MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239 chromosome 1

Total Repeats: 76836

< Previous12...3233343536373839404142...153154Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
18001	NC_012029	ACGG	2	8	635666	635673	25 %	0 %	50 %	25 %	222479051
18002	NC_012029	GGC	2	6	635692	635697	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222479051
18003	NC_012029	CGT	2	6	635790	635795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222479051
18004	NC_012029	CG	4	8	635815	635822	0 %	0 %	50 %	50 %	222479051
18005	NC_012029	CGA	3	9	635857	635865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222479051
18006	NC_012029	GCC	2	6	635933	635938	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222479051
18007	NC_012029	GC	4	8	635950	635957	0 %	0 %	50 %	50 %	222479051
18008	NC_012029	CGG	2	6	636004	636009	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222479051
18009	NC_012029	CGA	2	6	636088	636093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222479051
18010	NC_012029	GCC	2	6	636101	636106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222479051
18011	NC_012029	CGC	2	6	636136	636141	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222479051
18012	NC_012029	CG	3	6	636146	636151	0 %	0 %	50 %	50 %	222479051
18013	NC_012029	CGA	2	6	636154	636159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222479051
18014	NC_012029	CGA	2	6	636162	636167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222479051
18015	NC_012029	ACG	2	6	636177	636182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222479051
18016	NC_012029	TCG	2	6	636189	636194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222479051
18017	NC_012029	CG	4	8	636193	636200	0 %	0 %	50 %	50 %	222479051
18018	NC_012029	GGA	3	9	636226	636234	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222479051
18019	NC_012029	CGC	2	6	636241	636246	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222479051
18020	NC_012029	GCC	2	6	636257	636262	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222479051
18021	NC_012029	CGTCGC	2	12	636313	636324	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	222479051
18022	NC_012029	CGA	2	6	636328	636333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222479051
18023	NC_012029	GGCT	2	8	636345	636352	0 %	25 %	50 %	25 %	222479051
18024	NC_012029	CGG	2	6	636364	636369	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222479051
18025	NC_012029	GCGG	2	8	636380	636387	0 %	0 %	75 %	25 %	222479051
18026	NC_012029	CCG	2	6	636393	636398	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222479051
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18031	NC_012029	GAG	2	6	636518	636523	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222479051
18032	NC_012029	CGAC	2	8	636531	636538	25 %	0 %	25 %	50 %	222479051
18033	NC_012029	GC	3	6	636552	636557	0 %	0 %	50 %	50 %	222479051
18034	NC_012029	CGC	2	6	636559	636564	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222479051
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18039	NC_012029	CGCT	2	8	636668	636675	0 %	25 %	25 %	50 %	222479052
18040	NC_012029	CGA	2	6	636678	636683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222479052
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18049	NC_012029	CGA	2	6	636840	636845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222479052
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18052	NC_012029	GTC	2	6	637008	637013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222479053
18053	NC_012029	ACG	3	9	637026	637034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222479053
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18057	NC_012029	CCG	2	6	637169	637174	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222479053
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18063	NC_012029	CCG	2	6	637292	637297	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222479053
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18066	NC_012029	TCGT	2	8	637347	637354	0 %	50 %	25 %	25 %	222479053
18067	NC_012029	TCG	2	6	637363	637368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222479053
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18070	NC_012029	CGC	2	6	637472	637477	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222479053
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18073	NC_012029	CGA	2	6	637529	637534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222479053
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18075	NC_012029	TGC	2	6	637592	637597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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18085	NC_012029	AGCG	2	8	637943	637950	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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18087	NC_012029	CACT	2	8	638004	638011	25 %	25 %	0 %	50 %	222479054
18088	NC_012029	TCGC	2	8	638072	638079	0 %	25 %	25 %	50 %	222479054
18089	NC_012029	TCGACG	2	12	638086	638097	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	222479054
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18106	NC_012029	GCC	2	6	638931	638936	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222479055
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18108	NC_012029	CG	3	6	639006	639011	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18109	NC_012029	GCC	2	6	639057	639062	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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18238	NC_012029	CGA	3	9	643112	643120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222479059
18239	NC_012029	GAG	2	6	643128	643133	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222479059
18240	NC_012029	CGA	2	6	643178	643183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222479059
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18280	NC_012029	CCG	2	6	644407	644412	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18281	NC_012029	TC	3	6	644443	644448	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18282	NC_012029	CGAAA	2	10	644450	644459	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
18283	NC_012029	CG	3	6	644480	644485	0 %	0 %	50 %	50 %	222479061
18284	NC_012029	CCGA	2	8	644486	644493	25 %	0 %	25 %	50 %	222479061
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18287	NC_012029	CGA	2	6	644601	644606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222479061
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18343	NC_012029	CGCC	2	8	646639	646646	0 %	0 %	25 %	75 %	222479063
18344	NC_012029	CGCGT	2	10	646670	646679	0 %	20 %	40 %	40 %	222479063
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18346	NC_012029	TCGT	2	8	646771	646778	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
18347	NC_012029	GTC	2	6	646910	646915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222479064
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18350	NC_012029	CGTC	2	8	647014	647021	0 %	25 %	25 %	50 %	222479064
18351	NC_012029	TCG	2	6	647028	647033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222479064
18352	NC_012029	GTCGC	2	10	647040	647049	0 %	20 %	40 %	40 %	222479064
18353	NC_012029	CGA	2	6	647050	647055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222479064
18354	NC_012029	GGA	2	6	647074	647079	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222479064
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18356	NC_012029	CCG	2	6	647107	647112	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222479064
18357	NC_012029	CGA	2	6	647122	647127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222479064
18358	NC_012029	CG	3	6	647144	647149	0 %	0 %	50 %	50 %	222479064
18359	NC_012029	CTCGG	2	10	647150	647159	0 %	20 %	40 %	40 %	222479064
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18421	NC_012029	CGGC	2	8	649218	649225	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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18428	NC_012029	CT	3	6	649528	649533	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18429	NC_012029	GTC	2	6	649538	649543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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18461	NC_012029	CACC	2	8	650756	650763	25 %	0 %	0 %	75 %	222479066
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18465	NC_012029	CGA	2	6	650825	650830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222479066
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18472	NC_012029	GAT	3	9	651108	651116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222479066
18473	NC_012029	GCCA	2	8	651133	651140	25 %	0 %	25 %	50 %	222479066
18474	NC_012029	GTG	2	6	651148	651153	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222479066
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18477	NC_012029	CGA	2	6	651234	651239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222479066
18478	NC_012029	CCG	2	6	651356	651361	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222479066
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18480	NC_012029	AGG	2	6	651403	651408	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222479066
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