MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halorhabdus utahensis DSM 12940 chromosome

Total Repeats: 74047

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
56001	NC_013158	GGAC	2	8	2358764	2358771	25 %	0 %	50 %	25 %	257053385
56002	NC_013158	CGA	3	9	2358776	2358784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053385
56003	NC_013158	TGG	2	6	2358848	2358853	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257053385
56004	NC_013158	ACG	2	6	2358886	2358891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053385
56005	NC_013158	TCG	3	9	2358910	2358918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053385
56006	NC_013158	GCGTG	2	10	2358923	2358932	0 %	20 %	60 %	20 %	257053385
56007	NC_013158	GACG	2	8	2358947	2358954	25 %	0 %	50 %	25 %	257053385
56008	NC_013158	GAG	2	6	2358957	2358962	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257053385
56009	NC_013158	GCC	2	6	2358998	2359003	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257053385
56010	NC_013158	CA	3	6	2359032	2359037	50 %	0 %	0 %	50 %	257053385
56011	NC_013158	AAT	2	6	2359096	2359101	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257053385
56012	NC_013158	TCGAC	2	10	2359119	2359128	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
56013	NC_013158	ACC	2	6	2359150	2359155	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
56014	NC_013158	CCA	2	6	2359204	2359209	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257053386
56015	NC_013158	GGAT	2	8	2359301	2359308	25 %	25 %	50 %	0 %	257053386
56016	NC_013158	CGA	2	6	2359374	2359379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053386
56017	NC_013158	GTC	2	6	2359381	2359386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053386
56018	NC_013158	TCG	2	6	2359394	2359399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053386
56019	NC_013158	GAG	2	6	2359519	2359524	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257053386
56020	NC_013158	TCG	2	6	2359529	2359534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053386
56021	NC_013158	CCGG	2	8	2359544	2359551	0 %	0 %	50 %	50 %	257053386
56022	NC_013158	CCAG	2	8	2359596	2359603	25 %	0 %	25 %	50 %	257053386
56023	NC_013158	GTG	2	6	2359628	2359633	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257053386
56024	NC_013158	GAC	2	6	2359654	2359659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053386
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56026	NC_013158	TAC	2	6	2359723	2359728	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257053386
56027	NC_013158	TCG	2	6	2359745	2359750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053386
56028	NC_013158	AGAT	2	8	2359875	2359882	50 %	25 %	25 %	0 %	257053387
56029	NC_013158	CGA	2	6	2359978	2359983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053387
56030	NC_013158	AGT	2	6	2359988	2359993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257053387
56031	NC_013158	TCG	2	6	2360028	2360033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053387
56032	NC_013158	CGACGG	2	12	2360038	2360049	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	257053387
56033	NC_013158	CGA	2	6	2360059	2360064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053387
56034	NC_013158	ACG	2	6	2360079	2360084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053387
56035	NC_013158	GAG	2	6	2360090	2360095	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257053387
56036	NC_013158	GAC	3	9	2360117	2360125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053387
56037	NC_013158	CGGTGT	2	12	2360152	2360163	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	257053387
56038	NC_013158	CGT	2	6	2360206	2360211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053387
56039	NC_013158	TTG	2	6	2360252	2360257	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257053387
56040	NC_013158	GTC	2	6	2360267	2360272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053387
56041	NC_013158	GCG	2	6	2360383	2360388	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257053387
56042	NC_013158	AGG	2	6	2360415	2360420	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257053387
56043	NC_013158	GAT	2	6	2360452	2360457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257053387
56044	NC_013158	TGC	2	6	2360511	2360516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053387
56045	NC_013158	GCG	2	6	2360568	2360573	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257053387
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56049	NC_013158	GTT	2	6	2360650	2360655	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257053387
56050	NC_013158	GCTC	2	8	2360670	2360677	0 %	25 %	25 %	50 %	257053387
56051	NC_013158	ATC	2	6	2360690	2360695	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257053387
56052	NC_013158	GAC	2	6	2360716	2360721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053387
56053	NC_013158	CGC	2	6	2360767	2360772	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
56054	NC_013158	CCGG	2	8	2360838	2360845	0 %	0 %	50 %	50 %	257053388
56055	NC_013158	GCG	2	6	2360865	2360870	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257053388
56056	NC_013158	GCG	3	9	2360905	2360913	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257053388
56057	NC_013158	TCGC	3	12	2360921	2360932	0 %	25 %	25 %	50 %	257053388
56058	NC_013158	CGA	2	6	2360933	2360938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053388
56059	NC_013158	CAA	2	6	2360963	2360968	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257053388
56060	NC_013158	GAG	2	6	2360976	2360981	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257053388
56061	NC_013158	GAC	2	6	2360982	2360987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053388
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56063	NC_013158	GAC	2	6	2361039	2361044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053388
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56065	NC_013158	CGACAT	2	12	2361233	2361244	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	257053388
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56070	NC_013158	GCCG	2	8	2361429	2361436	0 %	0 %	50 %	50 %	257053389
56071	NC_013158	CTC	2	6	2361439	2361444	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257053389
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56084	NC_013158	GC	3	6	2361815	2361820	0 %	0 %	50 %	50 %	257053389
56085	NC_013158	GC	3	6	2361896	2361901	0 %	0 %	50 %	50 %	257053389
56086	NC_013158	CCG	2	6	2361915	2361920	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257053389
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56099	NC_013158	CGA	2	6	2362242	2362247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053389
56100	NC_013158	ACG	2	6	2362289	2362294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56101	NC_013158	TTC	2	6	2362324	2362329	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56102	NC_013158	CGG	2	6	2362397	2362402	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
56103	NC_013158	ACC	2	6	2362413	2362418	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
56104	NC_013158	CCT	2	6	2362449	2362454	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
56105	NC_013158	GCTC	2	8	2362496	2362503	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
56106	NC_013158	CGCT	2	8	2362515	2362522	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
56107	NC_013158	TCGC	2	8	2362523	2362530	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
56108	NC_013158	GAA	2	6	2362551	2362556	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56109	NC_013158	CGT	2	6	2362558	2362563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56110	NC_013158	GCT	2	6	2362662	2362667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56111	NC_013158	GATC	2	8	2362691	2362698	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
56112	NC_013158	ATC	2	6	2362716	2362721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56113	NC_013158	TG	3	6	2362724	2362729	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
56114	NC_013158	GAGC	2	8	2362737	2362744	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
56115	NC_013158	GC	3	6	2362754	2362759	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
56116	NC_013158	CGA	2	6	2362810	2362815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56117	NC_013158	GCC	2	6	2362841	2362846	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
56118	NC_013158	GGA	2	6	2362867	2362872	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
56119	NC_013158	CGA	2	6	2362914	2362919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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56122	NC_013158	CAC	2	6	2363211	2363216	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
56123	NC_013158	CGT	2	6	2363237	2363242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56124	NC_013158	CCA	2	6	2363282	2363287	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
56125	NC_013158	GA	4	8	2363289	2363296	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
56126	NC_013158	GAC	2	6	2363318	2363323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053391
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56232	NC_013158	CG	3	6	2367790	2367795	0 %	0 %	50 %	50 %	257053396
56233	NC_013158	CGATCG	2	12	2367899	2367910	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	257053396
56234	NC_013158	GCC	2	6	2367976	2367981	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257053396
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56348	NC_013158	GAC	2	6	2372067	2372072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053400
56349	NC_013158	CGA	3	9	2372090	2372098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053400
56350	NC_013158	GGT	2	6	2372105	2372110	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257053400
56351	NC_013158	ACG	2	6	2372115	2372120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053400
56352	NC_013158	CGT	2	6	2372129	2372134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053400
56353	NC_013158	C	6	6	2372137	2372142	0 %	0 %	0 %	100 %	257053400
56354	NC_013158	TTC	2	6	2372145	2372150	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257053400
56355	NC_013158	CGGC	2	8	2372165	2372172	0 %	0 %	50 %	50 %	257053400
56356	NC_013158	GAT	2	6	2372204	2372209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257053400
56357	NC_013158	TCA	2	6	2372245	2372250	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257053400
56358	NC_013158	GAC	2	6	2372270	2372275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053400
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56360	NC_013158	CGT	2	6	2372405	2372410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053400
56361	NC_013158	GGC	2	6	2372418	2372423	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257053400
56362	NC_013158	GCT	2	6	2372498	2372503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053400
56363	NC_013158	CGG	2	6	2372528	2372533	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257053400
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56368	NC_013158	CGT	3	9	2372771	2372779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053400
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56371	NC_013158	GGT	2	6	2372867	2372872	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257053400
56372	NC_013158	CGA	2	6	2372873	2372878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053400
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56376	NC_013158	CGC	2	6	2373003	2373008	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257053401
56377	NC_013158	TCGG	2	8	2373061	2373068	0 %	25 %	50 %	25 %	257053401
56378	NC_013158	CGA	2	6	2373128	2373133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053401
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56382	NC_013158	CGCC	2	8	2373270	2373277	0 %	0 %	25 %	75 %	257053401
56383	NC_013158	TGA	2	6	2373308	2373313	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257053401
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56387	NC_013158	CGA	2	6	2373597	2373602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053402
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56402	NC_013158	CT	3	6	2374318	2374323	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
56403	NC_013158	TA	3	6	2374362	2374367	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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56405	NC_013158	ACTC	2	8	2374422	2374429	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
56406	NC_013158	ACC	2	6	2374571	2374576	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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56409	NC_013158	ATA	2	6	2374672	2374677	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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56412	NC_013158	TC	3	6	2374834	2374839	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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56425	NC_013158	TCG	2	6	2375640	2375645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053403
56426	NC_013158	TCG	2	6	2375715	2375720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053403
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56452	NC_013158	GCCC	2	8	2376436	2376443	0 %	0 %	25 %	75 %	257053404
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56464	NC_013158	CGA	2	6	2376862	2376867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257053404
56465	NC_013158	GGT	2	6	2376868	2376873	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257053404
56466	NC_013158	TCGA	2	8	2376936	2376943	25 %	25 %	25 %	25 %	257053404
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56491	NC_013158	GC	3	6	2378050	2378055	0 %	0 %	50 %	50 %	257053404
56492	NC_013158	GCG	2	6	2378068	2378073	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257053404
56493	NC_013158	GCC	2	6	2378090	2378095	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257053404
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56499	NC_013158	GTC	2	6	2378285	2378290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257053404
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