MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239 chromosome 2

Total Repeats: 11568

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_012028	AAC	2	6	164358	164363	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3502	NC_012028	GGT	2	6	164411	164416	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3503	NC_012028	AGC	2	6	164451	164456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3504	NC_012028	ACC	2	6	164529	164534	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3505	NC_012028	AGC	2	6	164649	164654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3506	NC_012028	AGCG	2	8	164882	164889	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3507	NC_012028	GAA	2	6	165047	165052	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3508	NC_012028	TAA	2	6	165107	165112	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3509	NC_012028	CGG	2	6	165215	165220	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3510	NC_012028	GTA	2	6	165248	165253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3511	NC_012028	GCA	2	6	165425	165430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3512	NC_012028	TAGG	2	8	165431	165438	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3513	NC_012028	ACA	2	6	165477	165482	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3514	NC_012028	TAC	2	6	165489	165494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3515	NC_012028	GAG	2	6	165523	165528	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3516	NC_012028	GC	3	6	165584	165589	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3517	NC_012028	ATC	2	6	165596	165601	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3518	NC_012028	TGACGC	2	12	165672	165683	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3519	NC_012028	GTC	2	6	165763	165768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3520	NC_012028	GTT	2	6	165857	165862	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3521	NC_012028	AGG	2	6	165873	165878	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3522	NC_012028	CGT	2	6	165898	165903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3523	NC_012028	GCT	2	6	165915	165920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3524	NC_012028	GAAC	2	8	165951	165958	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3525	NC_012028	TG	3	6	166005	166010	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3526	NC_012028	AAG	2	6	166084	166089	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3527	NC_012028	AGA	2	6	166109	166114	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3528	NC_012028	ACC	2	6	166267	166272	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3529	NC_012028	TC	4	8	166283	166290	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3530	NC_012028	AG	4	8	166302	166309	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3531	NC_012028	GGC	2	6	166340	166345	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3532	NC_012028	CCA	2	6	166395	166400	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3533	NC_012028	CGC	2	6	166448	166453	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3534	NC_012028	TCG	2	6	166573	166578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3535	NC_012028	CAA	2	6	166667	166672	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3536	NC_012028	TAC	2	6	166675	166680	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222475830
3537	NC_012028	GAG	2	6	166746	166751	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222475830
3538	NC_012028	GTC	2	6	166804	166809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475830
3539	NC_012028	GAC	2	6	166879	166884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475830
3540	NC_012028	GTGA	2	8	166898	166905	25 %	25 %	50 %	0 %	222475830
3541	NC_012028	GCG	2	6	166958	166963	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3542	NC_012028	AGG	2	6	166967	166972	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3543	NC_012028	TCT	2	6	166986	166991	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3544	NC_012028	GCTG	2	8	167014	167021	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3545	NC_012028	GCG	2	6	167060	167065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3546	NC_012028	GTC	2	6	167089	167094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3547	NC_012028	TGA	2	6	167097	167102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3548	NC_012028	TTCG	2	8	167123	167130	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3549	NC_012028	GGC	2	6	167194	167199	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3550	NC_012028	GTC	2	6	167210	167215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3551	NC_012028	CTC	2	6	167231	167236	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3552	NC_012028	ATG	2	6	167292	167297	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3553	NC_012028	GAC	2	6	167332	167337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3554	NC_012028	TCG	2	6	167378	167383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3555	NC_012028	CAG	2	6	167471	167476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3556	NC_012028	GAA	2	6	167509	167514	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3557	NC_012028	ACA	2	6	167555	167560	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3558	NC_012028	GCG	2	6	167579	167584	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3559	NC_012028	GTGG	2	8	167676	167683	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
3560	NC_012028	TGT	2	6	167694	167699	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3561	NC_012028	CGA	2	6	167850	167855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3562	NC_012028	AC	3	6	167856	167861	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3563	NC_012028	TGT	2	6	167901	167906	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222475831
3564	NC_012028	TCT	2	6	167921	167926	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222475831
3565	NC_012028	TCG	2	6	167942	167947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475831
3566	NC_012028	GTA	2	6	167989	167994	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222475831
3567	NC_012028	CTG	2	6	168025	168030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475831
3568	NC_012028	CGA	2	6	168039	168044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475831
3569	NC_012028	CAA	2	6	168054	168059	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222475831
3570	NC_012028	GGT	2	6	168069	168074	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222475831
3571	NC_012028	CCG	2	6	168134	168139	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222475831
3572	NC_012028	CT	3	6	168224	168229	0 %	50 %	0 %	50 %	222475831
3573	NC_012028	TTC	2	6	168241	168246	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222475831
3574	NC_012028	TCC	2	6	168265	168270	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222475831
3575	NC_012028	CTGT	2	8	168273	168280	0 %	50 %	25 %	25 %	222475831
3576	NC_012028	GT	3	6	168279	168284	0 %	50 %	50 %	0 %	222475831
3577	NC_012028	TCG	2	6	168288	168293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475831
3578	NC_012028	AG	3	6	168316	168321	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3579	NC_012028	TC	3	6	168347	168352	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3580	NC_012028	A	6	6	168353	168358	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3581	NC_012028	CGTGA	2	10	168414	168423	20 %	20 %	40 %	20 %	222475832
3582	NC_012028	ACGTA	2	10	168442	168451	40 %	20 %	20 %	20 %	222475832
3583	NC_012028	TCT	2	6	168463	168468	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222475832
3584	NC_012028	ATT	2	6	168569	168574	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222475832
3585	NC_012028	AGA	2	6	168584	168589	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222475832
3586	NC_012028	ACG	2	6	168614	168619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475832
3587	NC_012028	TTGACG	2	12	168670	168681	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	222475832
3588	NC_012028	GTA	2	6	168733	168738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222475832
3589	NC_012028	GAA	2	6	168789	168794	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222475832
3590	NC_012028	AC	3	6	168825	168830	50 %	0 %	0 %	50 %	222475832
3591	NC_012028	GAT	2	6	168875	168880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222475832
3592	NC_012028	TGG	2	6	168965	168970	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222475832
3593	NC_012028	CAT	2	6	168971	168976	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222475832
3594	NC_012028	GATT	2	8	169011	169018	25 %	50 %	25 %	0 %	222475832
3595	NC_012028	TCA	2	6	169036	169041	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3596	NC_012028	ATTC	2	8	169079	169086	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3597	NC_012028	TTG	2	6	169180	169185	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3598	NC_012028	CCG	2	6	169199	169204	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3599	NC_012028	CG	3	6	169213	169218	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3600	NC_012028	GTG	2	6	169252	169257	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3601	NC_012028	A	6	6	169318	169323	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3602	NC_012028	ACC	2	6	169367	169372	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3603	NC_012028	CGA	2	6	169406	169411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3604	NC_012028	AGA	2	6	169412	169417	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3605	NC_012028	GA	4	8	169443	169450	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3606	NC_012028	CAG	2	6	169461	169466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3607	NC_012028	CGGC	2	8	169485	169492	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3608	NC_012028	TCG	2	6	169656	169661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475833
3609	NC_012028	CTG	2	6	169682	169687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475833
3610	NC_012028	GTC	2	6	169692	169697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475833
3611	NC_012028	ACG	2	6	169710	169715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475833
3612	NC_012028	TGT	2	6	169806	169811	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222475833
3613	NC_012028	TG	3	6	169857	169862	0 %	50 %	50 %	0 %	222475833
3614	NC_012028	ACG	2	6	169930	169935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3615	NC_012028	GGA	2	6	169951	169956	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3616	NC_012028	GAAC	2	8	170015	170022	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3617	NC_012028	ATCGAT	2	12	170054	170065	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
3618	NC_012028	CGA	2	6	170156	170161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3619	NC_012028	GA	3	6	170160	170165	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3620	NC_012028	ACGG	2	8	170169	170176	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3621	NC_012028	GCTGTC	2	12	170188	170199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3622	NC_012028	GGC	2	6	170200	170205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3623	NC_012028	GCC	2	6	170211	170216	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3624	NC_012028	CACT	2	8	170233	170240	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3625	NC_012028	TCGG	2	8	170253	170260	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3626	NC_012028	GTC	2	6	170279	170284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475834
3627	NC_012028	TCG	2	6	170339	170344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475834
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3629	NC_012028	CGCC	2	8	170388	170395	0 %	0 %	25 %	75 %	222475834
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3994	NC_012028	TGG	2	6	186641	186646	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3995	NC_012028	TTC	2	6	186661	186666	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3996	NC_012028	ATTGT	2	10	186714	186723	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
3997	NC_012028	TC	3	6	186731	186736	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3998	NC_012028	GA	3	6	186747	186752	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3999	NC_012028	TTG	2	6	186856	186861	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222475850
4000	NC_012028	TCG	3	9	186882	186890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475850

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