MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239 chromosome 1

Total Repeats: 76836

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_012029	CCG	2	6	357838	357843	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478771
10002	NC_012029	CG	3	6	357881	357886	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10003	NC_012029	CGA	2	6	357892	357897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10004	NC_012029	CG	3	6	357952	357957	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10005	NC_012029	CGT	2	6	357982	357987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10006	NC_012029	GTCGAT	2	12	357992	358003	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
10007	NC_012029	GCA	2	6	358025	358030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10008	NC_012029	CGG	2	6	358073	358078	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10009	NC_012029	CGAT	2	8	358155	358162	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10010	NC_012029	CAC	2	6	358246	358251	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10011	NC_012029	GTC	2	6	358271	358276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10012	NC_012029	CGG	2	6	358327	358332	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10013	NC_012029	GTC	2	6	358345	358350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10014	NC_012029	GCCG	2	8	358379	358386	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10015	NC_012029	GTC	2	6	358451	358456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478772
10016	NC_012029	CGG	2	6	358499	358504	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478772
10017	NC_012029	ATC	2	6	358508	358513	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222478772
10018	NC_012029	GT	3	6	358529	358534	0 %	50 %	50 %	0 %	222478772
10019	NC_012029	CGAT	2	8	358542	358549	25 %	25 %	25 %	25 %	222478772
10020	NC_012029	CGCGA	2	10	358550	358559	20 %	0 %	40 %	40 %	222478772
10021	NC_012029	GTT	2	6	358564	358569	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222478772
10022	NC_012029	CAA	2	6	358588	358593	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222478772
10023	NC_012029	CTGA	2	8	358604	358611	25 %	25 %	25 %	25 %	222478772
10024	NC_012029	GCC	2	6	358616	358621	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478772
10025	NC_012029	CCG	2	6	358636	358641	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478772
10026	NC_012029	GATG	2	8	358654	358661	25 %	25 %	50 %	0 %	222478772
10027	NC_012029	GGGCGG	2	12	358690	358701	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	222478772
10028	NC_012029	AGG	2	6	358716	358721	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222478772
10029	NC_012029	TCG	2	6	358722	358727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478772
10030	NC_012029	GAG	2	6	358817	358822	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222478772
10031	NC_012029	GCG	2	6	358842	358847	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478772
10032	NC_012029	C	7	7	358848	358854	0 %	0 %	0 %	100 %	222478772
10033	NC_012029	ACG	2	6	358878	358883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478772
10034	NC_012029	TGG	2	6	358893	358898	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222478772
10035	NC_012029	CTGAC	2	10	358914	358923	20 %	20 %	20 %	40 %	222478772
10036	NC_012029	CGC	2	6	358960	358965	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478772
10037	NC_012029	CGG	2	6	359015	359020	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478772
10038	NC_012029	GAC	2	6	359030	359035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478772
10039	NC_012029	GAG	2	6	359039	359044	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222478772
10040	NC_012029	CGA	2	6	359125	359130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478772
10041	NC_012029	CG	3	6	359140	359145	0 %	0 %	50 %	50 %	222478772
10042	NC_012029	CGA	2	6	359152	359157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478772
10043	NC_012029	CTA	2	6	359176	359181	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222478772
10044	NC_012029	CGG	2	6	359200	359205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478772
10045	NC_012029	GTC	2	6	359258	359263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478772
10046	NC_012029	GAAC	2	8	359272	359279	50 %	0 %	25 %	25 %	222478772
10047	NC_012029	TCG	2	6	359280	359285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478772
10048	NC_012029	CGA	2	6	359463	359468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10049	NC_012029	AG	3	6	359510	359515	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10050	NC_012029	CCCGA	2	10	359635	359644	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
10051	NC_012029	GGCGC	2	10	359657	359666	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
10052	NC_012029	CG	3	6	359787	359792	0 %	0 %	50 %	50 %	222478773
10053	NC_012029	CG	3	6	359868	359873	0 %	0 %	50 %	50 %	222478773
10054	NC_012029	CGC	2	6	359983	359988	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478773
10055	NC_012029	TCC	2	6	360039	360044	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222478773
10056	NC_012029	GAG	2	6	360056	360061	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222478773
10057	NC_012029	ACG	2	6	360126	360131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478773
10058	NC_012029	CCG	2	6	360138	360143	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478773
10059	NC_012029	CCG	2	6	360156	360161	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478773
10060	NC_012029	ACG	2	6	360180	360185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478773
10061	NC_012029	CG	3	6	360196	360201	0 %	0 %	50 %	50 %	222478773
10062	NC_012029	CGA	2	6	360220	360225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478773
10063	NC_012029	GTG	2	6	360227	360232	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222478773
10064	NC_012029	GCT	2	6	360313	360318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478773
10065	NC_012029	CCCG	2	8	360373	360380	0 %	0 %	25 %	75 %	222478773
10066	NC_012029	CGA	2	6	360418	360423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478773
10067	NC_012029	TCG	2	6	360429	360434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478773
10068	NC_012029	CCGA	2	8	360443	360450	25 %	0 %	25 %	50 %	222478773
10069	NC_012029	CTCG	2	8	360491	360498	0 %	25 %	25 %	50 %	222478773
10070	NC_012029	CGAG	2	8	360534	360541	25 %	0 %	50 %	25 %	222478773
10071	NC_012029	CGAC	2	8	360601	360608	25 %	0 %	25 %	50 %	222478773
10072	NC_012029	CGT	2	6	360628	360633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478773
10073	NC_012029	GAC	2	6	360656	360661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478773
10074	NC_012029	GTCG	2	8	360681	360688	0 %	25 %	50 %	25 %	222478773
10075	NC_012029	GC	4	8	360740	360747	0 %	0 %	50 %	50 %	222478773
10076	NC_012029	GACG	2	8	360751	360758	25 %	0 %	50 %	25 %	222478773
10077	NC_012029	GACGGA	2	12	360776	360787	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	222478773
10078	NC_012029	GC	3	6	360793	360798	0 %	0 %	50 %	50 %	222478773
10079	NC_012029	CGGC	2	8	360830	360837	0 %	0 %	50 %	50 %	222478773
10080	NC_012029	GCC	2	6	360856	360861	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478773
10081	NC_012029	CGC	2	6	360880	360885	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478773
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10085	NC_012029	CGGC	2	8	361014	361021	0 %	0 %	50 %	50 %	222478773
10086	NC_012029	GC	3	6	361152	361157	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10087	NC_012029	AGG	2	6	361199	361204	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10088	NC_012029	CGG	2	6	361233	361238	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10089	NC_012029	CGA	2	6	361298	361303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478774
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10092	NC_012029	CCAG	2	8	361358	361365	25 %	0 %	25 %	50 %	222478774
10093	NC_012029	GAACGC	2	12	361383	361394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478774
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10097	NC_012029	GTT	2	6	361497	361502	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222478774
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10101	NC_012029	CGA	2	6	361686	361691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478775
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10103	NC_012029	GAG	2	6	361790	361795	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222478775
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10106	NC_012029	CGGCG	2	10	361855	361864	0 %	0 %	60 %	40 %	222478775
10107	NC_012029	AGG	2	6	361865	361870	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222478775
10108	NC_012029	GACC	2	8	361909	361916	25 %	0 %	25 %	50 %	222478775
10109	NC_012029	GCC	2	6	361960	361965	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478775
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10111	NC_012029	CGA	2	6	362024	362029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478776
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10113	NC_012029	GCG	2	6	362041	362046	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478776
10114	NC_012029	CGG	2	6	362057	362062	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478776
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10119	NC_012029	GC	3	6	362187	362192	0 %	0 %	50 %	50 %	222478776
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10121	NC_012029	CGA	2	6	362306	362311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478776
10122	NC_012029	CGA	2	6	362324	362329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478776
10123	NC_012029	GAA	2	6	362331	362336	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222478776
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10239	NC_012029	TCGTC	2	10	366644	366653	0 %	40 %	20 %	40 %	222478782
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10242	NC_012029	TCT	2	6	366772	366777	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222478782
10243	NC_012029	ATCG	2	8	366788	366795	25 %	25 %	25 %	25 %	222478782
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10245	NC_012029	ACGG	2	8	366860	366867	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10246	NC_012029	CGGG	2	8	366883	366890	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
10247	NC_012029	GACGGA	2	12	366896	366907	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
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10333	NC_012029	GC	3	6	369694	369699	0 %	0 %	50 %	50 %	222478786
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10479	NC_012029	CGT	2	6	374879	374884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478791
10480	NC_012029	CCG	2	6	374900	374905	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478791
10481	NC_012029	TCG	2	6	374908	374913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478791
10482	NC_012029	GAT	2	6	374931	374936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222478791
10483	NC_012029	CG	3	6	374988	374993	0 %	0 %	50 %	50 %	222478791
10484	NC_012029	GTCGGC	2	12	375057	375068	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	222478791
10485	NC_012029	GC	3	6	375067	375072	0 %	0 %	50 %	50 %	222478791
10486	NC_012029	TCG	3	9	375117	375125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478792
10487	NC_012029	CTC	2	6	375128	375133	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222478792
10488	NC_012029	GGC	2	6	375170	375175	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478792
10489	NC_012029	CGTCGC	2	12	375193	375204	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	222478792
10490	NC_012029	GTC	3	9	375254	375262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478792
10491	NC_012029	GTG	2	6	375263	375268	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222478792
10492	NC_012029	CCT	2	6	375295	375300	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222478792
10493	NC_012029	TCG	2	6	375309	375314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478792
10494	NC_012029	CGC	2	6	375412	375417	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478792
10495	NC_012029	CGG	2	6	375420	375425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478792
10496	NC_012029	CTC	2	6	375431	375436	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222478792
10497	NC_012029	GA	3	6	375438	375443	50 %	0 %	50 %	0 %	222478792
10498	NC_012029	CCG	2	6	375543	375548	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478792
10499	NC_012029	CCGCG	2	10	375553	375562	0 %	0 %	40 %	60 %	222478792
10500	NC_012029	CGG	2	6	375594	375599	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478792

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