MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halorhabdus utahensis DSM 12940 chromosome

Total Repeats: 74047

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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58002	NC_013158	ATC	2	6	2439461	2439466	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257053457
58003	NC_013158	CGT	2	6	2439499	2439504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053457
58004	NC_013158	CCAGCT	2	12	2439526	2439537	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	257053457
58005	NC_013158	GAG	2	6	2439566	2439571	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257053457
58006	NC_013158	GGC	2	6	2439613	2439618	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257053457
58007	NC_013158	GATC	2	8	2439733	2439740	25 %	25 %	25 %	25 %	257053457
58008	NC_013158	CA	3	6	2439786	2439791	50 %	0 %	0 %	50 %	257053457
58009	NC_013158	GCC	2	6	2439794	2439799	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257053457
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58011	NC_013158	GTC	2	6	2439857	2439862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053457
58012	NC_013158	CGA	2	6	2439931	2439936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053457
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58014	NC_013158	ACG	2	6	2440125	2440130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053457
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58016	NC_013158	CGA	2	6	2440141	2440146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053457
58017	NC_013158	GACT	2	8	2440156	2440163	25 %	25 %	25 %	25 %	257053457
58018	NC_013158	ACG	2	6	2440181	2440186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053457
58019	NC_013158	GAC	2	6	2440234	2440239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053457
58020	NC_013158	AGTC	2	8	2440242	2440249	25 %	25 %	25 %	25 %	257053457
58021	NC_013158	ACG	3	9	2440271	2440279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053457
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58024	NC_013158	CGA	2	6	2440341	2440346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053457
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58026	NC_013158	CGA	3	9	2440359	2440367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053457
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58050	NC_013158	GAG	2	6	2441069	2441074	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257053457
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58082	NC_013158	GAC	2	6	2442326	2442331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053458
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58101	NC_013158	GATGGC	2	12	2442959	2442970	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	257053458
58102	NC_013158	GGCGAT	2	12	2442974	2442985	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	257053458
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58104	NC_013158	TGATC	2	10	2443018	2443027	20 %	40 %	20 %	20 %	257053458
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58106	NC_013158	GAC	2	6	2443174	2443179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053458
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58111	NC_013158	TCG	3	9	2443260	2443268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053458
58112	NC_013158	GGT	2	6	2443271	2443276	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257053458
58113	NC_013158	GACGGT	2	12	2443343	2443354	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	257053458
58114	NC_013158	TCG	2	6	2443374	2443379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053458
58115	NC_013158	GATC	2	8	2443384	2443391	25 %	25 %	25 %	25 %	257053458
58116	NC_013158	ACG	2	6	2443397	2443402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053458
58117	NC_013158	GAC	2	6	2443525	2443530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053458
58118	NC_013158	GCC	2	6	2443538	2443543	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257053458
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58120	NC_013158	ACG	3	9	2443578	2443586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053458
58121	NC_013158	CGG	2	6	2443647	2443652	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
58122	NC_013158	GATC	2	8	2443680	2443687	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
58123	NC_013158	GCT	2	6	2443713	2443718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58124	NC_013158	ACTG	2	8	2443732	2443739	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
58125	NC_013158	CGAC	2	8	2443765	2443772	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
58126	NC_013158	AC	3	6	2443783	2443788	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
58127	NC_013158	GACA	2	8	2443809	2443816	50 %	0 %	25 %	25 %	257053459
58128	NC_013158	ACA	3	9	2443814	2443822	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257053459
58129	NC_013158	CGA	2	6	2443829	2443834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053459
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58132	NC_013158	CGT	2	6	2444033	2444038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053459
58133	NC_013158	GCTGG	2	10	2444061	2444070	0 %	20 %	60 %	20 %	257053459
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58228	NC_013158	CGT	2	6	2447547	2447552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053460
58229	NC_013158	ATCG	2	8	2447563	2447570	25 %	25 %	25 %	25 %	257053460
58230	NC_013158	GCC	3	9	2447576	2447584	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257053460
58231	NC_013158	GATCGA	2	12	2447653	2447664	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	257053460
58232	NC_013158	AC	3	6	2447693	2447698	50 %	0 %	0 %	50 %	257053461
58233	NC_013158	GAC	3	9	2447708	2447716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053461
58234	NC_013158	CGA	2	6	2447726	2447731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053461
58235	NC_013158	CGG	2	6	2447783	2447788	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257053461
58236	NC_013158	AGC	3	9	2447800	2447808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053461
58237	NC_013158	GGC	2	6	2447813	2447818	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257053461
58238	NC_013158	CGG	2	6	2447836	2447841	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257053461
58239	NC_013158	TCG	2	6	2447847	2447852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053461
58240	NC_013158	CGC	3	9	2447880	2447888	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257053461
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58242	NC_013158	G	6	6	2447943	2447948	0 %	0 %	100 %	0 %	257053461
58243	NC_013158	GACG	2	8	2448007	2448014	25 %	0 %	50 %	25 %	257053461
58244	NC_013158	CTG	2	6	2448023	2448028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053461
58245	NC_013158	GAC	3	9	2448038	2448046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053461
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58247	NC_013158	CGA	2	6	2448133	2448138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053461
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58251	NC_013158	ATC	2	6	2448225	2448230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257053461
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58342	NC_013158	TCC	2	6	2451470	2451475	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257053462
58343	NC_013158	GCT	2	6	2451495	2451500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053462
58344	NC_013158	GCA	2	6	2451529	2451534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053462
58345	NC_013158	TCG	2	6	2451551	2451556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053462
58346	NC_013158	CGG	2	6	2451582	2451587	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257053462
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58348	NC_013158	TCGC	2	8	2451645	2451652	0 %	25 %	25 %	50 %	257053462
58349	NC_013158	CGA	2	6	2451657	2451662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053462
58350	NC_013158	TG	3	6	2451674	2451679	0 %	50 %	50 %	0 %	257053462
58351	NC_013158	CTG	2	6	2451697	2451702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053462
58352	NC_013158	GGC	2	6	2451730	2451735	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257053462
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58354	NC_013158	GCA	2	6	2451780	2451785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053462
58355	NC_013158	TCG	2	6	2451797	2451802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053462
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58358	NC_013158	CGG	2	6	2451864	2451869	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257053462
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58360	NC_013158	CGCGAT	2	12	2452020	2452031	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	257053462
58361	NC_013158	GGA	2	6	2452059	2452064	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257053462
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58363	NC_013158	CGA	2	6	2452083	2452088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053462
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58368	NC_013158	CG	3	6	2452192	2452197	0 %	0 %	50 %	50 %	257053462
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58371	NC_013158	GAC	2	6	2452339	2452344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053462
58372	NC_013158	GTC	2	6	2452345	2452350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053462
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58377	NC_013158	GCG	3	9	2452516	2452524	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257053462
58378	NC_013158	ACG	2	6	2452559	2452564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053462
58379	NC_013158	CGA	2	6	2452616	2452621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053462
58380	NC_013158	CGACG	2	10	2452662	2452671	20 %	0 %	40 %	40 %	257053462
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58382	NC_013158	CGC	2	6	2452746	2452751	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257053462
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58384	NC_013158	CGA	2	6	2452851	2452856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053462
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58399	NC_013158	CGA	2	6	2453364	2453369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053462
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58422	NC_013158	GGC	2	6	2453854	2453859	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257053462
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58434	NC_013158	GGC	2	6	2454295	2454300	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257053462
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58438	NC_013158	GGGT	2	8	2454462	2454469	0 %	25 %	75 %	0 %	257053462
58439	NC_013158	GAG	2	6	2454493	2454498	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257053462
58440	NC_013158	CGG	2	6	2454573	2454578	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257053463
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58442	NC_013158	CTC	2	6	2454603	2454608	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257053463
58443	NC_013158	CAC	2	6	2454656	2454661	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257053463
58444	NC_013158	GAC	2	6	2454714	2454719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053463
58445	NC_013158	GGC	2	6	2454767	2454772	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257053463
58446	NC_013158	CGAT	2	8	2454820	2454827	25 %	25 %	25 %	25 %	257053463
58447	NC_013158	CGG	2	6	2454830	2454835	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257053463
58448	NC_013158	CGA	2	6	2454935	2454940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053463
58449	NC_013158	CGT	2	6	2454944	2454949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053463
58450	NC_013158	CGA	2	6	2455022	2455027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053463
58451	NC_013158	AAC	2	6	2455035	2455040	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257053463
58452	NC_013158	TCACG	2	10	2455049	2455058	20 %	20 %	20 %	40 %	257053463
58453	NC_013158	CCT	2	6	2455060	2455065	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257053463
58454	NC_013158	CGA	2	6	2455073	2455078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053463
58455	NC_013158	TC	3	6	2455082	2455087	0 %	50 %	0 %	50 %	257053463
58456	NC_013158	ACC	2	6	2455101	2455106	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257053463
58457	NC_013158	ACG	2	6	2455110	2455115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053463
58458	NC_013158	CGT	2	6	2455283	2455288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053463
58459	NC_013158	AAC	2	6	2455293	2455298	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257053463
58460	NC_013158	CTT	2	6	2455307	2455312	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257053463
58461	NC_013158	CGG	2	6	2455342	2455347	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257053463
58462	NC_013158	TCG	2	6	2455354	2455359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053463
58463	NC_013158	GAT	2	6	2455386	2455391	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257053463
58464	NC_013158	CT	4	8	2455415	2455422	0 %	50 %	0 %	50 %	257053463
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58467	NC_013158	CCG	2	6	2455498	2455503	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257053463
58468	NC_013158	CA	3	6	2455537	2455542	50 %	0 %	0 %	50 %	257053463
58469	NC_013158	TC	3	6	2455544	2455549	0 %	50 %	0 %	50 %	257053463
58470	NC_013158	ACG	2	6	2455585	2455590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053463
58471	NC_013158	CCTG	2	8	2455694	2455701	0 %	25 %	25 %	50 %	257053463
58472	NC_013158	GCC	3	9	2455761	2455769	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257053463
58473	NC_013158	CGG	2	6	2455799	2455804	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257053463
58474	NC_013158	CGA	2	6	2455814	2455819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053463
58475	NC_013158	CGA	2	6	2455841	2455846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053463
58476	NC_013158	CGG	2	6	2455865	2455870	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257053463
58477	NC_013158	TGA	2	6	2455883	2455888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257053463
58478	NC_013158	CGG	2	6	2455949	2455954	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257053463
58479	NC_013158	ACG	2	6	2456023	2456028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053463
58480	NC_013158	CGA	2	6	2456033	2456038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053463
58481	NC_013158	ACG	2	6	2456070	2456075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053463
58482	NC_013158	GTC	3	9	2456082	2456090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053463
58483	NC_013158	CGACG	2	10	2456096	2456105	20 %	0 %	40 %	40 %	257053463
58484	NC_013158	TCG	2	6	2456161	2456166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053463
58485	NC_013158	GAC	2	6	2456184	2456189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053463
58486	NC_013158	GACAGC	2	12	2456196	2456207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053463
58487	NC_013158	GTG	3	9	2456236	2456244	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257053463
58488	NC_013158	GAC	2	6	2456256	2456261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053463
58489	NC_013158	GAT	2	6	2456274	2456279	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257053463
58490	NC_013158	GAC	2	6	2456303	2456308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053463
58491	NC_013158	TCG	2	6	2456344	2456349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053463
58492	NC_013158	GTG	2	6	2456420	2456425	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257053463
58493	NC_013158	ACG	2	6	2456482	2456487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053463
58494	NC_013158	CGA	2	6	2456497	2456502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053463
58495	NC_013158	CGTGA	2	10	2456522	2456531	20 %	20 %	40 %	20 %	257053463
58496	NC_013158	GCCG	2	8	2456559	2456566	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
58497	NC_013158	GTTC	2	8	2456595	2456602	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
58498	NC_013158	G	6	6	2456612	2456617	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
58499	NC_013158	G	6	6	2456634	2456639	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
58500	NC_013158	GACT	2	8	2456642	2456649	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding

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