MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239 plasmid pHLAC01

Total Repeats: 9364

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_012030	AC	4	8	68668	68675	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1502	NC_012030	GCG	2	6	68725	68730	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1503	NC_012030	GAG	2	6	68859	68864	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1504	NC_012030	CCGA	2	8	69000	69007	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1505	NC_012030	GAA	2	6	69198	69203	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1506	NC_012030	GGGC	2	8	69252	69259	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1507	NC_012030	GGCA	2	8	69260	69267	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1508	NC_012030	CGA	2	6	69283	69288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1509	NC_012030	GGT	2	6	69319	69324	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1510	NC_012030	GTC	2	6	69414	69419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1511	NC_012030	TGA	2	6	69461	69466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1512	NC_012030	GTC	2	6	69477	69482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1513	NC_012030	CGTC	2	8	69520	69527	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1514	NC_012030	TGC	2	6	69534	69539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1515	NC_012030	GGC	2	6	69655	69660	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1516	NC_012030	CGG	2	6	69667	69672	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1517	NC_012030	CGAC	2	8	69678	69685	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1518	NC_012030	CAC	2	6	69882	69887	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1519	NC_012030	GAC	2	6	69944	69949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1520	NC_012030	CCA	2	6	69956	69961	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1521	NC_012030	GATCGC	2	12	70020	70031	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1522	NC_012030	CGA	2	6	70144	70149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1523	NC_012030	GTC	2	6	70157	70162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1524	NC_012030	CGA	2	6	70211	70216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1525	NC_012030	CGA	2	6	70267	70272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1526	NC_012030	CGC	2	6	70291	70296	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1527	NC_012030	GTGA	2	8	70350	70357	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1528	NC_012030	GACGG	2	10	70409	70418	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
1529	NC_012030	GTT	2	6	70467	70472	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1530	NC_012030	ATC	2	6	70535	70540	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1531	NC_012030	CGG	2	6	70554	70559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1532	NC_012030	TTGGG	2	10	70598	70607	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
1533	NC_012030	CGC	2	6	70611	70616	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1534	NC_012030	GTC	2	6	70618	70623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1535	NC_012030	AGA	2	6	70653	70658	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1536	NC_012030	CGT	2	6	70668	70673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1537	NC_012030	CGG	2	6	70730	70735	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1538	NC_012030	AGC	2	6	70739	70744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1539	NC_012030	AGG	2	6	70982	70987	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1540	NC_012030	GAC	2	6	71059	71064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1541	NC_012030	GA	4	8	71074	71081	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1542	NC_012030	CGA	2	6	71130	71135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1543	NC_012030	GTC	2	6	71264	71269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1544	NC_012030	GTC	2	6	71315	71320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1545	NC_012030	AAC	2	6	71342	71347	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1546	NC_012030	AGTC	2	8	71579	71586	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1547	NC_012030	CCG	2	6	71797	71802	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1548	NC_012030	CGT	2	6	71918	71923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1549	NC_012030	GT	3	6	71987	71992	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1550	NC_012030	GCT	2	6	72144	72149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222481207
1551	NC_012030	TCG	2	6	72274	72279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222481207
1552	NC_012030	TCG	2	6	72339	72344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222481207
1553	NC_012030	GTCA	2	8	72441	72448	25 %	25 %	25 %	25 %	222481207
1554	NC_012030	GCCGA	2	10	72523	72532	20 %	0 %	40 %	40 %	222481207
1555	NC_012030	TC	3	6	72578	72583	0 %	50 %	0 %	50 %	222481207
1556	NC_012030	GTA	2	6	72668	72673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1557	NC_012030	ACGC	2	8	72731	72738	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1558	NC_012030	ACA	2	6	72801	72806	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1559	NC_012030	CTG	2	6	72851	72856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1560	NC_012030	AGG	2	6	72904	72909	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1561	NC_012030	CAA	2	6	72978	72983	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1562	NC_012030	CGA	2	6	72995	73000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1563	NC_012030	GT	3	6	73178	73183	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1564	NC_012030	GAC	2	6	73454	73459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1565	NC_012030	TCA	2	6	73513	73518	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1566	NC_012030	TGT	2	6	73597	73602	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1567	NC_012030	GAC	2	6	73654	73659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1568	NC_012030	AGT	2	6	73787	73792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1569	NC_012030	AC	3	6	73985	73990	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1570	NC_012030	TCG	2	6	74045	74050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1571	NC_012030	GCG	2	6	74115	74120	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1572	NC_012030	GTC	2	6	74129	74134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1573	NC_012030	CGGT	2	8	74183	74190	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1574	NC_012030	GGC	2	6	74230	74235	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1575	NC_012030	TCG	2	6	74255	74260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1576	NC_012030	TCTTCG	2	12	74367	74378	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
1577	NC_012030	GCC	2	6	74516	74521	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1578	NC_012030	CGA	2	6	74579	74584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1579	NC_012030	TCG	2	6	74638	74643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1580	NC_012030	ACA	2	6	74653	74658	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1581	NC_012030	CGC	2	6	74659	74664	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1582	NC_012030	GAT	2	6	74853	74858	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1583	NC_012030	CCT	2	6	74891	74896	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1584	NC_012030	ACG	2	6	74979	74984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1585	NC_012030	CGCAC	2	10	75294	75303	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
1586	NC_012030	TCA	2	6	75369	75374	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1587	NC_012030	CGA	2	6	75379	75384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1588	NC_012030	GTTC	2	8	75424	75431	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1589	NC_012030	CGT	2	6	75437	75442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1590	NC_012030	CGA	2	6	75644	75649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1591	NC_012030	TCG	2	6	75694	75699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1592	NC_012030	CTC	2	6	75756	75761	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1593	NC_012030	TCG	2	6	75766	75771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1594	NC_012030	TCG	2	6	75816	75821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1595	NC_012030	CA	3	6	76170	76175	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1596	NC_012030	TCG	2	6	76209	76214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1597	NC_012030	GTC	2	6	76276	76281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222481208
1598	NC_012030	GT	3	6	76298	76303	0 %	50 %	50 %	0 %	222481208
1599	NC_012030	CTG	2	6	76426	76431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222481208
1600	NC_012030	GGA	2	6	76452	76457	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222481208
1601	NC_012030	GTTC	2	8	76475	76482	0 %	50 %	25 %	25 %	222481208
1602	NC_012030	GAAC	2	8	76506	76513	50 %	0 %	25 %	25 %	222481208
1603	NC_012030	ACC	3	9	76519	76527	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222481209
1604	NC_012030	TCGG	2	8	76530	76537	0 %	25 %	50 %	25 %	222481209
1605	NC_012030	CTT	2	6	76565	76570	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222481209
1606	NC_012030	TCA	2	6	76728	76733	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222481209
1607	NC_012030	CGAG	2	8	76810	76817	25 %	0 %	50 %	25 %	222481209
1608	NC_012030	CATG	2	8	76843	76850	25 %	25 %	25 %	25 %	222481209
1609	NC_012030	AAT	2	6	77014	77019	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222481209
1610	NC_012030	TGCG	2	8	77026	77033	0 %	25 %	50 %	25 %	222481209
1611	NC_012030	TGCT	2	8	77074	77081	0 %	50 %	25 %	25 %	222481209
1612	NC_012030	CGAT	2	8	77103	77110	25 %	25 %	25 %	25 %	222481209
1613	NC_012030	CGAA	2	8	77119	77126	50 %	0 %	25 %	25 %	222481209
1614	NC_012030	ATC	2	6	77184	77189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222481209
1615	NC_012030	CGA	2	6	77208	77213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222481209
1616	NC_012030	ATC	2	6	77219	77224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222481209
1617	NC_012030	CG	3	6	77228	77233	0 %	0 %	50 %	50 %	222481209
1618	NC_012030	CGA	2	6	77242	77247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222481209
1619	NC_012030	GA	3	6	77259	77264	50 %	0 %	50 %	0 %	222481209
1620	NC_012030	GT	3	6	77452	77457	0 %	50 %	50 %	0 %	222481209
1621	NC_012030	TGA	2	6	77493	77498	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222481209
1622	NC_012030	T	6	6	77560	77565	0 %	100 %	0 %	0 %	222481210
1623	NC_012030	GAT	2	6	77602	77607	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222481210
1624	NC_012030	CGG	2	6	77628	77633	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222481210
1625	NC_012030	CCT	2	6	77658	77663	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222481210
1626	NC_012030	GTTC	2	8	77669	77676	0 %	50 %	25 %	25 %	222481210
1627	NC_012030	GTA	2	6	77737	77742	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222481210
1628	NC_012030	CGA	2	6	77776	77781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222481210
1629	NC_012030	TCACC	2	10	77796	77805	20 %	20 %	0 %	60 %	222481210
1630	NC_012030	CGG	2	6	77852	77857	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222481210
1631	NC_012030	TG	3	6	77883	77888	0 %	50 %	50 %	0 %	222481210
1632	NC_012030	CGCTG	2	10	77905	77914	0 %	20 %	40 %	40 %	222481210
1633	NC_012030	AGC	2	6	77981	77986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222481210
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1758	NC_012030	CTG	2	6	83921	83926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222481214
1759	NC_012030	TCG	2	6	83929	83934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222481214
1760	NC_012030	GT	3	6	84074	84079	0 %	50 %	50 %	0 %	222481214
1761	NC_012030	CA	3	6	84105	84110	50 %	0 %	0 %	50 %	222481214
1762	NC_012030	A	6	6	84227	84232	100 %	0 %	0 %	0 %	222481214
1763	NC_012030	CGG	2	6	84389	84394	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222481214
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1765	NC_012030	AGT	2	6	84423	84428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222481214
1766	NC_012030	CAGT	2	8	84461	84468	25 %	25 %	25 %	25 %	222481214
1767	NC_012030	GTA	2	6	84494	84499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222481214
1768	NC_012030	TTCG	2	8	84521	84528	0 %	50 %	25 %	25 %	222481214
1769	NC_012030	GAAC	2	8	84637	84644	50 %	0 %	25 %	25 %	222481214
1770	NC_012030	CGT	2	6	84677	84682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222481214
1771	NC_012030	CGATC	2	10	84693	84702	20 %	20 %	20 %	40 %	222481214
1772	NC_012030	GGA	2	6	84732	84737	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222481214
1773	NC_012030	TG	3	6	84740	84745	0 %	50 %	50 %	0 %	222481214
1774	NC_012030	ATC	2	6	84765	84770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222481214
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1776	NC_012030	TCG	2	6	84823	84828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222481214
1777	NC_012030	CGT	2	6	84863	84868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222481214
1778	NC_012030	CGTAC	2	10	84894	84903	20 %	20 %	20 %	40 %	222481214
1779	NC_012030	GGT	2	6	84970	84975	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222481214
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1782	NC_012030	ATG	2	6	85033	85038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222481214
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1786	NC_012030	AGT	2	6	85294	85299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222481215
1787	NC_012030	GGT	2	6	85361	85366	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222481215
1788	NC_012030	GT	3	6	85365	85370	0 %	50 %	50 %	0 %	222481215
1789	NC_012030	AGA	2	6	85381	85386	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222481215
1790	NC_012030	CAG	2	6	85387	85392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222481215
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1793	NC_012030	CAA	2	6	85451	85456	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222481215
1794	NC_012030	GAT	2	6	85472	85477	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222481215
1795	NC_012030	CGT	2	6	85522	85527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222481215
1796	NC_012030	CCT	2	6	85642	85647	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222481215
1797	NC_012030	G	6	6	85659	85664	0 %	0 %	100 %	0 %	222481215
1798	NC_012030	TGG	2	6	85688	85693	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222481215
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1801	NC_012030	AAT	2	6	85864	85869	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1802	NC_012030	GATGT	2	10	85911	85920	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
1803	NC_012030	ACA	2	6	85949	85954	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1804	NC_012030	GTT	2	6	85972	85977	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1806	NC_012030	TTG	2	6	86054	86059	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1847	NC_012030	TAA	2	6	88271	88276	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1849	NC_012030	CGAC	2	8	88396	88403	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1850	NC_012030	TC	3	6	88425	88430	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1851	NC_012030	CGT	2	6	88475	88480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1855	NC_012030	GAA	2	6	88651	88656	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1856	NC_012030	A	6	6	88655	88660	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1857	NC_012030	AAT	2	6	88699	88704	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1858	NC_012030	TA	3	6	88716	88721	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1859	NC_012030	TAC	2	6	88788	88793	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1860	NC_012030	AC	3	6	88792	88797	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1861	NC_012030	AC	3	6	88811	88816	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1862	NC_012030	AAC	2	6	88818	88823	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1863	NC_012030	GGTT	2	8	88825	88832	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1866	NC_012030	CAT	2	6	88990	88995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1869	NC_012030	GTTT	2	8	89123	89130	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1870	NC_012030	CTG	2	6	89134	89139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1871	NC_012030	CAAGT	2	10	89200	89209	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
1872	NC_012030	GTA	2	6	89304	89309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1873	NC_012030	TGT	2	6	89327	89332	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1875	NC_012030	GTTT	2	8	89369	89376	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1876	NC_012030	TGT	2	6	89401	89406	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1877	NC_012030	GTCT	2	8	89409	89416	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1878	NC_012030	TGG	2	6	89461	89466	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1879	NC_012030	CGA	2	6	89535	89540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1880	NC_012030	GTG	2	6	89648	89653	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222481218
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1986	NC_012030	GTAG	2	8	94436	94443	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1987	NC_012030	GTGTCT	2	12	94517	94528	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
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1989	NC_012030	GA	3	6	94581	94586	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1995	NC_012030	AATC	2	8	95058	95065	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1996	NC_012030	TCG	2	6	95117	95122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1997	NC_012030	GA	3	6	95152	95157	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1998	NC_012030	TTG	2	6	95186	95191	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222481224
1999	NC_012030	GA	3	6	95214	95219	50 %	0 %	50 %	0 %	222481224
2000	NC_012030	GCG	2	6	95308	95313	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222481224

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