MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239 chromosome 2

Total Repeats: 11568

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_012028	TGTC	2	8	187033	187040	0 %	50 %	25 %	25 %	222475850
4002	NC_012028	GAAT	2	8	187046	187053	50 %	25 %	25 %	0 %	222475850
4003	NC_012028	TGT	2	6	187102	187107	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222475850
4004	NC_012028	GAC	2	6	187115	187120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475850
4005	NC_012028	TCG	2	6	187143	187148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475850
4006	NC_012028	TCGGC	2	10	187162	187171	0 %	20 %	40 %	40 %	222475850
4007	NC_012028	TCTG	2	8	187191	187198	0 %	50 %	25 %	25 %	222475850
4008	NC_012028	GCT	2	6	187224	187229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475850
4009	NC_012028	CGA	2	6	187342	187347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475850
4010	NC_012028	AG	3	6	187367	187372	50 %	0 %	50 %	0 %	222475850
4011	NC_012028	ATCTCG	2	12	187416	187427	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	222475850
4012	NC_012028	CGAC	2	8	187480	187487	25 %	0 %	25 %	50 %	222475850
4013	NC_012028	GCT	2	6	187513	187518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475850
4014	NC_012028	GCA	2	6	187539	187544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475850
4015	NC_012028	GTG	2	6	187614	187619	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222475850
4016	NC_012028	GAG	2	6	187736	187741	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222475850
4017	NC_012028	CTG	2	6	187817	187822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475850
4018	NC_012028	GTC	2	6	187824	187829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475850
4019	NC_012028	CGA	2	6	187834	187839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475850
4020	NC_012028	GAGC	2	8	187888	187895	25 %	0 %	50 %	25 %	222475850
4021	NC_012028	GCC	2	6	187899	187904	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222475850
4022	NC_012028	CAC	2	6	187922	187927	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222475850
4023	NC_012028	TCG	2	6	188034	188039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475850
4024	NC_012028	ACC	2	6	188145	188150	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222475850
4025	NC_012028	CTG	2	6	188181	188186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475850
4026	NC_012028	GAC	2	6	188198	188203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475850
4027	NC_012028	GCG	2	6	188278	188283	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222475850
4028	NC_012028	GAA	2	6	188324	188329	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222475850
4029	NC_012028	CCA	2	6	188355	188360	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222475850
4030	NC_012028	TGG	2	6	188411	188416	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222475850
4031	NC_012028	TCG	2	6	188457	188462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475850
4032	NC_012028	GTG	2	6	188473	188478	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222475850
4033	NC_012028	TCA	2	6	188537	188542	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4034	NC_012028	AATA	2	8	188625	188632	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4035	NC_012028	CA	3	6	188720	188725	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4036	NC_012028	CGG	2	6	188841	188846	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4037	NC_012028	TCC	2	6	188870	188875	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4038	NC_012028	TAA	2	6	188886	188891	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4039	NC_012028	CA	4	8	188899	188906	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4040	NC_012028	GTC	2	6	188922	188927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4041	NC_012028	TTC	2	6	189056	189061	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222475851
4042	NC_012028	GTC	2	6	189074	189079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475851
4043	NC_012028	GATCG	2	10	189219	189228	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
4044	NC_012028	CCG	2	6	189231	189236	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4045	NC_012028	TA	3	6	189240	189245	50 %	50 %	0 %	0 %	222475852
4046	NC_012028	GTCC	2	8	189328	189335	0 %	25 %	25 %	50 %	222475852
4047	NC_012028	CCG	2	6	189348	189353	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222475852
4048	NC_012028	TTC	2	6	189374	189379	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222475852
4049	NC_012028	TCCT	2	8	189384	189391	0 %	50 %	0 %	50 %	222475852
4050	NC_012028	TC	4	8	189399	189406	0 %	50 %	0 %	50 %	222475852
4051	NC_012028	CGA	2	6	189441	189446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475852
4052	NC_012028	GCT	2	6	189456	189461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475852
4053	NC_012028	GTC	2	6	189508	189513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4054	NC_012028	TCG	2	6	189524	189529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4055	NC_012028	GTC	2	6	189574	189579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475853
4056	NC_012028	TCC	2	6	189587	189592	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222475853
4057	NC_012028	TCG	2	6	189633	189638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475853
4058	NC_012028	TGC	2	6	189641	189646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475853
4059	NC_012028	GAAT	2	8	189655	189662	50 %	25 %	25 %	0 %	222475853
4060	NC_012028	TTCGAG	2	12	189710	189721	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	222475853
4061	NC_012028	TCGGGA	2	12	189741	189752	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	222475853
4062	NC_012028	CGG	2	6	189778	189783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222475853
4063	NC_012028	CCGG	2	8	189815	189822	0 %	0 %	50 %	50 %	222475853
4064	NC_012028	GTC	2	6	189833	189838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475853
4065	NC_012028	TCA	2	6	189879	189884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222475853
4066	NC_012028	CGC	2	6	189903	189908	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222475853
4067	NC_012028	TCG	2	6	189927	189932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475853
4068	NC_012028	GAG	2	6	190028	190033	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222475853
4069	NC_012028	AC	3	6	190048	190053	50 %	0 %	0 %	50 %	222475853
4070	NC_012028	GCA	2	6	190060	190065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475853
4071	NC_012028	TCC	2	6	190074	190079	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222475853
4072	NC_012028	TCA	2	6	190095	190100	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222475853
4073	NC_012028	GTTCGC	2	12	190120	190131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475853
4074	NC_012028	GGT	2	6	190159	190164	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222475853
4075	NC_012028	TCG	2	6	190176	190181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475853
4076	NC_012028	GTCGGA	2	12	190184	190195	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	222475853
4077	NC_012028	ATCC	2	8	190234	190241	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4078	NC_012028	ACG	3	9	190386	190394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475854
4079	NC_012028	ATCG	2	8	190484	190491	25 %	25 %	25 %	25 %	222475854
4080	NC_012028	CCG	2	6	190509	190514	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222475854
4081	NC_012028	GCC	2	6	190578	190583	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222475854
4082	NC_012028	CGA	2	6	190631	190636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475854
4083	NC_012028	GAC	2	6	190653	190658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475854
4084	NC_012028	CGT	2	6	190718	190723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475854
4085	NC_012028	GGC	2	6	190760	190765	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222475854
4086	NC_012028	CGA	2	6	190799	190804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475854
4087	NC_012028	GTC	2	6	190842	190847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475854
4088	NC_012028	CGT	2	6	190862	190867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475854
4089	NC_012028	GGA	2	6	190937	190942	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222475854
4090	NC_012028	CCG	2	6	190978	190983	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222475854
4091	NC_012028	GACG	2	8	191046	191053	25 %	0 %	50 %	25 %	222475854
4092	NC_012028	GAC	2	6	191061	191066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475854
4093	NC_012028	CCG	2	6	191128	191133	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222475855
4094	NC_012028	GTT	2	6	191167	191172	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222475855
4095	NC_012028	CAT	2	6	191191	191196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222475855
4096	NC_012028	GCT	2	6	191197	191202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475855
4097	NC_012028	CGG	2	6	191215	191220	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222475855
4098	NC_012028	CGG	2	6	191242	191247	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222475855
4099	NC_012028	CG	3	6	191342	191347	0 %	0 %	50 %	50 %	222475855
4100	NC_012028	CGG	2	6	191391	191396	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222475855
4101	NC_012028	CCT	3	9	191422	191430	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222475855
4102	NC_012028	TTC	2	6	191456	191461	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222475855
4103	NC_012028	GCC	2	6	191477	191482	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222475855
4104	NC_012028	ACT	2	6	191512	191517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222475855
4105	NC_012028	TCA	2	6	191580	191585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222475855
4106	NC_012028	GCT	2	6	191623	191628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475855
4107	NC_012028	GCC	2	6	191631	191636	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222475855
4108	NC_012028	CGCCGA	2	12	191736	191747	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	222475855
4109	NC_012028	CGC	2	6	191767	191772	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222475855
4110	NC_012028	TCG	2	6	191838	191843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475855
4111	NC_012028	TCAC	2	8	191907	191914	25 %	25 %	0 %	50 %	222475855
4112	NC_012028	GTC	2	6	191990	191995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475855
4113	NC_012028	CCG	2	6	192016	192021	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222475855
4114	NC_012028	GTT	2	6	192160	192165	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222475855
4115	NC_012028	GTG	2	6	192176	192181	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222475855
4116	NC_012028	CT	3	6	192257	192262	0 %	50 %	0 %	50 %	222475855
4117	NC_012028	CCT	2	6	192268	192273	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222475855
4118	NC_012028	TC	3	6	192441	192446	0 %	50 %	0 %	50 %	222475855
4119	NC_012028	CGCT	2	8	192558	192565	0 %	25 %	25 %	50 %	222475855
4120	NC_012028	TCG	2	6	192636	192641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475855
4121	NC_012028	GTC	2	6	192720	192725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4123	NC_012028	GACC	2	8	192751	192758	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4124	NC_012028	TCGGC	2	10	192781	192790	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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4246	NC_012028	CAG	2	6	198454	198459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475859
4247	NC_012028	CGA	2	6	198465	198470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475859
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4249	NC_012028	TCG	2	6	198569	198574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475859
4250	NC_012028	GAT	2	6	198592	198597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222475859
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4262	NC_012028	TCAG	2	8	199608	199615	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4263	NC_012028	CTTG	2	8	199739	199746	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4264	NC_012028	GTC	2	6	199814	199819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4269	NC_012028	GTA	2	6	200178	200183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222475860
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4371	NC_012028	GAA	2	6	205075	205080	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222475865
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4401	NC_012028	CGG	2	6	206671	206676	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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4403	NC_012028	GTCG	2	8	206712	206719	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4404	NC_012028	TCG	2	6	206737	206742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4454	NC_012028	GC	3	6	208567	208572	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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4494	NC_012028	CTC	2	6	210341	210346	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222475873
4495	NC_012028	TTG	2	6	210405	210410	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222475873
4496	NC_012028	AGT	2	6	210462	210467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4497	NC_012028	AC	3	6	210531	210536	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4498	NC_012028	TC	3	6	210576	210581	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4499	NC_012028	TGG	2	6	210585	210590	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4500	NC_012028	TCTGT	2	10	210597	210606	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding

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