MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239 plasmid pHLAC01

Total Repeats: 9364

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8001	NC_012030	TTTG	2	8	366431	366438	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
8002	NC_012030	TGTAC	2	10	366464	366473	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
8003	NC_012030	GTA	2	6	366674	366679	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8004	NC_012030	TCA	2	6	366687	366692	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8005	NC_012030	CAC	2	6	366779	366784	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8006	NC_012030	TCG	2	6	366840	366845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222481478
8007	NC_012030	CAG	3	9	366901	366909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222481478
8008	NC_012030	TCG	2	6	366954	366959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222481478
8009	NC_012030	AG	3	6	367013	367018	50 %	0 %	50 %	0 %	222481478
8010	NC_012030	TCG	2	6	367038	367043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222481478
8011	NC_012030	GGT	2	6	367061	367066	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222481478
8012	NC_012030	AGT	2	6	367098	367103	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222481478
8013	NC_012030	GTC	2	6	367118	367123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222481478
8014	NC_012030	GTG	2	6	367190	367195	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222481478
8015	NC_012030	GAG	2	6	367205	367210	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222481478
8016	NC_012030	AGCG	2	8	367212	367219	25 %	0 %	50 %	25 %	222481478
8017	NC_012030	GGTC	2	8	367309	367316	0 %	25 %	50 %	25 %	222481478
8018	NC_012030	ACGG	2	8	367385	367392	25 %	0 %	50 %	25 %	222481478
8019	NC_012030	CGA	2	6	367429	367434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222481478
8020	NC_012030	GAG	2	6	367437	367442	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222481478
8021	NC_012030	GAT	2	6	367511	367516	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222481478
8022	NC_012030	GATCAA	2	12	367549	367560	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	222481478
8023	NC_012030	AG	3	6	367591	367596	50 %	0 %	50 %	0 %	222481478
8024	NC_012030	TAG	2	6	367624	367629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222481478
8025	NC_012030	GAG	2	6	367652	367657	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222481478
8026	NC_012030	TCG	2	6	367743	367748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222481478
8027	NC_012030	TGT	2	6	367829	367834	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8028	NC_012030	ATT	2	6	367858	367863	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8029	NC_012030	ACCC	2	8	367924	367931	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
8030	NC_012030	TG	3	6	367995	368000	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8031	NC_012030	TCAC	2	8	368003	368010	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
8032	NC_012030	GAC	2	6	368017	368022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8033	NC_012030	TGT	2	6	368062	368067	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8034	NC_012030	TTTG	2	8	368112	368119	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
8035	NC_012030	CGA	2	6	368125	368130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8036	NC_012030	GT	3	6	368197	368202	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8037	NC_012030	CAG	2	6	368206	368211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8038	NC_012030	TGT	2	6	368226	368231	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8039	NC_012030	TC	3	6	368247	368252	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8040	NC_012030	TTA	2	6	368284	368289	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8041	NC_012030	GAA	2	6	368312	368317	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8042	NC_012030	CTGT	2	8	368323	368330	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
8043	NC_012030	CTG	2	6	368334	368339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8044	NC_012030	GAA	2	6	368345	368350	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8045	NC_012030	CTG	2	6	368412	368417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8046	NC_012030	TCG	2	6	368607	368612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222481479
8047	NC_012030	GA	3	6	368670	368675	50 %	0 %	50 %	0 %	222481479
8048	NC_012030	CTAAAA	2	12	368763	368774	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
8049	NC_012030	TTC	2	6	368814	368819	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8050	NC_012030	ATC	2	6	368837	368842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8051	NC_012030	TGTA	2	8	368852	368859	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
8052	NC_012030	TAT	2	6	368941	368946	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8053	NC_012030	TA	3	6	368963	368968	50 %	50 %	0 %	0 %	222481480
8054	NC_012030	CTG	2	6	369014	369019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222481480
8055	NC_012030	TTG	2	6	369188	369193	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222481480
8056	NC_012030	GAC	2	6	369214	369219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222481480
8057	NC_012030	CAACG	2	10	369235	369244	40 %	0 %	20 %	40 %	222481480
8058	NC_012030	GTT	2	6	369273	369278	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222481480
8059	NC_012030	CAGA	2	8	369321	369328	50 %	0 %	25 %	25 %	222481480
8060	NC_012030	ACAG	2	8	369359	369366	50 %	0 %	25 %	25 %	222481480
8061	NC_012030	TC	3	6	369372	369377	0 %	50 %	0 %	50 %	222481480
8062	NC_012030	GCTG	2	8	369400	369407	0 %	25 %	50 %	25 %	222481480
8063	NC_012030	AAAG	2	8	369492	369499	75 %	0 %	25 %	0 %	222481480
8064	NC_012030	CA	3	6	369505	369510	50 %	0 %	0 %	50 %	222481480
8065	NC_012030	CAAC	2	8	369534	369541	50 %	0 %	0 %	50 %	222481480
8066	NC_012030	CCG	2	6	369572	369577	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8067	NC_012030	GTC	2	6	369622	369627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8068	NC_012030	GAAGCC	2	12	369666	369677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8069	NC_012030	CGA	2	6	369852	369857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8070	NC_012030	TCG	3	9	369872	369880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8071	NC_012030	GAT	2	6	369892	369897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8072	NC_012030	CGA	2	6	369910	369915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8073	NC_012030	TAG	2	6	369940	369945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8074	NC_012030	CTA	2	6	369978	369983	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8075	NC_012030	TGA	2	6	370059	370064	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8076	NC_012030	TCG	2	6	370100	370105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8077	NC_012030	CGG	2	6	370155	370160	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8078	NC_012030	TGA	2	6	370236	370241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8079	NC_012030	CGT	2	6	370248	370253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8080	NC_012030	GGA	2	6	370269	370274	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8081	NC_012030	CTC	2	6	370348	370353	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8082	NC_012030	TCA	2	6	370466	370471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8083	NC_012030	GTC	2	6	370477	370482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8084	NC_012030	CGC	2	6	370549	370554	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8085	NC_012030	GAT	2	6	370567	370572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8086	NC_012030	TCT	2	6	370583	370588	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8087	NC_012030	ATTG	2	8	370617	370624	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
8088	NC_012030	TTG	2	6	370756	370761	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8089	NC_012030	ACTG	2	8	370778	370785	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8090	NC_012030	GGT	2	6	370801	370806	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8091	NC_012030	CA	3	6	370858	370863	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8092	NC_012030	GTC	2	6	370901	370906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8093	NC_012030	TTC	2	6	370955	370960	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8094	NC_012030	GGC	3	9	370964	370972	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8095	NC_012030	CGT	2	6	371017	371022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8096	NC_012030	CGT	2	6	371092	371097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8097	NC_012030	TCG	2	6	371292	371297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8098	NC_012030	CGA	2	6	371299	371304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8099	NC_012030	GAC	2	6	371402	371407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8100	NC_012030	TCAGA	2	10	371602	371611	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
8101	NC_012030	ATT	2	6	371636	371641	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8102	NC_012030	GTGG	2	8	371714	371721	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
8103	NC_012030	TTC	2	6	371732	371737	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8104	NC_012030	TTG	2	6	371801	371806	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8105	NC_012030	CTC	2	6	371860	371865	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8106	NC_012030	CTG	2	6	371879	371884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8107	NC_012030	CA	3	6	371930	371935	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8108	NC_012030	ACT	2	6	371990	371995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8109	NC_012030	CTA	2	6	372000	372005	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8110	NC_012030	ATA	2	6	372063	372068	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8111	NC_012030	ATT	2	6	372086	372091	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8112	NC_012030	GCTC	2	8	372225	372232	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
8113	NC_012030	ACT	2	6	372238	372243	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8114	NC_012030	TC	3	6	372295	372300	0 %	50 %	0 %	50 %	222481481
8115	NC_012030	TC	3	6	372305	372310	0 %	50 %	0 %	50 %	222481481
8116	NC_012030	GGAG	2	8	372382	372389	25 %	0 %	75 %	0 %	222481481
8117	NC_012030	GAT	2	6	372421	372426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222481481
8118	NC_012030	GTG	2	6	372459	372464	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222481481
8119	NC_012030	CACAA	2	10	372690	372699	60 %	0 %	0 %	40 %	222481481
8120	NC_012030	TCA	3	9	372772	372780	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222481481
8121	NC_012030	TA	3	6	372933	372938	50 %	50 %	0 %	0 %	222481481
8122	NC_012030	CATTC	2	10	372944	372953	20 %	40 %	0 %	40 %	222481481
8123	NC_012030	TGAGT	2	10	372956	372965	20 %	40 %	40 %	0 %	222481481
8124	NC_012030	GA	3	6	372973	372978	50 %	0 %	50 %	0 %	222481481
8125	NC_012030	CTG	2	6	373104	373109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222481481
8126	NC_012030	CCAAG	2	10	373163	373172	40 %	0 %	20 %	40 %	222481481
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8128	NC_012030	CAT	2	6	373322	373327	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222481481
8129	NC_012030	CGA	2	6	373328	373333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222481481
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8133	NC_012030	GAT	2	6	373382	373387	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222481481
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8256	NC_012030	CAGT	2	8	379160	379167	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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8265	NC_012030	AT	3	6	379842	379847	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8266	NC_012030	CTT	2	6	379864	379869	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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