MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239 plasmid pHLAC01

Total Repeats: 9364

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7501	NC_012030	GAGT	2	8	343331	343338	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
7502	NC_012030	CGG	2	6	343355	343360	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7503	NC_012030	CCG	3	9	343365	343373	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7504	NC_012030	TCCG	2	8	343395	343402	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
7505	NC_012030	TC	3	6	343407	343412	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7506	NC_012030	ATG	2	6	343521	343526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7507	NC_012030	CGT	2	6	343531	343536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7508	NC_012030	CG	4	8	343576	343583	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7509	NC_012030	ACG	2	6	343587	343592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7510	NC_012030	GGCT	2	8	343718	343725	0 %	25 %	50 %	25 %	222481459
7511	NC_012030	CCA	2	6	343765	343770	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222481459
7512	NC_012030	TCA	2	6	343788	343793	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222481459
7513	NC_012030	GGCC	2	8	343853	343860	0 %	0 %	50 %	50 %	222481459
7514	NC_012030	ACCG	2	8	343868	343875	25 %	0 %	25 %	50 %	222481459
7515	NC_012030	CCGG	2	8	343884	343891	0 %	0 %	50 %	50 %	222481459
7516	NC_012030	GA	3	6	343902	343907	50 %	0 %	50 %	0 %	222481459
7517	NC_012030	CCT	2	6	343915	343920	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222481459
7518	NC_012030	GC	3	6	343975	343980	0 %	0 %	50 %	50 %	222481459
7519	NC_012030	CGG	3	9	344029	344037	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222481459
7520	NC_012030	TCG	2	6	344109	344114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222481459
7521	NC_012030	GTA	2	6	344186	344191	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222481459
7522	NC_012030	GCC	2	6	344204	344209	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222481459
7523	NC_012030	CGG	2	6	344224	344229	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222481459
7524	NC_012030	GGC	2	6	344291	344296	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222481459
7525	NC_012030	TCA	2	6	344319	344324	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222481459
7526	NC_012030	CGA	3	9	344326	344334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222481459
7527	NC_012030	AAG	2	6	344366	344371	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222481459
7528	NC_012030	GAG	2	6	344387	344392	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222481459
7529	NC_012030	CCT	2	6	344497	344502	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222481460
7530	NC_012030	GAT	2	6	344554	344559	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222481460
7531	NC_012030	ATA	2	6	344584	344589	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222481460
7532	NC_012030	TCC	2	6	344622	344627	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222481460
7533	NC_012030	CGA	2	6	344709	344714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222481460
7534	NC_012030	TGTCGG	2	12	344722	344733	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	222481460
7535	NC_012030	TCGA	2	8	344810	344817	25 %	25 %	25 %	25 %	222481460
7536	NC_012030	TCT	2	6	344889	344894	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222481460
7537	NC_012030	TCG	2	6	344928	344933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222481460
7538	NC_012030	CTC	2	6	344975	344980	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222481460
7539	NC_012030	CGG	2	6	344989	344994	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222481460
7540	NC_012030	ATT	2	6	345011	345016	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222481460
7541	NC_012030	TCT	2	6	345124	345129	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222481460
7542	NC_012030	TCC	2	6	345148	345153	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222481460
7543	NC_012030	CGC	2	6	345198	345203	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222481460
7544	NC_012030	TGG	2	6	345215	345220	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222481460
7545	NC_012030	TGG	2	6	345231	345236	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222481460
7546	NC_012030	AG	3	6	345293	345298	50 %	0 %	50 %	0 %	222481460
7547	NC_012030	CGTTG	2	10	345365	345374	0 %	40 %	40 %	20 %	222481460
7548	NC_012030	CTG	2	6	345380	345385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222481460
7549	NC_012030	GT	3	6	345419	345424	0 %	50 %	50 %	0 %	222481460
7550	NC_012030	CCT	2	6	345430	345435	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222481460
7551	NC_012030	CAG	2	6	345511	345516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222481460
7552	NC_012030	AG	3	6	345515	345520	50 %	0 %	50 %	0 %	222481460
7553	NC_012030	CAG	2	6	345541	345546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222481460
7554	NC_012030	GAG	2	6	345594	345599	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222481460
7555	NC_012030	TCC	2	6	345611	345616	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222481460
7556	NC_012030	ACG	2	6	345631	345636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222481460
7557	NC_012030	ATA	2	6	345642	345647	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222481460
7558	NC_012030	CATG	2	8	345672	345679	25 %	25 %	25 %	25 %	222481460
7559	NC_012030	CG	3	6	345713	345718	0 %	0 %	50 %	50 %	222481460
7560	NC_012030	AT	3	6	345813	345818	50 %	50 %	0 %	0 %	222481460
7561	NC_012030	TCC	2	6	345868	345873	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222481461
7562	NC_012030	GGATCG	2	12	345970	345981	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	222481461
7563	NC_012030	TC	3	6	346005	346010	0 %	50 %	0 %	50 %	222481461
7564	NC_012030	GCA	2	6	346048	346053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222481461
7565	NC_012030	ATC	2	6	346083	346088	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222481461
7566	NC_012030	TCA	2	6	346259	346264	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222481461
7567	NC_012030	CT	3	6	346269	346274	0 %	50 %	0 %	50 %	222481461
7568	NC_012030	AT	3	6	346281	346286	50 %	50 %	0 %	0 %	222481461
7569	NC_012030	CCG	2	6	346297	346302	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222481461
7570	NC_012030	CGA	2	6	346390	346395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222481461
7571	NC_012030	CGTACA	2	12	346463	346474	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	222481461
7572	NC_012030	GTT	2	6	346542	346547	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222481461
7573	NC_012030	CAA	2	6	346580	346585	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222481461
7574	NC_012030	CGT	2	6	346658	346663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222481461
7575	NC_012030	TC	3	6	346765	346770	0 %	50 %	0 %	50 %	222481461
7576	NC_012030	TGT	2	6	346781	346786	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222481461
7577	NC_012030	ACC	2	6	346805	346810	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222481461
7578	NC_012030	CTT	2	6	346846	346851	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7579	NC_012030	CGG	2	6	346895	346900	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7580	NC_012030	CCTT	2	8	346916	346923	0 %	50 %	0 %	50 %	222481462
7581	NC_012030	TGG	2	6	346965	346970	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222481462
7582	NC_012030	CGT	2	6	346991	346996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222481462
7583	NC_012030	GAG	3	9	347046	347054	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222481462
7584	NC_012030	ATT	2	6	347105	347110	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222481462
7585	NC_012030	GAG	2	6	347112	347117	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222481462
7586	NC_012030	TC	3	6	347177	347182	0 %	50 %	0 %	50 %	222481462
7587	NC_012030	AGTC	2	8	347281	347288	25 %	25 %	25 %	25 %	222481462
7588	NC_012030	TTAG	2	8	347434	347441	25 %	50 %	25 %	0 %	222481462
7589	NC_012030	TGCT	2	8	347448	347455	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
7590	NC_012030	GT	3	6	347460	347465	0 %	50 %	50 %	0 %	222481463
7591	NC_012030	CTT	2	6	347507	347512	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222481463
7592	NC_012030	CTG	2	6	347577	347582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222481463
7593	NC_012030	TCG	2	6	347601	347606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222481463
7594	NC_012030	CTA	2	6	347809	347814	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222481463
7595	NC_012030	GAC	2	6	347825	347830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222481463
7596	NC_012030	CG	3	6	347899	347904	0 %	0 %	50 %	50 %	222481463
7597	NC_012030	GAA	2	6	347908	347913	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222481463
7598	NC_012030	AGT	2	6	347963	347968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222481463
7599	NC_012030	TTC	2	6	347981	347986	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222481463
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7601	NC_012030	ATC	2	6	348101	348106	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222481463
7602	NC_012030	GTAC	2	8	348228	348235	25 %	25 %	25 %	25 %	222481463
7603	NC_012030	CGC	2	6	348280	348285	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222481463
7604	NC_012030	CAC	2	6	348306	348311	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222481463
7605	NC_012030	ACT	2	6	348327	348332	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222481463
7606	NC_012030	CGACAA	2	12	348384	348395	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	222481463
7607	NC_012030	GCT	2	6	348415	348420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222481463
7608	NC_012030	GTG	3	9	348425	348433	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222481463
7609	NC_012030	GGCG	2	8	348497	348504	0 %	0 %	75 %	25 %	222481463
7610	NC_012030	TGG	3	9	348512	348520	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222481463
7611	NC_012030	CGA	2	6	348548	348553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222481463
7612	NC_012030	GAC	2	6	348608	348613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222481463
7613	NC_012030	ACC	2	6	348628	348633	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222481463
7614	NC_012030	GAGT	2	8	348651	348658	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
7615	NC_012030	CGG	2	6	348675	348680	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7616	NC_012030	CCG	3	9	348685	348693	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7617	NC_012030	TCCG	2	8	348715	348722	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
7618	NC_012030	TC	3	6	348727	348732	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7619	NC_012030	CTT	2	6	348884	348889	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222481464
7620	NC_012030	TCC	2	6	348909	348914	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222481464
7621	NC_012030	AG	3	6	348942	348947	50 %	0 %	50 %	0 %	222481464
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7623	NC_012030	AG	3	6	349022	349027	50 %	0 %	50 %	0 %	222481464
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7999	NC_012030	CCG	2	6	366350	366355	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8000	NC_012030	CAC	2	6	366369	366374	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding

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