MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239 chromosome 1

Total Repeats: 76836

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_012029	AAC	2	6	200197	200202	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222478623
5502	NC_012029	CAG	2	6	200209	200214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478623
5503	NC_012029	CA	3	6	200229	200234	50 %	0 %	0 %	50 %	222478623
5504	NC_012029	AAG	2	6	200242	200247	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222478623
5505	NC_012029	AGG	2	6	200330	200335	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222478623
5506	NC_012029	CCG	2	6	200351	200356	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478623
5507	NC_012029	GAC	2	6	200380	200385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478623
5508	NC_012029	AAC	2	6	200398	200403	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222478623
5509	NC_012029	CGT	2	6	200412	200417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478623
5510	NC_012029	AAG	2	6	200419	200424	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222478623
5511	NC_012029	GC	3	6	200445	200450	0 %	0 %	50 %	50 %	222478623
5512	NC_012029	CGG	2	6	200499	200504	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478623
5513	NC_012029	AGG	2	6	200522	200527	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222478623
5514	NC_012029	CCG	2	6	200590	200595	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478623
5515	NC_012029	GCC	2	6	200616	200621	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478623
5516	NC_012029	GACG	2	8	200664	200671	25 %	0 %	50 %	25 %	222478623
5517	NC_012029	GCCG	2	8	200772	200779	0 %	0 %	50 %	50 %	222478623
5518	NC_012029	CGA	2	6	200790	200795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478623
5519	NC_012029	GACT	2	8	200820	200827	25 %	25 %	25 %	25 %	222478623
5520	NC_012029	GAT	2	6	200862	200867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222478623
5521	NC_012029	GCT	2	6	200871	200876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478623
5522	NC_012029	CGA	2	6	200895	200900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478623
5523	NC_012029	ATC	2	6	200917	200922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222478623
5524	NC_012029	GCC	2	6	200923	200928	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478623
5525	NC_012029	ATC	2	6	201025	201030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222478623
5526	NC_012029	CGA	2	6	201078	201083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478623
5527	NC_012029	CGA	2	6	201162	201167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478623
5528	NC_012029	GAC	2	6	201187	201192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478623
5529	NC_012029	CAG	2	6	201217	201222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478623
5530	NC_012029	GAC	2	6	201223	201228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478623
5531	NC_012029	GTTC	2	8	201295	201302	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5532	NC_012029	TCG	2	6	201307	201312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5533	NC_012029	GAA	2	6	201353	201358	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222478624
5534	NC_012029	GCCGAC	2	12	201392	201403	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	222478624
5535	NC_012029	GC	4	8	201412	201419	0 %	0 %	50 %	50 %	222478624
5536	NC_012029	CGT	2	6	201424	201429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478624
5537	NC_012029	CGC	2	6	201478	201483	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5538	NC_012029	CTC	2	6	201523	201528	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5539	NC_012029	TCT	2	6	201529	201534	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5540	NC_012029	GATC	2	8	201535	201542	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5541	NC_012029	CGCC	2	8	201558	201565	0 %	0 %	25 %	75 %	222478625
5542	NC_012029	GTC	2	6	201580	201585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478625
5543	NC_012029	GATC	2	8	201633	201640	25 %	25 %	25 %	25 %	222478625
5544	NC_012029	CCG	2	6	201656	201661	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478625
5545	NC_012029	GCC	3	9	201676	201684	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478625
5546	NC_012029	CCGAT	2	10	201711	201720	20 %	20 %	20 %	40 %	222478625
5547	NC_012029	GTC	2	6	201742	201747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478625
5548	NC_012029	CCGG	2	8	201754	201761	0 %	0 %	50 %	50 %	222478625
5549	NC_012029	CCGTC	2	10	201771	201780	0 %	20 %	20 %	60 %	222478625
5550	NC_012029	ACG	2	6	201797	201802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478625
5551	NC_012029	CTCC	2	8	201810	201817	0 %	25 %	0 %	75 %	222478625
5552	NC_012029	TCG	2	6	201830	201835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478625
5553	NC_012029	CTGC	2	8	201837	201844	0 %	25 %	25 %	50 %	222478625
5554	NC_012029	GTT	2	6	201859	201864	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222478625
5555	NC_012029	GGC	2	6	201906	201911	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478625
5556	NC_012029	CCG	2	6	201954	201959	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478625
5557	NC_012029	CGC	2	6	202009	202014	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478625
5558	NC_012029	CTCG	2	8	202030	202037	0 %	25 %	25 %	50 %	222478625
5559	NC_012029	CGG	2	6	202144	202149	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478625
5560	NC_012029	CGT	2	6	202161	202166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478625
5561	NC_012029	TGG	2	6	202256	202261	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222478625
5562	NC_012029	CGA	2	6	202263	202268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478625
5563	NC_012029	AGCG	2	8	202270	202277	25 %	0 %	50 %	25 %	222478625
5564	NC_012029	CGG	2	6	202341	202346	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478625
5565	NC_012029	TGA	2	6	202415	202420	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222478625
5566	NC_012029	CGTCG	2	10	202444	202453	0 %	20 %	40 %	40 %	222478625
5567	NC_012029	GCT	2	6	202461	202466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478625
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5569	NC_012029	GCC	2	6	202490	202495	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478625
5570	NC_012029	CGA	2	6	202614	202619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478625
5571	NC_012029	CGA	2	6	202623	202628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478625
5572	NC_012029	CGA	2	6	202632	202637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478625
5573	NC_012029	CGA	3	9	202647	202655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478625
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5575	NC_012029	GTCG	2	8	202695	202702	0 %	25 %	50 %	25 %	222478625
5576	NC_012029	ACG	2	6	202786	202791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5577	NC_012029	CTCG	2	8	202819	202826	0 %	25 %	25 %	50 %	222478626
5578	NC_012029	AGC	2	6	202917	202922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478626
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5581	NC_012029	GCCG	2	8	203000	203007	0 %	0 %	50 %	50 %	222478626
5582	NC_012029	CGC	2	6	203013	203018	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478626
5583	NC_012029	GCCA	2	8	203027	203034	25 %	0 %	25 %	50 %	222478626
5584	NC_012029	TCG	3	9	203063	203071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478626
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5589	NC_012029	CGT	2	6	203136	203141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478626
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5591	NC_012029	GCC	2	6	203264	203269	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478626
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5593	NC_012029	GTCG	2	8	203314	203321	0 %	25 %	50 %	25 %	222478626
5594	NC_012029	TCG	2	6	203342	203347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478626
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5611	NC_012029	GGTC	2	8	203948	203955	0 %	25 %	50 %	25 %	222478627
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5619	NC_012029	TC	3	6	204167	204172	0 %	50 %	0 %	50 %	222478627
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5865	NC_012029	CT	3	6	212878	212883	0 %	50 %	0 %	50 %	222478633
5866	NC_012029	GAGC	2	8	212932	212939	25 %	0 %	50 %	25 %	222478633
5867	NC_012029	GTC	2	6	212950	212955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478633
5868	NC_012029	GGCG	2	8	212995	213002	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5869	NC_012029	CGTAT	2	10	213010	213019	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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5872	NC_012029	GAC	2	6	213087	213092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478634
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5880	NC_012029	CGT	2	6	213304	213309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478634
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5984	NC_012029	CGA	2	6	216488	216493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478638
5985	NC_012029	ACG	2	6	216595	216600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478638
5986	NC_012029	CGG	2	6	216620	216625	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478638
5987	NC_012029	CG	3	6	216630	216635	0 %	0 %	50 %	50 %	222478638
5988	NC_012029	TCGC	2	8	216694	216701	0 %	25 %	25 %	50 %	222478638
5989	NC_012029	GTC	2	6	216720	216725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478638
5990	NC_012029	CGC	2	6	216776	216781	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478638
5991	NC_012029	GTC	2	6	216810	216815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478638
5992	NC_012029	CTCGGT	2	12	216852	216863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478638
5993	NC_012029	CGA	2	6	216890	216895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478638
5994	NC_012029	TCGGT	2	10	216936	216945	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
5995	NC_012029	CGC	2	6	216982	216987	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5996	NC_012029	GGC	2	6	217055	217060	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478639
5997	NC_012029	GTT	2	6	217106	217111	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222478639
5998	NC_012029	TCGCCG	2	12	217144	217155	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	222478639
5999	NC_012029	TCG	2	6	217305	217310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478639
6000	NC_012029	CGACG	2	10	217328	217337	20 %	0 %	40 %	40 %	222478639

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