MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239 chromosome 1

Total Repeats: 76836

< Previous12...2930313233343536373839...153154Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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16502	NC_012029	GAC	2	6	582915	582920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16503	NC_012029	GAC	2	6	582931	582936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16504	NC_012029	GAC	2	6	582947	582952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16505	NC_012029	CGAT	2	8	582973	582980	25 %	25 %	25 %	25 %	222478996
16506	NC_012029	CGA	2	6	582988	582993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478996
16507	NC_012029	CGA	2	6	583027	583032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478996
16508	NC_012029	TCGA	2	8	583050	583057	25 %	25 %	25 %	25 %	222478996
16509	NC_012029	CGC	2	6	583105	583110	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478996
16510	NC_012029	TCG	2	6	583122	583127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478996
16511	NC_012029	TCG	2	6	583149	583154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478996
16512	NC_012029	CCGC	2	8	583168	583175	0 %	0 %	25 %	75 %	222478996
16513	NC_012029	CGT	2	6	583225	583230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478996
16514	NC_012029	TGGC	2	8	583269	583276	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
16515	NC_012029	TGG	2	6	583332	583337	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16516	NC_012029	CGC	2	6	583385	583390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478997
16517	NC_012029	CGT	2	6	583402	583407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478997
16518	NC_012029	CGC	2	6	583414	583419	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478997
16519	NC_012029	CAC	2	6	583436	583441	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222478997
16520	NC_012029	CG	3	6	583470	583475	0 %	0 %	50 %	50 %	222478997
16521	NC_012029	CGG	2	6	583513	583518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478997
16522	NC_012029	CGA	2	6	583546	583551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478997
16523	NC_012029	CGA	2	6	583609	583614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478997
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16525	NC_012029	CGA	2	6	583684	583689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478997
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16527	NC_012029	TCG	2	6	583741	583746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478997
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16529	NC_012029	GGC	2	6	583805	583810	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478997
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16531	NC_012029	GCG	2	6	583827	583832	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478997
16532	NC_012029	CGT	2	6	583937	583942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478997
16533	NC_012029	CCGG	2	8	583960	583967	0 %	0 %	50 %	50 %	222478997
16534	NC_012029	ACC	2	6	584013	584018	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222478997
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16536	NC_012029	CG	3	6	584110	584115	0 %	0 %	50 %	50 %	222478997
16537	NC_012029	TCG	2	6	584127	584132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478997
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16539	NC_012029	CGA	2	6	584170	584175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478997
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16541	NC_012029	GTCG	2	8	584274	584281	0 %	25 %	50 %	25 %	222478997
16542	NC_012029	GAG	2	6	584286	584291	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222478997
16543	NC_012029	TCGAG	2	10	584296	584305	20 %	20 %	40 %	20 %	222478997
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16547	NC_012029	CGC	2	6	584410	584415	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478997
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16549	NC_012029	CGG	2	6	584434	584439	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478997
16550	NC_012029	GAT	2	6	584444	584449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222478997
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16552	NC_012029	CGA	2	6	584491	584496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478997
16553	NC_012029	GTC	2	6	584504	584509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478997
16554	NC_012029	GCC	2	6	584510	584515	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478997
16555	NC_012029	CTC	2	6	584519	584524	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222478997
16556	NC_012029	CGT	2	6	584548	584553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478997
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16561	NC_012029	TGA	2	6	584635	584640	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222478997
16562	NC_012029	GAGCT	2	10	584685	584694	20 %	20 %	40 %	20 %	222478997
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16589	NC_012029	GC	3	6	585884	585889	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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16611	NC_012029	GCC	2	6	586757	586762	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222479002
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16858	NC_012029	GTC	2	6	595364	595369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222479012
16859	NC_012029	GAC	2	6	595382	595387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222479012
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16875	NC_012029	GCTCGG	2	12	595978	595989	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	222479013
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16897	NC_012029	GCC	3	9	596809	596817	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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16976	NC_012029	GTG	2	6	600152	600157	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222479016
16977	NC_012029	CGT	2	6	600193	600198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222479016
16978	NC_012029	GAG	2	6	600207	600212	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222479016
16979	NC_012029	GTC	2	6	600236	600241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222479016
16980	NC_012029	AGCC	2	8	600267	600274	25 %	0 %	25 %	50 %	222479016
16981	NC_012029	CGC	2	6	600301	600306	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222479016
16982	NC_012029	CGG	2	6	600354	600359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222479016
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16984	NC_012029	GC	3	6	600480	600485	0 %	0 %	50 %	50 %	222479016
16985	NC_012029	GCC	2	6	600491	600496	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222479016
16986	NC_012029	GC	3	6	600522	600527	0 %	0 %	50 %	50 %	222479016
16987	NC_012029	GAG	2	6	600534	600539	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222479016
16988	NC_012029	CGA	2	6	600541	600546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222479016
16989	NC_012029	GAA	2	6	600563	600568	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222479016
16990	NC_012029	TCG	2	6	600597	600602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222479016
16991	NC_012029	TCCGGT	2	12	600617	600628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222479016
16992	NC_012029	AGGA	2	8	600639	600646	50 %	0 %	50 %	0 %	222479016
16993	NC_012029	GCC	2	6	600649	600654	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222479016
16994	NC_012029	CCG	2	6	600675	600680	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222479016
16995	NC_012029	CG	3	6	600739	600744	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16996	NC_012029	G	6	6	600764	600769	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
16997	NC_012029	ATCG	2	8	600770	600777	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
16998	NC_012029	CG	3	6	600791	600796	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16999	NC_012029	CCGC	2	8	600814	600821	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
17000	NC_012029	ACG	2	6	600966	600971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222479017

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