MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239 chromosome 1

Total Repeats: 76836

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13501	NC_012029	TCG	2	6	480501	480506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13502	NC_012029	TTCG	2	8	480512	480519	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
13503	NC_012029	CTC	2	6	480537	480542	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13504	NC_012029	CCCG	2	8	480611	480618	0 %	0 %	25 %	75 %	222478898
13505	NC_012029	CGA	2	6	480625	480630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478898
13506	NC_012029	GCG	2	6	480690	480695	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478898
13507	NC_012029	CGG	2	6	480700	480705	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478898
13508	NC_012029	CGA	2	6	480763	480768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478898
13509	NC_012029	CGT	2	6	480790	480795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478898
13510	NC_012029	GAC	2	6	480872	480877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478898
13511	NC_012029	CCG	2	6	480962	480967	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478898
13512	NC_012029	GGC	2	6	481010	481015	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478898
13513	NC_012029	CGCGG	2	10	481088	481097	0 %	0 %	60 %	40 %	222478898
13514	NC_012029	CGT	3	9	481106	481114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478898
13515	NC_012029	GCC	2	6	481170	481175	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478898
13516	NC_012029	CGT	2	6	481211	481216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478898
13517	NC_012029	CG	3	6	481229	481234	0 %	0 %	50 %	50 %	222478898
13518	NC_012029	CG	3	6	481255	481260	0 %	0 %	50 %	50 %	222478898
13519	NC_012029	CCG	2	6	481266	481271	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478898
13520	NC_012029	GTA	2	6	481280	481285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222478898
13521	NC_012029	GAT	2	6	481358	481363	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222478898
13522	NC_012029	GCG	2	6	481375	481380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478898
13523	NC_012029	CG	3	6	481422	481427	0 %	0 %	50 %	50 %	222478898
13524	NC_012029	CGC	2	6	481453	481458	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478898
13525	NC_012029	GGT	2	6	481481	481486	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222478898
13526	NC_012029	CGC	2	6	481498	481503	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478898
13527	NC_012029	GCG	3	9	481504	481512	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478898
13528	NC_012029	ACC	2	6	481560	481565	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13529	NC_012029	CGC	2	6	481597	481602	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13530	NC_012029	CGG	3	9	481678	481686	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13531	NC_012029	CACCG	2	10	481714	481723	20 %	0 %	20 %	60 %	222478899
13532	NC_012029	AGC	2	6	481753	481758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478899
13533	NC_012029	CGG	3	9	481784	481792	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478899
13534	NC_012029	GAC	2	6	481809	481814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478899
13535	NC_012029	GCCC	2	8	481826	481833	0 %	0 %	25 %	75 %	222478899
13536	NC_012029	GTC	2	6	481843	481848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478899
13537	NC_012029	CGCGAG	2	12	481935	481946	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	222478899
13538	NC_012029	GAG	2	6	482070	482075	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222478899
13539	NC_012029	CGA	2	6	482093	482098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478899
13540	NC_012029	CCG	2	6	482104	482109	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478899
13541	NC_012029	GCG	2	6	482116	482121	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478899
13542	NC_012029	CGA	2	6	482153	482158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478899
13543	NC_012029	CGA	2	6	482165	482170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478899
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13545	NC_012029	GTC	2	6	482205	482210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478899
13546	NC_012029	CGT	2	6	482231	482236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478899
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13548	NC_012029	CG	3	6	482283	482288	0 %	0 %	50 %	50 %	222478900
13549	NC_012029	CCCCG	2	10	482333	482342	0 %	0 %	20 %	80 %	222478900
13550	NC_012029	CGG	2	6	482404	482409	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478900
13551	NC_012029	GC	3	6	482459	482464	0 %	0 %	50 %	50 %	222478900
13552	NC_012029	CGC	2	6	482471	482476	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478900
13553	NC_012029	GAG	2	6	482486	482491	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222478900
13554	NC_012029	GCC	2	6	482527	482532	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478900
13555	NC_012029	CCG	2	6	482540	482545	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478900
13556	NC_012029	C	7	7	482567	482573	0 %	0 %	0 %	100 %	222478900
13557	NC_012029	GTCG	2	8	482600	482607	0 %	25 %	50 %	25 %	222478900
13558	NC_012029	GCG	2	6	482628	482633	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478900
13559	NC_012029	CAG	2	6	482661	482666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478900
13560	NC_012029	CG	3	6	482668	482673	0 %	0 %	50 %	50 %	222478900
13561	NC_012029	CCG	2	6	482703	482708	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478900
13562	NC_012029	AGC	2	6	482712	482717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478900
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13564	NC_012029	CGG	2	6	482758	482763	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478900
13565	NC_012029	GCTC	2	8	482776	482783	0 %	25 %	25 %	50 %	222478900
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13569	NC_012029	CGCC	2	8	482876	482883	0 %	0 %	25 %	75 %	222478900
13570	NC_012029	CGC	2	6	482911	482916	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478900
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13587	NC_012029	TCG	2	6	483567	483572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478900
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13591	NC_012029	TCG	2	6	483629	483634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478901
13592	NC_012029	GCC	2	6	483636	483641	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478901
13593	NC_012029	CGCGG	2	10	483655	483664	0 %	0 %	60 %	40 %	222478901
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13597	NC_012029	GGTCG	2	10	483757	483766	0 %	20 %	60 %	20 %	222478901
13598	NC_012029	GCTC	2	8	483791	483798	0 %	25 %	25 %	50 %	222478901
13599	NC_012029	GCC	2	6	483800	483805	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478901
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13601	NC_012029	CTCG	2	8	483858	483865	0 %	25 %	25 %	50 %	222478901
13602	NC_012029	CGG	2	6	483875	483880	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478901
13603	NC_012029	CGG	2	6	483903	483908	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478901
13604	NC_012029	TCG	2	6	483926	483931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478901
13605	NC_012029	CGG	2	6	483984	483989	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478901
13606	NC_012029	CGCGGC	2	12	483999	484010	0 %	0 %	50 %	50 %	222478901
13607	NC_012029	ACG	2	6	484037	484042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478901
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13609	NC_012029	GAC	3	9	484063	484071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478901
13610	NC_012029	CGA	2	6	484116	484121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478901
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13617	NC_012029	CGC	2	6	484289	484294	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478902
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13979	NC_012029	CGC	2	6	497634	497639	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478914
13980	NC_012029	TCG	2	6	497662	497667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478914
13981	NC_012029	GCTCGC	2	12	497672	497683	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	222478914
13982	NC_012029	CGG	2	6	497733	497738	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478914
13983	NC_012029	TCGC	2	8	497739	497746	0 %	25 %	25 %	50 %	222478914
13984	NC_012029	CGT	2	6	497840	497845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478914
13985	NC_012029	CGG	2	6	497889	497894	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478914
13986	NC_012029	TTC	2	6	497895	497900	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222478914
13987	NC_012029	CGC	2	6	497924	497929	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478914
13988	NC_012029	CGT	2	6	497936	497941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478914
13989	NC_012029	CG	3	6	498081	498086	0 %	0 %	50 %	50 %	222478914
13990	NC_012029	TCT	2	6	498097	498102	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222478914
13991	NC_012029	TCG	2	6	498109	498114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478914
13992	NC_012029	CGA	2	6	498158	498163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478914
13993	NC_012029	CTG	2	6	498213	498218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478914
13994	NC_012029	GCG	2	6	498273	498278	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478914
13995	NC_012029	GTC	2	6	498327	498332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478914
13996	NC_012029	GTA	2	6	498381	498386	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222478914
13997	NC_012029	GAG	2	6	498462	498467	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222478914
13998	NC_012029	CGC	2	6	498490	498495	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13999	NC_012029	GAC	2	6	498579	498584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14000	NC_012029	CGA	2	6	498589	498594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

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