MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239 plasmid pHLAC01

Total Repeats: 9364

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8501	NC_012030	C	6	6	389686	389691	0 %	0 %	0 %	100 %	222481494
8502	NC_012030	GTC	2	6	389723	389728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222481494
8503	NC_012030	GTGG	2	8	389758	389765	0 %	25 %	75 %	0 %	222481494
8504	NC_012030	TAC	2	6	389824	389829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222481494
8505	NC_012030	CGT	2	6	389848	389853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222481494
8506	NC_012030	GAC	2	6	389915	389920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222481494
8507	NC_012030	TGA	2	6	389950	389955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222481494
8508	NC_012030	TTC	2	6	389958	389963	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222481494
8509	NC_012030	GTC	2	6	389970	389975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222481494
8510	NC_012030	GTC	2	6	389988	389993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222481494
8511	NC_012030	GA	3	6	390003	390008	50 %	0 %	50 %	0 %	222481494
8512	NC_012030	GTT	2	6	390053	390058	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222481494
8513	NC_012030	CGA	2	6	390115	390120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222481494
8514	NC_012030	CGT	2	6	390157	390162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222481494
8515	NC_012030	ACCG	2	8	390193	390200	25 %	0 %	25 %	50 %	222481494
8516	NC_012030	CGA	2	6	390232	390237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222481494
8517	NC_012030	TTGTC	2	10	390273	390282	0 %	60 %	20 %	20 %	222481494
8518	NC_012030	AGT	2	6	390284	390289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222481494
8519	NC_012030	GCC	2	6	390303	390308	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222481494
8520	NC_012030	CCT	2	6	390312	390317	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222481494
8521	NC_012030	CCA	2	6	390336	390341	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222481494
8522	NC_012030	GGGC	2	8	390391	390398	0 %	0 %	75 %	25 %	222481494
8523	NC_012030	TCG	2	6	390402	390407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222481494
8524	NC_012030	GTT	2	6	390423	390428	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222481494
8525	NC_012030	CTGTGG	3	18	390464	390481	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	222481494
8526	NC_012030	GCA	2	6	390513	390518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222481494
8527	NC_012030	TTC	2	6	390548	390553	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222481494
8528	NC_012030	AGC	2	6	390576	390581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222481494
8529	NC_012030	TTC	2	6	390593	390598	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222481494
8530	NC_012030	TGAT	2	8	390627	390634	25 %	50 %	25 %	0 %	222481494
8531	NC_012030	GCT	2	6	390651	390656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222481494
8532	NC_012030	TCTGC	2	10	390682	390691	0 %	40 %	20 %	40 %	222481494
8533	NC_012030	TTC	2	6	390692	390697	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222481494
8534	NC_012030	CTT	2	6	390709	390714	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222481494
8535	NC_012030	TAA	2	6	390774	390779	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222481494
8536	NC_012030	CGA	2	6	390785	390790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222481494
8537	NC_012030	GACGA	2	10	390792	390801	40 %	0 %	40 %	20 %	222481494
8538	NC_012030	TCG	2	6	390831	390836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222481494
8539	NC_012030	CAT	2	6	390838	390843	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222481494
8540	NC_012030	TGG	2	6	390857	390862	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222481494
8541	NC_012030	CAT	2	6	390898	390903	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222481494
8542	NC_012030	AGAT	2	8	390917	390924	50 %	25 %	25 %	0 %	222481494
8543	NC_012030	TGA	2	6	390982	390987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222481494
8544	NC_012030	CTC	2	6	391043	391048	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222481494
8545	NC_012030	TGC	2	6	391088	391093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222481494
8546	NC_012030	GAA	2	6	391097	391102	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222481494
8547	NC_012030	CTT	2	6	391114	391119	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222481494
8548	NC_012030	GTTG	2	8	391147	391154	0 %	50 %	50 %	0 %	222481494
8549	NC_012030	GAA	2	6	391241	391246	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222481494
8550	NC_012030	GATC	2	8	391339	391346	25 %	25 %	25 %	25 %	222481494
8551	NC_012030	CTT	2	6	391366	391371	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222481494
8552	NC_012030	GAA	2	6	391460	391465	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222481494
8553	NC_012030	ACCA	2	8	391484	391491	50 %	0 %	0 %	50 %	222481494
8554	NC_012030	GCTC	2	8	391492	391499	0 %	25 %	25 %	50 %	222481494
8555	NC_012030	TC	4	8	391518	391525	0 %	50 %	0 %	50 %	222481494
8556	NC_012030	TG	3	6	391568	391573	0 %	50 %	50 %	0 %	222481494
8557	NC_012030	CCG	2	6	391668	391673	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222481494
8558	NC_012030	TCC	2	6	391689	391694	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222481494
8559	NC_012030	GTG	2	6	391768	391773	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222481494
8560	NC_012030	GTT	2	6	391774	391779	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222481494
8561	NC_012030	CTT	2	6	391793	391798	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222481494
8562	NC_012030	CAAC	2	8	391802	391809	50 %	0 %	0 %	50 %	222481494
8563	NC_012030	CGAC	2	8	391867	391874	25 %	0 %	25 %	50 %	222481494
8564	NC_012030	CGT	2	6	391906	391911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222481494
8565	NC_012030	TCG	3	9	391977	391985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222481494
8566	NC_012030	CTT	2	6	392003	392008	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222481494
8567	NC_012030	AG	3	6	392053	392058	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8568	NC_012030	TAC	2	6	392089	392094	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8569	NC_012030	AAT	2	6	392128	392133	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8570	NC_012030	TTA	2	6	392164	392169	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8571	NC_012030	GTA	2	6	392244	392249	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222481495
8572	NC_012030	TCA	2	6	392372	392377	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8573	NC_012030	AGT	2	6	392428	392433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8574	NC_012030	GAC	2	6	392472	392477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8575	NC_012030	ATCG	2	8	392482	392489	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8576	NC_012030	ATC	2	6	392503	392508	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8577	NC_012030	TGT	2	6	392524	392529	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8578	NC_012030	AGT	2	6	392544	392549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8579	NC_012030	TGT	2	6	392579	392584	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8580	NC_012030	CCG	2	6	392601	392606	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8581	NC_012030	AGCG	2	8	392658	392665	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
8582	NC_012030	ACA	2	6	392763	392768	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222481496
8583	NC_012030	AGT	2	6	392783	392788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222481496
8584	NC_012030	CAG	2	6	392791	392796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222481496
8585	NC_012030	ACT	3	9	392810	392818	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222481496
8586	NC_012030	CCG	2	6	392831	392836	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222481496
8587	NC_012030	TCT	2	6	392844	392849	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222481496
8588	NC_012030	CGA	3	9	392961	392969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222481496
8589	NC_012030	GAA	2	6	392977	392982	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222481496
8590	NC_012030	ACC	2	6	393012	393017	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222481496
8591	NC_012030	ACGA	2	8	393023	393030	50 %	0 %	25 %	25 %	222481496
8592	NC_012030	CA	3	6	393071	393076	50 %	0 %	0 %	50 %	222481496
8593	NC_012030	ACC	2	6	393095	393100	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222481496
8594	NC_012030	CTG	2	6	393146	393151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8595	NC_012030	CGAC	2	8	393212	393219	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
8596	NC_012030	GAT	2	6	393277	393282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8597	NC_012030	GTG	3	9	393330	393338	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222481497
8598	NC_012030	CAA	2	6	393394	393399	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222481497
8599	NC_012030	TCAA	2	8	393452	393459	50 %	25 %	0 %	25 %	222481497
8600	NC_012030	CTC	2	6	393502	393507	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222481497
8601	NC_012030	CAG	2	6	393519	393524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222481497
8602	NC_012030	CGA	2	6	393657	393662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222481497
8603	NC_012030	CTT	2	6	393694	393699	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222481497
8604	NC_012030	CAT	2	6	393703	393708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222481497
8605	NC_012030	GTA	2	6	393712	393717	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222481497
8606	NC_012030	TCA	2	6	393722	393727	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222481497
8607	NC_012030	TCA	2	6	393764	393769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222481497
8608	NC_012030	CA	3	6	393789	393794	50 %	0 %	0 %	50 %	222481497
8609	NC_012030	TCG	2	6	393902	393907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222481497
8610	NC_012030	CAA	2	6	394011	394016	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222481497
8611	NC_012030	CGA	2	6	394027	394032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222481497
8612	NC_012030	GAA	2	6	394048	394053	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222481497
8613	NC_012030	TCG	2	6	394130	394135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222481497
8614	NC_012030	TCA	2	6	394185	394190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222481497
8615	NC_012030	CGT	3	9	394220	394228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222481497
8616	NC_012030	TCG	2	6	394238	394243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222481497
8617	NC_012030	CGA	2	6	394248	394253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222481497
8618	NC_012030	ATAC	2	8	394305	394312	50 %	25 %	0 %	25 %	222481497
8619	NC_012030	GTTGC	2	10	394334	394343	0 %	40 %	40 %	20 %	222481497
8620	NC_012030	ATC	2	6	394430	394435	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222481497
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8622	NC_012030	AT	3	6	394483	394488	50 %	50 %	0 %	0 %	222481497
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8998	NC_012030	ACT	2	6	412024	412029	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222481517
8999	NC_012030	GAC	2	6	412052	412057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222481517
9000	NC_012030	AACGCC	2	12	412108	412119	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	222481517

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