MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239 chromosome 1

Total Repeats: 76836

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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12002	NC_012029	GGC	2	6	428019	428024	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478846
12003	NC_012029	GCG	2	6	428050	428055	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478846
12004	NC_012029	GAC	2	6	428109	428114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478846
12005	NC_012029	GCG	2	6	428127	428132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478846
12006	NC_012029	GCG	2	6	428188	428193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478846
12007	NC_012029	CGGGAG	2	12	428235	428246	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	222478846
12008	NC_012029	CGG	2	6	428261	428266	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478846
12009	NC_012029	CGA	3	9	428288	428296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478846
12010	NC_012029	CGC	2	6	428363	428368	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478846
12011	NC_012029	CGG	2	6	428369	428374	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478846
12012	NC_012029	CTCA	2	8	428388	428395	25 %	25 %	0 %	50 %	222478846
12013	NC_012029	TCG	2	6	428396	428401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478846
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12015	NC_012029	GTC	2	6	428413	428418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478847
12016	NC_012029	CGGT	2	8	428420	428427	0 %	25 %	50 %	25 %	222478847
12017	NC_012029	CGG	2	6	428433	428438	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478847
12018	NC_012029	GCC	2	6	428447	428452	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478847
12019	NC_012029	TCG	2	6	428453	428458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478847
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12021	NC_012029	GC	3	6	428473	428478	0 %	0 %	50 %	50 %	222478847
12022	NC_012029	TCG	2	6	428486	428491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478847
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12024	NC_012029	CGT	2	6	428553	428558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478847
12025	NC_012029	GTC	2	6	428578	428583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478847
12026	NC_012029	CGGG	2	8	428765	428772	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
12027	NC_012029	GCA	2	6	428807	428812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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12029	NC_012029	CGG	2	6	428936	428941	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12030	NC_012029	GC	3	6	428983	428988	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12031	NC_012029	GTT	2	6	429140	429145	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12032	NC_012029	AC	3	6	429154	429159	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12033	NC_012029	TGA	3	9	429267	429275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12034	NC_012029	GGC	2	6	429280	429285	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12035	NC_012029	GCT	2	6	429322	429327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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12037	NC_012029	AAT	2	6	429366	429371	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222478848
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12045	NC_012029	GGC	2	6	429605	429610	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478848
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12106	NC_012029	CGAG	2	8	432094	432101	25 %	0 %	50 %	25 %	222478848
12107	NC_012029	GCGT	2	8	432103	432110	0 %	25 %	50 %	25 %	222478848
12108	NC_012029	TCGG	2	8	432159	432166	0 %	25 %	50 %	25 %	222478848
12109	NC_012029	CGTC	2	8	432214	432221	0 %	25 %	25 %	50 %	222478848
12110	NC_012029	ACGGT	2	10	432223	432232	20 %	20 %	40 %	20 %	222478848
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12118	NC_012029	GAC	2	6	432378	432383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478848
12119	NC_012029	CGA	2	6	432389	432394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478848
12120	NC_012029	GAC	2	6	432399	432404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478848
12121	NC_012029	CGA	2	6	432410	432415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478848
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12123	NC_012029	GAC	2	6	432441	432446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478848
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12126	NC_012029	TCG	2	6	432496	432501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478848
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12130	NC_012029	ACG	2	6	432665	432670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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12137	NC_012029	CGC	2	6	432931	432936	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12138	NC_012029	CGC	2	6	432949	432954	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12139	NC_012029	GACGA	2	10	432962	432971	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
12140	NC_012029	ACA	2	6	433011	433016	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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12159	NC_012029	CCGA	2	8	433622	433629	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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12162	NC_012029	CGCT	2	8	433837	433844	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
12163	NC_012029	CCCAC	2	10	433926	433935	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
12164	NC_012029	TCG	2	6	433975	433980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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12231	NC_012029	AGGTC	2	10	436738	436747	20 %	20 %	40 %	20 %	222478852
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12233	NC_012029	CGG	2	6	436761	436766	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478852
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12235	NC_012029	GTC	2	6	436808	436813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478852
12236	NC_012029	AGA	2	6	436828	436833	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222478852
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12478	NC_012029	GCGG	2	8	445869	445876	0 %	0 %	75 %	25 %	222478863
12479	NC_012029	TTC	2	6	445915	445920	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222478863
12480	NC_012029	GTA	2	6	446082	446087	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222478863
12481	NC_012029	TCG	2	6	446184	446189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12482	NC_012029	GTC	2	6	446279	446284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12483	NC_012029	GTC	2	6	446295	446300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12484	NC_012029	GCCG	2	8	446314	446321	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12485	NC_012029	AGTC	2	8	446322	446329	25 %	25 %	25 %	25 %	222478864
12486	NC_012029	CGG	2	6	446338	446343	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478864
12487	NC_012029	TCG	2	6	446352	446357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478864
12488	NC_012029	CGT	2	6	446362	446367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478864
12489	NC_012029	GCCT	2	8	446381	446388	0 %	25 %	25 %	50 %	222478864
12490	NC_012029	TCG	2	6	446422	446427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478864
12491	NC_012029	CGC	2	6	446438	446443	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478864
12492	NC_012029	TCG	2	6	446445	446450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478864
12493	NC_012029	TCG	2	6	446463	446468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478864
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12497	NC_012029	TCGCC	2	10	446572	446581	0 %	20 %	20 %	60 %	222478864
12498	NC_012029	CGC	2	6	446626	446631	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478864
12499	NC_012029	CG	3	6	446642	446647	0 %	0 %	50 %	50 %	222478864
12500	NC_012029	GTC	2	6	446654	446659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478864

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