MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239 chromosome 1

Total Repeats: 76836

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15001	NC_012029	CG	4	8	532382	532389	0 %	0 %	50 %	50 %	222478946
15002	NC_012029	TCA	2	6	532390	532395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222478946
15003	NC_012029	CGGC	2	8	532414	532421	0 %	0 %	50 %	50 %	222478946
15004	NC_012029	TCG	2	6	532432	532437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478946
15005	NC_012029	CGG	2	6	532457	532462	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478946
15006	NC_012029	TCG	2	6	532513	532518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478946
15007	NC_012029	GCC	2	6	532530	532535	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478946
15008	NC_012029	ACCGCG	2	12	532537	532548	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	222478946
15009	NC_012029	CGT	2	6	532562	532567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478946
15010	NC_012029	CTC	2	6	532580	532585	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222478946
15011	NC_012029	CGG	2	6	532595	532600	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478946
15012	NC_012029	TTC	2	6	532656	532661	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222478946
15013	NC_012029	CGG	2	6	532688	532693	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478946
15014	NC_012029	TCA	2	6	532753	532758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222478946
15015	NC_012029	CGA	2	6	532844	532849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478946
15016	NC_012029	TCG	2	6	532894	532899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478946
15017	NC_012029	CAA	2	6	532901	532906	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222478946
15018	NC_012029	GC	3	6	532964	532969	0 %	0 %	50 %	50 %	222478946
15019	NC_012029	CGA	2	6	532975	532980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478946
15020	NC_012029	G	6	6	532992	532997	0 %	0 %	100 %	0 %	222478946
15021	NC_012029	GAC	2	6	533028	533033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478946
15022	NC_012029	GGGA	2	8	533035	533042	25 %	0 %	75 %	0 %	222478946
15023	NC_012029	GAC	2	6	533049	533054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478946
15024	NC_012029	G	8	8	533055	533062	0 %	0 %	100 %	0 %	222478946
15025	NC_012029	GAC	2	6	533064	533069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478946
15026	NC_012029	ATCGA	2	10	533187	533196	40 %	20 %	20 %	20 %	222478946
15027	NC_012029	GAG	2	6	533217	533222	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222478946
15028	NC_012029	GC	3	6	533251	533256	0 %	0 %	50 %	50 %	222478946
15029	NC_012029	CGG	2	6	533316	533321	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478946
15030	NC_012029	CGC	2	6	533342	533347	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478946
15031	NC_012029	TCG	2	6	533353	533358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478946
15032	NC_012029	GGA	2	6	533388	533393	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222478946
15033	NC_012029	GAC	2	6	533394	533399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478946
15034	NC_012029	CGCGA	2	10	533421	533430	20 %	0 %	40 %	40 %	222478946
15035	NC_012029	ACG	2	6	533447	533452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15036	NC_012029	CTC	2	6	533532	533537	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222478947
15037	NC_012029	CGC	2	6	533552	533557	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478947
15038	NC_012029	CGA	2	6	533609	533614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478947
15039	NC_012029	GGCG	2	8	533657	533664	0 %	0 %	75 %	25 %	222478947
15040	NC_012029	GAC	2	6	533670	533675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478947
15041	NC_012029	CTC	2	6	533688	533693	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222478947
15042	NC_012029	CGC	2	6	533705	533710	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478947
15043	NC_012029	CGA	2	6	533741	533746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478947
15044	NC_012029	CGA	2	6	533870	533875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478947
15045	NC_012029	CGT	2	6	533882	533887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478947
15046	NC_012029	TCG	2	6	533892	533897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478947
15047	NC_012029	CGG	2	6	533902	533907	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478947
15048	NC_012029	CGCGGC	2	12	533912	533923	0 %	0 %	50 %	50 %	222478947
15049	NC_012029	CGA	2	6	533927	533932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478947
15050	NC_012029	TCG	2	6	533971	533976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478947
15051	NC_012029	CGA	2	6	533986	533991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478947
15052	NC_012029	CCG	2	6	534009	534014	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478947
15053	NC_012029	TCG	2	6	534049	534054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478947
15054	NC_012029	ACG	2	6	534121	534126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478947
15055	NC_012029	CGA	2	6	534130	534135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478947
15056	NC_012029	CGA	2	6	534143	534148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478947
15057	NC_012029	CG	3	6	534188	534193	0 %	0 %	50 %	50 %	222478947
15058	NC_012029	CGT	2	6	534205	534210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478947
15059	NC_012029	CGACCT	2	12	534233	534244	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	222478947
15060	NC_012029	CGA	2	6	534277	534282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478947
15061	NC_012029	TCG	2	6	534358	534363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478947
15062	NC_012029	CTG	2	6	534381	534386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478947
15063	NC_012029	TCG	2	6	534412	534417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478947
15064	NC_012029	GAG	2	6	534426	534431	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222478947
15065	NC_012029	TCG	2	6	534436	534441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478947
15066	NC_012029	TCGG	2	8	534459	534466	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
15067	NC_012029	GGGA	2	8	534484	534491	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
15068	NC_012029	CCGG	2	8	534498	534505	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15069	NC_012029	TCT	2	6	534543	534548	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222478948
15070	NC_012029	CCGTC	2	10	534564	534573	0 %	20 %	20 %	60 %	222478948
15071	NC_012029	GTC	3	9	534571	534579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478948
15072	NC_012029	CGGT	2	8	534602	534609	0 %	25 %	50 %	25 %	222478948
15073	NC_012029	TC	3	6	534648	534653	0 %	50 %	0 %	50 %	222478948
15074	NC_012029	GTC	2	6	534739	534744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478948
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15079	NC_012029	CGC	2	6	535051	535056	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15080	NC_012029	CCGCC	2	10	535120	535129	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
15081	NC_012029	CGC	2	6	535138	535143	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15082	NC_012029	CG	4	8	535162	535169	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15083	NC_012029	GAC	2	6	535208	535213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478949
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15087	NC_012029	CCG	2	6	535264	535269	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478949
15088	NC_012029	GTCG	2	8	535270	535277	0 %	25 %	50 %	25 %	222478949
15089	NC_012029	GC	3	6	535282	535287	0 %	0 %	50 %	50 %	222478949
15090	NC_012029	CTC	2	6	535313	535318	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222478949
15091	NC_012029	GACGC	2	10	535325	535334	20 %	0 %	40 %	40 %	222478949
15092	NC_012029	GAC	2	6	535337	535342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478949
15093	NC_012029	CGGG	2	8	535368	535375	0 %	0 %	75 %	25 %	222478949
15094	NC_012029	CGA	2	6	535405	535410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478949
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15099	NC_012029	GAC	2	6	535574	535579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478949
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15102	NC_012029	CGG	2	6	535634	535639	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478949
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15104	NC_012029	CGC	2	6	535657	535662	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478949
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15106	NC_012029	CGA	3	9	535702	535710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478949
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15109	NC_012029	CGA	2	6	535792	535797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478949
15110	NC_012029	G	6	6	535802	535807	0 %	0 %	100 %	0 %	222478949
15111	NC_012029	CG	3	6	535824	535829	0 %	0 %	50 %	50 %	222478949
15112	NC_012029	CTC	2	6	535918	535923	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222478949
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15119	NC_012029	GCT	2	6	536140	536145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478949
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15239	NC_012029	CGT	2	6	539898	539903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478954
15240	NC_012029	CGG	2	6	539928	539933	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478954
15241	NC_012029	CGC	2	6	539940	539945	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478954
15242	NC_012029	GTG	2	6	539948	539953	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222478954
15243	NC_012029	CGC	2	6	539968	539973	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478954
15244	NC_012029	CGCTCG	2	12	540033	540044	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	222478954
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15250	NC_012029	TCGGC	2	10	540166	540175	0 %	20 %	40 %	40 %	222478954
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15253	NC_012029	GCT	2	6	540292	540297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478954
15254	NC_012029	CGA	2	6	540371	540376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478954
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15258	NC_012029	GAG	2	6	540611	540616	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222478954
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15260	NC_012029	CGG	2	6	540685	540690	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478954
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15262	NC_012029	CGT	2	6	540706	540711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478954
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15267	NC_012029	CGC	2	6	540792	540797	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478954
15268	NC_012029	GTC	2	6	540806	540811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478954
15269	NC_012029	CGA	2	6	540819	540824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478954
15270	NC_012029	GCT	2	6	540903	540908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478954
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15272	NC_012029	CCG	2	6	540990	540995	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478954
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15274	NC_012029	GCT	2	6	541027	541032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478954
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15284	NC_012029	CGGG	2	8	541489	541496	0 %	0 %	75 %	25 %	222478954
15285	NC_012029	CGT	2	6	541504	541509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478954
15286	NC_012029	CGC	2	6	541518	541523	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478954
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15288	NC_012029	CGA	2	6	541543	541548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478954
15289	NC_012029	GTC	2	6	541598	541603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478954
15290	NC_012029	GTC	2	6	541628	541633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478954
15291	NC_012029	CCG	2	6	541650	541655	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478954
15292	NC_012029	CGT	2	6	541663	541668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478954
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15296	NC_012029	CG	3	6	541714	541719	0 %	0 %	50 %	50 %	222478954
15297	NC_012029	ACC	2	6	541767	541772	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15298	NC_012029	CGG	2	6	541787	541792	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15299	NC_012029	CAA	2	6	541830	541835	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222478955
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15301	NC_012029	ATC	2	6	541895	541900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222478955
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15310	NC_012029	CGCGA	2	10	542237	542246	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
15311	NC_012029	CGAGG	2	10	542265	542274	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
15312	NC_012029	CGA	2	6	542305	542310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478956
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15322	NC_012029	CGT	2	6	542568	542573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478956
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15324	NC_012029	TCG	2	6	542669	542674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478956
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15327	NC_012029	TCG	3	9	542741	542749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478956
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15333	NC_012029	GCGG	2	8	543032	543039	0 %	0 %	75 %	25 %	222478956
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15339	NC_012029	GGTG	2	8	543160	543167	0 %	25 %	75 %	0 %	222478957
15340	NC_012029	TCG	2	6	543174	543179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478957
15341	NC_012029	TCG	2	6	543259	543264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478957
15342	NC_012029	CGCC	2	8	543306	543313	0 %	0 %	25 %	75 %	222478957
15343	NC_012029	GATC	2	8	543316	543323	25 %	25 %	25 %	25 %	222478957
15344	NC_012029	CGA	3	9	543352	543360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478957
15345	NC_012029	CG	3	6	543363	543368	0 %	0 %	50 %	50 %	222478957
15346	NC_012029	CGA	2	6	543376	543381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478957
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15350	NC_012029	CGT	3	9	543494	543502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478957
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15354	NC_012029	CCGAG	2	10	543645	543654	20 %	0 %	40 %	40 %	222478957
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15356	NC_012029	TCG	2	6	543676	543681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478957
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15358	NC_012029	CGG	2	6	543709	543714	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478957
15359	NC_012029	CGT	2	6	543719	543724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478957
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15373	NC_012029	CGAT	2	8	544291	544298	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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15434	NC_012029	GCG	2	6	546596	546601	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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15479	NC_012029	GAG	2	6	547797	547802	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222478962
15480	NC_012029	CGA	2	6	547850	547855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478962
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