MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halorhabdus utahensis DSM 12940 chromosome

Total Repeats: 74047

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
60501	NC_013158	ACC	2	6	2541460	2541465	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257053529
60502	NC_013158	CCA	2	6	2541508	2541513	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257053529
60503	NC_013158	GTC	2	6	2541517	2541522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053529
60504	NC_013158	TCG	2	6	2541560	2541565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053529
60505	NC_013158	CGA	2	6	2541582	2541587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053529
60506	NC_013158	CTC	2	6	2541610	2541615	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257053529
60507	NC_013158	CGA	2	6	2541687	2541692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053529
60508	NC_013158	TCG	2	6	2541713	2541718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053529
60509	NC_013158	CGA	2	6	2541747	2541752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053529
60510	NC_013158	GGC	2	6	2541756	2541761	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257053529
60511	NC_013158	CAC	2	6	2541781	2541786	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257053529
60512	NC_013158	CTGC	2	8	2541889	2541896	0 %	25 %	25 %	50 %	257053529
60513	NC_013158	CGC	2	6	2541910	2541915	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257053529
60514	NC_013158	GTC	2	6	2541934	2541939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053529
60515	NC_013158	CCGAAC	2	12	2541950	2541961	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	257053529
60516	NC_013158	TCC	2	6	2541986	2541991	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257053529
60517	NC_013158	GCT	2	6	2542080	2542085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60518	NC_013158	CAAT	2	8	2542113	2542120	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
60519	NC_013158	GCC	2	6	2542138	2542143	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257053530
60520	NC_013158	ATC	2	6	2542147	2542152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257053530
60521	NC_013158	GAG	2	6	2542201	2542206	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257053530
60522	NC_013158	GTG	2	6	2542273	2542278	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257053530
60523	NC_013158	TCC	2	6	2542325	2542330	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257053530
60524	NC_013158	AGG	2	6	2542385	2542390	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257053530
60525	NC_013158	CCG	2	6	2542408	2542413	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257053530
60526	NC_013158	TCA	2	6	2542418	2542423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257053530
60527	NC_013158	CGA	2	6	2542449	2542454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053530
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60529	NC_013158	CGGC	2	8	2542554	2542561	0 %	0 %	50 %	50 %	257053530
60530	NC_013158	GCGT	2	8	2542611	2542618	0 %	25 %	50 %	25 %	257053530
60531	NC_013158	GAG	2	6	2542624	2542629	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257053530
60532	NC_013158	GAC	2	6	2542662	2542667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053530
60533	NC_013158	CGT	2	6	2542719	2542724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053530
60534	NC_013158	ACG	2	6	2542754	2542759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053530
60535	NC_013158	CGCT	2	8	2542832	2542839	0 %	25 %	25 %	50 %	257053530
60536	NC_013158	CGA	2	6	2542905	2542910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053530
60537	NC_013158	GA	3	6	2542927	2542932	50 %	0 %	50 %	0 %	257053530
60538	NC_013158	CGA	2	6	2542971	2542976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053530
60539	NC_013158	TTCGA	2	10	2543038	2543047	20 %	40 %	20 %	20 %	257053530
60540	NC_013158	CGC	2	6	2543063	2543068	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257053530
60541	NC_013158	GC	3	6	2543071	2543076	0 %	0 %	50 %	50 %	257053530
60542	NC_013158	CTA	2	6	2543091	2543096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257053530
60543	NC_013158	GT	3	6	2543173	2543178	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
60544	NC_013158	GCC	2	6	2543190	2543195	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
60545	NC_013158	TGA	2	6	2543206	2543211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257053531
60546	NC_013158	TGG	2	6	2543300	2543305	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257053531
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60548	NC_013158	ACT	2	6	2543347	2543352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257053531
60549	NC_013158	GCTG	2	8	2543399	2543406	0 %	25 %	50 %	25 %	257053531
60550	NC_013158	CGA	2	6	2543423	2543428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053531
60551	NC_013158	G	6	6	2543468	2543473	0 %	0 %	100 %	0 %	257053531
60552	NC_013158	CG	3	6	2543484	2543489	0 %	0 %	50 %	50 %	257053531
60553	NC_013158	CGA	2	6	2543509	2543514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053531
60554	NC_013158	CGG	2	6	2543534	2543539	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257053531
60555	NC_013158	GAC	2	6	2543540	2543545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053531
60556	NC_013158	CGC	2	6	2543585	2543590	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257053531
60557	NC_013158	TCG	2	6	2543624	2543629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053531
60558	NC_013158	CCGAA	2	10	2543648	2543657	40 %	0 %	20 %	40 %	257053531
60559	NC_013158	GGC	2	6	2543715	2543720	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257053531
60560	NC_013158	GGC	2	6	2543777	2543782	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
60561	NC_013158	CGT	2	6	2543877	2543882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053532
60562	NC_013158	GAT	2	6	2543892	2543897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257053532
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60564	NC_013158	GTC	2	6	2544001	2544006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053532
60565	NC_013158	TAC	2	6	2544019	2544024	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257053532
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60568	NC_013158	GGC	2	6	2544216	2544221	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257053532
60569	NC_013158	GAT	2	6	2544222	2544227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257053532
60570	NC_013158	CGT	2	6	2544311	2544316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053533
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60573	NC_013158	TCCCG	2	10	2544358	2544367	0 %	20 %	20 %	60 %	257053533
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60580	NC_013158	CGAT	2	8	2544614	2544621	25 %	25 %	25 %	25 %	257053533
60581	NC_013158	CGGCG	2	10	2544623	2544632	0 %	0 %	60 %	40 %	257053533
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60584	NC_013158	TGC	2	6	2544783	2544788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053533
60585	NC_013158	TGA	2	6	2544797	2544802	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257053533
60586	NC_013158	GAC	2	6	2544885	2544890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053533
60587	NC_013158	TCG	3	9	2544898	2544906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053533
60588	NC_013158	GCTCG	2	10	2544914	2544923	0 %	20 %	40 %	40 %	257053533
60589	NC_013158	GTC	2	6	2544933	2544938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053533
60590	NC_013158	GACG	2	8	2544995	2545002	25 %	0 %	50 %	25 %	257053533
60591	NC_013158	CCGTC	2	10	2545004	2545013	0 %	20 %	20 %	60 %	257053533
60592	NC_013158	CGG	2	6	2545037	2545042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257053533
60593	NC_013158	ACCCA	2	10	2545094	2545103	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
60594	NC_013158	GTC	2	6	2545213	2545218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053534
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60599	NC_013158	CGG	2	6	2545492	2545497	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
60600	NC_013158	GATCG	2	10	2545557	2545566	20 %	20 %	40 %	20 %	257053535
60601	NC_013158	CGA	2	6	2545622	2545627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053535
60602	NC_013158	CGT	2	6	2545751	2545756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053535
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60604	NC_013158	CGA	2	6	2545814	2545819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053535
60605	NC_013158	CCG	2	6	2545872	2545877	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257053535
60606	NC_013158	GCC	2	6	2545995	2546000	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257053535
60607	NC_013158	GAG	2	6	2546025	2546030	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257053535
60608	NC_013158	CGA	2	6	2546057	2546062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053535
60609	NC_013158	TC	5	10	2546102	2546111	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
60610	NC_013158	TA	3	6	2546194	2546199	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60611	NC_013158	TAG	2	6	2546203	2546208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60612	NC_013158	GAT	2	6	2546224	2546229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257053536
60613	NC_013158	GC	3	6	2546245	2546250	0 %	0 %	50 %	50 %	257053536
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60615	NC_013158	AAC	2	6	2546357	2546362	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257053536
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