MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239 chromosome 1

Total Repeats: 76836

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_012029	GCG	2	6	410809	410814	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478826
11502	NC_012029	GAGG	2	8	410815	410822	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
11503	NC_012029	GCGCC	2	10	410832	410841	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
11504	NC_012029	CTC	2	6	410846	410851	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222478827
11505	NC_012029	CG	3	6	410859	410864	0 %	0 %	50 %	50 %	222478827
11506	NC_012029	CGT	2	6	410867	410872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478827
11507	NC_012029	CG	4	8	410876	410883	0 %	0 %	50 %	50 %	222478827
11508	NC_012029	GCTC	2	8	410894	410901	0 %	25 %	25 %	50 %	222478827
11509	NC_012029	GATGT	2	10	410906	410915	20 %	40 %	40 %	0 %	222478827
11510	NC_012029	GCCG	2	8	410930	410937	0 %	0 %	50 %	50 %	222478827
11511	NC_012029	CCTCGT	2	12	410956	410967	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	222478827
11512	NC_012029	AGA	2	6	410971	410976	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222478827
11513	NC_012029	GGA	2	6	411001	411006	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222478827
11514	NC_012029	CGA	3	9	411031	411039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478827
11515	NC_012029	CGG	2	6	411066	411071	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478827
11516	NC_012029	TCGA	2	8	411108	411115	25 %	25 %	25 %	25 %	222478827
11517	NC_012029	GTC	2	6	411143	411148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478827
11518	NC_012029	TGG	2	6	411231	411236	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222478827
11519	NC_012029	CGT	2	6	411259	411264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478827
11520	NC_012029	GGCG	2	8	411433	411440	0 %	0 %	75 %	25 %	222478827
11521	NC_012029	TTGG	2	8	411474	411481	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11522	NC_012029	CGCC	2	8	411484	411491	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
11523	NC_012029	CGG	2	6	411526	411531	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11524	NC_012029	CGC	2	6	411618	411623	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11525	NC_012029	CGA	3	9	411644	411652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478828
11526	NC_012029	CCG	2	6	411675	411680	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478828
11527	NC_012029	TCC	2	6	411717	411722	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222478828
11528	NC_012029	GAG	2	6	411724	411729	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222478828
11529	NC_012029	TCG	2	6	411737	411742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478828
11530	NC_012029	CGACC	2	10	411762	411771	20 %	0 %	20 %	60 %	222478828
11531	NC_012029	CGC	3	9	411807	411815	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478828
11532	NC_012029	TCG	3	9	411869	411877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478828
11533	NC_012029	GTC	2	6	411928	411933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478828
11534	NC_012029	GAC	2	6	411958	411963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478828
11535	NC_012029	GGC	2	6	411981	411986	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478828
11536	NC_012029	ACG	2	6	412052	412057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478828
11537	NC_012029	GGTCG	2	10	412124	412133	0 %	20 %	60 %	20 %	222478828
11538	NC_012029	TCG	2	6	412151	412156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478828
11539	NC_012029	GAC	2	6	412180	412185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478828
11540	NC_012029	TCC	2	6	412205	412210	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222478828
11541	NC_012029	CGC	2	6	412215	412220	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478828
11542	NC_012029	TCG	2	6	412229	412234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478828
11543	NC_012029	GTC	2	6	412243	412248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478828
11544	NC_012029	CGC	2	6	412311	412316	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478828
11545	NC_012029	CGG	2	6	412326	412331	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478828
11546	NC_012029	GA	4	8	412384	412391	50 %	0 %	50 %	0 %	222478828
11547	NC_012029	GTC	2	6	412431	412436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478828
11548	NC_012029	GC	3	6	412437	412442	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11549	NC_012029	GCC	2	6	412447	412452	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11550	NC_012029	GC	3	6	412453	412458	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11551	NC_012029	CGG	2	6	412523	412528	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478829
11552	NC_012029	GTC	2	6	412557	412562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478829
11553	NC_012029	GCC	2	6	412567	412572	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478829
11554	NC_012029	CGC	2	6	412584	412589	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478829
11555	NC_012029	GCG	2	6	412592	412597	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478829
11556	NC_012029	GTC	2	6	412608	412613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478829
11557	NC_012029	CGA	2	6	412619	412624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478829
11558	NC_012029	TCC	2	6	412645	412650	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222478829
11559	NC_012029	AGC	2	6	412702	412707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478829
11560	NC_012029	CGA	2	6	412718	412723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478829
11561	NC_012029	GAC	2	6	412743	412748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478829
11562	NC_012029	TCG	2	6	412759	412764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478829
11563	NC_012029	CGAG	2	8	412768	412775	25 %	0 %	50 %	25 %	222478829
11564	NC_012029	CGTC	2	8	412805	412812	0 %	25 %	25 %	50 %	222478829
11565	NC_012029	TCG	2	6	412855	412860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478829
11566	NC_012029	TCG	2	6	412894	412899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478829
11567	NC_012029	CGA	2	6	412904	412909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478829
11568	NC_012029	CGA	2	6	412922	412927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478829
11569	NC_012029	CG	3	6	412959	412964	0 %	0 %	50 %	50 %	222478829
11570	NC_012029	CGG	2	6	413014	413019	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478829
11571	NC_012029	GTC	2	6	413024	413029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478829
11572	NC_012029	CGT	2	6	413048	413053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478829
11573	NC_012029	CGA	2	6	413054	413059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478829
11574	NC_012029	TCG	2	6	413065	413070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478829
11575	NC_012029	GCAG	2	8	413087	413094	25 %	0 %	50 %	25 %	222478829
11576	NC_012029	AGC	2	6	413101	413106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478829
11577	NC_012029	TCG	2	6	413128	413133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478829
11578	NC_012029	AGT	2	6	413138	413143	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222478829
11579	NC_012029	GTGACG	2	12	413155	413166	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	222478829
11580	NC_012029	CGG	3	9	413174	413182	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478829
11581	NC_012029	GAC	2	6	413220	413225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478829
11582	NC_012029	GCCG	2	8	413240	413247	0 %	0 %	50 %	50 %	222478829
11583	NC_012029	TCG	2	6	413254	413259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478829
11584	NC_012029	GCC	2	6	413305	413310	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478829
11585	NC_012029	TCG	2	6	413374	413379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478829
11586	NC_012029	GATC	2	8	413402	413409	25 %	25 %	25 %	25 %	222478829
11587	NC_012029	TC	3	6	413454	413459	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11588	NC_012029	ATC	2	6	413521	413526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11589	NC_012029	GATTTT	2	12	413535	413546	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11590	NC_012029	GC	5	10	413559	413568	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11591	NC_012029	CGA	2	6	413588	413593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11592	NC_012029	CAG	2	6	413599	413604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11593	NC_012029	CCG	2	6	413619	413624	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11594	NC_012029	TCG	3	9	413677	413685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478830
11595	NC_012029	GC	3	6	413686	413691	0 %	0 %	50 %	50 %	222478830
11596	NC_012029	TCC	2	6	413701	413706	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222478830
11597	NC_012029	GCTG	2	8	413807	413814	0 %	25 %	50 %	25 %	222478830
11598	NC_012029	GCT	2	6	413825	413830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478830
11599	NC_012029	CGT	2	6	413849	413854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478830
11600	NC_012029	CGG	2	6	413884	413889	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478830
11601	NC_012029	GAG	2	6	413898	413903	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222478830
11602	NC_012029	CGG	2	6	413918	413923	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11603	NC_012029	CGG	2	6	413929	413934	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478831
11604	NC_012029	AGG	2	6	413938	413943	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222478831
11605	NC_012029	TCG	2	6	413952	413957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478831
11606	NC_012029	TCG	2	6	414027	414032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478831
11607	NC_012029	ACG	2	6	414033	414038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478831
11608	NC_012029	CGG	2	6	414164	414169	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478831
11609	NC_012029	GTC	2	6	414173	414178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478831
11610	NC_012029	TTCC	2	8	414196	414203	0 %	50 %	0 %	50 %	222478831
11611	NC_012029	TTG	2	6	414289	414294	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11612	NC_012029	CAGT	2	8	414350	414357	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11613	NC_012029	CG	4	8	414371	414378	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11614	NC_012029	CGG	2	6	414459	414464	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11615	NC_012029	GCC	2	6	414478	414483	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11616	NC_012029	CGG	2	6	414484	414489	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11617	NC_012029	AACG	2	8	414490	414497	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
11618	NC_012029	CGA	2	6	414534	414539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478832
11619	NC_012029	GTC	2	6	414571	414576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478832
11620	NC_012029	ACG	2	6	414577	414582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478832
11621	NC_012029	CGC	2	6	414603	414608	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478832
11622	NC_012029	CGC	2	6	414651	414656	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478832
11623	NC_012029	GTGCTG	2	12	414670	414681	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	222478832
11624	NC_012029	GAT	2	6	414717	414722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222478832
11625	NC_012029	TCA	2	6	414788	414793	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222478832
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11627	NC_012029	GAC	2	6	414845	414850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478833
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11629	NC_012029	TCGA	2	8	414870	414877	25 %	25 %	25 %	25 %	222478833
11630	NC_012029	ACT	2	6	414912	414917	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222478833
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11640	NC_012029	CGA	2	6	415429	415434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478833
11641	NC_012029	GCGCG	2	10	415435	415444	0 %	0 %	60 %	40 %	222478833
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11656	NC_012029	CGA	2	6	416317	416322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478833
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11860	NC_012029	GAC	2	6	423355	423360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478841
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11980	NC_012029	GA	3	6	427293	427298	50 %	0 %	50 %	0 %	222478845
11981	NC_012029	G	6	6	427304	427309	0 %	0 %	100 %	0 %	222478845
11982	NC_012029	GAG	2	6	427328	427333	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222478845
11983	NC_012029	CGA	2	6	427401	427406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478845
11984	NC_012029	GCGG	3	12	427454	427465	0 %	0 %	75 %	25 %	222478845
11985	NC_012029	CG	3	6	427563	427568	0 %	0 %	50 %	50 %	222478845
11986	NC_012029	GAA	2	6	427593	427598	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11987	NC_012029	GAA	2	6	427602	427607	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11988	NC_012029	ACGAAA	2	12	427609	427620	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
11989	NC_012029	CGG	2	6	427627	427632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11990	NC_012029	GAAC	2	8	427642	427649	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
11991	NC_012029	ACT	2	6	427670	427675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222478846
11992	NC_012029	CGA	3	9	427688	427696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478846
11993	NC_012029	GAG	2	6	427737	427742	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222478846
11994	NC_012029	GGCCGA	2	12	427748	427759	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	222478846
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11997	NC_012029	CGA	2	6	427832	427837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478846
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11999	NC_012029	GAC	2	6	427932	427937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478846
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