MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239 chromosome 1

Total Repeats: 76836

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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11002	NC_012029	GCG	2	6	392916	392921	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478806
11003	NC_012029	TCG	2	6	392948	392953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478806
11004	NC_012029	CTTCG	2	10	392971	392980	0 %	40 %	20 %	40 %	222478806
11005	NC_012029	TCTG	2	8	392991	392998	0 %	50 %	25 %	25 %	222478806
11006	NC_012029	GTC	2	6	393052	393057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478806
11007	NC_012029	TCG	2	6	393140	393145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478806
11008	NC_012029	CGG	2	6	393155	393160	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478806
11009	NC_012029	GTC	2	6	393176	393181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478806
11010	NC_012029	CCCG	2	8	393187	393194	0 %	0 %	25 %	75 %	222478806
11011	NC_012029	GAG	2	6	393199	393204	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222478806
11012	NC_012029	GGC	2	6	393268	393273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478806
11013	NC_012029	CGG	3	9	393288	393296	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478806
11014	NC_012029	CGGT	2	8	393349	393356	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
11015	NC_012029	GC	3	6	393375	393380	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11016	NC_012029	GA	4	8	393413	393420	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11017	NC_012029	CCGG	2	8	393447	393454	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11018	NC_012029	GA	3	6	393472	393477	50 %	0 %	50 %	0 %	222478807
11019	NC_012029	CGATCG	2	12	393530	393541	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	222478807
11020	NC_012029	CCG	2	6	393595	393600	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478807
11021	NC_012029	TTCG	2	8	393654	393661	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
11022	NC_012029	CGA	2	6	393702	393707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11023	NC_012029	GCC	2	6	393753	393758	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11024	NC_012029	CGG	2	6	393759	393764	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11025	NC_012029	CTG	2	6	393793	393798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478808
11026	NC_012029	GGA	2	6	393849	393854	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222478808
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11034	NC_012029	AGT	2	6	394156	394161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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11037	NC_012029	CGAAGG	2	12	394286	394297	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	222478809
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11041	NC_012029	CGC	2	6	394405	394410	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11042	NC_012029	CGA	2	6	394464	394469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11043	NC_012029	CGA	2	6	394504	394509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478810
11044	NC_012029	ACGA	2	8	394553	394560	50 %	0 %	25 %	25 %	222478810
11045	NC_012029	CGA	2	6	394618	394623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478810
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11052	NC_012029	TCG	2	6	395088	395093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478810
11053	NC_012029	CG	3	6	395125	395130	0 %	0 %	50 %	50 %	222478810
11054	NC_012029	CGA	2	6	395200	395205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478810
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11082	NC_012029	CCT	2	6	396203	396208	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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11090	NC_012029	CTG	2	6	396470	396475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478812
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11095	NC_012029	CGCGAT	2	12	396719	396730	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	222478812
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11104	NC_012029	GC	3	6	397163	397168	0 %	0 %	50 %	50 %	222478812
11105	NC_012029	CAG	2	6	397229	397234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478812
11106	NC_012029	GCGAT	2	10	397293	397302	20 %	20 %	40 %	20 %	222478812
11107	NC_012029	CGT	2	6	397324	397329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478812
11108	NC_012029	CCGTC	2	10	397348	397357	0 %	20 %	20 %	60 %	222478812
11109	NC_012029	CGT	2	6	397407	397412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478813
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11359	NC_012029	CCT	2	6	405979	405984	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222478822
11360	NC_012029	CG	4	8	405997	406004	0 %	0 %	50 %	50 %	222478822
11361	NC_012029	CGTCG	2	10	406040	406049	0 %	20 %	40 %	40 %	222478822
11362	NC_012029	CGC	2	6	406075	406080	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478822
11363	NC_012029	GTC	2	6	406122	406127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478822
11364	NC_012029	CGT	3	9	406168	406176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478822
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11400	NC_012029	GCT	2	6	407443	407448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478824
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11466	NC_012029	GTCGA	2	10	409628	409637	20 %	20 %	40 %	20 %	222478825
11467	NC_012029	ATCG	3	12	409641	409652	25 %	25 %	25 %	25 %	222478825
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11474	NC_012029	CGG	2	6	409993	409998	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478825
11475	NC_012029	CGGTGA	2	12	410001	410012	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	222478825
11476	NC_012029	GAG	2	6	410024	410029	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222478825
11477	NC_012029	CGTCAC	2	12	410050	410061	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	222478825
11478	NC_012029	CGGCGA	2	12	410071	410082	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	222478825
11479	NC_012029	ACC	2	6	410099	410104	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222478825
11480	NC_012029	CGG	2	6	410136	410141	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478825
11481	NC_012029	CGT	2	6	410158	410163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478825
11482	NC_012029	CGA	2	6	410164	410169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478825
11483	NC_012029	TCG	2	6	410184	410189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478825
11484	NC_012029	CGC	2	6	410211	410216	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478825
11485	NC_012029	CGA	3	9	410224	410232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478825
11486	NC_012029	TCG	3	9	410241	410249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11487	NC_012029	CCG	2	6	410343	410348	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478826
11488	NC_012029	GC	3	6	410359	410364	0 %	0 %	50 %	50 %	222478826
11489	NC_012029	CTG	2	6	410387	410392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478826
11490	NC_012029	GCG	2	6	410418	410423	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478826
11491	NC_012029	CGA	2	6	410463	410468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478826
11492	NC_012029	GAC	2	6	410492	410497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478826
11493	NC_012029	CGG	2	6	410518	410523	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478826
11494	NC_012029	GCC	2	6	410590	410595	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478826
11495	NC_012029	CGG	2	6	410610	410615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478826
11496	NC_012029	CGC	2	6	410650	410655	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478826
11497	NC_012029	CGG	2	6	410677	410682	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478826
11498	NC_012029	CGT	2	6	410688	410693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478826
11499	NC_012029	ACGA	2	8	410708	410715	50 %	0 %	25 %	25 %	222478826
11500	NC_012029	GTC	2	6	410792	410797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478826

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