MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239 plasmid pHLAC01

Total Repeats: 9364

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
9001	NC_012030	TAT	2	6	412175	412180	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222481517
9002	NC_012030	GGC	2	6	412181	412186	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222481517
9003	NC_012030	GTTTC	2	10	412231	412240	0 %	60 %	20 %	20 %	222481517
9004	NC_012030	TTG	2	6	412492	412497	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222481517
9005	NC_012030	TGC	2	6	412570	412575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222481517
9006	NC_012030	GAG	2	6	412725	412730	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222481517
9007	NC_012030	GAA	2	6	412803	412808	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222481517
9008	NC_012030	CAG	2	6	412849	412854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222481517
9009	NC_012030	TGC	2	6	412907	412912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222481517
9010	NC_012030	AC	3	6	412916	412921	50 %	0 %	0 %	50 %	222481517
9011	NC_012030	CGAC	2	8	412957	412964	25 %	0 %	25 %	50 %	222481517
9012	NC_012030	TCA	2	6	412975	412980	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222481517
9013	NC_012030	TGA	2	6	412988	412993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222481517
9014	NC_012030	AGA	2	6	413042	413047	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222481517
9015	NC_012030	ATC	2	6	413094	413099	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222481517
9016	NC_012030	AAC	2	6	413144	413149	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222481517
9017	NC_012030	GAG	2	6	413258	413263	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9018	NC_012030	CTC	2	6	413271	413276	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9019	NC_012030	TCG	2	6	413309	413314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9020	NC_012030	TCC	2	6	413356	413361	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9021	NC_012030	CTC	2	6	413568	413573	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9022	NC_012030	GTCTCA	2	12	413657	413668	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
9023	NC_012030	AAT	2	6	413794	413799	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222481518
9024	NC_012030	AG	3	6	413830	413835	50 %	0 %	50 %	0 %	222481518
9025	NC_012030	GA	3	6	413865	413870	50 %	0 %	50 %	0 %	222481518
9026	NC_012030	ATT	2	6	413948	413953	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222481518
9027	NC_012030	GAC	2	6	413960	413965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222481518
9028	NC_012030	GCG	2	6	413978	413983	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222481518
9029	NC_012030	AATA	2	8	414020	414027	75 %	25 %	0 %	0 %	222481518
9030	NC_012030	CGAAA	2	10	414040	414049	60 %	0 %	20 %	20 %	222481518
9031	NC_012030	TCAG	2	8	414077	414084	25 %	25 %	25 %	25 %	222481518
9032	NC_012030	CGA	2	6	414235	414240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222481518
9033	NC_012030	TGA	2	6	414241	414246	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222481518
9034	NC_012030	CGATT	2	10	414249	414258	20 %	40 %	20 %	20 %	222481518
9035	NC_012030	AACG	2	8	414269	414276	50 %	0 %	25 %	25 %	222481518
9036	NC_012030	GAA	2	6	414305	414310	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222481518
9037	NC_012030	CAG	2	6	414377	414382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222481518
9038	NC_012030	GCG	2	6	414432	414437	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222481518
9039	NC_012030	ATC	2	6	414497	414502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222481518
9040	NC_012030	GA	3	6	414513	414518	50 %	0 %	50 %	0 %	222481518
9041	NC_012030	AAC	2	6	414534	414539	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222481518
9042	NC_012030	ATC	2	6	414602	414607	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222481518
9043	NC_012030	AC	3	6	414669	414674	50 %	0 %	0 %	50 %	222481518
9044	NC_012030	CAG	2	6	414781	414786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222481518
9045	NC_012030	CGA	3	9	414850	414858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222481518
9046	NC_012030	AACG	2	8	414929	414936	50 %	0 %	25 %	25 %	222481518
9047	NC_012030	GAC	2	6	415046	415051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222481518
9048	NC_012030	TGA	2	6	415093	415098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222481518
9049	NC_012030	TCG	2	6	415221	415226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222481518
9050	NC_012030	T	6	6	415360	415365	0 %	100 %	0 %	0 %	222481518
9051	NC_012030	ACT	2	6	415380	415385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222481518
9052	NC_012030	CGA	2	6	415486	415491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222481518
9053	NC_012030	GTC	2	6	415502	415507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222481518
9054	NC_012030	GGA	2	6	415516	415521	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222481518
9055	NC_012030	CAG	2	6	415556	415561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222481518
9056	NC_012030	GAC	3	9	415625	415633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222481518
9057	NC_012030	GTC	2	6	415739	415744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222481518
9058	NC_012030	CGA	2	6	415816	415821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222481518
9059	NC_012030	CAAAT	2	10	415824	415833	60 %	20 %	0 %	20 %	222481518
9060	NC_012030	CAAC	2	8	415860	415867	50 %	0 %	0 %	50 %	222481518
9061	NC_012030	CGA	2	6	416047	416052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222481518
9062	NC_012030	CTG	2	6	416078	416083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222481518
9063	NC_012030	ACA	2	6	416135	416140	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222481518
9064	NC_012030	TCT	2	6	416214	416219	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222481518
9065	NC_012030	TCG	2	6	416283	416288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222481518
9066	NC_012030	TGG	2	6	416296	416301	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222481518
9067	NC_012030	TCT	2	6	416340	416345	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222481518
9068	NC_012030	AATG	2	8	416379	416386	50 %	25 %	25 %	0 %	222481519
9069	NC_012030	GCC	3	9	416423	416431	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222481519
9070	NC_012030	GAT	2	6	416518	416523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222481519
9071	NC_012030	TCAC	2	8	416539	416546	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
9072	NC_012030	GCA	2	6	416609	416614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9073	NC_012030	GA	3	6	416676	416681	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9074	NC_012030	CAG	2	6	416697	416702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9075	NC_012030	ATT	2	6	416803	416808	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9076	NC_012030	CCA	2	6	416862	416867	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222481520
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9078	NC_012030	CGA	2	6	416957	416962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222481520
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9080	NC_012030	GA	3	6	417044	417049	50 %	0 %	50 %	0 %	222481520
9081	NC_012030	CCA	2	6	417075	417080	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222481520
9082	NC_012030	GTC	2	6	417147	417152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222481520
9083	NC_012030	CGA	2	6	417208	417213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222481520
9084	NC_012030	GTCA	2	8	417215	417222	25 %	25 %	25 %	25 %	222481520
9085	NC_012030	TCC	2	6	417279	417284	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222481520
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9087	NC_012030	CTG	2	6	417440	417445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222481520
9088	NC_012030	CGGT	2	8	417471	417478	0 %	25 %	50 %	25 %	222481520
9089	NC_012030	ATT	2	6	417507	417512	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222481520
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9091	NC_012030	CTC	2	6	417650	417655	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222481520
9092	NC_012030	GTG	2	6	417670	417675	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222481520
9093	NC_012030	GAG	2	6	417779	417784	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222481520
9094	NC_012030	GTT	2	6	417803	417808	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222481520
9095	NC_012030	AG	3	6	417811	417816	50 %	0 %	50 %	0 %	222481520
9096	NC_012030	GCT	2	6	417881	417886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222481520
9097	NC_012030	GTC	3	9	417908	417916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222481520
9098	NC_012030	CCAA	2	8	418080	418087	50 %	0 %	0 %	50 %	222481520
9099	NC_012030	CAG	2	6	418120	418125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222481520
9100	NC_012030	ACGT	2	8	418131	418138	25 %	25 %	25 %	25 %	222481520
9101	NC_012030	CGA	2	6	418156	418161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222481520
9102	NC_012030	T	6	6	418217	418222	0 %	100 %	0 %	0 %	222481520
9103	NC_012030	TTTG	2	8	418281	418288	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
9104	NC_012030	ACTG	2	8	418324	418331	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
9105	NC_012030	TAA	2	6	418448	418453	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9106	NC_012030	TTAT	3	12	418504	418515	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
9107	NC_012030	TAG	2	6	418545	418550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9108	NC_012030	T	6	6	418601	418606	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9109	NC_012030	AAC	2	6	418616	418621	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9110	NC_012030	TGA	2	6	418729	418734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9111	NC_012030	GA	3	6	418744	418749	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9112	NC_012030	GGA	2	6	418766	418771	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9113	NC_012030	TATTT	2	10	418823	418832	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
9114	NC_012030	TGT	2	6	418991	418996	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9115	NC_012030	C	7	7	419047	419053	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
9116	NC_012030	ACG	2	6	419263	419268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222481521
9117	NC_012030	ATC	2	6	419271	419276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222481521
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9121	NC_012030	TAC	2	6	419438	419443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222481521
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9123	NC_012030	TC	3	6	419462	419467	0 %	50 %	0 %	50 %	222481521
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9244	NC_012030	CGC	2	6	425154	425159	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9245	NC_012030	A	6	6	425170	425175	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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