MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Hirschia baltica ATCC 49814 chromosome

Total Repeats: 66690

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_012982	CGG	2	6	26344	26349	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254292403
502	NC_012982	TCA	2	6	26370	26375	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254292403
503	NC_012982	TTG	3	9	26408	26416	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254292403
504	NC_012982	CCA	2	6	26469	26474	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	254292403
505	NC_012982	GGC	2	6	26618	26623	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254292403
506	NC_012982	CAT	3	9	26632	26640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254292403
507	NC_012982	GCA	2	6	26646	26651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254292403
508	NC_012982	TTTA	2	8	26741	26748	25 %	75 %	0 %	0 %	254292403
509	NC_012982	GCG	2	6	26952	26957	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254292403
510	NC_012982	AAT	3	9	27000	27008	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254292403
511	NC_012982	GGC	2	6	27011	27016	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254292403
512	NC_012982	TCA	2	6	27030	27035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254292403
513	NC_012982	TCAA	2	8	27045	27052	50 %	25 %	0 %	25 %	254292403
514	NC_012982	TTGT	2	8	27113	27120	0 %	75 %	25 %	0 %	254292403
515	NC_012982	AG	3	6	27126	27131	50 %	0 %	50 %	0 %	254292403
516	NC_012982	T	6	6	27194	27199	0 %	100 %	0 %	0 %	254292403
517	NC_012982	CAT	3	9	27286	27294	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254292403
518	NC_012982	TCT	2	6	27378	27383	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254292403
519	NC_012982	T	6	6	27440	27445	0 %	100 %	0 %	0 %	254292403
520	NC_012982	GAA	2	6	27531	27536	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254292403
521	NC_012982	CAT	2	6	27565	27570	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254292403
522	NC_012982	CTT	2	6	27583	27588	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254292403
523	NC_012982	CTG	2	6	27613	27618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254292403
524	NC_012982	GGT	2	6	27673	27678	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254292403
525	NC_012982	TGC	2	6	27682	27687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254292403
526	NC_012982	GTTT	2	8	27858	27865	0 %	75 %	25 %	0 %	254292403
527	NC_012982	AGC	2	6	27890	27895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254292403
528	NC_012982	T	6	6	27963	27968	0 %	100 %	0 %	0 %	254292403
529	NC_012982	CTTGTT	2	12	28009	28020	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	254292403
530	NC_012982	TTGC	2	8	28030	28037	0 %	50 %	25 %	25 %	254292403
531	NC_012982	GTTTTT	2	12	28062	28073	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	254292403
532	NC_012982	TCG	2	6	28093	28098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254292403
533	NC_012982	CTT	2	6	28261	28266	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254292403
534	NC_012982	TGAT	2	8	28364	28371	25 %	50 %	25 %	0 %	254292403
535	NC_012982	GCTTTT	2	12	28395	28406	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	254292403
536	NC_012982	CAT	2	6	28426	28431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254292403
537	NC_012982	TTG	2	6	28462	28467	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254292403
538	NC_012982	GGC	2	6	28481	28486	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254292403
539	NC_012982	T	6	6	28505	28510	0 %	100 %	0 %	0 %	254292403
540	NC_012982	CTT	2	6	28525	28530	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254292403
541	NC_012982	CTT	3	9	28633	28641	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254292403
542	NC_012982	AAT	2	6	28680	28685	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254292403
543	NC_012982	AATAA	2	10	28752	28761	80 %	20 %	0 %	0 %	254292403
544	NC_012982	TTTTC	2	10	28825	28834	0 %	80 %	0 %	20 %	254292403
545	NC_012982	GCC	2	6	28931	28936	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254292403
546	NC_012982	T	7	7	28937	28943	0 %	100 %	0 %	0 %	254292403
547	NC_012982	TGA	2	6	29078	29083	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254292403
548	NC_012982	AAAGC	2	10	29094	29103	60 %	0 %	20 %	20 %	254292403
549	NC_012982	CAAA	2	8	29155	29162	75 %	0 %	0 %	25 %	254292403
550	NC_012982	TGTT	2	8	29174	29181	0 %	75 %	25 %	0 %	254292403
551	NC_012982	CTT	2	6	29194	29199	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254292403
552	NC_012982	TGAA	2	8	29337	29344	50 %	25 %	25 %	0 %	254292404
553	NC_012982	CTT	2	6	29356	29361	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254292404
554	NC_012982	TTGGCA	2	12	29376	29387	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	254292404
555	NC_012982	CG	3	6	29425	29430	0 %	0 %	50 %	50 %	254292404
556	NC_012982	ATC	2	6	29534	29539	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254292404
557	NC_012982	TGTT	2	8	29540	29547	0 %	75 %	25 %	0 %	254292404
558	NC_012982	CTGA	2	8	29629	29636	25 %	25 %	25 %	25 %	254292404
559	NC_012982	TGA	2	6	29644	29649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254292404
560	NC_012982	TCA	2	6	29676	29681	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254292404
561	NC_012982	GC	3	6	29770	29775	0 %	0 %	50 %	50 %	254292404
562	NC_012982	CCG	2	6	29808	29813	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254292404
563	NC_012982	TTGA	2	8	29924	29931	25 %	50 %	25 %	0 %	254292404
564	NC_012982	A	6	6	29983	29988	100 %	0 %	0 %	0 %	254292404
565	NC_012982	TCG	2	6	30030	30035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254292404
566	NC_012982	TCG	2	6	30054	30059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254292404
567	NC_012982	GGCG	2	8	30221	30228	0 %	0 %	75 %	25 %	254292404
568	NC_012982	TAT	2	6	30257	30262	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254292404
569	NC_012982	A	6	6	30309	30314	100 %	0 %	0 %	0 %	254292404
570	NC_012982	ATC	2	6	30323	30328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254292404
571	NC_012982	GT	3	6	30477	30482	0 %	50 %	50 %	0 %	254292405
572	NC_012982	CCG	2	6	30591	30596	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254292405
573	NC_012982	CGA	2	6	30604	30609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254292405
574	NC_012982	CTT	2	6	30670	30675	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254292405
575	NC_012982	ATA	2	6	30728	30733	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254292405
576	NC_012982	CAA	2	6	30751	30756	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254292405
577	NC_012982	ATCA	2	8	30842	30849	50 %	25 %	0 %	25 %	254292405
578	NC_012982	CAA	2	6	30910	30915	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254292405
579	NC_012982	TTG	2	6	30925	30930	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254292405
580	NC_012982	GAT	2	6	31004	31009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254292405
581	NC_012982	GCG	2	6	31055	31060	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254292405
582	NC_012982	G	6	6	31060	31065	0 %	0 %	100 %	0 %	254292405
583	NC_012982	CAT	2	6	31070	31075	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254292405
584	NC_012982	GGT	2	6	31114	31119	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254292405
585	NC_012982	GCA	2	6	31159	31164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254292405
586	NC_012982	TAT	2	6	31165	31170	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254292405
587	NC_012982	CCA	2	6	31183	31188	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	254292405
588	NC_012982	CGG	2	6	31194	31199	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254292405
589	NC_012982	TTC	2	6	31319	31324	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254292405
590	NC_012982	GGT	2	6	31331	31336	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254292405
591	NC_012982	TCA	2	6	31377	31382	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254292405
592	NC_012982	CTG	2	6	31383	31388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254292405
593	NC_012982	CA	3	6	31397	31402	50 %	0 %	0 %	50 %	254292405
594	NC_012982	GTC	2	6	31416	31421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254292405
595	NC_012982	CAT	2	6	31554	31559	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254292406
596	NC_012982	GC	3	6	31567	31572	0 %	0 %	50 %	50 %	254292406
597	NC_012982	GCG	2	6	31643	31648	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254292406
598	NC_012982	TTC	2	6	31654	31659	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254292406
599	NC_012982	GTT	2	6	31725	31730	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254292406
600	NC_012982	ATC	2	6	31813	31818	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254292406
601	NC_012982	AGC	2	6	31837	31842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254292406
602	NC_012982	AT	3	6	31926	31931	50 %	50 %	0 %	0 %	254292406
603	NC_012982	GCG	3	9	31973	31981	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254292406
604	NC_012982	GT	3	6	31995	32000	0 %	50 %	50 %	0 %	254292406
605	NC_012982	TG	3	6	32076	32081	0 %	50 %	50 %	0 %	254292406
606	NC_012982	GAA	2	6	32090	32095	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254292406
607	NC_012982	CAT	2	6	32104	32109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254292406
608	NC_012982	AC	3	6	32253	32258	50 %	0 %	0 %	50 %	254292406
609	NC_012982	GCG	2	6	32288	32293	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254292406
610	NC_012982	T	6	6	32299	32304	0 %	100 %	0 %	0 %	254292406
611	NC_012982	AGGTG	2	10	32317	32326	20 %	20 %	60 %	0 %	254292406
612	NC_012982	AAT	2	6	32333	32338	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254292406
613	NC_012982	TGA	2	6	32374	32379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254292406
614	NC_012982	GC	3	6	32421	32426	0 %	0 %	50 %	50 %	254292406
615	NC_012982	TTC	2	6	32446	32451	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254292406
616	NC_012982	GC	3	6	32491	32496	0 %	0 %	50 %	50 %	254292406
617	NC_012982	AAG	2	6	32501	32506	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254292406
618	NC_012982	CCA	2	6	32536	32541	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	254292406
619	NC_012982	AGGT	2	8	32707	32714	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
620	NC_012982	CAG	2	6	32732	32737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254292407
621	NC_012982	TCCG	2	8	32810	32817	0 %	25 %	25 %	50 %	254292407
622	NC_012982	ACA	2	6	32833	32838	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254292407
623	NC_012982	TCG	2	6	32918	32923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254292407
624	NC_012982	AAC	2	6	32993	32998	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254292407
625	NC_012982	CTG	2	6	33008	33013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254292407
626	NC_012982	ATG	2	6	33077	33082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254292407
627	NC_012982	TGT	2	6	33141	33146	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254292407
628	NC_012982	CTT	4	12	33161	33172	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254292407
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