MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halorhabdus utahensis DSM 12940 chromosome

Total Repeats: 74047

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
61001	NC_013158	GCG	2	6	2561906	2561911	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257053552
61002	NC_013158	CGC	2	6	2562008	2562013	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257053552
61003	NC_013158	CGT	2	6	2562019	2562024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053552
61004	NC_013158	CGC	2	6	2562118	2562123	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257053552
61005	NC_013158	TCC	2	6	2562132	2562137	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257053552
61006	NC_013158	CCGA	2	8	2562179	2562186	25 %	0 %	25 %	50 %	257053552
61007	NC_013158	GTCG	2	8	2562191	2562198	0 %	25 %	50 %	25 %	257053552
61008	NC_013158	CGG	2	6	2562201	2562206	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257053552
61009	NC_013158	CGG	2	6	2562239	2562244	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257053552
61010	NC_013158	GAG	2	6	2562248	2562253	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257053552
61011	NC_013158	CTG	2	6	2562296	2562301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053552
61012	NC_013158	CGG	2	6	2562320	2562325	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257053552
61013	NC_013158	GTC	2	6	2562404	2562409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053552
61014	NC_013158	CGA	2	6	2562421	2562426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053552
61015	NC_013158	CGA	2	6	2562576	2562581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053552
61016	NC_013158	GAGC	2	8	2562601	2562608	25 %	0 %	50 %	25 %	257053552
61017	NC_013158	CG	3	6	2562652	2562657	0 %	0 %	50 %	50 %	257053552
61018	NC_013158	TCA	2	6	2562672	2562677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257053552
61019	NC_013158	GAT	2	6	2562691	2562696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257053552
61020	NC_013158	GCT	2	6	2562760	2562765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053552
61021	NC_013158	CAA	2	6	2562775	2562780	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257053552
61022	NC_013158	CACC	2	8	2562809	2562816	25 %	0 %	0 %	75 %	257053552
61023	NC_013158	GCC	2	6	2562887	2562892	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257053552
61024	NC_013158	GCCTC	2	10	2562932	2562941	0 %	20 %	20 %	60 %	257053552
61025	NC_013158	GAC	2	6	2562992	2562997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053552
61026	NC_013158	GCCC	2	8	2563068	2563075	0 %	0 %	25 %	75 %	257053552
61027	NC_013158	GGT	2	6	2563184	2563189	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257053552
61028	NC_013158	TGA	2	6	2563201	2563206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257053552
61029	NC_013158	TGG	2	6	2563386	2563391	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257053553
61030	NC_013158	G	6	6	2563405	2563410	0 %	0 %	100 %	0 %	257053553
61031	NC_013158	GCC	2	6	2563436	2563441	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257053553
61032	NC_013158	CGA	3	9	2563458	2563466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053553
61033	NC_013158	TGA	2	6	2563485	2563490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257053553
61034	NC_013158	GCT	2	6	2563522	2563527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053553
61035	NC_013158	GGC	2	6	2563582	2563587	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257053553
61036	NC_013158	CCG	2	6	2563606	2563611	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257053553
61037	NC_013158	CAC	2	6	2563633	2563638	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257053553
61038	NC_013158	CTG	2	6	2563649	2563654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053553
61039	NC_013158	TCG	2	6	2563656	2563661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053553
61040	NC_013158	CCT	2	6	2563668	2563673	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257053553
61041	NC_013158	CAG	2	6	2563688	2563693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053553
61042	NC_013158	GTCC	2	8	2563710	2563717	0 %	25 %	25 %	50 %	257053553
61043	NC_013158	CAC	2	6	2563789	2563794	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257053553
61044	NC_013158	GGGCTG	2	12	2563880	2563891	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	257053553
61045	NC_013158	GAC	2	6	2564030	2564035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053553
61046	NC_013158	GTC	2	6	2564071	2564076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61047	NC_013158	GTT	2	6	2564147	2564152	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61048	NC_013158	CCG	2	6	2564245	2564250	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257053554
61049	NC_013158	CGCA	2	8	2564267	2564274	25 %	0 %	25 %	50 %	257053554
61050	NC_013158	CGAG	2	8	2564314	2564321	25 %	0 %	50 %	25 %	257053554
61051	NC_013158	CCG	2	6	2564359	2564364	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257053554
61052	NC_013158	GCT	2	6	2564378	2564383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053554
61053	NC_013158	TGGA	2	8	2564386	2564393	25 %	25 %	50 %	0 %	257053554
61054	NC_013158	CGGC	2	8	2564407	2564414	0 %	0 %	50 %	50 %	257053554
61055	NC_013158	GGC	2	6	2564418	2564423	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257053554
61056	NC_013158	CGA	2	6	2564432	2564437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053554
61057	NC_013158	CGC	2	6	2564452	2564457	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257053554
61058	NC_013158	CGTCGA	2	12	2564480	2564491	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	257053554
61059	NC_013158	GGT	2	6	2564492	2564497	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257053554
61060	NC_013158	CGA	3	9	2564513	2564521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053554
61061	NC_013158	TGCGG	2	10	2564540	2564549	0 %	20 %	60 %	20 %	257053554
61062	NC_013158	ACG	2	6	2564550	2564555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053554
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61065	NC_013158	GTC	2	6	2564586	2564591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053554
61066	NC_013158	CG	3	6	2564603	2564608	0 %	0 %	50 %	50 %	257053554
61067	NC_013158	ACG	2	6	2564614	2564619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053554
61068	NC_013158	TCC	2	6	2564630	2564635	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
61069	NC_013158	TCC	2	6	2564789	2564794	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
61070	NC_013158	GAC	3	9	2564858	2564866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61071	NC_013158	GGCGT	2	10	2565024	2565033	0 %	20 %	60 %	20 %	257053555
61072	NC_013158	TGGTA	2	10	2565110	2565119	20 %	40 %	40 %	0 %	257053555
61073	NC_013158	TGA	2	6	2565167	2565172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257053555
61074	NC_013158	TGG	2	6	2565184	2565189	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257053555
61075	NC_013158	TGA	2	6	2565287	2565292	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257053555
61076	NC_013158	GAC	2	6	2565293	2565298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053555
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61079	NC_013158	ACC	2	6	2565671	2565676	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257053555
61080	NC_013158	GA	3	6	2565680	2565685	50 %	0 %	50 %	0 %	257053555
61081	NC_013158	CGA	3	9	2565698	2565706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053555
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61084	NC_013158	TCCG	2	8	2565786	2565793	0 %	25 %	25 %	50 %	257053555
61085	NC_013158	TGT	2	6	2565794	2565799	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257053555
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61088	NC_013158	TTG	2	6	2566050	2566055	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61089	NC_013158	TCG	2	6	2566074	2566079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61090	NC_013158	GTC	2	6	2566176	2566181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053556
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61100	NC_013158	GGCC	2	8	2566719	2566726	0 %	0 %	50 %	50 %	257053556
61101	NC_013158	GCC	2	6	2566816	2566821	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257053556
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61107	NC_013158	CG	3	6	2566969	2566974	0 %	0 %	50 %	50 %	257053556
61108	NC_013158	CGC	3	9	2566994	2567002	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257053556
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61111	NC_013158	GCTC	2	8	2567056	2567063	0 %	25 %	25 %	50 %	257053556
61112	NC_013158	TCGG	2	8	2567073	2567080	0 %	25 %	50 %	25 %	257053556
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61114	NC_013158	GGTC	2	8	2567096	2567103	0 %	25 %	50 %	25 %	257053556
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61118	NC_013158	GACG	2	8	2567243	2567250	25 %	0 %	50 %	25 %	257053556
61119	NC_013158	TGA	2	6	2567267	2567272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257053556
61120	NC_013158	CGT	2	6	2567295	2567300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053556
61121	NC_013158	CGA	2	6	2567321	2567326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053556
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61230	NC_013158	GTC	2	6	2571327	2571332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053560
61231	NC_013158	CGC	2	6	2571386	2571391	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257053560
61232	NC_013158	GTC	2	6	2571417	2571422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053560
61233	NC_013158	CGG	2	6	2571440	2571445	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257053560
61234	NC_013158	CGT	2	6	2571488	2571493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053560
61235	NC_013158	TG	3	6	2571534	2571539	0 %	50 %	50 %	0 %	257053561
61236	NC_013158	GACTC	2	10	2571550	2571559	20 %	20 %	20 %	40 %	257053561
61237	NC_013158	CGG	2	6	2571592	2571597	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257053561
61238	NC_013158	TCGCG	2	10	2571613	2571622	0 %	20 %	40 %	40 %	257053561
61239	NC_013158	GCG	3	9	2571620	2571628	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257053561
61240	NC_013158	TCGA	2	8	2571641	2571648	25 %	25 %	25 %	25 %	257053561
61241	NC_013158	CCCG	2	8	2571702	2571709	0 %	0 %	25 %	75 %	257053561
61242	NC_013158	GTG	2	6	2571779	2571784	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257053561
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61245	NC_013158	GCA	2	6	2571934	2571939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053561
61246	NC_013158	GCG	2	6	2571968	2571973	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257053561
61247	NC_013158	GTGAAC	2	12	2572019	2572030	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	257053561
61248	NC_013158	TCGG	2	8	2572066	2572073	0 %	25 %	50 %	25 %	257053561
61249	NC_013158	GGT	2	6	2572075	2572080	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257053561
61250	NC_013158	GAC	2	6	2572107	2572112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053562
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61257	NC_013158	CGA	2	6	2572467	2572472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053562
61258	NC_013158	CGG	2	6	2572500	2572505	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257053562
61259	NC_013158	GAC	3	9	2572506	2572514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053562
61260	NC_013158	GTC	2	6	2572557	2572562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053562
61261	NC_013158	CGAG	2	8	2572622	2572629	25 %	0 %	50 %	25 %	257053562
61262	NC_013158	GCTG	2	8	2572644	2572651	0 %	25 %	50 %	25 %	257053562
61263	NC_013158	CGA	2	6	2572672	2572677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053562
61264	NC_013158	CGG	2	6	2572755	2572760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257053562
61265	NC_013158	TTCG	2	8	2572812	2572819	0 %	50 %	25 %	25 %	257053562
61266	NC_013158	CGA	2	6	2572826	2572831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053562
61267	NC_013158	TC	3	6	2572890	2572895	0 %	50 %	0 %	50 %	257053562
61268	NC_013158	AC	3	6	2572932	2572937	50 %	0 %	0 %	50 %	257053562
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61272	NC_013158	CGG	2	6	2573030	2573035	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257053562
61273	NC_013158	CTG	2	6	2573068	2573073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053562
61274	NC_013158	GATCGT	2	12	2573088	2573099	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	257053563
61275	NC_013158	GGTC	2	8	2573108	2573115	0 %	25 %	50 %	25 %	257053563
61276	NC_013158	CGG	2	6	2573126	2573131	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257053563
61277	NC_013158	CGA	2	6	2573135	2573140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053563
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61280	NC_013158	GCC	2	6	2573271	2573276	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257053563
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61282	NC_013158	GTCC	2	8	2573372	2573379	0 %	25 %	25 %	50 %	257053563
61283	NC_013158	CG	3	6	2573408	2573413	0 %	0 %	50 %	50 %	257053563
61284	NC_013158	CGT	2	6	2573440	2573445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053563
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61288	NC_013158	CG	3	6	2573539	2573544	0 %	0 %	50 %	50 %	257053563
61289	NC_013158	CCT	2	6	2573591	2573596	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257053563
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61291	NC_013158	CGC	2	6	2573750	2573755	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257053563
61292	NC_013158	CGC	2	6	2573757	2573762	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257053563
61293	NC_013158	TCG	2	6	2573824	2573829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053563
61294	NC_013158	GAC	2	6	2573831	2573836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053563
61295	NC_013158	GAG	2	6	2573853	2573858	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257053563
61296	NC_013158	TGGAC	2	10	2573876	2573885	20 %	20 %	40 %	20 %	257053563
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61302	NC_013158	GTG	2	6	2574119	2574124	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257053564
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61304	NC_013158	TGG	2	6	2574174	2574179	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257053564
61305	NC_013158	CGGG	2	8	2574187	2574194	0 %	0 %	75 %	25 %	257053564
61306	NC_013158	CGG	2	6	2574218	2574223	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257053564
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61309	NC_013158	GC	4	8	2574338	2574345	0 %	0 %	50 %	50 %	257053564
61310	NC_013158	GGC	2	6	2574435	2574440	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257053564
61311	NC_013158	TCG	2	6	2574545	2574550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053564
61312	NC_013158	GAC	2	6	2574597	2574602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053564
61313	NC_013158	GCGAT	2	10	2574605	2574614	20 %	20 %	40 %	20 %	257053564
61314	NC_013158	CGT	2	6	2574615	2574620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053564
61315	NC_013158	CG	3	6	2574645	2574650	0 %	0 %	50 %	50 %	257053564
61316	NC_013158	GCG	2	6	2574682	2574687	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257053564
61317	NC_013158	GCGT	2	8	2574691	2574698	0 %	25 %	50 %	25 %	257053564
61318	NC_013158	GCC	2	6	2574747	2574752	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257053564
61319	NC_013158	ACC	2	6	2574787	2574792	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257053564
61320	NC_013158	AG	3	6	2574849	2574854	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
61321	NC_013158	CGA	2	6	2574877	2574882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053565
61322	NC_013158	CGA	2	6	2574894	2574899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053565
61323	NC_013158	GCA	2	6	2574911	2574916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053565
61324	NC_013158	CGA	2	6	2574918	2574923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053565
61325	NC_013158	CGA	2	6	2574925	2574930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053565
61326	NC_013158	GCG	2	6	2574933	2574938	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257053565
61327	NC_013158	CGC	2	6	2574985	2574990	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257053565
61328	NC_013158	GTG	2	6	2575018	2575023	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257053565
61329	NC_013158	GAC	2	6	2575042	2575047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053565
61330	NC_013158	TGCG	2	8	2575068	2575075	0 %	25 %	50 %	25 %	257053565
61331	NC_013158	TCC	2	6	2575101	2575106	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257053565
61332	NC_013158	TGGC	2	8	2575207	2575214	0 %	25 %	50 %	25 %	257053565
61333	NC_013158	GAC	2	6	2575226	2575231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053565
61334	NC_013158	GAC	2	6	2575238	2575243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053565
61335	NC_013158	CGC	2	6	2575249	2575254	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257053565
61336	NC_013158	GCA	2	6	2575265	2575270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053565
61337	NC_013158	TCG	2	6	2575290	2575295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053565
61338	NC_013158	ACG	2	6	2575319	2575324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053565
61339	NC_013158	CGG	2	6	2575474	2575479	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257053565
61340	NC_013158	CCT	2	6	2575516	2575521	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257053565
61341	NC_013158	GCCA	2	8	2575560	2575567	25 %	0 %	25 %	50 %	257053565
61342	NC_013158	GAG	2	6	2575590	2575595	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257053565
61343	NC_013158	TCA	2	6	2575607	2575612	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257053566
61344	NC_013158	ACG	2	6	2575650	2575655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053566
61345	NC_013158	GAGT	2	8	2575664	2575671	25 %	25 %	50 %	0 %	257053566
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61455	NC_013158	GACCAG	2	12	2580383	2580394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053572
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61457	NC_013158	CGA	2	6	2580587	2580592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61458	NC_013158	GGACG	2	10	2580673	2580682	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
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61462	NC_013158	CGA	2	6	2580760	2580765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053573
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61492	NC_013158	TCG	3	9	2582183	2582191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053575
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