MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239 chromosome 1

Total Repeats: 76836

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_012029	CG	3	6	464073	464078	0 %	0 %	50 %	50 %	222478882
13002	NC_012029	CGG	2	6	464107	464112	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478882
13003	NC_012029	CG	3	6	464138	464143	0 %	0 %	50 %	50 %	222478882
13004	NC_012029	CGA	2	6	464152	464157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478882
13005	NC_012029	CGA	2	6	464164	464169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478882
13006	NC_012029	CTA	2	6	464194	464199	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222478882
13007	NC_012029	CGG	2	6	464212	464217	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478882
13008	NC_012029	CAG	2	6	464222	464227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478882
13009	NC_012029	TGG	2	6	464277	464282	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222478882
13010	NC_012029	CGCT	2	8	464306	464313	0 %	25 %	25 %	50 %	222478882
13011	NC_012029	ACG	3	9	464334	464342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478882
13012	NC_012029	CGA	2	6	464358	464363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478882
13013	NC_012029	CGA	2	6	464365	464370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478882
13014	NC_012029	GAG	2	6	464387	464392	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222478882
13015	NC_012029	GCC	2	6	464411	464416	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478882
13016	NC_012029	ACT	2	6	464424	464429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222478882
13017	NC_012029	GC	3	6	464434	464439	0 %	0 %	50 %	50 %	222478882
13018	NC_012029	CAGCG	2	10	464489	464498	20 %	0 %	40 %	40 %	222478882
13019	NC_012029	GAC	3	9	464516	464524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478882
13020	NC_012029	GAG	2	6	464528	464533	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222478882
13021	NC_012029	TCGCGA	2	12	464559	464570	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	222478882
13022	NC_012029	ACC	2	6	464660	464665	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222478882
13023	NC_012029	GGC	2	6	464671	464676	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478882
13024	NC_012029	CCG	2	6	464688	464693	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478882
13025	NC_012029	GC	4	8	464771	464778	0 %	0 %	50 %	50 %	222478882
13026	NC_012029	GGA	2	6	464788	464793	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222478882
13027	NC_012029	CGA	2	6	464797	464802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478882
13028	NC_012029	GAG	2	6	464810	464815	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222478882
13029	NC_012029	GCG	2	6	464817	464822	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478882
13030	NC_012029	ACG	2	6	464823	464828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478882
13031	NC_012029	GAC	2	6	464837	464842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478882
13032	NC_012029	CGA	2	6	464848	464853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478882
13033	NC_012029	GAC	3	9	464858	464866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478882
13034	NC_012029	CGA	2	6	464908	464913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478882
13035	NC_012029	CGA	2	6	464926	464931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478882
13036	NC_012029	GAG	2	6	464966	464971	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222478882
13037	NC_012029	CGA	2	6	464992	464997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478882
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13039	NC_012029	TCG	2	6	465042	465047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478882
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13041	NC_012029	ACG	2	6	465066	465071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478882
13042	NC_012029	GAC	2	6	465074	465079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478882
13043	NC_012029	GTC	2	6	465095	465100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478882
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13046	NC_012029	GAG	2	6	465170	465175	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222478882
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13049	NC_012029	GCCGG	2	10	465203	465212	0 %	0 %	60 %	40 %	222478882
13050	NC_012029	GCG	2	6	465281	465286	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478883
13051	NC_012029	CGT	2	6	465334	465339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478883
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13053	NC_012029	CGC	2	6	465490	465495	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478883
13054	NC_012029	CGA	2	6	465522	465527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478883
13055	NC_012029	TCGG	2	8	465668	465675	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
13056	NC_012029	TC	3	6	465687	465692	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13057	NC_012029	CG	3	6	465697	465702	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13058	NC_012029	TCG	2	6	465776	465781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478884
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13061	NC_012029	CGT	2	6	465854	465859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478884
13062	NC_012029	GCCGG	2	10	465885	465894	0 %	0 %	60 %	40 %	222478884
13063	NC_012029	CGA	2	6	465938	465943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478884
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13069	NC_012029	GA	3	6	466191	466196	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13070	NC_012029	GTA	2	6	466254	466259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13071	NC_012029	GTA	2	6	466308	466313	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13072	NC_012029	CGA	2	6	466320	466325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13081	NC_012029	TCG	2	6	466661	466666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13084	NC_012029	GGC	2	6	466765	466770	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13085	NC_012029	GCC	2	6	466775	466780	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13086	NC_012029	CG	3	6	466792	466797	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13087	NC_012029	CGG	2	6	466822	466827	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13088	NC_012029	CGC	3	9	466832	466840	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13089	NC_012029	GTC	2	6	466856	466861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13093	NC_012029	CGC	2	6	467036	467041	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478885
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13100	NC_012029	GC	3	6	467372	467377	0 %	0 %	50 %	50 %	222478885
13101	NC_012029	CGG	2	6	467379	467384	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478885
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13105	NC_012029	CT	3	6	467446	467451	0 %	50 %	0 %	50 %	222478885
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13107	NC_012029	TCGCGC	2	12	467501	467512	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	222478885
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13109	NC_012029	GTT	2	6	467616	467621	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222478885
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13112	NC_012029	TCC	2	6	467696	467701	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222478885
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13114	NC_012029	CGACCG	2	12	467732	467743	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	222478885
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13116	NC_012029	CCGA	2	8	467807	467814	25 %	0 %	25 %	50 %	222478885
13117	NC_012029	TGC	2	6	467838	467843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478885
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13120	NC_012029	TCG	2	6	467867	467872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478885
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13122	NC_012029	TCG	3	9	467930	467938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478885
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13476	NC_012029	TAC	2	6	479691	479696	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222478896
13477	NC_012029	CGGAA	2	10	479735	479744	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
13478	NC_012029	GCG	3	9	479798	479806	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478897
13479	NC_012029	GCC	2	6	479808	479813	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478897
13480	NC_012029	GGT	2	6	479820	479825	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222478897
13481	NC_012029	GAC	4	12	479867	479878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478897
13482	NC_012029	CGA	2	6	479882	479887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478897
13483	NC_012029	TCGCGT	2	12	479899	479910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478897
13484	NC_012029	GAC	2	6	479922	479927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478897
13485	NC_012029	AC	3	6	479951	479956	50 %	0 %	0 %	50 %	222478897
13486	NC_012029	GAC	2	6	480057	480062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478897
13487	NC_012029	GACC	2	8	480070	480077	25 %	0 %	25 %	50 %	222478897
13488	NC_012029	TCGGT	2	10	480112	480121	0 %	40 %	40 %	20 %	222478897
13489	NC_012029	GCA	2	6	480143	480148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478897
13490	NC_012029	GAC	2	6	480150	480155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478897
13491	NC_012029	CGA	3	9	480185	480193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478897
13492	NC_012029	CGG	2	6	480262	480267	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13493	NC_012029	CGCT	2	8	480298	480305	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
13494	NC_012029	CGC	2	6	480352	480357	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13495	NC_012029	GAC	2	6	480358	480363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13496	NC_012029	TGC	2	6	480374	480379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13497	NC_012029	GC	3	6	480378	480383	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13498	NC_012029	TGCT	2	8	480416	480423	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
13499	NC_012029	TCG	3	9	480434	480442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13500	NC_012029	ACCGCA	2	12	480470	480481	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding

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