MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239 plasmid pHLAC01

Total Repeats: 9364

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_012030	GCT	2	6	166020	166025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222481288
3502	NC_012030	A	7	7	166118	166124	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3503	NC_012030	CAA	2	6	166148	166153	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3504	NC_012030	TCG	2	6	166157	166162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3505	NC_012030	AGTG	2	8	166208	166215	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3506	NC_012030	TCG	2	6	166251	166256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222481289
3507	NC_012030	AC	3	6	166309	166314	50 %	0 %	0 %	50 %	222481289
3508	NC_012030	TCG	2	6	166340	166345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222481289
3509	NC_012030	CGA	2	6	166358	166363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222481289
3510	NC_012030	CGA	2	6	166374	166379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222481289
3511	NC_012030	TGT	2	6	166390	166395	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222481289
3512	NC_012030	CTG	2	6	166427	166432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222481289
3513	NC_012030	TGA	2	6	166470	166475	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222481290
3514	NC_012030	TCG	2	6	166502	166507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222481290
3515	NC_012030	CGTG	2	8	166559	166566	0 %	25 %	50 %	25 %	222481290
3516	NC_012030	CGT	2	6	166614	166619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222481290
3517	NC_012030	GTTC	2	8	166622	166629	0 %	50 %	25 %	25 %	222481290
3518	NC_012030	ACTCC	2	10	166631	166640	20 %	20 %	0 %	60 %	222481290
3519	NC_012030	CGTCT	2	10	166651	166660	0 %	40 %	20 %	40 %	222481290
3520	NC_012030	TCG	2	6	166697	166702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222481290
3521	NC_012030	TCG	2	6	166739	166744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222481290
3522	NC_012030	CAG	2	6	166789	166794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222481290
3523	NC_012030	GCTT	2	8	166901	166908	0 %	50 %	25 %	25 %	222481290
3524	NC_012030	AGCCGT	2	12	166965	166976	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	222481290
3525	NC_012030	GTA	2	6	166978	166983	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222481290
3526	NC_012030	CGG	2	6	166989	166994	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222481290
3527	NC_012030	CGG	2	6	167025	167030	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222481290
3528	NC_012030	GGC	2	6	167089	167094	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222481290
3529	NC_012030	CGA	2	6	167100	167105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222481290
3530	NC_012030	TCG	2	6	167120	167125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222481290
3531	NC_012030	ACG	2	6	167126	167131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222481290
3532	NC_012030	TC	3	6	167165	167170	0 %	50 %	0 %	50 %	222481290
3533	NC_012030	CGG	2	6	167173	167178	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222481290
3534	NC_012030	TCGA	2	8	167179	167186	25 %	25 %	25 %	25 %	222481290
3535	NC_012030	GAC	2	6	167203	167208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222481290
3536	NC_012030	GTA	2	6	167257	167262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222481290
3537	NC_012030	TGG	2	6	167290	167295	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222481290
3538	NC_012030	TGA	2	6	167297	167302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222481290
3539	NC_012030	TTC	2	6	167344	167349	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222481290
3540	NC_012030	AAC	2	6	167375	167380	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222481290
3541	NC_012030	GAA	2	6	167407	167412	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222481290
3542	NC_012030	TCG	2	6	167414	167419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222481290
3543	NC_012030	GT	3	6	167483	167488	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3544	NC_012030	A	6	6	167549	167554	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3545	NC_012030	CTG	2	6	167582	167587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3546	NC_012030	GTC	2	6	167616	167621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3547	NC_012030	AT	3	6	167623	167628	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3548	NC_012030	CCT	2	6	167657	167662	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3549	NC_012030	GAGT	2	8	167723	167730	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3550	NC_012030	AGTG	2	8	167736	167743	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3551	NC_012030	CGCTC	2	10	167756	167765	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
3552	NC_012030	CTGG	2	8	167783	167790	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3553	NC_012030	GTC	2	6	167797	167802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3554	NC_012030	CT	3	6	167862	167867	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3555	NC_012030	TAA	2	6	167893	167898	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3556	NC_012030	GGC	2	6	167907	167912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3557	NC_012030	TC	3	6	167921	167926	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3558	NC_012030	GTT	2	6	167931	167936	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3559	NC_012030	CTA	2	6	167937	167942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3560	NC_012030	CAA	2	6	167950	167955	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3561	NC_012030	TGG	2	6	168172	168177	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222481291
3562	NC_012030	CT	3	6	168178	168183	0 %	50 %	0 %	50 %	222481291
3563	NC_012030	GTC	2	6	168192	168197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222481291
3564	NC_012030	AGC	3	9	168372	168380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3565	NC_012030	TCG	2	6	168493	168498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222481292
3566	NC_012030	AGC	2	6	168526	168531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222481292
3567	NC_012030	TGC	3	9	168534	168542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222481292
3568	NC_012030	GCA	2	6	168559	168564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222481292
3569	NC_012030	CGA	2	6	168581	168586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222481292
3570	NC_012030	GGA	2	6	168602	168607	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222481292
3571	NC_012030	TCA	2	6	168640	168645	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222481292
3572	NC_012030	AAG	2	6	168713	168718	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222481292
3573	NC_012030	GTA	2	6	168772	168777	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222481292
3574	NC_012030	TCG	2	6	168781	168786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222481292
3575	NC_012030	CTC	2	6	168855	168860	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222481292
3576	NC_012030	TGA	2	6	168871	168876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222481292
3577	NC_012030	TGGT	2	8	168899	168906	0 %	50 %	50 %	0 %	222481292
3578	NC_012030	TA	3	6	168918	168923	50 %	50 %	0 %	0 %	222481292
3579	NC_012030	CATT	2	8	168939	168946	25 %	50 %	0 %	25 %	222481292
3580	NC_012030	AG	3	6	169003	169008	50 %	0 %	50 %	0 %	222481293
3581	NC_012030	GTT	2	6	169044	169049	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222481293
3582	NC_012030	GCA	2	6	169062	169067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222481293
3583	NC_012030	CGG	2	6	169069	169074	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222481293
3584	NC_012030	TG	3	6	169083	169088	0 %	50 %	50 %	0 %	222481293
3585	NC_012030	GCT	2	6	169128	169133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222481293
3586	NC_012030	GGAC	2	8	169146	169153	25 %	0 %	50 %	25 %	222481293
3587	NC_012030	TGGGT	2	10	169270	169279	0 %	40 %	60 %	0 %	222481293
3588	NC_012030	TCA	2	6	169318	169323	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222481293
3589	NC_012030	GCT	2	6	169327	169332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222481293
3590	NC_012030	CGC	2	6	169349	169354	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222481293
3591	NC_012030	TCG	2	6	169359	169364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222481293
3592	NC_012030	AC	3	6	169402	169407	50 %	0 %	0 %	50 %	222481293
3593	NC_012030	GACC	2	8	169431	169438	25 %	0 %	25 %	50 %	222481293
3594	NC_012030	TC	3	6	169656	169661	0 %	50 %	0 %	50 %	222481293
3595	NC_012030	GTCT	2	8	169736	169743	0 %	50 %	25 %	25 %	222481293
3596	NC_012030	ACC	2	6	169847	169852	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222481293
3597	NC_012030	A	6	6	169980	169985	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3598	NC_012030	CA	3	6	170029	170034	50 %	0 %	0 %	50 %	222481294
3599	NC_012030	GTC	2	6	170050	170055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222481294
3600	NC_012030	GTC	2	6	170092	170097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222481294
3601	NC_012030	GTG	2	6	170109	170114	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222481294
3602	NC_012030	CTT	2	6	170116	170121	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222481294
3603	NC_012030	CCG	2	6	170132	170137	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222481294
3604	NC_012030	TGGT	2	8	170175	170182	0 %	50 %	50 %	0 %	222481294
3605	NC_012030	CGA	2	6	170265	170270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222481294
3606	NC_012030	CGT	2	6	170334	170339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222481294
3607	NC_012030	TC	3	6	170401	170406	0 %	50 %	0 %	50 %	222481294
3608	NC_012030	TGGGA	2	10	170426	170435	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
3609	NC_012030	ATG	2	6	170441	170446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3610	NC_012030	A	6	6	170471	170476	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3611	NC_012030	CGA	2	6	170503	170508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222481295
3612	NC_012030	CA	3	6	170533	170538	50 %	0 %	0 %	50 %	222481295
3613	NC_012030	AGC	2	6	170612	170617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222481295
3614	NC_012030	GCG	2	6	170634	170639	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222481295
3615	NC_012030	TCG	2	6	170661	170666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222481295
3616	NC_012030	AT	3	6	170714	170719	50 %	50 %	0 %	0 %	222481296
3617	NC_012030	ACG	2	6	170761	170766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222481296
3618	NC_012030	TCT	2	6	170852	170857	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222481296
3619	NC_012030	CTCTT	2	10	170896	170905	0 %	60 %	0 %	40 %	222481296
3620	NC_012030	GAT	2	6	170955	170960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222481296
3621	NC_012030	ATTCG	2	10	170988	170997	20 %	40 %	20 %	20 %	222481296
3622	NC_012030	T	6	6	171076	171081	0 %	100 %	0 %	0 %	222481296
3623	NC_012030	TCT	2	6	171203	171208	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222481296
3624	NC_012030	TGG	2	6	171213	171218	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222481296
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3735	NC_012030	AAG	2	6	178173	178178	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3740	NC_012030	TGCT	2	8	178425	178432	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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3993	NC_012030	AGC	2	6	190517	190522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222481312
3994	NC_012030	GCA	2	6	190573	190578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222481312
3995	NC_012030	GAA	2	6	190620	190625	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222481312
3996	NC_012030	GAA	2	6	190652	190657	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222481312
3997	NC_012030	CCA	2	6	190735	190740	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222481312
3998	NC_012030	ATT	2	6	190746	190751	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222481312
3999	NC_012030	AC	3	6	190759	190764	50 %	0 %	0 %	50 %	222481312
4000	NC_012030	GTG	2	6	190840	190845	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222481312

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