MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239 plasmid pHLAC01

Total Repeats: 9364

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_012030	CGA	2	6	246893	246898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222481371
5502	NC_012030	AGA	2	6	246959	246964	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222481371
5503	NC_012030	AACG	2	8	247002	247009	50 %	0 %	25 %	25 %	222481371
5504	NC_012030	TGA	2	6	247013	247018	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222481371
5505	NC_012030	AGC	2	6	247025	247030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222481371
5506	NC_012030	CAA	2	6	247034	247039	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222481371
5507	NC_012030	TAT	2	6	247137	247142	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222481371
5508	NC_012030	AGT	2	6	247162	247167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222481371
5509	NC_012030	TCG	2	6	247168	247173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5510	NC_012030	A	6	6	247235	247240	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5511	NC_012030	GCA	2	6	247266	247271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5512	NC_012030	GTA	2	6	247293	247298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5513	NC_012030	CAC	2	6	247306	247311	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5514	NC_012030	GAC	2	6	247482	247487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5515	NC_012030	TC	3	6	247525	247530	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5516	NC_012030	TGA	2	6	247535	247540	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5517	NC_012030	GA	3	6	247580	247585	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5518	NC_012030	TGA	2	6	247622	247627	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5519	NC_012030	CACTCA	2	12	247628	247639	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
5520	NC_012030	TC	3	6	247652	247657	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5521	NC_012030	GAT	2	6	247803	247808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5522	NC_012030	GC	3	6	247838	247843	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5523	NC_012030	TGA	2	6	247847	247852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5524	NC_012030	ACACA	2	10	247922	247931	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
5525	NC_012030	CTGATT	2	12	247961	247972	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
5526	NC_012030	AGTT	2	8	247997	248004	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5527	NC_012030	AAT	2	6	248024	248029	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5528	NC_012030	AG	4	8	248220	248227	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5529	NC_012030	GA	3	6	248230	248235	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5530	NC_012030	GCA	2	6	248236	248241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5531	NC_012030	ACG	2	6	248308	248313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222481372
5532	NC_012030	TCAA	2	8	248337	248344	50 %	25 %	0 %	25 %	222481372
5533	NC_012030	CCA	2	6	248357	248362	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222481372
5534	NC_012030	TTG	2	6	248389	248394	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222481372
5535	NC_012030	AAG	2	6	248454	248459	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222481372
5536	NC_012030	CT	3	6	248486	248491	0 %	50 %	0 %	50 %	222481372
5537	NC_012030	TCT	2	6	248533	248538	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5538	NC_012030	AG	3	6	248557	248562	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5539	NC_012030	CTC	2	6	248652	248657	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222481373
5540	NC_012030	CGA	2	6	248713	248718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222481373
5541	NC_012030	GAAT	2	8	248783	248790	50 %	25 %	25 %	0 %	222481373
5542	NC_012030	AC	3	6	249027	249032	50 %	0 %	0 %	50 %	222481373
5543	NC_012030	AC	3	6	249056	249061	50 %	0 %	0 %	50 %	222481373
5544	NC_012030	G	6	6	249068	249073	0 %	0 %	100 %	0 %	222481373
5545	NC_012030	AT	3	6	249153	249158	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5546	NC_012030	GAA	2	6	249163	249168	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5547	NC_012030	CAG	2	6	249177	249182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5548	NC_012030	CCTC	2	8	249203	249210	0 %	25 %	0 %	75 %	222481374
5549	NC_012030	TCT	2	6	249263	249268	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222481374
5550	NC_012030	GAG	2	6	249387	249392	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222481374
5551	NC_012030	GTA	2	6	249429	249434	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222481374
5552	NC_012030	AC	3	6	249451	249456	50 %	0 %	0 %	50 %	222481374
5553	NC_012030	GAC	3	9	249464	249472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222481374
5554	NC_012030	TTG	2	6	249508	249513	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222481374
5555	NC_012030	TCGG	2	8	249520	249527	0 %	25 %	50 %	25 %	222481374
5556	NC_012030	GCC	2	6	249555	249560	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222481374
5557	NC_012030	CAT	2	6	249561	249566	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222481374
5558	NC_012030	ACC	2	6	249648	249653	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222481375
5559	NC_012030	TGG	2	6	249666	249671	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222481375
5560	NC_012030	CTCTTC	2	12	249677	249688	0 %	50 %	0 %	50 %	222481375
5561	NC_012030	CAA	3	9	249697	249705	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222481375
5562	NC_012030	TTC	2	6	249728	249733	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222481375
5563	NC_012030	GTC	2	6	249782	249787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222481375
5564	NC_012030	GGCA	2	8	249826	249833	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5565	NC_012030	CCA	2	6	249946	249951	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5566	NC_012030	GTCA	2	8	249972	249979	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5567	NC_012030	TGA	2	6	250228	250233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222481376
5568	NC_012030	CGTTTC	2	12	250293	250304	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	222481376
5569	NC_012030	ATC	2	6	250335	250340	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222481376
5570	NC_012030	GCG	2	6	250384	250389	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222481376
5571	NC_012030	TCG	2	6	250432	250437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222481376
5572	NC_012030	GC	3	6	250465	250470	0 %	0 %	50 %	50 %	222481376
5573	NC_012030	ATC	2	6	250480	250485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222481376
5574	NC_012030	ATT	2	6	250557	250562	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222481376
5575	NC_012030	CAGC	2	8	250601	250608	25 %	0 %	25 %	50 %	222481376
5576	NC_012030	T	6	6	250616	250621	0 %	100 %	0 %	0 %	222481376
5577	NC_012030	GCT	3	9	250625	250633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222481376
5578	NC_012030	TGA	2	6	250670	250675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222481376
5579	NC_012030	CAC	2	6	250680	250685	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222481376
5580	NC_012030	GTCA	2	8	250686	250693	25 %	25 %	25 %	25 %	222481376
5581	NC_012030	GA	3	6	250714	250719	50 %	0 %	50 %	0 %	222481377
5582	NC_012030	CGAC	2	8	250731	250738	25 %	0 %	25 %	50 %	222481377
5583	NC_012030	GTA	2	6	250801	250806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222481377
5584	NC_012030	TGT	2	6	250828	250833	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222481377
5585	NC_012030	AAC	2	6	250865	250870	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222481377
5586	NC_012030	GTG	2	6	250907	250912	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5587	NC_012030	TCACG	2	10	250962	250971	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
5588	NC_012030	GCA	2	6	250979	250984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5589	NC_012030	TGAC	2	8	251024	251031	25 %	25 %	25 %	25 %	222481378
5590	NC_012030	GAC	2	6	251086	251091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222481378
5591	NC_012030	CCG	2	6	251103	251108	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222481378
5592	NC_012030	CGA	2	6	251118	251123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222481378
5593	NC_012030	T	6	6	251157	251162	0 %	100 %	0 %	0 %	222481378
5594	NC_012030	GAG	2	6	251178	251183	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222481378
5595	NC_012030	GTC	2	6	251251	251256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222481378
5596	NC_012030	GAT	2	6	251302	251307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222481378
5597	NC_012030	AC	3	6	251460	251465	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5598	NC_012030	GCT	2	6	251502	251507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5599	NC_012030	GC	4	8	251537	251544	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5600	NC_012030	ATG	2	6	251600	251605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5601	NC_012030	CGA	2	6	251690	251695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5602	NC_012030	GA	3	6	251694	251699	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5603	NC_012030	ACGG	2	8	251703	251710	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5604	NC_012030	GCTGTC	2	12	251722	251733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5605	NC_012030	GGC	2	6	251734	251739	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5606	NC_012030	GCC	2	6	251745	251750	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5607	NC_012030	CACT	2	8	251767	251774	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5608	NC_012030	TCGG	2	8	251787	251794	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5609	NC_012030	GTC	2	6	251813	251818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222481379
5610	NC_012030	TCG	2	6	251873	251878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222481379
5611	NC_012030	CCA	3	9	251906	251914	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222481379
5612	NC_012030	CGCC	2	8	251922	251929	0 %	0 %	25 %	75 %	222481379
5613	NC_012030	CGG	2	6	251931	251936	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222481379
5614	NC_012030	CAC	3	9	251993	252001	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222481379
5615	NC_012030	CAG	2	6	252005	252010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222481379
5616	NC_012030	GTTGTC	2	12	252030	252041	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	222481379
5617	NC_012030	AGT	2	6	252094	252099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222481379
5618	NC_012030	GTG	2	6	252115	252120	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222481379
5619	NC_012030	GCG	2	6	252141	252146	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222481379
5620	NC_012030	GTAC	2	8	252191	252198	25 %	25 %	25 %	25 %	222481379
5621	NC_012030	GAT	2	6	252320	252325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222481379
5622	NC_012030	AGC	2	6	252357	252362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222481379
5623	NC_012030	GAA	2	6	252440	252445	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222481379
5624	NC_012030	ACT	2	6	252458	252463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222481379
5625	NC_012030	TTC	2	6	252513	252518	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222481379
5626	NC_012030	CG	3	6	252522	252527	0 %	0 %	50 %	50 %	222481379
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5671	NC_012030	AC	3	6	254629	254634	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5672	NC_012030	GT	3	6	254663	254668	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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5712	NC_012030	AAG	2	6	256595	256600	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222481381
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5752	NC_012030	TGA	2	6	258547	258552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222481383
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5754	NC_012030	CGT	2	6	258600	258605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222481383
5755	NC_012030	TCA	2	6	258653	258658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222481383
5756	NC_012030	CTCCGT	2	12	258669	258680	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	222481383
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5760	NC_012030	GTT	2	6	258969	258974	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222481384
5761	NC_012030	ATGT	2	8	258987	258994	25 %	50 %	25 %	0 %	222481384
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5773	NC_012030	TGA	2	6	259665	259670	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5774	NC_012030	TAG	2	6	259877	259882	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5775	NC_012030	GA	3	6	259899	259904	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5776	NC_012030	TC	3	6	260077	260082	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5777	NC_012030	CTA	2	6	260091	260096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5779	NC_012030	GCT	2	6	260215	260220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5781	NC_012030	GA	3	6	260317	260322	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5782	NC_012030	GGCT	2	8	260382	260389	0 %	25 %	50 %	25 %	222481385
5783	NC_012030	TCC	2	6	260462	260467	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222481385
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5857	NC_012030	TATAA	2	10	264100	264109	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5859	NC_012030	GGA	2	6	264237	264242	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5867	NC_012030	GTCGG	2	10	264737	264746	0 %	20 %	60 %	20 %	222481388
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5875	NC_012030	CGAG	2	8	265088	265095	25 %	0 %	50 %	25 %	222481388
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5877	NC_012030	CGA	3	9	265223	265231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222481388
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5941	NC_012030	CTC	2	6	267816	267821	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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5999	NC_012030	GCGCT	2	10	270052	270061	0 %	20 %	40 %	40 %	222481391
6000	NC_012030	CCGT	2	8	270063	270070	0 %	25 %	25 %	50 %	222481391

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