MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239 chromosome 1

Total Repeats: 76836

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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7002	NC_012029	CCG	2	6	252121	252126	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478670
7003	NC_012029	GATC	2	8	252148	252155	25 %	25 %	25 %	25 %	222478670
7004	NC_012029	CCG	2	6	252226	252231	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478670
7005	NC_012029	GCCC	2	8	252292	252299	0 %	0 %	25 %	75 %	222478670
7006	NC_012029	CGT	2	6	252302	252307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478670
7007	NC_012029	GCGG	2	8	252317	252324	0 %	0 %	75 %	25 %	222478670
7008	NC_012029	TCG	2	6	252331	252336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478670
7009	NC_012029	CGG	2	6	252344	252349	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478670
7010	NC_012029	GGTCGC	2	12	252350	252361	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	222478670
7011	NC_012029	CGG	2	6	252367	252372	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478670
7012	NC_012029	GAT	2	6	252421	252426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222478670
7013	NC_012029	CGA	2	6	252481	252486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478671
7014	NC_012029	GGC	2	6	252487	252492	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478671
7015	NC_012029	GCG	2	6	252497	252502	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478671
7016	NC_012029	CG	3	6	252505	252510	0 %	0 %	50 %	50 %	222478671
7017	NC_012029	GTC	2	6	252530	252535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478671
7018	NC_012029	TCG	2	6	252543	252548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478671
7019	NC_012029	GCCC	2	8	252583	252590	0 %	0 %	25 %	75 %	222478671
7020	NC_012029	CGC	2	6	252673	252678	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478671
7021	NC_012029	GAG	2	6	252698	252703	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222478671
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7023	NC_012029	TCGCGC	2	12	252750	252761	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	222478671
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7025	NC_012029	CCG	2	6	252783	252788	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478671
7026	NC_012029	GCG	2	6	252809	252814	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478671
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7028	NC_012029	CGC	2	6	252862	252867	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478671
7029	NC_012029	GGCTC	2	10	252930	252939	0 %	20 %	40 %	40 %	222478671
7030	NC_012029	GTC	2	6	252955	252960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478671
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7033	NC_012029	CTT	2	6	253046	253051	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222478671
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7035	NC_012029	TCG	2	6	253074	253079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478671
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7037	NC_012029	CGA	2	6	253094	253099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478671
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7045	NC_012029	GGC	2	6	253259	253264	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478672
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7050	NC_012029	GCGG	2	8	253459	253466	0 %	0 %	75 %	25 %	222478672
7051	NC_012029	CCT	2	6	253473	253478	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222478672
7052	NC_012029	CGC	2	6	253485	253490	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478672
7053	NC_012029	CGGCG	2	10	253509	253518	0 %	0 %	60 %	40 %	222478672
7054	NC_012029	CCG	2	6	253547	253552	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478672
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7056	NC_012029	CGA	2	6	253619	253624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478672
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7058	NC_012029	CGT	2	6	253665	253670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478672
7059	NC_012029	GAC	2	6	253696	253701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478672
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7061	NC_012029	CGG	2	6	253725	253730	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478672
7062	NC_012029	CGA	2	6	253746	253751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478672
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7069	NC_012029	GCC	2	6	254006	254011	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478673
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7086	NC_012029	CGGCG	2	10	254495	254504	0 %	0 %	60 %	40 %	222478673
7087	NC_012029	GC	3	6	254510	254515	0 %	0 %	50 %	50 %	222478673
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7100	NC_012029	GACCG	2	10	255031	255040	20 %	0 %	40 %	40 %	222478674
7101	NC_012029	CGA	2	6	255057	255062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478674
7102	NC_012029	GCGG	2	8	255072	255079	0 %	0 %	75 %	25 %	222478674
7103	NC_012029	GTC	2	6	255160	255165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478674
7104	NC_012029	GACG	2	8	255234	255241	25 %	0 %	50 %	25 %	222478674
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7106	NC_012029	CGG	2	6	255331	255336	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478674
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7108	NC_012029	TCG	2	6	255362	255367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478674
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7121	NC_012029	CAC	2	6	255671	255676	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222478675
7122	NC_012029	CGA	3	9	255677	255685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478675
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7207	NC_012029	CCGGA	2	10	258283	258292	20 %	0 %	40 %	40 %	222478677
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7210	NC_012029	ACG	2	6	258319	258324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478677
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7220	NC_012029	CCGG	2	8	258581	258588	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7221	NC_012029	CGA	2	6	258594	258599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7222	NC_012029	GCGAC	2	10	258676	258685	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
7223	NC_012029	CGG	2	6	258710	258715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478678
7224	NC_012029	CG	3	6	258787	258792	0 %	0 %	50 %	50 %	222478678
7225	NC_012029	GCGG	2	8	258800	258807	0 %	0 %	75 %	25 %	222478678
7226	NC_012029	GAG	2	6	258819	258824	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222478678
7227	NC_012029	ACC	2	6	258828	258833	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222478678
7228	NC_012029	CGACG	2	10	258854	258863	20 %	0 %	40 %	40 %	222478678
7229	NC_012029	GGCG	2	8	258866	258873	0 %	0 %	75 %	25 %	222478678
7230	NC_012029	CCG	3	9	258886	258894	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478678
7231	NC_012029	CGA	2	6	258971	258976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478678
7232	NC_012029	CGA	3	9	259016	259024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478678
7233	NC_012029	ACC	2	6	259036	259041	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222478678
7234	NC_012029	CGC	2	6	259070	259075	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478678
7235	NC_012029	CGT	2	6	259100	259105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478678
7236	NC_012029	CTCGC	2	10	259132	259141	0 %	20 %	20 %	60 %	222478678
7237	NC_012029	GAC	2	6	259185	259190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478678
7238	NC_012029	TGCG	2	8	259240	259247	0 %	25 %	50 %	25 %	222478678
7239	NC_012029	CGC	2	6	259294	259299	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478678
7240	NC_012029	AAC	2	6	259320	259325	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222478678
7241	NC_012029	CCGTT	2	10	259376	259385	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
7242	NC_012029	CGA	2	6	259476	259481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478679
7243	NC_012029	CGT	2	6	259518	259523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478679
7244	NC_012029	CGG	2	6	259530	259535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478679
7245	NC_012029	CCGCC	2	10	259545	259554	0 %	0 %	20 %	80 %	222478679
7246	NC_012029	GTTC	2	8	259626	259633	0 %	50 %	25 %	25 %	222478679
7247	NC_012029	CGA	2	6	259653	259658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478679
7248	NC_012029	TACGGC	2	12	259711	259722	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	222478679
7249	NC_012029	ATC	2	6	259729	259734	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222478679
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7252	NC_012029	GCC	2	6	259849	259854	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478679
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7266	NC_012029	AG	3	6	260269	260274	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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7272	NC_012029	GC	3	6	260397	260402	0 %	0 %	50 %	50 %	222478680
7273	NC_012029	GTCGCC	2	12	260469	260480	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	222478680
7274	NC_012029	TCG	2	6	260538	260543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478680
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7352	NC_012029	TGA	2	6	263249	263254	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222478681
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7359	NC_012029	GAG	2	6	263497	263502	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222478681
7360	NC_012029	GAG	2	6	263518	263523	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222478681
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7362	NC_012029	GACT	2	8	263599	263606	25 %	25 %	25 %	25 %	222478681
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7482	NC_012029	CGA	2	6	268185	268190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478686
7483	NC_012029	CT	3	6	268204	268209	0 %	50 %	0 %	50 %	222478686
7484	NC_012029	TCG	2	6	268217	268222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478686
7485	NC_012029	CGC	2	6	268297	268302	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478686
7486	NC_012029	CGG	2	6	268321	268326	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478686
7487	NC_012029	GAAC	2	8	268354	268361	50 %	0 %	25 %	25 %	222478686
7488	NC_012029	CGC	2	6	268395	268400	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478686
7489	NC_012029	CGA	2	6	268518	268523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478686
7490	NC_012029	ACC	2	6	268568	268573	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222478686
7491	NC_012029	GA	3	6	268574	268579	50 %	0 %	50 %	0 %	222478686
7492	NC_012029	TCG	2	6	268682	268687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478686
7493	NC_012029	GCGCTG	2	12	268735	268746	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	222478686
7494	NC_012029	CCG	2	6	268748	268753	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478686
7495	NC_012029	CGG	2	6	268785	268790	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478686
7496	NC_012029	GACC	2	8	268794	268801	25 %	0 %	25 %	50 %	222478686
7497	NC_012029	GC	3	6	268820	268825	0 %	0 %	50 %	50 %	222478686
7498	NC_012029	CGC	2	6	268829	268834	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478686
7499	NC_012029	CGT	2	6	268851	268856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478686
7500	NC_012029	TGA	2	6	268875	268880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222478686

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