MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239 plasmid pHLAC01

Total Repeats: 9364

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2002	NC_012030	GTT	2	6	95330	95335	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222481224
2003	NC_012030	TTG	2	6	95346	95351	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222481224
2004	NC_012030	TAGTC	2	10	95382	95391	20 %	40 %	20 %	20 %	222481224
2005	NC_012030	CGA	2	6	95470	95475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2006	NC_012030	GA	3	6	95474	95479	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2007	NC_012030	ACGG	2	8	95483	95490	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2008	NC_012030	GCTGTC	2	12	95502	95513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2009	NC_012030	GGC	2	6	95514	95519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2010	NC_012030	GCC	2	6	95525	95530	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2011	NC_012030	CGA	2	6	95562	95567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2012	NC_012030	CAG	2	6	95586	95591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2013	NC_012030	AAG	2	6	95656	95661	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2014	NC_012030	AC	3	6	95703	95708	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2015	NC_012030	AGCA	2	8	95713	95720	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2016	NC_012030	CTAA	2	8	95727	95734	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2017	NC_012030	ATA	2	6	95754	95759	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2018	NC_012030	GACA	2	8	95803	95810	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2019	NC_012030	AAAGA	2	10	95840	95849	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
2020	NC_012030	AGC	2	6	95874	95879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2021	NC_012030	GA	3	6	95889	95894	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2022	NC_012030	CTG	2	6	95979	95984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222481225
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2024	NC_012030	GAG	2	6	96120	96125	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222481225
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2125	NC_012030	GAT	2	6	101243	101248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222481228
2126	NC_012030	AGG	2	6	101253	101258	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222481228
2127	NC_012030	ACG	2	6	101262	101267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222481228
2128	NC_012030	TAC	2	6	101303	101308	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222481228
2129	NC_012030	TCC	2	6	101438	101443	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222481228
2130	NC_012030	CTG	2	6	101476	101481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222481228
2131	NC_012030	CAG	2	6	101489	101494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222481228
2132	NC_012030	GAC	2	6	101498	101503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222481228
2133	NC_012030	TAC	2	6	101506	101511	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222481228
2134	NC_012030	CGTG	2	8	101520	101527	0 %	25 %	50 %	25 %	222481228
2135	NC_012030	GAC	2	6	101528	101533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222481228
2136	NC_012030	GAAG	2	8	101557	101564	50 %	0 %	50 %	0 %	222481228
2137	NC_012030	TAC	2	6	101675	101680	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222481228
2138	NC_012030	GAA	2	6	101765	101770	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222481228
2139	NC_012030	TGC	2	6	101880	101885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222481228
2140	NC_012030	CTC	2	6	101894	101899	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222481228
2141	NC_012030	CGA	2	6	101908	101913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222481228
2142	NC_012030	CAC	2	6	101947	101952	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222481228
2143	NC_012030	AAC	2	6	101975	101980	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222481228
2144	NC_012030	TATAAC	2	12	102026	102037	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	222481228
2145	NC_012030	CGCC	2	8	102046	102053	0 %	0 %	25 %	75 %	222481228
2146	NC_012030	AC	3	6	102054	102059	50 %	0 %	0 %	50 %	222481228
2147	NC_012030	AT	3	6	102072	102077	50 %	50 %	0 %	0 %	222481228
2148	NC_012030	CGA	2	6	102172	102177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222481228
2149	NC_012030	GAT	2	6	102233	102238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222481228
2150	NC_012030	GAG	2	6	102254	102259	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222481228
2151	NC_012030	ATC	2	6	102326	102331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222481228
2152	NC_012030	TCC	2	6	102337	102342	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222481228
2153	NC_012030	TAC	2	6	102344	102349	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222481228
2154	NC_012030	GAA	2	6	102448	102453	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222481228
2155	NC_012030	TGT	2	6	102463	102468	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222481228
2156	NC_012030	GAC	2	6	102563	102568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222481228
2157	NC_012030	TAT	2	6	102571	102576	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222481228
2158	NC_012030	CCA	2	6	102589	102594	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222481228
2159	NC_012030	CT	3	6	102660	102665	0 %	50 %	0 %	50 %	222481228
2160	NC_012030	GAG	2	6	102687	102692	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222481228
2161	NC_012030	ATC	2	6	102731	102736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222481228
2162	NC_012030	AAG	2	6	102753	102758	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222481228
2163	NC_012030	AGA	2	6	102763	102768	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222481228
2164	NC_012030	GATC	2	8	102820	102827	25 %	25 %	25 %	25 %	222481228
2165	NC_012030	CGA	2	6	102985	102990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222481228
2166	NC_012030	GCT	2	6	102994	102999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222481228
2167	NC_012030	GAA	2	6	103001	103006	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222481228
2168	NC_012030	GAG	2	6	103025	103030	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222481228
2169	NC_012030	GAG	2	6	103079	103084	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222481228
2170	NC_012030	AG	3	6	103119	103124	50 %	0 %	50 %	0 %	222481228
2171	NC_012030	AGGA	2	8	103167	103174	50 %	0 %	50 %	0 %	222481228
2172	NC_012030	GAC	2	6	103175	103180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222481228
2173	NC_012030	TAC	2	6	103265	103270	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222481228
2174	NC_012030	GACC	2	8	103279	103286	25 %	0 %	25 %	50 %	222481228
2175	NC_012030	GAA	2	6	103294	103299	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222481228
2176	NC_012030	ATG	2	6	103374	103379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222481228
2177	NC_012030	GCT	2	6	103506	103511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2178	NC_012030	TGA	2	6	103518	103523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222481229
2179	NC_012030	CGT	2	6	103543	103548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222481229
2180	NC_012030	AGA	2	6	103564	103569	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222481229
2181	NC_012030	TGA	2	6	103573	103578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222481229
2182	NC_012030	TGA	2	6	103582	103587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222481229
2183	NC_012030	TTC	2	6	103608	103613	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222481229
2184	NC_012030	CGA	2	6	103621	103626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222481229
2185	NC_012030	GTC	2	6	103655	103660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222481229
2186	NC_012030	CTG	2	6	103748	103753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222481229
2187	NC_012030	AAT	2	6	103757	103762	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222481229
2188	NC_012030	TGC	2	6	103950	103955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2189	NC_012030	TCG	2	6	103981	103986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2190	NC_012030	GAAG	2	8	104001	104008	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2191	NC_012030	TAT	2	6	104009	104014	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2192	NC_012030	ATC	2	6	104020	104025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2193	NC_012030	ATC	2	6	104095	104100	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222481230
2194	NC_012030	TTC	2	6	104221	104226	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222481230
2195	NC_012030	TAC	2	6	104231	104236	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222481230
2196	NC_012030	GA	4	8	104239	104246	50 %	0 %	50 %	0 %	222481230
2197	NC_012030	TCG	2	6	104255	104260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222481230
2198	NC_012030	AGA	2	6	104310	104315	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222481230
2199	NC_012030	GAC	2	6	104338	104343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222481230
2200	NC_012030	TTC	2	6	104365	104370	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222481230
2201	NC_012030	TCA	2	6	104430	104435	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222481230
2202	NC_012030	TTC	2	6	104566	104571	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222481230
2203	NC_012030	TCC	2	6	104580	104585	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222481230
2204	NC_012030	ACCGAA	2	12	104659	104670	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	222481230
2205	NC_012030	CAT	2	6	104721	104726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222481230
2206	NC_012030	AACA	2	8	104755	104762	75 %	0 %	0 %	25 %	222481230
2207	NC_012030	ACG	3	9	104765	104773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222481230
2208	NC_012030	CAG	2	6	104857	104862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222481230
2209	NC_012030	T	6	6	104940	104945	0 %	100 %	0 %	0 %	222481231
2210	NC_012030	TCC	2	6	104954	104959	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222481231
2211	NC_012030	AGT	2	6	105013	105018	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222481231
2212	NC_012030	GAC	2	6	105037	105042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222481231
2213	NC_012030	CAC	2	6	105090	105095	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222481231
2214	NC_012030	TGA	2	6	105198	105203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222481231
2215	NC_012030	CCT	2	6	105318	105323	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222481231
2216	NC_012030	GA	3	6	105380	105385	50 %	0 %	50 %	0 %	222481231
2217	NC_012030	GCT	2	6	105398	105403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222481231
2218	NC_012030	GTA	2	6	105409	105414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222481231
2219	NC_012030	CCTG	2	8	105461	105468	0 %	25 %	25 %	50 %	222481231
2220	NC_012030	CTG	2	6	105487	105492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222481231
2221	NC_012030	GTAC	2	8	105531	105538	25 %	25 %	25 %	25 %	222481231
2222	NC_012030	TCA	2	6	105557	105562	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222481231
2223	NC_012030	CAG	2	6	105586	105591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222481231
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2225	NC_012030	GATA	2	8	105660	105667	50 %	25 %	25 %	0 %	222481231
2226	NC_012030	GCA	2	6	105686	105691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222481231
2227	NC_012030	ATC	2	6	105692	105697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222481231
2228	NC_012030	TC	3	6	105700	105705	0 %	50 %	0 %	50 %	222481231
2229	NC_012030	GGACGT	2	12	105741	105752	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	222481231
2230	NC_012030	CGA	2	6	105759	105764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222481231
2231	NC_012030	TCA	2	6	105776	105781	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222481231
2232	NC_012030	CTC	2	6	105787	105792	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222481231
2233	NC_012030	CTC	2	6	105841	105846	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222481231
2234	NC_012030	CTG	2	6	105954	105959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222481231
2235	NC_012030	CTT	2	6	105976	105981	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222481231
2236	NC_012030	CT	3	6	106081	106086	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2237	NC_012030	GAC	2	6	106096	106101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2238	NC_012030	TTC	2	6	106106	106111	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2239	NC_012030	TGCT	2	8	106169	106176	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2240	NC_012030	GT	3	6	106181	106186	0 %	50 %	50 %	0 %	222481232
2241	NC_012030	CTT	2	6	106228	106233	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222481232
2242	NC_012030	CTG	2	6	106298	106303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222481232
2243	NC_012030	TCG	2	6	106322	106327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222481232
2244	NC_012030	CTA	2	6	106530	106535	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222481232
2245	NC_012030	GAC	2	6	106546	106551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222481232
2246	NC_012030	CG	3	6	106620	106625	0 %	0 %	50 %	50 %	222481232
2247	NC_012030	GAA	2	6	106629	106634	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222481232
2248	NC_012030	AGT	2	6	106684	106689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222481232
2249	NC_012030	TTC	2	6	106702	106707	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222481232
2250	NC_012030	GCT	2	6	106785	106790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222481232
2251	NC_012030	ATC	2	6	106822	106827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222481232
2252	NC_012030	GTAC	2	8	106949	106956	25 %	25 %	25 %	25 %	222481232
2253	NC_012030	CGC	2	6	107001	107006	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222481232
2254	NC_012030	CAC	2	6	107027	107032	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222481232
2255	NC_012030	ACT	2	6	107048	107053	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222481232
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2257	NC_012030	GCT	2	6	107136	107141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222481232
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2259	NC_012030	GGCG	2	8	107218	107225	0 %	0 %	75 %	25 %	222481232
2260	NC_012030	TGG	3	9	107233	107241	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222481232
2261	NC_012030	CGA	2	6	107269	107274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222481232
2262	NC_012030	GAC	2	6	107329	107334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222481232
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2264	NC_012030	GAGT	2	8	107372	107379	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
2265	NC_012030	CGG	2	6	107396	107401	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2266	NC_012030	CCG	3	9	107406	107414	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2267	NC_012030	TCCG	2	8	107436	107443	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2268	NC_012030	TC	3	6	107448	107453	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2269	NC_012030	TCG	2	6	107561	107566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2271	NC_012030	CCT	2	6	107713	107718	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222481233
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2279	NC_012030	CTCAT	2	10	108114	108123	20 %	40 %	0 %	40 %	222481233
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2282	NC_012030	TCG	2	6	108336	108341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222481233
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2319	NC_012030	CCCGG	2	10	109717	109726	0 %	0 %	40 %	60 %	222481233
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2322	NC_012030	ATG	2	6	109889	109894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222481233
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2331	NC_012030	TCTCA	2	10	110177	110186	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
2332	NC_012030	CCAC	2	8	110243	110250	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
2333	NC_012030	CTC	2	6	110317	110322	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222481235
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2335	NC_012030	TG	3	6	110597	110602	0 %	50 %	50 %	0 %	222481235
2336	NC_012030	TCT	2	6	110612	110617	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222481235
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2338	NC_012030	CTC	2	6	110728	110733	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222481235
2339	NC_012030	GCC	2	6	110742	110747	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222481235
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2342	NC_012030	TTTC	2	8	110910	110917	0 %	75 %	0 %	25 %	222481235
2343	NC_012030	GAT	2	6	111000	111005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222481235
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2347	NC_012030	GTC	2	6	111127	111132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222481235
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2350	NC_012030	TCG	2	6	111245	111250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222481235
2351	NC_012030	CTG	2	6	111331	111336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222481235
2352	NC_012030	AG	3	6	111416	111421	50 %	0 %	50 %	0 %	222481235
2353	NC_012030	GGA	2	6	111427	111432	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222481235
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2355	NC_012030	ACC	2	6	111717	111722	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222481235
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2358	NC_012030	TC	3	6	111841	111846	0 %	50 %	0 %	50 %	222481235
2359	NC_012030	CGT	2	6	111864	111869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222481235
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2362	NC_012030	CCT	2	6	112104	112109	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222481235
2363	NC_012030	AAG	2	6	112205	112210	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222481235
2364	NC_012030	GTT	2	6	112274	112279	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222481236
2365	NC_012030	TCA	2	6	112300	112305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222481236
2366	NC_012030	AG	3	6	112323	112328	50 %	0 %	50 %	0 %	222481236
2367	NC_012030	GA	3	6	112347	112352	50 %	0 %	50 %	0 %	222481236
2368	NC_012030	CG	3	6	112386	112391	0 %	0 %	50 %	50 %	222481236
2369	NC_012030	CAA	2	6	112400	112405	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222481236
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2373	NC_012030	TG	3	6	112756	112761	0 %	50 %	50 %	0 %	222481236
2374	NC_012030	AAG	2	6	112776	112781	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222481236
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2383	NC_012030	AAG	2	6	113585	113590	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2384	NC_012030	TAA	2	6	113592	113597	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2385	NC_012030	GCT	2	6	113607	113612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222481237
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2430	NC_012030	TCG	2	6	115672	115677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2432	NC_012030	TG	3	6	115756	115761	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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2436	NC_012030	GCTGTC	2	12	115901	115912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2473	NC_012030	ATA	2	6	117579	117584	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2493	NC_012030	GT	3	6	118516	118521	0 %	50 %	50 %	0 %	222481244
2494	NC_012030	AGT	2	6	118608	118613	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222481244
2495	NC_012030	TCT	2	6	118619	118624	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222481244
2496	NC_012030	TCG	2	6	118712	118717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222481244
2497	NC_012030	TCGT	2	8	118727	118734	0 %	50 %	25 %	25 %	222481244
2498	NC_012030	TCG	2	6	118772	118777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222481244
2499	NC_012030	AG	3	6	118819	118824	50 %	0 %	50 %	0 %	222481244
2500	NC_012030	GTT	2	6	118912	118917	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222481244

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