MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halorhabdus utahensis DSM 12940 chromosome

Total Repeats: 74047

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
57001	NC_013158	GGTCG	2	10	2400065	2400074	0 %	20 %	60 %	20 %	257053420
57002	NC_013158	CTC	2	6	2400110	2400115	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257053420
57003	NC_013158	CCG	2	6	2400150	2400155	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257053420
57004	NC_013158	TCG	2	6	2400186	2400191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053420
57005	NC_013158	ATGG	2	8	2400203	2400210	25 %	25 %	50 %	0 %	257053420
57006	NC_013158	GTGTC	2	10	2400232	2400241	0 %	40 %	40 %	20 %	257053420
57007	NC_013158	CG	3	6	2400271	2400276	0 %	0 %	50 %	50 %	257053420
57008	NC_013158	GATC	2	8	2400293	2400300	25 %	25 %	25 %	25 %	257053420
57009	NC_013158	CGT	2	6	2400425	2400430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053420
57010	NC_013158	CGG	2	6	2400494	2400499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257053420
57011	NC_013158	TCGA	2	8	2400537	2400544	25 %	25 %	25 %	25 %	257053420
57012	NC_013158	CGA	2	6	2400655	2400660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053420
57013	NC_013158	CGA	2	6	2400721	2400726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053420
57014	NC_013158	TACT	2	8	2400773	2400780	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
57015	NC_013158	TTC	2	6	2400905	2400910	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257053421
57016	NC_013158	GCTG	2	8	2400911	2400918	0 %	25 %	50 %	25 %	257053421
57017	NC_013158	ACG	2	6	2400979	2400984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053421
57018	NC_013158	CCT	2	6	2400988	2400993	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257053421
57019	NC_013158	GCC	2	6	2401002	2401007	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257053421
57020	NC_013158	CCT	2	6	2401051	2401056	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257053421
57021	NC_013158	CGA	2	6	2401066	2401071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053421
57022	NC_013158	TCG	2	6	2401116	2401121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053421
57023	NC_013158	TTC	2	6	2401157	2401162	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257053421
57024	NC_013158	CCT	2	6	2401240	2401245	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257053421
57025	NC_013158	ACG	2	6	2401251	2401256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053421
57026	NC_013158	CG	3	6	2401280	2401285	0 %	0 %	50 %	50 %	257053421
57027	NC_013158	GGC	2	6	2401286	2401291	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257053421
57028	NC_013158	CGA	2	6	2401351	2401356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053421
57029	NC_013158	GTC	2	6	2401358	2401363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053421
57030	NC_013158	CGCA	2	8	2401379	2401386	25 %	0 %	25 %	50 %	257053421
57031	NC_013158	TCA	2	6	2401389	2401394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257053421
57032	NC_013158	CGG	2	6	2401411	2401416	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257053421
57033	NC_013158	CGAT	2	8	2401422	2401429	25 %	25 %	25 %	25 %	257053421
57034	NC_013158	TCC	2	6	2401515	2401520	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257053421
57035	NC_013158	CCT	2	6	2401534	2401539	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257053421
57036	NC_013158	CGAT	2	8	2401540	2401547	25 %	25 %	25 %	25 %	257053421
57037	NC_013158	TCG	2	6	2401620	2401625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053421
57038	NC_013158	CGA	2	6	2401735	2401740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053421
57039	NC_013158	TCG	2	6	2401752	2401757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053421
57040	NC_013158	TCA	2	6	2401957	2401962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257053421
57041	NC_013158	ACA	2	6	2401977	2401982	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257053421
57042	NC_013158	TCG	2	6	2401992	2401997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053421
57043	NC_013158	GAC	2	6	2402054	2402059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053421
57044	NC_013158	CT	3	6	2402082	2402087	0 %	50 %	0 %	50 %	257053421
57045	NC_013158	TCC	2	6	2402106	2402111	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257053421
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57048	NC_013158	G	6	6	2402143	2402148	0 %	0 %	100 %	0 %	257053421
57049	NC_013158	TCTG	2	8	2402154	2402161	0 %	50 %	25 %	25 %	257053421
57050	NC_013158	AAAT	2	8	2402183	2402190	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
57051	NC_013158	TAA	2	6	2402194	2402199	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57052	NC_013158	ACA	2	6	2402247	2402252	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57053	NC_013158	GCT	2	6	2402278	2402283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57054	NC_013158	CTC	2	6	2402310	2402315	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
57055	NC_013158	CG	3	6	2402335	2402340	0 %	0 %	50 %	50 %	257053422
57056	NC_013158	CGA	2	6	2402426	2402431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053422
57057	NC_013158	GTT	2	6	2402442	2402447	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257053422
57058	NC_013158	CCG	2	6	2402504	2402509	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257053422
57059	NC_013158	CGGCG	2	10	2402534	2402543	0 %	0 %	60 %	40 %	257053422
57060	NC_013158	AGC	2	6	2402554	2402559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053422
57061	NC_013158	ACGCC	2	10	2402567	2402576	20 %	0 %	20 %	60 %	257053422
57062	NC_013158	CCG	2	6	2402623	2402628	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257053422
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57067	NC_013158	GTC	2	6	2402805	2402810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053422
57068	NC_013158	CGA	2	6	2402885	2402890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053422
57069	NC_013158	TCG	2	6	2402911	2402916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053422
57070	NC_013158	CGA	2	6	2402939	2402944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053422
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57073	NC_013158	CGGC	2	8	2403029	2403036	0 %	0 %	50 %	50 %	257053422
57074	NC_013158	CGA	2	6	2403056	2403061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053422
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57076	NC_013158	GGCC	2	8	2403086	2403093	0 %	0 %	50 %	50 %	257053422
57077	NC_013158	CGTC	2	8	2403112	2403119	0 %	25 %	25 %	50 %	257053422
57078	NC_013158	TCC	2	6	2403144	2403149	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257053422
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57080	NC_013158	CGT	2	6	2403254	2403259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053422
57081	NC_013158	GAAC	2	8	2403332	2403339	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
57082	NC_013158	GGT	2	6	2403358	2403363	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257053423
57083	NC_013158	TCG	2	6	2403408	2403413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053423
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57085	NC_013158	CGT	2	6	2403497	2403502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053423
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57088	NC_013158	TCG	2	6	2403558	2403563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053423
57089	NC_013158	TGAC	2	8	2403573	2403580	25 %	25 %	25 %	25 %	257053423
57090	NC_013158	CTC	2	6	2403590	2403595	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257053423
57091	NC_013158	CGA	2	6	2403634	2403639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053423
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57093	NC_013158	CGA	2	6	2403691	2403696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053423
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57099	NC_013158	CGA	2	6	2403874	2403879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053423
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57101	NC_013158	CGGCGA	2	12	2403934	2403945	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	257053423
57102	NC_013158	TCGA	2	8	2403962	2403969	25 %	25 %	25 %	25 %	257053423
57103	NC_013158	CCG	2	6	2403993	2403998	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257053423
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57106	NC_013158	GTCGA	2	10	2404064	2404073	20 %	20 %	40 %	20 %	257053423
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57108	NC_013158	CGG	2	6	2404129	2404134	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257053423
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57112	NC_013158	CTC	2	6	2404178	2404183	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257053423
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57114	NC_013158	CGT	2	6	2404220	2404225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053423
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57116	NC_013158	TCG	3	9	2404282	2404290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053423
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57231	NC_013158	TC	3	6	2409373	2409378	0 %	50 %	0 %	50 %	257053427
57232	NC_013158	GCT	2	6	2409466	2409471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053427
57233	NC_013158	TCG	2	6	2409492	2409497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053427
57234	NC_013158	GCT	2	6	2409520	2409525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053427
57235	NC_013158	TCC	2	6	2409552	2409557	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257053427
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57237	NC_013158	AGT	2	6	2409660	2409665	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257053427
57238	NC_013158	CGCC	2	8	2409691	2409698	0 %	0 %	25 %	75 %	257053428
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57240	NC_013158	GCCC	2	8	2409710	2409717	0 %	0 %	25 %	75 %	257053428
57241	NC_013158	CGG	2	6	2409781	2409786	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257053428
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57255	NC_013158	CTGA	2	8	2410229	2410236	25 %	25 %	25 %	25 %	257053428
57256	NC_013158	TCA	2	6	2410239	2410244	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257053428
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57259	NC_013158	GCG	2	6	2410425	2410430	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257053428
57260	NC_013158	GCA	2	6	2410431	2410436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053428
57261	NC_013158	TCA	2	6	2410455	2410460	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257053428
57262	NC_013158	CGA	2	6	2410525	2410530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053428
57263	NC_013158	ATCG	2	8	2410589	2410596	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
57264	NC_013158	GCGA	2	8	2410649	2410656	25 %	0 %	50 %	25 %	257053429
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57320	NC_013158	CGG	2	6	2412680	2412685	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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57322	NC_013158	CTG	2	6	2412719	2412724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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57327	NC_013158	CT	3	6	2412986	2412991	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
57328	NC_013158	GAC	2	6	2413025	2413030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57329	NC_013158	GTG	2	6	2413208	2413213	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
57330	NC_013158	AAC	2	6	2413250	2413255	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257053432
57331	NC_013158	CGCC	2	8	2413261	2413268	0 %	0 %	25 %	75 %	257053432
57332	NC_013158	GC	3	6	2413278	2413283	0 %	0 %	50 %	50 %	257053432
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57335	NC_013158	TGA	2	6	2413443	2413448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257053432
57336	NC_013158	GCGTT	2	10	2413457	2413466	0 %	40 %	40 %	20 %	257053432
57337	NC_013158	TCG	2	6	2413526	2413531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053432
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57340	NC_013158	GC	3	6	2413704	2413709	0 %	0 %	50 %	50 %	257053432
57341	NC_013158	CGA	2	6	2413719	2413724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053432
57342	NC_013158	TCG	3	9	2413732	2413740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053433
57343	NC_013158	GCG	2	6	2413744	2413749	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257053433
57344	NC_013158	TCG	2	6	2413774	2413779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053433
57345	NC_013158	AGC	2	6	2413780	2413785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053433
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