MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halorhabdus utahensis DSM 12940 chromosome

Total Repeats: 74047

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
57501	NC_013158	CTT	2	6	2420823	2420828	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57502	NC_013158	AG	3	6	2420832	2420837	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
57503	NC_013158	AGC	2	6	2420847	2420852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053442
57504	NC_013158	ACG	2	6	2420978	2420983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053442
57505	NC_013158	CCGA	2	8	2420997	2421004	25 %	0 %	25 %	50 %	257053442
57506	NC_013158	CGA	2	6	2421023	2421028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053442
57507	NC_013158	CACT	2	8	2421039	2421046	25 %	25 %	0 %	50 %	257053442
57508	NC_013158	CGA	2	6	2421049	2421054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053442
57509	NC_013158	GACG	2	8	2421059	2421066	25 %	0 %	50 %	25 %	257053442
57510	NC_013158	TCG	2	6	2421085	2421090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053442
57511	NC_013158	GCTG	2	8	2421122	2421129	0 %	25 %	50 %	25 %	257053442
57512	NC_013158	CAT	2	6	2421218	2421223	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257053443
57513	NC_013158	GTT	2	6	2421256	2421261	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257053443
57514	NC_013158	CGG	2	6	2421335	2421340	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257053443
57515	NC_013158	GCC	2	6	2421371	2421376	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257053443
57516	NC_013158	GAA	2	6	2421385	2421390	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257053443
57517	NC_013158	AG	3	6	2421436	2421441	50 %	0 %	50 %	0 %	257053443
57518	NC_013158	CT	3	6	2421444	2421449	0 %	50 %	0 %	50 %	257053443
57519	NC_013158	CGT	2	6	2421525	2421530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053443
57520	NC_013158	TCG	3	9	2421540	2421548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053443
57521	NC_013158	CA	3	6	2421552	2421557	50 %	0 %	0 %	50 %	257053443
57522	NC_013158	CCT	2	6	2421580	2421585	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257053443
57523	NC_013158	ACG	2	6	2421620	2421625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053443
57524	NC_013158	TCAG	2	8	2421636	2421643	25 %	25 %	25 %	25 %	257053443
57525	NC_013158	GAACT	2	10	2421737	2421746	40 %	20 %	20 %	20 %	257053444
57526	NC_013158	GCGA	2	8	2421754	2421761	25 %	0 %	50 %	25 %	257053444
57527	NC_013158	GGCCGA	2	12	2421840	2421851	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	257053444
57528	NC_013158	CAG	2	6	2421907	2421912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053444
57529	NC_013158	GCC	2	6	2421931	2421936	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257053444
57530	NC_013158	CGGA	2	8	2421952	2421959	25 %	0 %	50 %	25 %	257053444
57531	NC_013158	TAC	2	6	2422001	2422006	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57532	NC_013158	CCG	2	6	2422015	2422020	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
57533	NC_013158	CGACG	2	10	2422048	2422057	20 %	0 %	40 %	40 %	257053445
57534	NC_013158	CTG	2	6	2422106	2422111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053445
57535	NC_013158	TCG	2	6	2422197	2422202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053445
57536	NC_013158	GAC	2	6	2422214	2422219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053445
57537	NC_013158	GGA	2	6	2422264	2422269	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257053445
57538	NC_013158	GATC	2	8	2422291	2422298	25 %	25 %	25 %	25 %	257053445
57539	NC_013158	CCCG	2	8	2422356	2422363	0 %	0 %	25 %	75 %	257053445
57540	NC_013158	CGG	2	6	2422374	2422379	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257053445
57541	NC_013158	GGGC	2	8	2422380	2422387	0 %	0 %	75 %	25 %	257053445
57542	NC_013158	ACG	2	6	2422399	2422404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053445
57543	NC_013158	GT	3	6	2422425	2422430	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
57544	NC_013158	GGC	2	6	2422436	2422441	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
57545	NC_013158	CGC	2	6	2422525	2422530	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257053446
57546	NC_013158	CGC	2	6	2422592	2422597	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257053446
57547	NC_013158	CGA	3	9	2422625	2422633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053446
57548	NC_013158	CCG	2	6	2422651	2422656	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257053446
57549	NC_013158	CGT	2	6	2422672	2422677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053446
57550	NC_013158	CGA	2	6	2422682	2422687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053446
57551	NC_013158	CGA	2	6	2422691	2422696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053446
57552	NC_013158	GGC	2	6	2422754	2422759	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257053446
57553	NC_013158	CGG	2	6	2422764	2422769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257053446
57554	NC_013158	GCC	2	6	2422825	2422830	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257053446
57555	NC_013158	CTT	2	6	2422835	2422840	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257053446
57556	NC_013158	CGATG	2	10	2422845	2422854	20 %	20 %	40 %	20 %	257053446
57557	NC_013158	ACG	2	6	2422983	2422988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053446
57558	NC_013158	GCG	2	6	2422989	2422994	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257053446
57559	NC_013158	GGT	2	6	2423030	2423035	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257053446
57560	NC_013158	ACC	2	6	2423039	2423044	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257053446
57561	NC_013158	GCC	2	6	2423108	2423113	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257053446
57562	NC_013158	ACC	2	6	2423116	2423121	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257053446
57563	NC_013158	CCAA	2	8	2423157	2423164	50 %	0 %	0 %	50 %	257053446
57564	NC_013158	CGC	2	6	2423212	2423217	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
57565	NC_013158	GTTC	2	8	2423218	2423225	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
57566	NC_013158	CGT	2	6	2423272	2423277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053447
57567	NC_013158	TCG	2	6	2423298	2423303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053447
57568	NC_013158	GTC	2	6	2423392	2423397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053447
57569	NC_013158	CCCCG	2	10	2423408	2423417	0 %	0 %	20 %	80 %	257053447
57570	NC_013158	GCG	2	6	2423438	2423443	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257053447
57571	NC_013158	GCC	2	6	2423444	2423449	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257053447
57572	NC_013158	GCCG	2	8	2423473	2423480	0 %	0 %	50 %	50 %	257053447
57573	NC_013158	CTT	2	6	2423533	2423538	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257053447
57574	NC_013158	CGA	2	6	2423613	2423618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053447
57575	NC_013158	GAC	2	6	2423665	2423670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053447
57576	NC_013158	GCG	2	6	2423684	2423689	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257053447
57577	NC_013158	AGC	2	6	2423695	2423700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053447
57578	NC_013158	TC	3	6	2423847	2423852	0 %	50 %	0 %	50 %	257053447
57579	NC_013158	GGC	2	6	2423914	2423919	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257053447
57580	NC_013158	TCGA	2	8	2423938	2423945	25 %	25 %	25 %	25 %	257053447
57581	NC_013158	CA	3	6	2423952	2423957	50 %	0 %	0 %	50 %	257053447
57582	NC_013158	CAGC	2	8	2423971	2423978	25 %	0 %	25 %	50 %	257053447
57583	NC_013158	CGG	2	6	2423981	2423986	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257053447
57584	NC_013158	TGC	2	6	2424007	2424012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053447
57585	NC_013158	CT	3	6	2424046	2424051	0 %	50 %	0 %	50 %	257053447
57586	NC_013158	TCCA	2	8	2424130	2424137	25 %	25 %	0 %	50 %	257053447
57587	NC_013158	CAGA	2	8	2424142	2424149	50 %	0 %	25 %	25 %	257053447
57588	NC_013158	CGG	2	6	2424180	2424185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257053447
57589	NC_013158	GT	3	6	2424221	2424226	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
57590	NC_013158	CAGG	2	8	2424262	2424269	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
57591	NC_013158	TCA	2	6	2424273	2424278	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57592	NC_013158	GATATC	2	12	2424311	2424322	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
57593	NC_013158	AAC	2	6	2424348	2424353	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57594	NC_013158	CCG	2	6	2424424	2424429	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257053448
57595	NC_013158	GCC	2	6	2424436	2424441	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257053448
57596	NC_013158	GTC	2	6	2424447	2424452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053448
57597	NC_013158	CAC	2	6	2424470	2424475	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257053448
57598	NC_013158	TCG	2	6	2424487	2424492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053448
57599	NC_013158	CCG	2	6	2424581	2424586	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257053448
57600	NC_013158	GTC	2	6	2424633	2424638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053448
57601	NC_013158	CGTTC	2	10	2424641	2424650	0 %	40 %	20 %	40 %	257053448
57602	NC_013158	CGAT	2	8	2424685	2424692	25 %	25 %	25 %	25 %	257053448
57603	NC_013158	CTG	2	6	2424739	2424744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053448
57604	NC_013158	CGG	3	9	2424773	2424781	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257053448
57605	NC_013158	CAT	2	6	2424837	2424842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257053448
57606	NC_013158	CGA	2	6	2424845	2424850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053448
57607	NC_013158	CCT	2	6	2424851	2424856	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257053448
57608	NC_013158	GTC	2	6	2424873	2424878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053448
57609	NC_013158	CGT	2	6	2424884	2424889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053448
57610	NC_013158	CGA	2	6	2424929	2424934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053448
57611	NC_013158	GTC	2	6	2425008	2425013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053448
57612	NC_013158	GGTC	2	8	2425022	2425029	0 %	25 %	50 %	25 %	257053448
57613	NC_013158	GTCGC	2	10	2425069	2425078	0 %	20 %	40 %	40 %	257053448
57614	NC_013158	CGG	2	6	2425085	2425090	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257053448
57615	NC_013158	TCG	2	6	2425105	2425110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053448
57616	NC_013158	CGA	2	6	2425112	2425117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053448
57617	NC_013158	CG	5	10	2425143	2425152	0 %	0 %	50 %	50 %	257053448
57618	NC_013158	TCGA	2	8	2425156	2425163	25 %	25 %	25 %	25 %	257053448
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57964	NC_013158	TGT	2	6	2437851	2437856	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257053456
57965	NC_013158	CGT	2	6	2437910	2437915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053456
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