MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239 chromosome 1

Total Repeats: 76836

< Previous12...3334353637383940414243...153154Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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18502	NC_012029	TCG	2	6	652504	652509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222479067
18503	NC_012029	GGC	2	6	652584	652589	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222479067
18504	NC_012029	CGAG	2	8	652616	652623	25 %	0 %	50 %	25 %	222479067
18505	NC_012029	CGT	2	6	652643	652648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222479067
18506	NC_012029	CGG	2	6	652656	652661	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222479067
18507	NC_012029	GCCG	2	8	652725	652732	0 %	0 %	50 %	50 %	222479067
18508	NC_012029	GCT	2	6	652748	652753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222479067
18509	NC_012029	CCG	2	6	652765	652770	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222479067
18510	NC_012029	CCT	2	6	652775	652780	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222479067
18511	NC_012029	ACTCGT	2	12	652805	652816	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	222479067
18512	NC_012029	CGG	3	9	652844	652852	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222479067
18513	NC_012029	CGT	2	6	652869	652874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222479067
18514	NC_012029	CGT	2	6	652881	652886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222479067
18515	NC_012029	CGC	2	6	652958	652963	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222479067
18516	NC_012029	CGC	2	6	652967	652972	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222479067
18517	NC_012029	CGC	2	6	652976	652981	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222479067
18518	NC_012029	AGCG	2	8	653007	653014	25 %	0 %	50 %	25 %	222479067
18519	NC_012029	C	6	6	653023	653028	0 %	0 %	0 %	100 %	222479067
18520	NC_012029	ACA	2	6	653070	653075	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18521	NC_012029	CG	3	6	653138	653143	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18522	NC_012029	CGGAT	2	10	653161	653170	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
18523	NC_012029	CGG	2	6	653173	653178	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18524	NC_012029	TGC	2	6	653205	653210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18525	NC_012029	TCC	2	6	653238	653243	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18526	NC_012029	CGG	2	6	653255	653260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18527	NC_012029	TGC	2	6	653270	653275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18528	NC_012029	AC	3	6	653391	653396	50 %	0 %	0 %	50 %	222479068
18529	NC_012029	TCG	2	6	653424	653429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222479068
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18531	NC_012029	GAC	2	6	653503	653508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222479068
18532	NC_012029	GGA	2	6	653533	653538	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222479068
18533	NC_012029	GTTCG	2	10	653555	653564	0 %	40 %	40 %	20 %	222479068
18534	NC_012029	ACG	2	6	653565	653570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222479068
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18537	NC_012029	CGA	2	6	653761	653766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222479068
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18539	NC_012029	CGA	2	6	653851	653856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222479068
18540	NC_012029	GC	3	6	653896	653901	0 %	0 %	50 %	50 %	222479068
18541	NC_012029	AAG	2	6	653961	653966	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222479068
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18551	NC_012029	GTC	2	6	654302	654307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222479068
18552	NC_012029	CG	3	6	654361	654366	0 %	0 %	50 %	50 %	222479068
18553	NC_012029	CGA	2	6	654397	654402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222479068
18554	NC_012029	GTG	2	6	654410	654415	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222479068
18555	NC_012029	CGA	2	6	654475	654480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222479068
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18557	NC_012029	GCC	2	6	654614	654619	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18558	NC_012029	TCG	2	6	654649	654654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18559	NC_012029	CG	3	6	654677	654682	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18560	NC_012029	CGG	2	6	654693	654698	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18561	NC_012029	CGC	2	6	654702	654707	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18562	NC_012029	ACT	2	6	654736	654741	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18563	NC_012029	GC	4	8	654771	654778	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18564	NC_012029	TCAG	2	8	654841	654848	25 %	25 %	25 %	25 %	222479069
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18568	NC_012029	CG	4	8	654921	654928	0 %	0 %	50 %	50 %	222479069
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18604	NC_012029	CGA	2	6	655934	655939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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18608	NC_012029	GCT	2	6	656106	656111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18609	NC_012029	CGT	2	6	656143	656148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18610	NC_012029	CGG	2	6	656150	656155	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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18741	NC_012029	TCC	2	6	660835	660840	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222479075
18742	NC_012029	ACG	2	6	660850	660855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222479075
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18744	NC_012029	GTC	2	6	661017	661022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222479075
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18752	NC_012029	TCG	3	9	661279	661287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222479075
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18763	NC_012029	CGG	2	6	661607	661612	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222479076
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18793	NC_012029	CGC	2	6	662742	662747	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222479077
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18805	NC_012029	GTC	2	6	663064	663069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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18838	NC_012029	TCG	2	6	664374	664379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222479079
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18847	NC_012029	GGCC	2	8	664970	664977	0 %	0 %	50 %	50 %	222479080
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18852	NC_012029	GGC	3	9	665140	665148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222479080
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18855	NC_012029	CGG	2	6	665318	665323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222479081
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18857	NC_012029	GCGATC	2	12	665379	665390	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	222479081
18858	NC_012029	CTC	2	6	665394	665399	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222479081
18859	NC_012029	GAT	2	6	665501	665506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222479081
18860	NC_012029	TCC	2	6	665527	665532	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222479081
18861	NC_012029	TCC	2	6	665551	665556	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222479081
18862	NC_012029	TGA	2	6	665563	665568	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222479081
18863	NC_012029	GAA	2	6	665573	665578	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222479081
18864	NC_012029	GCC	2	6	665581	665586	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222479081
18865	NC_012029	GGA	2	6	665594	665599	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222479081
18866	NC_012029	CGGCGT	2	12	665627	665638	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	222479081
18867	NC_012029	TAACC	2	10	665648	665657	40 %	20 %	0 %	40 %	222479081
18868	NC_012029	AAG	2	6	665691	665696	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222479081
18869	NC_012029	A	6	6	665716	665721	100 %	0 %	0 %	0 %	222479082
18870	NC_012029	CAC	2	6	665790	665795	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222479082
18871	NC_012029	TCG	2	6	665825	665830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222479082
18872	NC_012029	GCT	2	6	665841	665846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222479082
18873	NC_012029	TAC	2	6	665857	665862	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222479082
18874	NC_012029	CG	3	6	665863	665868	0 %	0 %	50 %	50 %	222479082
18875	NC_012029	ACA	2	6	665912	665917	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222479082
18876	NC_012029	CTGGTA	2	12	665922	665933	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	222479082
18877	NC_012029	CTCG	2	8	665943	665950	0 %	25 %	25 %	50 %	222479082
18878	NC_012029	CT	3	6	665956	665961	0 %	50 %	0 %	50 %	222479082
18879	NC_012029	ATC	2	6	665962	665967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222479082
18880	NC_012029	CGG	2	6	665981	665986	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222479082
18881	NC_012029	GC	3	6	665993	665998	0 %	0 %	50 %	50 %	222479082
18882	NC_012029	CTA	2	6	666009	666014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222479082
18883	NC_012029	CCG	2	6	666026	666031	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222479082
18884	NC_012029	GCC	2	6	666034	666039	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222479082
18885	NC_012029	CGT	2	6	666072	666077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222479082
18886	NC_012029	GAT	2	6	666078	666083	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222479082
18887	NC_012029	GCTCC	2	10	666111	666120	0 %	20 %	20 %	60 %	222479082
18888	NC_012029	GCC	2	6	666133	666138	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222479082
18889	NC_012029	CGC	2	6	666150	666155	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222479082
18890	NC_012029	AGC	2	6	666290	666295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222479082
18891	NC_012029	GGC	2	6	666360	666365	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222479082
18892	NC_012029	CGG	2	6	666378	666383	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222479082
18893	NC_012029	CGTGTT	2	12	666429	666440	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	222479082
18894	NC_012029	GTG	2	6	666448	666453	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222479082
18895	NC_012029	GACG	2	8	666544	666551	25 %	0 %	50 %	25 %	222479083
18896	NC_012029	CGA	2	6	666559	666564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222479083
18897	NC_012029	GC	3	6	666569	666574	0 %	0 %	50 %	50 %	222479083
18898	NC_012029	ACGG	2	8	666575	666582	25 %	0 %	50 %	25 %	222479083
18899	NC_012029	CCG	2	6	666587	666592	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222479083
18900	NC_012029	GCC	2	6	666601	666606	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222479083
18901	NC_012029	CGC	2	6	666692	666697	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222479083
18902	NC_012029	GAGGAC	2	12	666698	666709	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	222479083
18903	NC_012029	ACGT	2	8	666725	666732	25 %	25 %	25 %	25 %	222479083
18904	NC_012029	CTT	2	6	666799	666804	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222479083
18905	NC_012029	ATC	2	6	666884	666889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222479083
18906	NC_012029	GCT	2	6	666922	666927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222479083
18907	NC_012029	CAA	2	6	667051	667056	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222479083
18908	NC_012029	GC	4	8	667062	667069	0 %	0 %	50 %	50 %	222479083
18909	NC_012029	AGC	2	6	667080	667085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222479083
18910	NC_012029	GCC	2	6	667094	667099	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222479083
18911	NC_012029	CTT	2	6	667156	667161	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222479083
18912	NC_012029	CTC	2	6	667181	667186	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222479083
18913	NC_012029	TGC	2	6	667200	667205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222479083
18914	NC_012029	CAT	2	6	667219	667224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222479083
18915	NC_012029	CGG	2	6	667277	667282	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222479083
18916	NC_012029	TAC	2	6	667283	667288	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222479083
18917	NC_012029	TGC	2	6	667290	667295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222479083
18918	NC_012029	CCG	2	6	667298	667303	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222479083
18919	NC_012029	CGC	2	6	667338	667343	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18920	NC_012029	TCA	3	9	667358	667366	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222479084
18921	NC_012029	ACG	3	9	667374	667382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222479084
18922	NC_012029	CGA	2	6	667393	667398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222479084
18923	NC_012029	CGATC	2	10	667405	667414	20 %	20 %	20 %	40 %	222479084
18924	NC_012029	ACGA	2	8	667422	667429	50 %	0 %	25 %	25 %	222479084
18925	NC_012029	GACG	2	8	667472	667479	25 %	0 %	50 %	25 %	222479084
18926	NC_012029	GTC	3	9	667484	667492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222479084
18927	NC_012029	TCT	2	6	667521	667526	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222479084
18928	NC_012029	GGC	2	6	667534	667539	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222479084
18929	NC_012029	CGC	2	6	667576	667581	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222479084
18930	NC_012029	GAC	2	6	667606	667611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222479084
18931	NC_012029	CCT	2	6	667621	667626	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222479084
18932	NC_012029	GAC	2	6	667652	667657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222479084
18933	NC_012029	TCG	2	6	667662	667667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222479084
18934	NC_012029	TCG	2	6	667698	667703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222479084
18935	NC_012029	GGT	2	6	667711	667716	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222479084
18936	NC_012029	GAC	2	6	667766	667771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222479084
18937	NC_012029	CGA	2	6	667774	667779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222479084
18938	NC_012029	GGCT	2	8	667842	667849	0 %	25 %	50 %	25 %	222479085
18939	NC_012029	CGG	2	6	667856	667861	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222479085
18940	NC_012029	TAC	2	6	667881	667886	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222479085
18941	NC_012029	GA	3	6	667936	667941	50 %	0 %	50 %	0 %	222479085
18942	NC_012029	TCG	2	6	667948	667953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222479085
18943	NC_012029	TTC	2	6	667965	667970	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222479085
18944	NC_012029	TGA	2	6	667975	667980	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222479085
18945	NC_012029	GC	3	6	668030	668035	0 %	0 %	50 %	50 %	222479085
18946	NC_012029	CGA	3	9	668042	668050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222479085
18947	NC_012029	CTT	2	6	668085	668090	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18948	NC_012029	GC	3	6	668153	668158	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18949	NC_012029	CGGA	2	8	668200	668207	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
18950	NC_012029	GAG	2	6	668231	668236	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18951	NC_012029	CGG	2	6	668297	668302	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18952	NC_012029	GTA	2	6	668401	668406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222479086
18953	NC_012029	AGC	2	6	668426	668431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222479086
18954	NC_012029	TCGA	2	8	668459	668466	25 %	25 %	25 %	25 %	222479086
18955	NC_012029	GATCAC	2	12	668530	668541	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	222479086
18956	NC_012029	GAAC	2	8	668574	668581	50 %	0 %	25 %	25 %	222479086
18957	NC_012029	GTG	2	6	668668	668673	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222479086
18958	NC_012029	GCA	2	6	668733	668738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222479086
18959	NC_012029	CAGC	2	8	668755	668762	25 %	0 %	25 %	50 %	222479086
18960	NC_012029	CA	3	6	668797	668802	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
18961	NC_012029	TTA	2	6	668815	668820	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222479087
18962	NC_012029	GC	3	6	668836	668841	0 %	0 %	50 %	50 %	222479087
18963	NC_012029	TCGA	2	8	668874	668881	25 %	25 %	25 %	25 %	222479087
18964	NC_012029	TCTCGA	2	12	668885	668896	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	222479087
18965	NC_012029	TCGG	2	8	668897	668904	0 %	25 %	50 %	25 %	222479087
18966	NC_012029	CCG	2	6	668990	668995	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222479087
18967	NC_012029	CCG	2	6	669049	669054	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222479087
18968	NC_012029	GCG	2	6	669107	669112	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222479087
18969	NC_012029	CGA	3	9	669116	669124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222479087
18970	NC_012029	CG	3	6	669155	669160	0 %	0 %	50 %	50 %	222479087
18971	NC_012029	TCG	2	6	669196	669201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222479087
18972	NC_012029	GAC	2	6	669204	669209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222479087
18973	NC_012029	TGAC	2	8	669271	669278	25 %	25 %	25 %	25 %	222479087
18974	NC_012029	CCG	2	6	669299	669304	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222479087
18975	NC_012029	AGC	2	6	669313	669318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222479087
18976	NC_012029	CGGT	2	8	669364	669371	0 %	25 %	50 %	25 %	222479087
18977	NC_012029	CGA	2	6	669401	669406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222479087
18978	NC_012029	TCG	2	6	669424	669429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222479087
18979	NC_012029	GAG	2	6	669441	669446	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222479087
18980	NC_012029	TCG	2	6	669460	669465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222479087
18981	NC_012029	TCC	2	6	669476	669481	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222479087
18982	NC_012029	GTC	2	6	669554	669559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222479087
18983	NC_012029	CGT	2	6	669560	669565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222479087
18984	NC_012029	CGA	2	6	669569	669574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222479087
18985	NC_012029	GGTG	2	8	669619	669626	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
18986	NC_012029	CGG	2	6	669645	669650	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18987	NC_012029	GC	3	6	669717	669722	0 %	0 %	50 %	50 %	222479088
18988	NC_012029	TCG	2	6	669731	669736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222479088
18989	NC_012029	CG	3	6	669746	669751	0 %	0 %	50 %	50 %	222479088
18990	NC_012029	CGT	2	6	669759	669764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222479088
18991	NC_012029	CGA	3	9	669777	669785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222479088
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18994	NC_012029	CGA	2	6	669921	669926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222479088
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18996	NC_012029	GCCG	2	8	670003	670010	0 %	0 %	50 %	50 %	222479088
18997	NC_012029	GTG	2	6	670030	670035	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222479088
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18999	NC_012029	CGA	2	6	670161	670166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222479088
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