MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239 chromosome 1

Total Repeats: 76836

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_012029	GCC	2	6	111757	111762	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478545
3002	NC_012029	GCA	2	6	111827	111832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478545
3003	NC_012029	CCGG	2	8	111848	111855	0 %	0 %	50 %	50 %	222478545
3004	NC_012029	TCA	2	6	111893	111898	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222478545
3005	NC_012029	ATC	2	6	111949	111954	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222478545
3006	NC_012029	GTC	2	6	112005	112010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478545
3007	NC_012029	TCG	2	6	112024	112029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478545
3008	NC_012029	TCC	2	6	112045	112050	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222478545
3009	NC_012029	CGC	2	6	112112	112117	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478545
3010	NC_012029	TCG	2	6	112138	112143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478545
3011	NC_012029	AGG	2	6	112147	112152	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222478545
3012	NC_012029	CGA	3	9	112166	112174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478545
3013	NC_012029	GAC	2	6	112181	112186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478545
3014	NC_012029	CCGCGT	2	12	112196	112207	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	222478545
3015	NC_012029	CGC	2	6	112265	112270	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478545
3016	NC_012029	CTTCG	2	10	112350	112359	0 %	40 %	20 %	40 %	222478545
3017	NC_012029	GTC	2	6	112381	112386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478546
3018	NC_012029	GTCG	2	8	112395	112402	0 %	25 %	50 %	25 %	222478546
3019	NC_012029	TCG	2	6	112466	112471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478546
3020	NC_012029	TTC	2	6	112508	112513	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222478546
3021	NC_012029	GCG	2	6	112617	112622	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478546
3022	NC_012029	GTCC	2	8	112660	112667	0 %	25 %	25 %	50 %	222478546
3023	NC_012029	ACC	2	6	112696	112701	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222478546
3024	NC_012029	CG	3	6	112798	112803	0 %	0 %	50 %	50 %	222478546
3025	NC_012029	GTC	2	6	112912	112917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478546
3026	NC_012029	GTA	2	6	112972	112977	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222478546
3027	NC_012029	TTG	2	6	112982	112987	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222478546
3028	NC_012029	TCC	2	6	112997	113002	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222478546
3029	NC_012029	TCG	2	6	113003	113008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478546
3030	NC_012029	CTC	2	6	113014	113019	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222478546
3031	NC_012029	GAG	2	6	113032	113037	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222478546
3032	NC_012029	TTC	2	6	113078	113083	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222478546
3033	NC_012029	GTC	2	6	113132	113137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478546
3034	NC_012029	CCT	2	6	113148	113153	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222478546
3035	NC_012029	GTC	2	6	113188	113193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478546
3036	NC_012029	TCG	2	6	113216	113221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478546
3037	NC_012029	GACG	2	8	113272	113279	25 %	0 %	50 %	25 %	222478546
3038	NC_012029	AGC	2	6	113294	113299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478546
3039	NC_012029	TCG	2	6	113375	113380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478546
3040	NC_012029	TCC	2	6	113426	113431	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222478546
3041	NC_012029	TCA	2	6	113436	113441	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222478546
3042	NC_012029	GCC	2	6	113473	113478	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478546
3043	NC_012029	TCG	3	9	113513	113521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478546
3044	NC_012029	CGA	2	6	113595	113600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478546
3045	NC_012029	CGC	3	9	113619	113627	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478546
3046	NC_012029	CAG	2	6	113698	113703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478546
3047	NC_012029	CG	3	6	113730	113735	0 %	0 %	50 %	50 %	222478546
3048	NC_012029	TCG	2	6	113822	113827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478546
3049	NC_012029	CCT	2	6	113832	113837	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222478546
3050	NC_012029	GTT	2	6	113857	113862	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222478546
3051	NC_012029	GTG	2	6	113875	113880	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222478546
3052	NC_012029	GAC	2	6	113946	113951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478547
3053	NC_012029	CAC	2	6	114003	114008	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222478547
3054	NC_012029	TCG	2	6	114025	114030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478547
3055	NC_012029	TCG	2	6	114100	114105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478547
3056	NC_012029	CCT	2	6	114107	114112	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222478547
3057	NC_012029	GTG	2	6	114170	114175	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3058	NC_012029	GA	3	6	114182	114187	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3059	NC_012029	TAC	2	6	114201	114206	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3060	NC_012029	ACG	3	9	114266	114274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3061	NC_012029	CA	3	6	114307	114312	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3062	NC_012029	CCG	2	6	114321	114326	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3063	NC_012029	CGC	2	6	114384	114389	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3064	NC_012029	GCC	2	6	114397	114402	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3065	NC_012029	CGC	2	6	114434	114439	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3066	NC_012029	CAC	2	6	114456	114461	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3067	NC_012029	GTC	2	6	114463	114468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3068	NC_012029	CAT	2	6	114539	114544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3069	NC_012029	CAT	2	6	114641	114646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3070	NC_012029	CGA	2	6	114698	114703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3071	NC_012029	GAGCG	2	10	114760	114769	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
3072	NC_012029	GAC	2	6	114818	114823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3073	NC_012029	AGC	2	6	114851	114856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478548
3074	NC_012029	TCT	2	6	114885	114890	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222478548
3075	NC_012029	GTC	3	9	114898	114906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478548
3076	NC_012029	CCT	2	6	114983	114988	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222478548
3077	NC_012029	TGT	2	6	115017	115022	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222478548
3078	NC_012029	TCGG	2	8	115039	115046	0 %	25 %	50 %	25 %	222478548
3079	NC_012029	TCA	2	6	115047	115052	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222478548
3080	NC_012029	GAG	2	6	115067	115072	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222478548
3081	NC_012029	ACC	2	6	115166	115171	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222478548
3082	NC_012029	TCG	2	6	115172	115177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478548
3083	NC_012029	CGCC	2	8	115200	115207	0 %	0 %	25 %	75 %	222478548
3084	NC_012029	GTT	2	6	115232	115237	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222478548
3085	NC_012029	TCG	2	6	115247	115252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478548
3086	NC_012029	TCG	2	6	115262	115267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478548
3087	NC_012029	GTCC	2	8	115290	115297	0 %	25 %	25 %	50 %	222478548
3088	NC_012029	CGT	2	6	115404	115409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478548
3089	NC_012029	CGG	2	6	115431	115436	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478548
3090	NC_012029	GTT	2	6	115438	115443	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222478548
3091	NC_012029	GTG	2	6	115480	115485	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222478548
3092	NC_012029	CGG	2	6	115489	115494	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478548
3093	NC_012029	GCC	2	6	115550	115555	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478548
3094	NC_012029	GGCC	2	8	115566	115573	0 %	0 %	50 %	50 %	222478548
3095	NC_012029	CTCG	2	8	115600	115607	0 %	25 %	25 %	50 %	222478548
3096	NC_012029	CGC	2	6	115632	115637	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478548
3097	NC_012029	CGA	2	6	115644	115649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478548
3098	NC_012029	TCG	2	6	115661	115666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478548
3099	NC_012029	CGT	2	6	115677	115682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478548
3100	NC_012029	CCT	2	6	115695	115700	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222478548
3101	NC_012029	CG	3	6	115701	115706	0 %	0 %	50 %	50 %	222478548
3102	NC_012029	CG	3	6	115765	115770	0 %	0 %	50 %	50 %	222478548
3103	NC_012029	GGCGT	2	10	115903	115912	0 %	20 %	60 %	20 %	222478549
3104	NC_012029	TCC	2	6	115952	115957	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222478549
3105	NC_012029	GC	3	6	115978	115983	0 %	0 %	50 %	50 %	222478549
3106	NC_012029	ATCG	2	8	116001	116008	25 %	25 %	25 %	25 %	222478549
3107	NC_012029	CG	3	6	116021	116026	0 %	0 %	50 %	50 %	222478549
3108	NC_012029	CGTC	2	8	116114	116121	0 %	25 %	25 %	50 %	222478549
3109	NC_012029	CTC	2	6	116188	116193	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222478549
3110	NC_012029	GGC	2	6	116194	116199	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478549
3111	NC_012029	CCG	2	6	116230	116235	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478549
3112	NC_012029	GAT	2	6	116236	116241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222478549
3113	NC_012029	AC	3	6	116278	116283	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3114	NC_012029	CCG	3	9	116326	116334	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3115	NC_012029	CGC	2	6	116346	116351	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3116	NC_012029	CGT	2	6	116390	116395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478550
3117	NC_012029	CCT	2	6	116438	116443	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222478550
3118	NC_012029	CGT	2	6	116492	116497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478550
3119	NC_012029	GAC	2	6	116523	116528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478550
3120	NC_012029	GTCGCG	2	12	116569	116580	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	222478550
3121	NC_012029	GCC	2	6	116583	116588	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478550
3122	NC_012029	CGC	2	6	116603	116608	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478550
3123	NC_012029	CCG	2	6	116632	116637	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478550
3124	NC_012029	CGG	2	6	116657	116662	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478550
3125	NC_012029	TTGT	2	8	116704	116711	0 %	75 %	25 %	0 %	222478550
3126	NC_012029	CGT	2	6	116726	116731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478550
3127	NC_012029	GCT	2	6	116733	116738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478550
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3131	NC_012029	GAC	2	6	116871	116876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478550
3132	NC_012029	GTC	2	6	116943	116948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478550
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3150	NC_012029	ACC	2	6	117894	117899	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3151	NC_012029	CGTCGC	2	12	117983	117994	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
3152	NC_012029	GTT	2	6	118083	118088	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3153	NC_012029	CTC	2	6	118105	118110	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3154	NC_012029	TC	3	6	118181	118186	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3155	NC_012029	GGTAG	2	10	118235	118244	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
3156	NC_012029	TCC	2	6	118252	118257	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3157	NC_012029	TTCG	2	8	118324	118331	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3158	NC_012029	GCC	2	6	118335	118340	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3159	NC_012029	CGCT	2	8	118364	118371	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3160	NC_012029	CGC	2	6	118385	118390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3161	NC_012029	CGCTC	2	10	118420	118429	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
3162	NC_012029	CGTG	2	8	118485	118492	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3163	NC_012029	GTGG	2	8	118526	118533	0 %	25 %	75 %	0 %	222478551
3164	NC_012029	CG	3	6	118545	118550	0 %	0 %	50 %	50 %	222478551
3165	NC_012029	CCG	2	6	118610	118615	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478551
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3171	NC_012029	AGTG	2	8	118769	118776	25 %	25 %	50 %	0 %	222478551
3172	NC_012029	GCCG	2	8	118780	118787	0 %	0 %	50 %	50 %	222478551
3173	NC_012029	TCG	3	9	118795	118803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478551
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3210	NC_012029	CGGT	2	8	119978	119985	0 %	25 %	50 %	25 %	222478551
3211	NC_012029	TAG	2	6	119997	120002	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222478551
3212	NC_012029	AGC	2	6	120013	120018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478551
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3221	NC_012029	CCG	2	6	120389	120394	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3222	NC_012029	CTT	2	6	120397	120402	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3223	NC_012029	CGC	2	6	120430	120435	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3224	NC_012029	CGC	2	6	120439	120444	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3225	NC_012029	CA	3	6	120511	120516	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3226	NC_012029	AAC	2	6	120519	120524	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3227	NC_012029	TCC	2	6	120537	120542	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3228	NC_012029	C	6	6	120623	120628	0 %	0 %	0 %	100 %	222478552
3229	NC_012029	GTC	2	6	120661	120666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478552
3230	NC_012029	CGC	2	6	120684	120689	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478552
3231	NC_012029	CGC	2	6	120734	120739	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3232	NC_012029	TC	4	8	120742	120749	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3233	NC_012029	CG	3	6	120880	120885	0 %	0 %	50 %	50 %	222478553
3234	NC_012029	CGC	2	6	120887	120892	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478553
3235	NC_012029	CGT	2	6	120962	120967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478553
3236	NC_012029	CGA	2	6	121043	121048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478553
3237	NC_012029	CGC	2	6	121096	121101	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3238	NC_012029	ACCG	2	8	121125	121132	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3239	NC_012029	CAA	2	6	121178	121183	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3240	NC_012029	ACG	2	6	121185	121190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3241	NC_012029	C	6	6	121206	121211	0 %	0 %	0 %	100 %	222478554
3242	NC_012029	CCCG	2	8	121253	121260	0 %	0 %	25 %	75 %	222478554
3243	NC_012029	GC	3	6	121277	121282	0 %	0 %	50 %	50 %	222478554
3244	NC_012029	GGT	2	6	121286	121291	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222478554
3245	NC_012029	CGC	2	6	121295	121300	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478554
3246	NC_012029	CGC	2	6	121325	121330	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478554
3247	NC_012029	CGG	2	6	121354	121359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478554
3248	NC_012029	CT	3	6	121390	121395	0 %	50 %	0 %	50 %	222478554
3249	NC_012029	CCG	2	6	121397	121402	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478554
3250	NC_012029	CG	3	6	121422	121427	0 %	0 %	50 %	50 %	222478554
3251	NC_012029	CGA	2	6	121454	121459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478554
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3254	NC_012029	T	6	6	121600	121605	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3255	NC_012029	CGG	2	6	121607	121612	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3256	NC_012029	GA	3	6	121695	121700	50 %	0 %	50 %	0 %	222478555
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3364	NC_012029	CGC	2	6	125517	125522	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478558
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3489	NC_012029	ACGG	2	8	129643	129650	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3490	NC_012029	ACGC	2	8	129709	129716	25 %	0 %	25 %	50 %	222478562
3491	NC_012029	GAC	2	6	129769	129774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478562
3492	NC_012029	GGC	2	6	129866	129871	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478562
3493	NC_012029	GAA	2	6	129920	129925	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222478562
3494	NC_012029	GAG	2	6	129926	129931	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222478562
3495	NC_012029	CGA	2	6	129967	129972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478562
3496	NC_012029	CGA	2	6	130063	130068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478562
3497	NC_012029	GCG	2	6	130086	130091	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478562
3498	NC_012029	ACG	2	6	130161	130166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478562
3499	NC_012029	GGCG	2	8	130189	130196	0 %	0 %	75 %	25 %	222478562
3500	NC_012029	CGA	2	6	130222	130227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478562

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