MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halorhabdus utahensis DSM 12940 chromosome

Total Repeats: 74047

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
60001	NC_013158	GAG	2	6	2519718	2519723	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257053511
60002	NC_013158	CGA	2	6	2519747	2519752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053511
60003	NC_013158	CGA	2	6	2519804	2519809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053511
60004	NC_013158	GTC	2	6	2519832	2519837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053511
60005	NC_013158	GAA	2	6	2519847	2519852	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257053511
60006	NC_013158	GCC	2	6	2519898	2519903	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257053511
60007	NC_013158	ACG	2	6	2519962	2519967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053511
60008	NC_013158	GAC	2	6	2520027	2520032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053511
60009	NC_013158	CCG	2	6	2520092	2520097	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
60010	NC_013158	CCG	2	6	2520105	2520110	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
60011	NC_013158	TGT	2	6	2520116	2520121	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60012	NC_013158	CGCGA	2	10	2520166	2520175	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
60013	NC_013158	GCCGAC	2	12	2520277	2520288	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	257053512
60014	NC_013158	GAG	2	6	2520313	2520318	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257053512
60015	NC_013158	TGG	2	6	2520370	2520375	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257053512
60016	NC_013158	CCG	2	6	2520416	2520421	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257053512
60017	NC_013158	GAG	2	6	2520559	2520564	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257053512
60018	NC_013158	GGATC	2	10	2520576	2520585	20 %	20 %	40 %	20 %	257053512
60019	NC_013158	CCG	2	6	2520604	2520609	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257053512
60020	NC_013158	CGA	2	6	2520807	2520812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053512
60021	NC_013158	CCT	2	6	2520831	2520836	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257053512
60022	NC_013158	CGT	2	6	2520969	2520974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053512
60023	NC_013158	TCG	2	6	2521022	2521027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053512
60024	NC_013158	CGG	2	6	2521121	2521126	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257053512
60025	NC_013158	GCG	2	6	2521127	2521132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257053512
60026	NC_013158	CGG	2	6	2521158	2521163	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257053512
60027	NC_013158	GAG	2	6	2521168	2521173	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257053512
60028	NC_013158	GTC	2	6	2521174	2521179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053512
60029	NC_013158	CGA	2	6	2521218	2521223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053512
60030	NC_013158	TCC	2	6	2521262	2521267	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257053512
60031	NC_013158	CGACGC	2	12	2521299	2521310	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	257053512
60032	NC_013158	CTT	2	6	2521320	2521325	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257053512
60033	NC_013158	CGT	2	6	2521356	2521361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053512
60034	NC_013158	CGGT	2	8	2521363	2521370	0 %	25 %	50 %	25 %	257053512
60035	NC_013158	GAC	2	6	2521420	2521425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053512
60036	NC_013158	GGC	2	6	2521452	2521457	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257053512
60037	NC_013158	CGG	3	9	2521458	2521466	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257053512
60038	NC_013158	CGA	2	6	2521536	2521541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053512
60039	NC_013158	GGCC	2	8	2521544	2521551	0 %	0 %	50 %	50 %	257053512
60040	NC_013158	TCG	2	6	2521631	2521636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053512
60041	NC_013158	CGAT	2	8	2521649	2521656	25 %	25 %	25 %	25 %	257053512
60042	NC_013158	ACG	2	6	2521673	2521678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053512
60043	NC_013158	TAC	2	6	2521681	2521686	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257053512
60044	NC_013158	GCC	2	6	2521729	2521734	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257053512
60045	NC_013158	CGA	2	6	2521770	2521775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053512
60046	NC_013158	CCGCG	2	10	2521909	2521918	0 %	0 %	40 %	60 %	257053513
60047	NC_013158	CGATCG	2	12	2521976	2521987	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	257053513
60048	NC_013158	GCC	2	6	2522080	2522085	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257053513
60049	NC_013158	CGG	2	6	2522096	2522101	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257053513
60050	NC_013158	GCG	2	6	2522124	2522129	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257053513
60051	NC_013158	GGCG	2	8	2522177	2522184	0 %	0 %	75 %	25 %	257053513
60052	NC_013158	CGGT	2	8	2522197	2522204	0 %	25 %	50 %	25 %	257053513
60053	NC_013158	CCGTCG	2	12	2522206	2522217	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	257053513
60054	NC_013158	GGCGA	2	10	2522230	2522239	20 %	0 %	60 %	20 %	257053513
60055	NC_013158	CCG	2	6	2522284	2522289	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257053513
60056	NC_013158	TCG	2	6	2522332	2522337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053513
60057	NC_013158	GCT	2	6	2522369	2522374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053513
60058	NC_013158	TCG	3	9	2522383	2522391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053513
60059	NC_013158	CGC	2	6	2522402	2522407	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257053513
60060	NC_013158	GCCCG	2	10	2522415	2522424	0 %	0 %	40 %	60 %	257053513
60061	NC_013158	CGG	2	6	2522465	2522470	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257053513
60062	NC_013158	GTT	2	6	2522496	2522501	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257053513
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60064	NC_013158	CGG	2	6	2522582	2522587	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257053513
60065	NC_013158	CGG	2	6	2522619	2522624	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257053513
60066	NC_013158	CGAT	2	8	2522761	2522768	25 %	25 %	25 %	25 %	257053513
60067	NC_013158	CGC	2	6	2522823	2522828	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257053513
60068	NC_013158	ACC	2	6	2522848	2522853	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257053513
60069	NC_013158	GC	3	6	2522878	2522883	0 %	0 %	50 %	50 %	257053513
60070	NC_013158	TCG	2	6	2522999	2523004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053513
60071	NC_013158	GCG	2	6	2523012	2523017	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257053513
60072	NC_013158	CCG	2	6	2523025	2523030	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257053513
60073	NC_013158	CGG	2	6	2523209	2523214	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257053513
60074	NC_013158	GTC	2	6	2523225	2523230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053513
60075	NC_013158	CCGC	2	8	2523326	2523333	0 %	0 %	25 %	75 %	257053513
60076	NC_013158	CGA	2	6	2523374	2523379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053513
60077	NC_013158	TCGCC	2	10	2523392	2523401	0 %	20 %	20 %	60 %	257053513
60078	NC_013158	GCC	2	6	2523484	2523489	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257053513
60079	NC_013158	CAG	2	6	2523531	2523536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053513
60080	NC_013158	GCG	2	6	2523559	2523564	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257053513
60081	NC_013158	CGCC	2	8	2523596	2523603	0 %	0 %	25 %	75 %	257053514
60082	NC_013158	CTG	2	6	2523635	2523640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053514
60083	NC_013158	CGG	2	6	2523667	2523672	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257053514
60084	NC_013158	GGC	2	6	2523677	2523682	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257053514
60085	NC_013158	GGT	2	6	2523868	2523873	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257053514
60086	NC_013158	CGG	2	6	2523875	2523880	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257053514
60087	NC_013158	TCGATC	2	12	2523939	2523950	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	257053514
60088	NC_013158	TCG	2	6	2523961	2523966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053514
60089	NC_013158	GAG	2	6	2524001	2524006	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257053514
60090	NC_013158	GGC	2	6	2524072	2524077	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
60091	NC_013158	CGC	2	6	2524162	2524167	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257053515
60092	NC_013158	TCGT	2	8	2524386	2524393	0 %	50 %	25 %	25 %	257053515
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60095	NC_013158	CAG	2	6	2524508	2524513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053515
60096	NC_013158	GGTA	2	8	2524540	2524547	25 %	25 %	50 %	0 %	257053515
60097	NC_013158	TCG	2	6	2524551	2524556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053515
60098	NC_013158	CCG	2	6	2524596	2524601	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257053515
60099	NC_013158	CGT	2	6	2524606	2524611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053515
60100	NC_013158	CCG	2	6	2524629	2524634	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257053515
60101	NC_013158	CGT	2	6	2524639	2524644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053515
60102	NC_013158	ACC	2	6	2524658	2524663	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257053515
60103	NC_013158	CGC	2	6	2524696	2524701	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257053515
60104	NC_013158	GCT	2	6	2524721	2524726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053515
60105	NC_013158	CGA	2	6	2524744	2524749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053515
60106	NC_013158	ATC	2	6	2524785	2524790	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257053515
60107	NC_013158	CTC	2	6	2524799	2524804	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257053515
60108	NC_013158	CGT	2	6	2524852	2524857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053515
60109	NC_013158	CGC	2	6	2524918	2524923	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257053515
60110	NC_013158	GTTC	2	8	2524930	2524937	0 %	50 %	25 %	25 %	257053515
60111	NC_013158	CAG	2	6	2525034	2525039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053515
60112	NC_013158	GTA	3	9	2525060	2525068	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257053515
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60114	NC_013158	CGA	2	6	2525215	2525220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053515
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60337	NC_013158	CGTCG	2	10	2535200	2535209	0 %	20 %	40 %	40 %	257053524
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60340	NC_013158	TGT	2	6	2535341	2535346	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60341	NC_013158	ACG	3	9	2535375	2535383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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60343	NC_013158	GCA	2	6	2535420	2535425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053525
60344	NC_013158	CGC	2	6	2535432	2535437	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257053525
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60346	NC_013158	TCG	2	6	2535463	2535468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053525
60347	NC_013158	CGT	2	6	2535471	2535476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053525
60348	NC_013158	CTG	3	9	2535511	2535519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053525
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60373	NC_013158	TCG	2	6	2536522	2536527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053526
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60437	NC_013158	CAA	2	6	2539142	2539147	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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60461	NC_013158	TCG	2	6	2540211	2540216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053529
60462	NC_013158	CGC	2	6	2540223	2540228	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257053529
60463	NC_013158	GCGG	2	8	2540233	2540240	0 %	0 %	75 %	25 %	257053529
60464	NC_013158	GCGTC	2	10	2540247	2540256	0 %	20 %	40 %	40 %	257053529
60465	NC_013158	CGG	2	6	2540281	2540286	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257053529
60466	NC_013158	CGT	2	6	2540325	2540330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053529
60467	NC_013158	TCG	2	6	2540342	2540347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053529
60468	NC_013158	TTC	2	6	2540353	2540358	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257053529
60469	NC_013158	TCA	2	6	2540415	2540420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257053529
60470	NC_013158	CGG	2	6	2540493	2540498	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257053529
60471	NC_013158	TCGC	2	8	2540505	2540512	0 %	25 %	25 %	50 %	257053529
60472	NC_013158	CGT	2	6	2540569	2540574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053529
60473	NC_013158	CAC	2	6	2540591	2540596	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257053529
60474	NC_013158	GCCG	2	8	2540611	2540618	0 %	0 %	50 %	50 %	257053529
60475	NC_013158	CGA	2	6	2540622	2540627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053529
60476	NC_013158	CTCG	2	8	2540653	2540660	0 %	25 %	25 %	50 %	257053529
60477	NC_013158	CGT	2	6	2540709	2540714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053529
60478	NC_013158	TCG	2	6	2540744	2540749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053529
60479	NC_013158	GGTTCG	2	12	2540750	2540761	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	257053529
60480	NC_013158	CGT	2	6	2540808	2540813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053529
60481	NC_013158	TCG	3	9	2540837	2540845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053529
60482	NC_013158	GCG	2	6	2540852	2540857	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257053529
60483	NC_013158	GTC	2	6	2540863	2540868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053529
60484	NC_013158	CAG	2	6	2540878	2540883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053529
60485	NC_013158	GTC	2	6	2540884	2540889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053529
60486	NC_013158	TGG	2	6	2540999	2541004	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257053529
60487	NC_013158	GC	3	6	2541013	2541018	0 %	0 %	50 %	50 %	257053529
60488	NC_013158	CAG	2	6	2541052	2541057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053529
60489	NC_013158	TCG	2	6	2541089	2541094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053529
60490	NC_013158	TCG	2	6	2541113	2541118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053529
60491	NC_013158	ACG	2	6	2541179	2541184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053529
60492	NC_013158	GCG	2	6	2541185	2541190	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257053529
60493	NC_013158	CGA	2	6	2541195	2541200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053529
60494	NC_013158	CGG	2	6	2541285	2541290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257053529
60495	NC_013158	GCG	2	6	2541351	2541356	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257053529
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60497	NC_013158	TCG	2	6	2541374	2541379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053529
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60499	NC_013158	CGG	2	6	2541420	2541425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257053529
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