257053576
61504	NC_013158	CGGA	2	8	2582681	2582688	25 %	0 %	50 %	25 %	257053576
61505	NC_013158	CGT	2	6	2582712	2582717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053576
61506	NC_013158	GAC	2	6	2582794	2582799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053576
61507	NC_013158	AGC	2	6	2582819	2582824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053576
61508	NC_013158	GAC	2	6	2582931	2582936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053576
61509	NC_013158	CTC	2	6	2582944	2582949	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257053576
61510	NC_013158	GCT	2	6	2582952	2582957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053576
61511	NC_013158	GCC	2	6	2583001	2583006	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257053576
61512	NC_013158	CGG	2	6	2583016	2583021	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257053576
61513	NC_013158	ACG	2	6	2583053	2583058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053576
61514	NC_013158	CTC	2	6	2583061	2583066	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257053576
61515	NC_013158	TCG	2	6	2583170	2583175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053576
61516	NC_013158	GGAC	2	8	2583194	2583201	25 %	0 %	50 %	25 %	257053576
61517	NC_013158	CCG	2	6	2583341	2583346	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257053576
61518	NC_013158	GAG	2	6	2583352	2583357	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257053576
61519	NC_013158	GCC	2	6	2583394	2583399	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257053576
61520	NC_013158	TCGC	2	8	2583443	2583450	0 %	25 %	25 %	50 %	257053576
61521	NC_013158	TCG	2	6	2583469	2583474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053576
61522	NC_013158	GTC	2	6	2583475	2583480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053576
61523	NC_013158	GCCG	2	8	2583568	2583575	0 %	0 %	50 %	50 %	257053577
61524	NC_013158	CTGG	2	8	2583601	2583608	0 %	25 %	50 %	25 %	257053577
61525	NC_013158	ACG	2	6	2583677	2583682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053577
61526	NC_013158	CCG	2	6	2583691	2583696	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257053577
61527	NC_013158	GTG	2	6	2583705	2583710	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257053577
61528	NC_013158	CGC	2	6	2583747	2583752	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257053577
61529	NC_013158	CGC	2	6	2583804	2583809	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257053577
61530	NC_013158	CGT	2	6	2583830	2583835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053577
61531	NC_013158	GT	3	6	2583858	2583863	0 %	50 %	50 %	0 %	257053577
61532	NC_013158	GAC	2	6	2583865	2583870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053577
61533	NC_013158	CCT	2	6	2583873	2583878	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257053577
61534	NC_013158	TCG	2	6	2583948	2583953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053577
61535	NC_013158	GAT	2	6	2584042	2584047	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257053577
61536	NC_013158	GTC	2	6	2584048	2584053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053577
61537	NC_013158	GAC	2	6	2584063	2584068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053577
61538	NC_013158	GT	3	6	2584105	2584110	0 %	50 %	50 %	0 %	257053577
61539	NC_013158	GAC	2	6	2584111	2584116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053577
61540	NC_013158	CGT	2	6	2584125	2584130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053577
61541	NC_013158	CGC	2	6	2584200	2584205	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257053577
61542	NC_013158	CGT	2	6	2584228	2584233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053577
61543	NC_013158	TCG	3	9	2584292	2584300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053577
61544	NC_013158	ACTCTG	2	12	2584387	2584398	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	257053577
61545	NC_013158	TCG	2	6	2584436	2584441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053577
61546	NC_013158	CTCG	2	8	2584465	2584472	0 %	25 %	25 %	50 %	257053577
61547	NC_013158	GTC	2	6	2584526	2584531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053577
61548	NC_013158	TCT	2	6	2584542	2584547	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257053577
61549	NC_013158	TTCGAG	2	12	2584549	2584560	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	257053577
61550	NC_013158	CTGG	2	8	2584593	2584600	0 %	25 %	50 %	25 %	257053577
61551	NC_013158	C	6	6	2584622	2584627	0 %	0 %	0 %	100 %	257053577
61552	NC_013158	CCA	2	6	2584646	2584651	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257053577
61553	NC_013158	CGC	3	9	2584670	2584678	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257053577
61554	NC_013158	CG	4	8	2584687	2584694	0 %	0 %	50 %	50 %	257053577
61555	NC_013158	CCA	2	6	2584708	2584713	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257053577
61556	NC_013158	AGC	2	6	2584751	2584756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053577
61557	NC_013158	CCCG	2	8	2584771	2584778	0 %	0 %	25 %	75 %	257053577
61558	NC_013158	C	6	6	2584793	2584798	0 %	0 %	0 %	100 %	257053577
61559	NC_013158	TCG	2	6	2584809	2584814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053577
61560	NC_013158	CGA	2	6	2584887	2584892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053577
61561	NC_013158	GCCG	2	8	2584894	2584901	0 %	0 %	50 %	50 %	257053577
61562	NC_013158	CGA	2	6	2584929	2584934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053577
61563	NC_013158	GGC	2	6	2584945	2584950	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257053577
61564	NC_013158	GCCGC	2	10	2585049	2585058	0 %	0 %	40 %	60 %	257053577
61565	NC_013158	CA	3	6	2585133	2585138	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
61566	NC_013158	TCGC	2	8	2585189	2585196	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
61567	NC_013158	CGA	2	6	2585231	2585236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61568	NC_013158	CGT	2	6	2585264	2585269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61569	NC_013158	AGC	2	6	2585347	2585352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053578
61570	NC_013158	GAC	2	6	2585358	2585363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053578
61571	NC_013158	TTG	3	9	2585383	2585391	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257053578
61572	NC_013158	CGT	2	6	2585418	2585423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053578
61573	NC_013158	GTT	2	6	2585424	2585429	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257053578
61574	NC_013158	CA	3	6	2585435	2585440	50 %	0 %	0 %	50 %	257053578
61575	NC_013158	CCT	2	6	2585471	2585476	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257053578
61576	NC_013158	CACGAC	2	12	2585508	2585519	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	257053578
61577	NC_013158	CGT	2	6	2585537	2585542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053578
61578	NC_013158	CCGG	2	8	2585574	2585581	0 %	0 %	50 %	50 %	257053578
61579	NC_013158	GAG	2	6	2585644	2585649	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257053578
61580	NC_013158	CGG	2	6	2585693	2585698	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257053578
61581	NC_013158	GGTC	2	8	2585711	2585718	0 %	25 %	50 %	25 %	257053578
61582	NC_013158	TCT	2	6	2585786	2585791	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257053578
61583	NC_013158	TCG	2	6	2585827	2585832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053578
61584	NC_013158	CAG	2	6	2585841	2585846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053578
61585	NC_013158	CT	3	6	2585899	2585904	0 %	50 %	0 %	50 %	257053578
61586	NC_013158	CGT	2	6	2585912	2585917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053578
61587	NC_013158	CGT	2	6	2585927	2585932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053578
61588	NC_013158	TCG	3	9	2585947	2585955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053578
61589	NC_013158	CGT	2	6	2585969	2585974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053578
61590	NC_013158	GC	3	6	2585984	2585989	0 %	0 %	50 %	50 %	257053578
61591	NC_013158	CAC	2	6	2586000	2586005	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257053578
61592	NC_013158	CGG	2	6	2586017	2586022	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257053578
61593	NC_013158	GGC	2	6	2586030	2586035	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257053578
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61595	NC_013158	TGA	2	6	2586094	2586099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257053579
61596	NC_013158	GTTC	2	8	2586100	2586107	0 %	50 %	25 %	25 %	257053579
61597	NC_013158	GGC	2	6	2586155	2586160	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257053579
61598	NC_013158	TCG	2	6	2586184	2586189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053579
61599	NC_013158	GAC	2	6	2586218	2586223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053579
61600	NC_013158	TTC	2	6	2586237	2586242	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257053579
61601	NC_013158	TGA	2	6	2586298	2586303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257053579
61602	NC_013158	CGA	2	6	2586314	2586319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053579
61603	NC_013158	TCG	2	6	2586438	2586443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053579
61604	NC_013158	CTC	2	6	2586473	2586478	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257053579
61605	NC_013158	CGA	2	6	2586487	2586492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053579
61606	NC_013158	GGT	2	6	2586512	2586517	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257053579
61607	NC_013158	CTCGTA	2	12	2586533	2586544	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	257053579
61608	NC_013158	CGT	2	6	2586559	2586564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053579
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61611	NC_013158	CGGT	2	8	2586627	2586634	0 %	25 %	50 %	25 %	257053579
61612	NC_013158	CGA	2	6	2586643	2586648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053579
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61991	NC_013158	CGA	2	6	2603123	2603128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053601
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61999	NC_013158	CGT	2	6	2603657	2603662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053601
62000	NC_013158	CGT	2	6	2603678	2603683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053601

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