MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239 chromosome 1

Total Repeats: 76836

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14501	NC_012029	GGCG	2	8	515982	515989	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
14502	NC_012029	CGCT	2	8	515992	515999	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
14503	NC_012029	GC	3	6	516000	516005	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14504	NC_012029	CCCG	2	8	516081	516088	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
14505	NC_012029	GCACC	2	10	516094	516103	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
14506	NC_012029	CGC	2	6	516121	516126	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14507	NC_012029	GCC	2	6	516128	516133	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14508	NC_012029	CGG	2	6	516136	516141	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14509	NC_012029	GC	3	6	516194	516199	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14510	NC_012029	GTCT	2	8	516225	516232	0 %	50 %	25 %	25 %	222478932
14511	NC_012029	CGT	2	6	516260	516265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478932
14512	NC_012029	GCGG	2	8	516267	516274	0 %	0 %	75 %	25 %	222478932
14513	NC_012029	GAG	2	6	516309	516314	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222478932
14514	NC_012029	TCG	2	6	516325	516330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478932
14515	NC_012029	CG	3	6	516345	516350	0 %	0 %	50 %	50 %	222478932
14516	NC_012029	AGGTC	2	10	516356	516365	20 %	20 %	40 %	20 %	222478932
14517	NC_012029	CGA	2	6	516431	516436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478932
14518	NC_012029	CGG	2	6	516449	516454	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478932
14519	NC_012029	CGT	3	9	516485	516493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478932
14520	NC_012029	CG	3	6	516535	516540	0 %	0 %	50 %	50 %	222478932
14521	NC_012029	CGA	2	6	516560	516565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478932
14522	NC_012029	AGCC	2	8	516581	516588	25 %	0 %	25 %	50 %	222478932
14523	NC_012029	CTC	2	6	516598	516603	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222478932
14524	NC_012029	TCG	2	6	516604	516609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478932
14525	NC_012029	TCG	2	6	516631	516636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478932
14526	NC_012029	TCG	3	9	516655	516663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478932
14527	NC_012029	CGT	2	6	516704	516709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478932
14528	NC_012029	CGA	2	6	516749	516754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478932
14529	NC_012029	TCG	2	6	516769	516774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478932
14530	NC_012029	CGT	2	6	516782	516787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478932
14531	NC_012029	CGGT	2	8	516790	516797	0 %	25 %	50 %	25 %	222478932
14532	NC_012029	CG	3	6	516806	516811	0 %	0 %	50 %	50 %	222478932
14533	NC_012029	GGT	2	6	516846	516851	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222478932
14534	NC_012029	CGA	2	6	516854	516859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478932
14535	NC_012029	TCT	2	6	516881	516886	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222478932
14536	NC_012029	CGG	2	6	516912	516917	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14537	NC_012029	CGG	2	6	516960	516965	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14538	NC_012029	CCG	2	6	516979	516984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14539	NC_012029	TCG	2	6	517071	517076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478933
14540	NC_012029	CGA	2	6	517078	517083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478933
14541	NC_012029	CGA	2	6	517089	517094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478933
14542	NC_012029	CG	3	6	517103	517108	0 %	0 %	50 %	50 %	222478933
14543	NC_012029	CGC	2	6	517117	517122	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478933
14544	NC_012029	TCG	2	6	517125	517130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478933
14545	NC_012029	G	6	6	517233	517238	0 %	0 %	100 %	0 %	222478933
14546	NC_012029	CGGC	2	8	517263	517270	0 %	0 %	50 %	50 %	222478933
14547	NC_012029	GC	3	6	517269	517274	0 %	0 %	50 %	50 %	222478933
14548	NC_012029	GGC	2	6	517295	517300	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478933
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14551	NC_012029	CGCT	2	8	517356	517363	0 %	25 %	25 %	50 %	222478933
14552	NC_012029	GTC	2	6	517382	517387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478933
14553	NC_012029	CGT	2	6	517462	517467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478933
14554	NC_012029	CTCG	2	8	517507	517514	0 %	25 %	25 %	50 %	222478933
14555	NC_012029	TCC	2	6	517551	517556	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222478933
14556	NC_012029	CGC	3	9	517576	517584	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478933
14557	NC_012029	GATCGA	2	12	517658	517669	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	222478934
14558	NC_012029	CGG	2	6	517688	517693	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478934
14559	NC_012029	GACGGC	2	12	517713	517724	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	222478934
14560	NC_012029	CCG	2	6	517747	517752	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478934
14561	NC_012029	TCG	2	6	517795	517800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478934
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14564	NC_012029	TCG	2	6	517909	517914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478934
14565	NC_012029	CG	3	6	517951	517956	0 %	0 %	50 %	50 %	222478934
14566	NC_012029	TGG	2	6	517963	517968	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222478934
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14568	NC_012029	CGC	2	6	518057	518062	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478934
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14571	NC_012029	GGC	2	6	518109	518114	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478934
14572	NC_012029	GAGCGC	2	12	518115	518126	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	222478934
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14575	NC_012029	CCGGC	2	10	518202	518211	0 %	0 %	40 %	60 %	222478934
14576	NC_012029	CG	3	6	518241	518246	0 %	0 %	50 %	50 %	222478934
14577	NC_012029	TCG	2	6	518263	518268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478934
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14580	NC_012029	CGA	2	6	518411	518416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478934
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14583	NC_012029	TCGC	2	8	518495	518502	0 %	25 %	25 %	50 %	222478935
14584	NC_012029	CTC	2	6	518528	518533	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222478935
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14587	NC_012029	CGC	2	6	518587	518592	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478935
14588	NC_012029	CGT	2	6	518608	518613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478935
14589	NC_012029	TCGCC	2	10	518620	518629	0 %	20 %	20 %	60 %	222478935
14590	NC_012029	GGC	2	6	518633	518638	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478935
14591	NC_012029	C	6	6	518688	518693	0 %	0 %	0 %	100 %	222478935
14592	NC_012029	TCG	2	6	518694	518699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478935
14593	NC_012029	CGC	2	6	518740	518745	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478935
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14595	NC_012029	TCG	3	9	518784	518792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478935
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14599	NC_012029	GC	3	6	518957	518962	0 %	0 %	50 %	50 %	222478935
14600	NC_012029	TCG	2	6	519000	519005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478935
14601	NC_012029	CGGG	2	8	519031	519038	0 %	0 %	75 %	25 %	222478935
14602	NC_012029	CGG	2	6	519139	519144	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478935
14603	NC_012029	G	6	6	519143	519148	0 %	0 %	100 %	0 %	222478935
14604	NC_012029	TGG	3	9	519150	519158	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222478935
14605	NC_012029	GTG	2	6	519173	519178	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222478935
14606	NC_012029	GCA	2	6	519190	519195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14607	NC_012029	GCG	3	9	519216	519224	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14608	NC_012029	GGC	2	6	519317	519322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478936
14609	NC_012029	CG	3	6	519457	519462	0 %	0 %	50 %	50 %	222478936
14610	NC_012029	CCCG	2	8	519480	519487	0 %	0 %	25 %	75 %	222478936
14611	NC_012029	CGA	2	6	519499	519504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478936
14612	NC_012029	TCG	2	6	519595	519600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478936
14613	NC_012029	CGA	2	6	519601	519606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478936
14614	NC_012029	CCGC	2	8	519635	519642	0 %	0 %	25 %	75 %	222478936
14615	NC_012029	TGGG	2	8	519660	519667	0 %	25 %	75 %	0 %	222478936
14616	NC_012029	CTG	2	6	519711	519716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478936
14617	NC_012029	TCG	3	9	519718	519726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478936
14618	NC_012029	CGC	2	6	519747	519752	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478936
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14620	NC_012029	AC	3	6	519785	519790	50 %	0 %	0 %	50 %	222478936
14621	NC_012029	CTCG	2	8	519791	519798	0 %	25 %	25 %	50 %	222478936
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14680	NC_012029	TA	3	6	521744	521749	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14681	NC_012029	GTCG	2	8	521770	521777	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
14682	NC_012029	TCATA	2	10	521784	521793	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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14846	NC_012029	GTC	2	6	526933	526938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478941
14847	NC_012029	CGA	2	6	527022	527027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478941
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14849	NC_012029	GCG	2	6	527143	527148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14850	NC_012029	CGA	2	6	527172	527177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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14852	NC_012029	GAC	2	6	527229	527234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478942
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14976	NC_012029	GTC	2	6	531628	531633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478944
14977	NC_012029	TCG	2	6	531634	531639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478944
14978	NC_012029	GCGCG	2	10	531656	531665	0 %	0 %	60 %	40 %	222478944
14979	NC_012029	CGG	2	6	531680	531685	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478944
14980	NC_012029	GTCG	2	8	531689	531696	0 %	25 %	50 %	25 %	222478944
14981	NC_012029	ACC	2	6	531736	531741	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14982	NC_012029	GTCG	2	8	531759	531766	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
14983	NC_012029	CGCT	2	8	531782	531789	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
14984	NC_012029	CT	3	6	531788	531793	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14985	NC_012029	CCCG	2	8	531795	531802	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
14986	NC_012029	CG	3	6	531965	531970	0 %	0 %	50 %	50 %	222478945
14987	NC_012029	CG	3	6	532017	532022	0 %	0 %	50 %	50 %	222478945
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14992	NC_012029	A	6	6	532131	532136	100 %	0 %	0 %	0 %	222478945
14993	NC_012029	ACG	2	6	532138	532143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478945
14994	NC_012029	ATC	2	6	532176	532181	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222478945
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14997	NC_012029	GAGC	2	8	532287	532294	25 %	0 %	50 %	25 %	222478945
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